MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols chromosome

Total Repeats: 22198

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_000919	TGC	2	6	617931	617936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639558
12002	NC_000919	GCA	2	6	617947	617952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639558
12003	NC_000919	TGC	2	6	617994	617999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639558
12004	NC_000919	TTC	2	6	618033	618038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639558
12005	NC_000919	GCA	2	6	618064	618069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639558
12006	NC_000919	TCA	2	6	618094	618099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639558
12007	NC_000919	GCT	2	6	618119	618124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639558
12008	NC_000919	GCTC	2	8	618190	618197	0 %	25 %	25 %	50 %	15639558
12009	NC_000919	CTC	2	6	618276	618281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639558
12010	NC_000919	CTG	2	6	618302	618307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639558
12011	NC_000919	CTG	2	6	618355	618360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639558
12012	NC_000919	AGA	2	6	618393	618398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639558
12013	NC_000919	AC	3	6	618438	618443	50 %	0 %	0 %	50 %	15639558
12014	NC_000919	GCG	2	6	618446	618451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639558
12015	NC_000919	CCA	2	6	618467	618472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639558
12016	NC_000919	GCA	2	6	618475	618480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639558
12017	NC_000919	CAA	2	6	618498	618503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15639558
12018	NC_000919	CAC	2	6	618504	618509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639558
12019	NC_000919	CTGC	2	8	618517	618524	0 %	25 %	25 %	50 %	15639558
12020	NC_000919	GC	3	6	618588	618593	0 %	0 %	50 %	50 %	15639558
12021	NC_000919	AC	3	6	618594	618599	50 %	0 %	0 %	50 %	15639558
12022	NC_000919	A	7	7	618606	618612	100 %	0 %	0 %	0 %	15639558
12023	NC_000919	ATGCA	2	10	618657	618666	40 %	20 %	20 %	20 %	15639558
12024	NC_000919	GAA	2	6	618667	618672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639558
12025	NC_000919	AAAG	2	8	618692	618699	75 %	0 %	25 %	0 %	15639558
12026	NC_000919	GAC	2	6	618714	618719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639558
12027	NC_000919	CCA	2	6	618728	618733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639558
12028	NC_000919	GC	3	6	618760	618765	0 %	0 %	50 %	50 %	15639558
12029	NC_000919	CA	3	6	618781	618786	50 %	0 %	0 %	50 %	15639558
12030	NC_000919	ACA	2	6	618800	618805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15639558
12031	NC_000919	GC	3	6	618838	618843	0 %	0 %	50 %	50 %	15639558
12032	NC_000919	CAA	2	6	618891	618896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15639558
12033	NC_000919	GGAA	2	8	618906	618913	50 %	0 %	50 %	0 %	15639558
12034	NC_000919	CTG	2	6	618990	618995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639558
12035	NC_000919	CGCC	2	8	619118	619125	0 %	0 %	25 %	75 %	15639558
12036	NC_000919	CAC	3	9	619224	619232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639558
12037	NC_000919	ATCT	2	8	619278	619285	25 %	50 %	0 %	25 %	15639558
12038	NC_000919	CATC	2	8	619376	619383	25 %	25 %	0 %	50 %	15639558
12039	NC_000919	TC	3	6	619388	619393	0 %	50 %	0 %	50 %	15639558
12040	NC_000919	AC	3	6	619419	619424	50 %	0 %	0 %	50 %	15639558
12041	NC_000919	CAG	2	6	619430	619435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639558
12042	NC_000919	T	7	7	619535	619541	0 %	100 %	0 %	0 %	15639559
12043	NC_000919	ACG	2	6	619611	619616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639559
12044	NC_000919	ATT	2	6	619636	619641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15639559
12045	NC_000919	GGCA	2	8	619665	619672	25 %	0 %	50 %	25 %	15639559
12046	NC_000919	CGC	2	6	619711	619716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15639559
12047	NC_000919	CA	3	6	619765	619770	50 %	0 %	0 %	50 %	15639559
12048	NC_000919	CG	4	8	619794	619801	0 %	0 %	50 %	50 %	15639559
12049	NC_000919	TGC	2	6	619813	619818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639559
12050	NC_000919	GC	3	6	619838	619843	0 %	0 %	50 %	50 %	15639559
12051	NC_000919	CCAC	2	8	619847	619854	25 %	0 %	0 %	75 %	15639559
12052	NC_000919	A	7	7	619873	619879	100 %	0 %	0 %	0 %	15639559
12053	NC_000919	AC	3	6	619882	619887	50 %	0 %	0 %	50 %	15639559
12054	NC_000919	GGC	2	6	619933	619938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639559
