MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols chromosome

Total Repeats: 22198

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_000919	GCT	2	6	270026	270031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639250
5003	NC_000919	TG	3	6	270129	270134	0 %	50 %	50 %	0 %	15639251
5004	NC_000919	GGA	3	9	270175	270183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639251
5005	NC_000919	GAT	2	6	270187	270192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639251
5006	NC_000919	CGG	2	6	270267	270272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639251
5007	NC_000919	GCC	2	6	270292	270297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15639251
5008	NC_000919	GGA	2	6	270301	270306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639251
5009	NC_000919	GAA	2	6	270311	270316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639251
5010	NC_000919	GAG	2	6	270338	270343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639251
5011	NC_000919	ATT	2	6	270473	270478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15639251
5012	NC_000919	TATC	2	8	270619	270626	25 %	50 %	0 %	25 %	15639251
5013	NC_000919	AGCT	2	8	270645	270652	25 %	25 %	25 %	25 %	15639251
5014	NC_000919	A	6	6	270675	270680	100 %	0 %	0 %	0 %	15639251
5015	NC_000919	GC	3	6	270724	270729	0 %	0 %	50 %	50 %	15639251
5016	NC_000919	GGTG	2	8	270932	270939	0 %	25 %	75 %	0 %	15639252
5017	NC_000919	C	6	6	270963	270968	0 %	0 %	0 %	100 %	15639252
5018	NC_000919	GC	3	6	271004	271009	0 %	0 %	50 %	50 %	15639252
5019	NC_000919	CCCTGC	2	12	271095	271106	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	15639252
5020	NC_000919	GC	5	10	271127	271136	0 %	0 %	50 %	50 %	15639252
5021	NC_000919	AT	3	6	271182	271187	50 %	50 %	0 %	0 %	15639252
5022	NC_000919	GCT	2	6	271247	271252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639252
5023	NC_000919	AG	3	6	271372	271377	50 %	0 %	50 %	0 %	15639252
5024	NC_000919	TGCG	2	8	271460	271467	0 %	25 %	50 %	25 %	15639252
5025	NC_000919	T	6	6	271473	271478	0 %	100 %	0 %	0 %	15639252
5026	NC_000919	T	6	6	271511	271516	0 %	100 %	0 %	0 %	15639252
5027	NC_000919	GCG	2	6	271527	271532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639252
5028	NC_000919	GTA	2	6	271551	271556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639252
5029	NC_000919	TCA	2	6	271648	271653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639252
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5031	NC_000919	G	6	6	271814	271819	0 %	0 %	100 %	0 %	15639252
5032	NC_000919	CTTT	2	8	271919	271926	0 %	75 %	0 %	25 %	15639252
5033	NC_000919	TCT	2	6	271970	271975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639252
5034	NC_000919	GGGA	2	8	272056	272063	25 %	0 %	75 %	0 %	15639252
5035	NC_000919	GGA	2	6	272069	272074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639252
5036	NC_000919	CAG	2	6	272106	272111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639252
5037	NC_000919	CAG	2	6	272127	272132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639252
5038	NC_000919	TAG	2	6	272182	272187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639252
5039	NC_000919	CACC	2	8	272190	272197	25 %	0 %	0 %	75 %	15639252
5040	NC_000919	TGG	2	6	272569	272574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639253
5041	NC_000919	TC	3	6	272662	272667	0 %	50 %	0 %	50 %	15639253
5042	NC_000919	AGG	2	6	272716	272721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639253
5043	NC_000919	GAG	2	6	272733	272738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639253
5044	NC_000919	TGC	2	6	272786	272791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639253
5045	NC_000919	CGGA	2	8	272827	272834	25 %	0 %	50 %	25 %	15639253
5046	NC_000919	GAG	2	6	272898	272903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639253
5047	NC_000919	CTT	2	6	273000	273005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639253
5048	NC_000919	GAG	2	6	273330	273335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639253
5049	NC_000919	GCGG	2	8	273449	273456	0 %	0 %	75 %	25 %	15639254
5050	NC_000919	GA	3	6	273527	273532	50 %	0 %	50 %	0 %	15639254
5051	NC_000919	ACG	2	6	273578	273583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639254
5052	NC_000919	TGT	2	6	273585	273590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15639254
5053	NC_000919	ATG	2	6	273628	273633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639254
5054	NC_000919	GCG	2	6	273675	273680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639254
5055	NC_000919	GCG	2	6	273696	273701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639254
5056	NC_000919	GCA	2	6	273788	273793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639254
5057	NC_000919	CG	3	6	273798	273803	0 %	0 %	50 %	50 %	15639254
5058	NC_000919	TAG	2	6	273923	273928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639254
5059	NC_000919	CTG	2	6	274038	274043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639255
5060	NC_000919	TACA	2	8	274081	274088	50 %	25 %	0 %	25 %	15639255
5061	NC_000919	TG	3	6	274141	274146	0 %	50 %	50 %	0 %	15639255
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5063	NC_000919	ATT	2	6	274161	274166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15639255
5064	NC_000919	CGG	2	6	274187	274192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639255
5065	NC_000919	TTG	2	6	274226	274231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15639255
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5074	NC_000919	GCA	2	6	274502	274507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639255
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5092	NC_000919	AGG	2	6	275207	275212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639255
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5100	NC_000919	T	7	7	275678	275684	0 %	100 %	0 %	0 %	15639255
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5109	NC_000919	GCGT	2	8	276039	276046	0 %	25 %	50 %	25 %	15639256
5110	NC_000919	GTC	2	6	276076	276081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639256
5111	NC_000919	AG	3	6	276109	276114	50 %	0 %	50 %	0 %	15639256
5112	NC_000919	CG	4	8	276156	276163	0 %	0 %	50 %	50 %	15639256
5113	NC_000919	AGATG	2	10	276201	276210	40 %	20 %	40 %	0 %	15639256
5114	NC_000919	TG	3	6	276232	276237	0 %	50 %	50 %	0 %	15639256
5115	NC_000919	CG	3	6	276284	276289	0 %	0 %	50 %	50 %	15639256
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5258	NC_000919	CTA	2	6	288960	288965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639264
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