MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga maritima MSB8 chromosome

Total Repeats: 38422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000853	AGGA	2	8	336	343	50 %	0 %	50 %	0 %	15642776
2	NC_000853	A	6	6	355	360	100 %	0 %	0 %	0 %	15642776
3	NC_000853	GT	3	6	376	381	0 %	50 %	50 %	0 %	15642776
4	NC_000853	CTG	2	6	525	530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642777
5	NC_000853	TCG	2	6	535	540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642777
6	NC_000853	GTTT	2	8	544	551	0 %	75 %	25 %	0 %	15642777
7	NC_000853	GGA	2	6	1793	1798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15642778
8	NC_000853	AAT	2	6	1818	1823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15642778
9	NC_000853	TCT	2	6	1854	1859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642778
10	NC_000853	AAT	2	6	1885	1890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15642778
11	NC_000853	AAT	2	6	1951	1956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15642779
12	NC_000853	AAT	2	6	2018	2023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15642779
13	NC_000853	CTT	2	6	3176	3181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642780
14	NC_000853	TCT	2	6	3200	3205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642780
15	NC_000853	TGGA	2	8	3212	3219	25 %	25 %	50 %	0 %	15642780
16	NC_000853	AG	3	6	3221	3226	50 %	0 %	50 %	0 %	15642780
17	NC_000853	TTTTC	2	10	3254	3263	0 %	80 %	0 %	20 %	15642780
18	NC_000853	GTGA	2	8	3270	3277	25 %	25 %	50 %	0 %	15642780
19	NC_000853	TCT	2	6	3287	3292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642780
20	NC_000853	GAT	3	9	3344	3352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642780
21	NC_000853	TCCCT	2	10	3363	3372	0 %	40 %	0 %	60 %	15642780
22	NC_000853	CT	3	6	3416	3421	0 %	50 %	0 %	50 %	15642780
23	NC_000853	ATC	2	6	3437	3442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642780
24	NC_000853	TGA	2	6	3451	3456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642780
25	NC_000853	TCC	2	6	3468	3473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642780
26	NC_000853	GA	3	6	3486	3491	50 %	0 %	50 %	0 %	15642780
27	NC_000853	TC	4	8	3535	3542	0 %	50 %	0 %	50 %	15642780
28	NC_000853	T	6	6	3612	3617	0 %	100 %	0 %	0 %	15642780
29	NC_000853	GA	3	6	3621	3626	50 %	0 %	50 %	0 %	15642780
30	NC_000853	ACA	2	6	3627	3632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15642780
31	NC_000853	CGT	2	6	3718	3723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642780
32	NC_000853	TTC	2	6	3728	3733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642780
33	NC_000853	GTTC	2	8	3754	3761	0 %	50 %	25 %	25 %	15642780
34	NC_000853	GAGAA	2	10	3779	3788	60 %	0 %	40 %	0 %	15642780
35	NC_000853	TTC	2	6	3815	3820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642780
36	NC_000853	TCT	2	6	3849	3854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642780
37	NC_000853	GTGG	2	8	3864	3871	0 %	25 %	75 %	0 %	15642780
38	NC_000853	CAA	2	6	3961	3966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15642780
39	NC_000853	TAT	2	6	4061	4066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15642780
40	NC_000853	TTC	2	6	4176	4181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642780
41	NC_000853	TCT	2	6	4198	4203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642780
42	NC_000853	T	7	7	4255	4261	0 %	100 %	0 %	0 %	15642780
43	NC_000853	TTC	2	6	4277	4282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642780
44	NC_000853	TCT	2	6	4288	4293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642780
45	NC_000853	CG	3	6	4363	4368	0 %	0 %	50 %	50 %	15642780
46	NC_000853	TTTC	2	8	4460	4467	0 %	75 %	0 %	25 %	15642780
47	NC_000853	GAAA	2	8	4540	4547	75 %	0 %	25 %	0 %	15642780
48	NC_000853	CTT	2	6	4621	4626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642780
49	NC_000853	T	6	6	4673	4678	0 %	100 %	0 %	0 %	15642780
50	NC_000853	GAA	2	6	4686	4691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642780
51	NC_000853	TCA	2	6	4696	4701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642780
52	NC_000853	TCT	2	6	4715	4720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642780
53	NC_000853	TCGC	2	8	4731	4738	0 %	25 %	25 %	50 %	15642780
