MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols chromosome

Total Repeats: 22198

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8002	NC_000919	GAA	2	6	423295	423300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639390
8003	NC_000919	CGGCG	2	10	423331	423340	0 %	0 %	60 %	40 %	15639390
8004	NC_000919	GTT	2	6	423359	423364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15639390
8005	NC_000919	TGA	2	6	423424	423429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639390
8006	NC_000919	CGT	2	6	423530	423535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639390
8007	NC_000919	GCA	2	6	423540	423545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639390
8008	NC_000919	A	6	6	423571	423576	100 %	0 %	0 %	0 %	15639390
8009	NC_000919	GCG	2	6	423646	423651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639390
8010	NC_000919	TAA	2	6	423658	423663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15639390
8011	NC_000919	CGA	2	6	423691	423696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639390
8012	NC_000919	GAT	2	6	423701	423706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639390
8013	NC_000919	GTA	2	6	423713	423718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639390
8014	NC_000919	AGAA	2	8	423814	423821	75 %	0 %	25 %	0 %	15639390
8015	NC_000919	A	8	8	423820	423827	100 %	0 %	0 %	0 %	15639390
8016	NC_000919	CT	3	6	424020	424025	0 %	50 %	0 %	50 %	15639390
8017	NC_000919	GAT	2	6	424160	424165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639390
8018	NC_000919	CCG	2	6	424247	424252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15639390
8019	NC_000919	CCT	2	6	424271	424276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639390
8020	NC_000919	GTCG	2	8	424318	424325	0 %	25 %	50 %	25 %	15639390
8021	NC_000919	AAG	2	6	424328	424333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639390
8022	NC_000919	AGT	2	6	424366	424371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639390
8023	NC_000919	AG	3	6	424431	424436	50 %	0 %	50 %	0 %	15639390
8024	NC_000919	GAAG	2	8	424459	424466	50 %	0 %	50 %	0 %	15639390
8025	NC_000919	CTG	2	6	424497	424502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639390
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8029	NC_000919	TTTA	2	8	424693	424700	25 %	75 %	0 %	0 %	15639390
8030	NC_000919	CGT	2	6	424745	424750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639390
8031	NC_000919	GCA	3	9	424774	424782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639390
8032	NC_000919	TGA	2	6	424785	424790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639390
8033	NC_000919	GTTGC	2	10	424913	424922	0 %	40 %	40 %	20 %	15639390
8034	NC_000919	GGA	2	6	424942	424947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639390
8035	NC_000919	GTA	2	6	424948	424953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639390
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8037	NC_000919	TC	3	6	425019	425024	0 %	50 %	0 %	50 %	15639391
8038	NC_000919	GGA	2	6	425066	425071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639391
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8040	NC_000919	TGA	2	6	425197	425202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639391
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8042	NC_000919	CG	3	6	425240	425245	0 %	0 %	50 %	50 %	15639391
8043	NC_000919	TTG	2	6	425250	425255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15639391
8044	NC_000919	CA	3	6	425354	425359	50 %	0 %	0 %	50 %	15639391
8045	NC_000919	TGA	2	6	425459	425464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639391
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8052	NC_000919	CGA	2	6	425738	425743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639391
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8055	NC_000919	GAAG	2	8	425870	425877	50 %	0 %	50 %	0 %	15639391
8056	NC_000919	GGA	2	6	425915	425920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639391
8057	NC_000919	CAG	2	6	425925	425930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639391
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8062	NC_000919	AGA	3	9	425990	425998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639391
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8087	NC_000919	AGC	2	6	426927	426932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639392
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8110	NC_000919	CG	3	6	428030	428035	0 %	0 %	50 %	50 %	15639393
8111	NC_000919	GCGCA	2	10	428039	428048	20 %	0 %	40 %	40 %	15639393
8112	NC_000919	CGT	2	6	428141	428146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639393
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8119	NC_000919	TCGA	2	8	428510	428517	25 %	25 %	25 %	25 %	15639394
8120	NC_000919	T	6	6	428572	428577	0 %	100 %	0 %	0 %	15639394
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