MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols chromosome

Total Repeats: 22198

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10502	NC_000919	TGC	2	6	543360	543365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639499
10503	NC_000919	CTA	2	6	543450	543455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639499
10504	NC_000919	TTA	2	6	543500	543505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15639499
10505	NC_000919	TGA	2	6	543565	543570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639499
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10507	NC_000919	AAT	2	6	543655	543660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15639499
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10509	NC_000919	TGG	2	6	543757	543762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639499
10510	NC_000919	CGTT	2	8	543765	543772	0 %	50 %	25 %	25 %	15639499
10511	NC_000919	GT	3	6	543800	543805	0 %	50 %	50 %	0 %	15639499
10512	NC_000919	GAT	2	6	543887	543892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639499
10513	NC_000919	GTCTT	2	10	544050	544059	0 %	60 %	20 %	20 %	15639499
10514	NC_000919	TGA	2	6	544060	544065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639499
10515	NC_000919	CAG	2	6	544088	544093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639499
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10517	NC_000919	GAA	2	6	544207	544212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639499
10518	NC_000919	TGGTG	2	10	544271	544280	0 %	40 %	60 %	0 %	15639499
10519	NC_000919	G	6	6	544421	544426	0 %	0 %	100 %	0 %	15639500
10520	NC_000919	TG	3	6	544504	544509	0 %	50 %	50 %	0 %	15639500
10521	NC_000919	CG	4	8	544531	544538	0 %	0 %	50 %	50 %	15639500
10522	NC_000919	GACA	2	8	544624	544631	50 %	0 %	25 %	25 %	15639500
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10529	NC_000919	CG	3	6	545293	545298	0 %	0 %	50 %	50 %	15639501
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10535	NC_000919	CA	3	6	545761	545766	50 %	0 %	0 %	50 %	15639501
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10552	NC_000919	CG	4	8	546824	546831	0 %	0 %	50 %	50 %	15639501
10553	NC_000919	GC	3	6	546924	546929	0 %	0 %	50 %	50 %	15639501
10554	NC_000919	TAG	2	6	546931	546936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639501
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10558	NC_000919	GCT	2	6	547165	547170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639502
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10561	NC_000919	GC	3	6	547276	547281	0 %	0 %	50 %	50 %	15639502
10562	NC_000919	TCTG	2	8	547291	547298	0 %	50 %	25 %	25 %	15639502
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10997	NC_000919	AACA	2	8	569629	569636	75 %	0 %	0 %	25 %	15639516
10998	NC_000919	AGC	2	6	569699	569704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639516
10999	NC_000919	CGGG	2	8	569744	569751	0 %	0 %	75 %	25 %	15639516
11000	NC_000919	GAA	2	6	569758	569763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639516

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