54	NC_000853	TGA	2	6	4798	4803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642780
55	NC_000853	TCT	2	6	4903	4908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642780
56	NC_000853	TTC	3	9	4909	4917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642780
57	NC_000853	TTC	2	6	4943	4948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642780
58	NC_000853	TC	3	6	4993	4998	0 %	50 %	0 %	50 %	15642780
59	NC_000853	TCC	2	6	5001	5006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642780
60	NC_000853	TCATC	2	10	5020	5029	20 %	40 %	0 %	40 %	15642780
61	NC_000853	CTT	2	6	5081	5086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642780
62	NC_000853	CTG	2	6	5093	5098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642780
63	NC_000853	CTT	2	6	5160	5165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642781
64	NC_000853	CGAG	2	8	5247	5254	25 %	0 %	50 %	25 %	15642781
65	NC_000853	CTT	2	6	5370	5375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642781
66	NC_000853	TCA	2	6	5388	5393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642781
67	NC_000853	CCG	2	6	5421	5426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642781
68	NC_000853	CTC	2	6	5480	5485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642781
69	NC_000853	GTT	2	6	5490	5495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642781
70	NC_000853	CCT	2	6	5550	5555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642781
71	NC_000853	CTTC	2	8	5637	5644	0 %	50 %	0 %	50 %	15642781
72	NC_000853	TC	3	6	5649	5654	0 %	50 %	0 %	50 %	15642781
73	NC_000853	TCT	2	6	5694	5699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642781
74	NC_000853	CCT	2	6	5703	5708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642781
75	NC_000853	ATCTC	2	10	5756	5765	20 %	40 %	0 %	40 %	15642781
76	NC_000853	TCC	2	6	5770	5775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642781
77	NC_000853	GA	4	8	5808	5815	50 %	0 %	50 %	0 %	15642781
78	NC_000853	GCT	2	6	5840	5845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642781
79	NC_000853	CTGT	2	8	5870	5877	0 %	50 %	25 %	25 %	15642781
80	NC_000853	ATC	2	6	5921	5926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642781
81	NC_000853	AAG	2	6	5950	5955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642781
82	NC_000853	AGG	2	6	5985	5990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15642781
83	NC_000853	TCGTAT	2	12	6092	6103	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15642781
84	NC_000853	GA	3	6	6109	6114	50 %	0 %	50 %	0 %	15642781
85	NC_000853	TTCACG	2	12	6119	6130	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15642781
86	NC_000853	TC	3	6	6141	6146	0 %	50 %	0 %	50 %	15642781
87	NC_000853	CCT	2	6	6150	6155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642782
88	NC_000853	TAA	2	6	6162	6167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15642782
89	NC_000853	CGT	2	6	6285	6290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642782
90	NC_000853	CCA	2	6	6294	6299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642782
91	NC_000853	TC	3	6	6350	6355	0 %	50 %	0 %	50 %	15642782
92	NC_000853	GAG	2	6	6426	6431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15642782
93	NC_000853	GTT	2	6	6541	6546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642782
94	NC_000853	CAC	2	6	6547	6552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642782
95	NC_000853	CAC	2	6	6667	6672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642782
96	NC_000853	ACC	2	6	6684	6689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642782
97	NC_000853	TG	3	6	6711	6716	0 %	50 %	50 %	0 %	15642782
98	NC_000853	CTT	2	6	6723	6728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642782
99	NC_000853	CT	3	6	6793	6798	0 %	50 %	0 %	50 %	15642782
100	NC_000853	A	6	6	6821	6826	100 %	0 %	0 %	0 %	15642782
101	NC_000853	GTA	2	6	6883	6888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642782
102	NC_000853	GGA	2	6	6970	6975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15642782
103	NC_000853	TTC	2	6	7068	7073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642782
104	NC_000853	CTT	2	6	7085	7090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642782
105	NC_000853	GAA	2	6	7144	7149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642782
