MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols chromosome

Total Repeats: 22198

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8502	NC_000919	CGA	2	6	445800	445805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639409
8503	NC_000919	TG	3	6	445913	445918	0 %	50 %	50 %	0 %	15639409
8504	NC_000919	GGA	2	6	445973	445978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639409
8505	NC_000919	AGG	2	6	446009	446014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639409
8506	NC_000919	TC	3	6	446046	446051	0 %	50 %	0 %	50 %	15639409
8507	NC_000919	ATGG	2	8	446056	446063	25 %	25 %	50 %	0 %	15639409
8508	NC_000919	TCC	2	6	446109	446114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639409
8509	NC_000919	GTT	2	6	446175	446180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15639409
8510	NC_000919	GTT	2	6	446206	446211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15639409
8511	NC_000919	CG	3	6	446260	446265	0 %	0 %	50 %	50 %	15639409
8512	NC_000919	GTT	2	6	446280	446285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15639409
8513	NC_000919	TGCG	2	8	446302	446309	0 %	25 %	50 %	25 %	15639409
8514	NC_000919	AAG	2	6	446323	446328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639409
8515	NC_000919	CG	3	6	446403	446408	0 %	0 %	50 %	50 %	15639409
8516	NC_000919	GAG	2	6	446410	446415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639409
8517	NC_000919	CG	3	6	446421	446426	0 %	0 %	50 %	50 %	15639409
8518	NC_000919	GCA	2	6	446503	446508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639409
8519	NC_000919	GGA	2	6	446514	446519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639409
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8521	NC_000919	TGC	2	6	446619	446624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639409
8522	NC_000919	AGT	2	6	446634	446639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639409
8523	NC_000919	TTGG	2	8	446697	446704	0 %	50 %	50 %	0 %	15639409
8524	NC_000919	TGG	2	6	446778	446783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639409
8525	NC_000919	CGA	2	6	446838	446843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639409
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8529	NC_000919	GCA	2	6	446949	446954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639410
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8531	NC_000919	GCG	2	6	446973	446978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639410
8532	NC_000919	AGC	2	6	446984	446989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639410
8533	NC_000919	TAC	2	6	447056	447061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639410
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8535	NC_000919	CG	3	6	447138	447143	0 %	0 %	50 %	50 %	15639410
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8537	NC_000919	TGG	2	6	447178	447183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639410
8538	NC_000919	GCA	2	6	447246	447251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639410
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8540	NC_000919	CG	3	6	447413	447418	0 %	0 %	50 %	50 %	15639410
8541	NC_000919	CG	4	8	447449	447456	0 %	0 %	50 %	50 %	15639410
8542	NC_000919	CGT	2	6	447460	447465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639410
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8547	NC_000919	GTTGCC	2	12	447639	447650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639411
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8551	NC_000919	GCA	2	6	447935	447940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639412
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8553	NC_000919	ATG	2	6	447987	447992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639412
8554	NC_000919	CTG	2	6	448020	448025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639412
8555	NC_000919	TAC	2	6	448067	448072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639412
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8557	NC_000919	CGG	2	6	448132	448137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639412
8558	NC_000919	CAG	2	6	448169	448174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639412
8559	NC_000919	CAG	2	6	448197	448202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639412
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8561	NC_000919	GCT	2	6	448333	448338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639412
8562	NC_000919	GTC	2	6	448470	448475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639412
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8585	NC_000919	CTG	2	6	450019	450024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639413
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8588	NC_000919	TGC	2	6	450133	450138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639413
8589	NC_000919	GCG	2	6	450147	450152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639413
8590	NC_000919	TCTTG	2	10	450173	450182	0 %	60 %	20 %	20 %	15639413
8591	NC_000919	GCGTGT	2	12	450194	450205	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	15639413
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8593	NC_000919	T	7	7	450251	450257	0 %	100 %	0 %	0 %	15639413
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8599	NC_000919	TGA	2	6	450500	450505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639413
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8605	NC_000919	GGTG	2	8	450686	450693	0 %	25 %	75 %	0 %	15639413
8606	NC_000919	T	6	6	450713	450718	0 %	100 %	0 %	0 %	15639413
8607	NC_000919	T	6	6	450776	450781	0 %	100 %	0 %	0 %	15639413
8608	NC_000919	GC	3	6	450831	450836	0 %	0 %	50 %	50 %	15639413
8609	NC_000919	GAA	2	6	451021	451026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639414
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8611	NC_000919	CGTT	2	8	451081	451088	0 %	50 %	25 %	25 %	15639414
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8615	NC_000919	TG	3	6	451237	451242	0 %	50 %	50 %	0 %	15639414
8616	NC_000919	AG	3	6	451280	451285	50 %	0 %	50 %	0 %	15639414
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8623	NC_000919	GCGT	2	8	451553	451560	0 %	25 %	50 %	25 %	15639414
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