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12057	NC_000919	GCA	2	6	620129	620134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639559
12058	NC_000919	AGTCC	2	10	620144	620153	20 %	20 %	20 %	40 %	15639559
12059	NC_000919	AGC	2	6	620160	620165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639559
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12061	NC_000919	GC	3	6	620228	620233	0 %	0 %	50 %	50 %	15639559
12062	NC_000919	GA	3	6	620299	620304	50 %	0 %	50 %	0 %	15639559
12063	NC_000919	CA	3	6	620356	620361	50 %	0 %	0 %	50 %	15639559
12064	NC_000919	CGGG	2	8	620414	620421	0 %	0 %	75 %	25 %	15639560
12065	NC_000919	GC	3	6	620577	620582	0 %	0 %	50 %	50 %	15639560
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12068	NC_000919	CACC	2	8	620692	620699	25 %	0 %	0 %	75 %	15639560
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12071	NC_000919	AC	3	6	620974	620979	50 %	0 %	0 %	50 %	15639560
12072	NC_000919	ACAA	2	8	621010	621017	75 %	0 %	0 %	25 %	15639560
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12074	NC_000919	CTT	2	6	621036	621041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639560
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12083	NC_000919	CCG	2	6	621429	621434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15639561
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12086	NC_000919	GAC	2	6	621532	621537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639561
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12088	NC_000919	AGG	2	6	621569	621574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639561
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12091	NC_000919	CGC	2	6	621826	621831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15639561
12092	NC_000919	CGCA	2	8	621847	621854	25 %	0 %	25 %	50 %	15639561
12093	NC_000919	GCT	2	6	621867	621872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639561
12094	NC_000919	TTC	2	6	621884	621889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639561
12095	NC_000919	CACG	2	8	621963	621970	25 %	0 %	25 %	50 %	15639561
12096	NC_000919	AC	3	6	622025	622030	50 %	0 %	0 %	50 %	15639561
12097	NC_000919	CAGA	2	8	622046	622053	50 %	0 %	25 %	25 %	15639561
12098	NC_000919	GC	3	6	622080	622085	0 %	0 %	50 %	50 %	15639561
12099	NC_000919	CTC	2	6	622134	622139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639561
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12101	NC_000919	AACCT	2	10	622281	622290	40 %	20 %	0 %	40 %	15639563
12102	NC_000919	AG	3	6	622325	622330	50 %	0 %	50 %	0 %	15639563
12103	NC_000919	GCA	2	6	622401	622406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639563
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12105	NC_000919	GAAG	2	8	622489	622496	50 %	0 %	50 %	0 %	15639563
12106	NC_000919	GTA	2	6	622547	622552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639563
12107	NC_000919	CCA	2	6	622628	622633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639563
12108	NC_000919	CAG	2	6	622639	622644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639563
12109	NC_000919	TCA	2	6	622689	622694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639563
12110	NC_000919	GTA	2	6	622697	622702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639563
12111	NC_000919	TCA	2	6	622726	622731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639563
12112	NC_000919	TGC	2	6	622870	622875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639563
12113	NC_000919	CG	3	6	623081	623086	0 %	0 %	50 %	50 %	15639563
12114	NC_000919	GCAC	2	8	623166	623173	25 %	0 %	25 %	50 %	15639563
12115	NC_000919	T	6	6	623211	623216	0 %	100 %	0 %	0 %	15639563
12116	NC_000919	CTG	2	6	623223	623228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639563
12117	NC_000919	GA	3	6	623247	623252	50 %	0 %	50 %	0 %	15639563
12118	NC_000919	CG	3	6	623360	623365	0 %	0 %	50 %	50 %	15639563
12119	NC_000919	AGT	2	6	623425	623430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639563
12120	NC_000919	ATG	2	6	623468	623473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639563
12121	NC_000919	CAAC	2	8	623491	623498	50 %	0 %	0 %	50 %	15639563
12122	NC_000919	AGT	2	6	623520	623525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639563
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12497	NC_000919	CCCT	2	8	644893	644900	0 %	25 %	0 %	75 %	15639581
12498	NC_000919	CACC	2	8	644961	644968	25 %	0 %	0 %	75 %	15639581
12499	NC_000919	AAAC	2	8	644979	644986	75 %	0 %	0 %	25 %	15639581
12500	NC_000919	TGA	2	6	645021	645026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639581

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