106	NC_000853	ACG	2	6	7178	7183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642782
107	NC_000853	CTT	2	6	7269	7274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642782
108	NC_000853	GAG	2	6	7297	7302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15642782
109	NC_000853	CT	3	6	7313	7318	0 %	50 %	0 %	50 %	15642782
110	NC_000853	TCT	2	6	7415	7420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642782
111	NC_000853	TTATC	2	10	7507	7516	20 %	60 %	0 %	20 %	15642783
112	NC_000853	AGA	2	6	7521	7526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642783
113	NC_000853	GA	3	6	7525	7530	50 %	0 %	50 %	0 %	15642783
114	NC_000853	CGC	2	6	7596	7601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642783
115	NC_000853	GAT	3	9	7608	7616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642783
116	NC_000853	TCA	2	6	7617	7622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642783
117	NC_000853	AC	3	6	7639	7644	50 %	0 %	0 %	50 %	15642783
118	NC_000853	GAA	2	6	7743	7748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642783
119	NC_000853	GAA	2	6	7780	7785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642783
120	NC_000853	TCT	2	6	7806	7811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642783
121	NC_000853	GAA	2	6	7841	7846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642783
122	NC_000853	CT	4	8	7921	7928	0 %	50 %	0 %	50 %	15642783
123	NC_000853	GAA	2	6	8016	8021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642783
124	NC_000853	CAG	2	6	8025	8030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642783
125	NC_000853	ATC	2	6	8041	8046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642783
126	NC_000853	AGA	2	6	8084	8089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642783
127	NC_000853	GAT	2	6	8253	8258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642784
128	NC_000853	TTCT	2	8	8271	8278	0 %	75 %	0 %	25 %	15642784
129	NC_000853	CT	3	6	8352	8357	0 %	50 %	0 %	50 %	15642784
130	NC_000853	ATC	2	6	8361	8366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642784
131	NC_000853	TTC	2	6	8376	8381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642784
132	NC_000853	CT	3	6	8500	8505	0 %	50 %	0 %	50 %	15642784
133	NC_000853	GTA	2	6	8568	8573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642784
134	NC_000853	AGA	2	6	8611	8616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642784
135	NC_000853	CCT	2	6	8641	8646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642785
136	NC_000853	AC	3	6	8718	8723	50 %	0 %	0 %	50 %	15642785
137	NC_000853	ATCA	2	8	8822	8829	50 %	25 %	0 %	25 %	15642785
138	NC_000853	CTT	2	6	8852	8857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642785
139	NC_000853	CTCTT	2	10	8868	8877	0 %	60 %	0 %	40 %	15642785
140	NC_000853	TCC	2	6	9006	9011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642785
141	NC_000853	TCT	2	6	9034	9039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642785
142	NC_000853	TCT	2	6	9055	9060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642785
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148	NC_000853	TCC	3	9	9305	9313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642785
149	NC_000853	CT	3	6	9329	9334	0 %	50 %	0 %	50 %	15642785
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151	NC_000853	TGA	2	6	9457	9462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642785
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153	NC_000853	CT	3	6	9562	9567	0 %	50 %	0 %	50 %	15642785
154	NC_000853	CAC	2	6	9601	9606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642785
155	NC_000853	CGCACC	2	12	9614	9625	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	15642785
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157	NC_000853	CT	3	6	9689	9694	0 %	50 %	0 %	50 %	15642785
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263	NC_000853	CA	3	6	15387	15392	50 %	0 %	0 %	50 %	15642793
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268	NC_000853	A	6	6	15646	15651	100 %	0 %	0 %	0 %	15642793
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401	NC_000853	ACA	2	6	21106	21111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15642798
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