MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols chromosome

Total Repeats: 22198

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_000919	GC	3	6	301612	301617	0 %	0 %	50 %	50 %	15639280
5502	NC_000919	CGC	2	6	301687	301692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15639280
5503	NC_000919	GT	4	8	301705	301712	0 %	50 %	50 %	0 %	15639280
5504	NC_000919	CTGCCG	2	12	301721	301732	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	15639280
5505	NC_000919	AGCG	2	8	301784	301791	25 %	0 %	50 %	25 %	15639280
5506	NC_000919	ATG	2	6	301798	301803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639280
5507	NC_000919	CT	3	6	301837	301842	0 %	50 %	0 %	50 %	15639280
5508	NC_000919	ATGCGT	2	12	301859	301870	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15639280
5509	NC_000919	CG	3	6	301872	301877	0 %	0 %	50 %	50 %	15639280
5510	NC_000919	GGT	3	9	301881	301889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639280
5511	NC_000919	GCG	2	6	301939	301944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639280
5512	NC_000919	G	6	6	302158	302163	0 %	0 %	100 %	0 %	15639281
5513	NC_000919	T	6	6	302324	302329	0 %	100 %	0 %	0 %	15639281
5514	NC_000919	CAC	2	6	302344	302349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639281
5515	NC_000919	TGG	2	6	302355	302360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639281
5516	NC_000919	AGA	2	6	302371	302376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639281
5517	NC_000919	AC	3	6	302378	302383	50 %	0 %	0 %	50 %	15639281
5518	NC_000919	CG	4	8	302387	302394	0 %	0 %	50 %	50 %	15639281
5519	NC_000919	ACGG	3	12	302464	302475	25 %	0 %	50 %	25 %	15639281
5520	NC_000919	CTT	2	6	302493	302498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639281
5521	NC_000919	GCTGCA	2	12	302570	302581	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	15639281
5522	NC_000919	GCG	2	6	302585	302590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639281
5523	NC_000919	T	6	6	302620	302625	0 %	100 %	0 %	0 %	15639281
5524	NC_000919	CTG	2	6	302661	302666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639281
5525	NC_000919	CTG	2	6	302670	302675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639281
5526	NC_000919	GCA	2	6	302698	302703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639281
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5529	NC_000919	A	6	6	302786	302791	100 %	0 %	0 %	0 %	15639281
5530	NC_000919	CTG	2	6	302794	302799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639281
5531	NC_000919	TGT	2	6	302830	302835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15639281
5532	NC_000919	AATG	2	8	302870	302877	50 %	25 %	25 %	0 %	15639281
5533	NC_000919	TC	3	6	302890	302895	0 %	50 %	0 %	50 %	15639281
5534	NC_000919	T	7	7	302935	302941	0 %	100 %	0 %	0 %	15639281
5535	NC_000919	GAA	2	6	302942	302947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639281
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5537	NC_000919	GGA	2	6	303019	303024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639281
5538	NC_000919	T	6	6	303048	303053	0 %	100 %	0 %	0 %	15639281
5539	NC_000919	AC	3	6	303201	303206	50 %	0 %	0 %	50 %	15639281
5540	NC_000919	CAA	2	6	303296	303301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15639281
5541	NC_000919	CCG	2	6	303333	303338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15639281
5542	NC_000919	T	8	8	303480	303487	0 %	100 %	0 %	0 %	15639281
5543	NC_000919	GC	3	6	303524	303529	0 %	0 %	50 %	50 %	15639281
5544	NC_000919	A	6	6	303535	303540	100 %	0 %	0 %	0 %	15639281
5545	NC_000919	GTG	2	6	303578	303583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639281
5546	NC_000919	TCA	2	6	303589	303594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639281
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5548	NC_000919	GTT	2	6	303755	303760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15639281
5549	NC_000919	AGGTT	2	10	303813	303822	20 %	40 %	40 %	0 %	15639282
5550	NC_000919	GGT	2	6	303823	303828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639282
5551	NC_000919	T	6	6	303847	303852	0 %	100 %	0 %	0 %	15639282
5552	NC_000919	GAA	2	6	303910	303915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639282
5553	NC_000919	TGC	2	6	303945	303950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639282
5554	NC_000919	GCAGTT	2	12	303973	303984	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15639282
5555	NC_000919	GTT	2	6	303995	304000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15639282
5556	NC_000919	TGC	2	6	304063	304068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639282
5557	NC_000919	CGT	2	6	304202	304207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639282
5558	NC_000919	G	6	6	304208	304213	0 %	0 %	100 %	0 %	15639282
5559	NC_000919	GC	3	6	304215	304220	0 %	0 %	50 %	50 %	15639282
5560	NC_000919	CAG	2	6	304317	304322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639282
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5562	NC_000919	AT	3	6	304422	304427	50 %	50 %	0 %	0 %	15639282
5563	NC_000919	TAC	2	6	304436	304441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639282
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5567	NC_000919	GGT	2	6	304621	304626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639282
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5574	NC_000919	A	7	7	305051	305057	100 %	0 %	0 %	0 %	15639283
5575	NC_000919	GA	3	6	305137	305142	50 %	0 %	50 %	0 %	15639283
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5579	NC_000919	GC	3	6	305312	305317	0 %	0 %	50 %	50 %	15639283
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5581	NC_000919	GC	3	6	305360	305365	0 %	0 %	50 %	50 %	15639283
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5587	NC_000919	GT	3	6	305542	305547	0 %	50 %	50 %	0 %	15639283
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5590	NC_000919	TG	3	6	305582	305587	0 %	50 %	50 %	0 %	15639284
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5593	NC_000919	CGG	2	6	305720	305725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639284
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5604	NC_000919	ATC	2	6	306107	306112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639284
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5606	NC_000919	AAG	2	6	306182	306187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639284
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5610	NC_000919	GCAC	2	8	306370	306377	25 %	0 %	25 %	50 %	15639284
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5614	NC_000919	GTT	2	6	306567	306572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15639284
5615	NC_000919	ACG	2	6	306591	306596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639284
5616	NC_000919	TA	3	6	306692	306697	50 %	50 %	0 %	0 %	15639284
5617	NC_000919	CG	3	6	306698	306703	0 %	0 %	50 %	50 %	15639284
5618	NC_000919	GCA	2	6	306714	306719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639284
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5621	NC_000919	GT	3	6	306851	306856	0 %	50 %	50 %	0 %	15639285
5622	NC_000919	GT	3	6	306865	306870	0 %	50 %	50 %	0 %	15639285
5623	NC_000919	GA	3	6	306951	306956	50 %	0 %	50 %	0 %	15639285
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5997	NC_000919	CG	3	6	324289	324294	0 %	0 %	50 %	50 %	15639299
5998	NC_000919	TGCAGG	2	12	324313	324324	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	15639299
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6000	NC_000919	G	7	7	324432	324438	0 %	0 %	100 %	0 %	15639299

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