MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols chromosome

Total Repeats: 22198

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_000919	TCGC	2	8	569829	569836	0 %	25 %	25 %	50 %	15639516
11003	NC_000919	TG	3	6	569872	569877	0 %	50 %	50 %	0 %	15639516
11004	NC_000919	GTAT	2	8	569930	569937	25 %	50 %	25 %	0 %	15639516
11005	NC_000919	A	7	7	569962	569968	100 %	0 %	0 %	0 %	15639516
11006	NC_000919	GCACG	2	10	570021	570030	20 %	0 %	40 %	40 %	15639516
11007	NC_000919	CG	3	6	570038	570043	0 %	0 %	50 %	50 %	15639516
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11011	NC_000919	AGC	2	6	570141	570146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639516
11012	NC_000919	GC	3	6	570195	570200	0 %	0 %	50 %	50 %	15639517
11013	NC_000919	CTC	2	6	570240	570245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639517
11014	NC_000919	TGCT	2	8	570295	570302	0 %	50 %	25 %	25 %	15639517
11015	NC_000919	TCC	2	6	570409	570414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639517
11016	NC_000919	GCA	2	6	570448	570453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639517
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11018	NC_000919	GCA	2	6	570565	570570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639517
11019	NC_000919	ATC	2	6	570573	570578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639517
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11021	NC_000919	AGA	2	6	570652	570657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639517
11022	NC_000919	AG	3	6	570671	570676	50 %	0 %	50 %	0 %	15639517
11023	NC_000919	CAAG	2	8	570713	570720	50 %	0 %	25 %	25 %	15639517
11024	NC_000919	TGG	2	6	570776	570781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639517
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11027	NC_000919	CGATA	2	10	570999	571008	40 %	20 %	20 %	20 %	15639518
11028	NC_000919	CTGA	2	8	571060	571067	25 %	25 %	25 %	25 %	15639518
11029	NC_000919	GGTCA	2	10	571378	571387	20 %	20 %	40 %	20 %	15639518
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11033	NC_000919	GC	3	6	571472	571477	0 %	0 %	50 %	50 %	15639518
11034	NC_000919	GTG	2	6	571547	571552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639518
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11054	NC_000919	TG	3	6	572356	572361	0 %	50 %	50 %	0 %	15639518
11055	NC_000919	CG	3	6	572362	572367	0 %	0 %	50 %	50 %	15639518
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11058	NC_000919	CGTA	2	8	572447	572454	25 %	25 %	25 %	25 %	15639519
11059	NC_000919	TACG	2	8	572462	572469	25 %	25 %	25 %	25 %	15639519
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11073	NC_000919	CA	3	6	572994	572999	50 %	0 %	0 %	50 %	15639519
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11105	NC_000919	AT	4	8	574730	574737	50 %	50 %	0 %	0 %	15639520
11106	NC_000919	CACG	2	8	574895	574902	25 %	0 %	25 %	50 %	15639521
11107	NC_000919	CCT	2	6	574905	574910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639521
11108	NC_000919	CT	3	6	574909	574914	0 %	50 %	0 %	50 %	15639521
11109	NC_000919	GC	3	6	574928	574933	0 %	0 %	50 %	50 %	15639521
11110	NC_000919	G	6	6	574972	574977	0 %	0 %	100 %	0 %	15639521
11111	NC_000919	GC	4	8	574997	575004	0 %	0 %	50 %	50 %	15639521
11112	NC_000919	CCT	2	6	575007	575012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639521
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11117	NC_000919	A	6	6	575810	575815	100 %	0 %	0 %	0 %	15639522
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11125	NC_000919	AG	3	6	576063	576068	50 %	0 %	50 %	0 %	15639522
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11499	NC_000919	CG	4	8	595070	595077	0 %	0 %	50 %	50 %	15639538
11500	NC_000919	TCT	2	6	595131	595136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639538

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