MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols chromosome

Total Repeats: 22198

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_000919	GAA	3	9	517745	517753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639477
10002	NC_000919	CCA	2	6	517815	517820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639477
10003	NC_000919	CG	3	6	517882	517887	0 %	0 %	50 %	50 %	15639477
10004	NC_000919	TCA	2	6	517896	517901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639477
10005	NC_000919	CTG	2	6	517957	517962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639477
10006	NC_000919	GCT	2	6	517968	517973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639477
10007	NC_000919	GC	3	6	517981	517986	0 %	0 %	50 %	50 %	15639477
10008	NC_000919	CG	3	6	517991	517996	0 %	0 %	50 %	50 %	15639477
10009	NC_000919	GCC	2	6	518036	518041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15639477
10010	NC_000919	CTG	2	6	518053	518058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639477
10011	NC_000919	GCC	2	6	518126	518131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15639477
10012	NC_000919	GC	3	6	518180	518185	0 %	0 %	50 %	50 %	15639477
10013	NC_000919	CCG	2	6	518205	518210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15639477
10014	NC_000919	CG	3	6	518209	518214	0 %	0 %	50 %	50 %	15639477
10015	NC_000919	CTG	2	6	518224	518229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639477
10016	NC_000919	CTG	2	6	518233	518238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639477
10017	NC_000919	GTT	2	6	518244	518249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15639477
10018	NC_000919	TTCC	2	8	518262	518269	0 %	50 %	0 %	50 %	15639477
10019	NC_000919	CCA	2	6	518346	518351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639477
10020	NC_000919	GC	3	6	518455	518460	0 %	0 %	50 %	50 %	15639477
10021	NC_000919	GA	3	6	518480	518485	50 %	0 %	50 %	0 %	15639477
10022	NC_000919	ACC	2	6	518495	518500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639477
10023	NC_000919	GC	3	6	518509	518514	0 %	0 %	50 %	50 %	15639477
10024	NC_000919	CGTG	2	8	518575	518582	0 %	25 %	50 %	25 %	15639477
10025	NC_000919	GGC	2	6	518605	518610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639477
10026	NC_000919	GGC	2	6	518620	518625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639477
10027	NC_000919	TGT	2	6	518640	518645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15639477
10028	NC_000919	ATG	2	6	518675	518680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639477
10029	NC_000919	CCG	2	6	518762	518767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15639477
10030	NC_000919	GCG	3	9	518807	518815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639477
10031	NC_000919	CA	3	6	518931	518936	50 %	0 %	0 %	50 %	15639477
10032	NC_000919	GCA	2	6	518940	518945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639477
10033	NC_000919	TTC	2	6	518948	518953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639477
10034	NC_000919	GC	4	8	519164	519171	0 %	0 %	50 %	50 %	15639478
10035	NC_000919	GCGT	2	8	519215	519222	0 %	25 %	50 %	25 %	15639478
10036	NC_000919	AGT	2	6	519252	519257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639478
10037	NC_000919	TGC	2	6	519392	519397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639478
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10039	NC_000919	TCCT	2	8	519509	519516	0 %	50 %	0 %	50 %	15639478
10040	NC_000919	GCG	2	6	519571	519576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639478
10041	NC_000919	TG	3	6	519581	519586	0 %	50 %	50 %	0 %	15639478
10042	NC_000919	TGTC	2	8	519601	519608	0 %	50 %	25 %	25 %	15639478
10043	NC_000919	T	6	6	519618	519623	0 %	100 %	0 %	0 %	15639478
10044	NC_000919	GAAGA	2	10	519636	519645	60 %	0 %	40 %	0 %	15639478
10045	NC_000919	GGA	2	6	519653	519658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639478
10046	NC_000919	GCA	2	6	519693	519698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639478
10047	NC_000919	GAA	2	6	519738	519743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639478
10048	NC_000919	TAC	2	6	519842	519847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639478
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10050	NC_000919	GC	3	6	519910	519915	0 %	0 %	50 %	50 %	15639478
10051	NC_000919	CGT	2	6	520045	520050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639478
10052	NC_000919	GCAC	2	8	520053	520060	25 %	0 %	25 %	50 %	15639478
10053	NC_000919	TG	3	6	520125	520130	0 %	50 %	50 %	0 %	15639478
10054	NC_000919	GCACCG	2	12	520138	520149	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	15639478
10055	NC_000919	TGC	2	6	520158	520163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639478
10056	NC_000919	ACG	2	6	520248	520253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639478
10057	NC_000919	GC	3	6	520296	520301	0 %	0 %	50 %	50 %	15639478
10058	NC_000919	T	8	8	520310	520317	0 %	100 %	0 %	0 %	15639478
10059	NC_000919	TGA	2	6	520359	520364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639478
10060	NC_000919	CG	3	6	520371	520376	0 %	0 %	50 %	50 %	15639478
10061	NC_000919	GGA	2	6	520391	520396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639478
10062	NC_000919	AGG	2	6	520397	520402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639478
10063	NC_000919	CTG	2	6	520445	520450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639478
10064	NC_000919	CAG	2	6	520456	520461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639478
10065	NC_000919	GGT	2	6	520471	520476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639478
10066	NC_000919	CAG	2	6	520480	520485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639478
10067	NC_000919	CCGT	2	8	520486	520493	0 %	25 %	25 %	50 %	15639478
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10069	NC_000919	CGC	2	6	520531	520536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15639478
10070	NC_000919	CG	3	6	520557	520562	0 %	0 %	50 %	50 %	15639478
10071	NC_000919	GCA	2	6	520565	520570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639478
10072	NC_000919	CTGG	2	8	520603	520610	0 %	25 %	50 %	25 %	15639478
10073	NC_000919	GAGG	2	8	520971	520978	25 %	0 %	75 %	0 %	15639479
10074	NC_000919	GT	3	6	520979	520984	0 %	50 %	50 %	0 %	15639479
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10080	NC_000919	GCT	2	6	521337	521342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639479
10081	NC_000919	GTCTG	2	10	521352	521361	0 %	40 %	40 %	20 %	15639479
10082	NC_000919	CCT	2	6	521447	521452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639479
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10086	NC_000919	CG	3	6	521592	521597	0 %	0 %	50 %	50 %	15639479
10087	NC_000919	GGT	2	6	521604	521609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639479
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10090	NC_000919	GTT	2	6	521696	521701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15639479
10091	NC_000919	TCG	2	6	521728	521733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639479
10092	NC_000919	CGG	2	6	521779	521784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639479
10093	NC_000919	TG	3	6	521825	521830	0 %	50 %	50 %	0 %	15639479
10094	NC_000919	G	7	7	521854	521860	0 %	0 %	100 %	0 %	15639479
10095	NC_000919	GCA	2	6	521928	521933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639479
10096	NC_000919	CGTC	2	8	521978	521985	0 %	25 %	25 %	50 %	15639479
10097	NC_000919	CGT	2	6	522099	522104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639479
10098	NC_000919	GC	3	6	522217	522222	0 %	0 %	50 %	50 %	15639479
10099	NC_000919	AGA	2	6	522261	522266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639479
10100	NC_000919	TGACC	2	10	522285	522294	20 %	20 %	20 %	40 %	15639479
10101	NC_000919	GCT	2	6	522330	522335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639479
10102	NC_000919	GCG	2	6	522411	522416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639479
10103	NC_000919	ATC	2	6	522556	522561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639479
10104	NC_000919	TCC	2	6	522622	522627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639479
10105	NC_000919	TGA	2	6	522684	522689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639479
10106	NC_000919	GCTT	2	8	522785	522792	0 %	50 %	25 %	25 %	15639479
10107	NC_000919	CGC	2	6	522849	522854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15639479
10108	NC_000919	GGC	2	6	522861	522866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639479
10109	NC_000919	GGT	2	6	522897	522902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639479
10110	NC_000919	GAG	2	6	523021	523026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639479
10111	NC_000919	GCC	2	6	523150	523155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15639479
10112	NC_000919	AGG	2	6	523169	523174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639479
10113	NC_000919	GAC	2	6	523231	523236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639479
10114	NC_000919	ATGA	2	8	523261	523268	50 %	25 %	25 %	0 %	15639479
10115	NC_000919	AGCA	2	8	523333	523340	50 %	0 %	25 %	25 %	15639479
10116	NC_000919	CAG	2	6	523347	523352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639479
10117	NC_000919	CTG	2	6	523406	523411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639479
10118	NC_000919	CTGC	2	8	523981	523988	0 %	25 %	25 %	50 %	15639480
10119	NC_000919	TAC	2	6	524016	524021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639480
10120	NC_000919	TGGAGA	2	12	524027	524038	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	15639480
10121	NC_000919	ACC	2	6	524141	524146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639480
10122	NC_000919	GAG	2	6	524359	524364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639480
10123	NC_000919	TGG	2	6	524448	524453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639480
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10360	NC_000919	TCC	2	6	536706	536711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639492
10361	NC_000919	T	7	7	536816	536822	0 %	100 %	0 %	0 %	15639492
10362	NC_000919	GGT	2	6	536848	536853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639492
10363	NC_000919	CT	3	6	536864	536869	0 %	50 %	0 %	50 %	15639492
10364	NC_000919	GAA	2	6	536871	536876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639492
10365	NC_000919	TAC	3	9	536879	536887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639492
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10491	NC_000919	TCT	2	6	542788	542793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639498
10492	NC_000919	TGA	2	6	542798	542803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639498
10493	NC_000919	GGCA	2	8	542831	542838	25 %	0 %	50 %	25 %	15639498
10494	NC_000919	TG	3	6	542844	542849	0 %	50 %	50 %	0 %	15639498
10495	NC_000919	GGA	2	6	542937	542942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639498
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