MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga maritima MSB8 chromosome

Total Repeats: 38422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25002	NC_000853	CTT	2	6	1208896	1208901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643947
25003	NC_000853	AGG	2	6	1208933	1208938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15643947
25004	NC_000853	T	6	6	1208945	1208950	0 %	100 %	0 %	0 %	15643947
25005	NC_000853	CTC	2	6	1208990	1208995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15643947
25006	NC_000853	TG	3	6	1209060	1209065	0 %	50 %	50 %	0 %	15643947
25007	NC_000853	CAT	2	6	1209116	1209121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15643947
25008	NC_000853	TC	4	8	1209122	1209129	0 %	50 %	0 %	50 %	15643948
25009	NC_000853	GTAGAA	2	12	1209139	1209150	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15643948
25010	NC_000853	TCT	2	6	1209161	1209166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643948
25011	NC_000853	GAC	2	6	1209172	1209177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15643948
25012	NC_000853	T	7	7	1209180	1209186	0 %	100 %	0 %	0 %	15643948
25013	NC_000853	GGA	2	6	1209190	1209195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15643948
25014	NC_000853	CTT	2	6	1209201	1209206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643948
25015	NC_000853	GGT	2	6	1209213	1209218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15643948
25016	NC_000853	CT	3	6	1209220	1209225	0 %	50 %	0 %	50 %	15643948
25017	NC_000853	GA	3	6	1209260	1209265	50 %	0 %	50 %	0 %	15643948
25018	NC_000853	AGACG	2	10	1209271	1209280	40 %	0 %	40 %	20 %	15643948
25019	NC_000853	TCC	2	6	1209296	1209301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15643948
25020	NC_000853	ATG	2	6	1209305	1209310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15643948
25021	NC_000853	GAG	2	6	1209334	1209339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15643948
25022	NC_000853	TTTC	2	8	1209348	1209355	0 %	75 %	0 %	25 %	15643948
25023	NC_000853	T	6	6	1209362	1209367	0 %	100 %	0 %	0 %	15643948
25024	NC_000853	CGAG	2	8	1209381	1209388	25 %	0 %	50 %	25 %	15643948
25025	NC_000853	ATC	2	6	1209391	1209396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15643948
25026	NC_000853	TGT	2	6	1209411	1209416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15643948
25027	NC_000853	TG	3	6	1209458	1209463	0 %	50 %	50 %	0 %	15643948
25028	NC_000853	CT	3	6	1209478	1209483	0 %	50 %	0 %	50 %	15643948
25029	NC_000853	TCT	2	6	1209584	1209589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643948
25030	NC_000853	GAA	2	6	1209657	1209662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643948
25031	NC_000853	TCT	2	6	1209692	1209697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643948
25032	NC_000853	T	6	6	1209758	1209763	0 %	100 %	0 %	0 %	15643948
25033	NC_000853	CGT	2	6	1210113	1210118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15643948
25034	NC_000853	TTC	2	6	1210145	1210150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643948
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25036	NC_000853	GTT	2	6	1210249	1210254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15643948
25037	NC_000853	CGA	2	6	1210263	1210268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15643948
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25039	NC_000853	GT	3	6	1210296	1210301	0 %	50 %	50 %	0 %	15643948
25040	NC_000853	GTC	2	6	1210342	1210347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15643948
25041	NC_000853	GAA	2	6	1210402	1210407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643948
25042	NC_000853	CTT	2	6	1210449	1210454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643948
25043	NC_000853	CAC	2	6	1210501	1210506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15643948
25044	NC_000853	GGT	2	6	1210541	1210546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15643948
25045	NC_000853	GAAA	2	8	1210549	1210556	75 %	0 %	25 %	0 %	15643948
25046	NC_000853	ACC	2	6	1210565	1210570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15643948
25047	NC_000853	GTT	2	6	1210594	1210599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15643948
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25050	NC_000853	CT	3	6	1210747	1210752	0 %	50 %	0 %	50 %	15643948
25051	NC_000853	CA	3	6	1210774	1210779	50 %	0 %	0 %	50 %	15643948
25052	NC_000853	GTAT	2	8	1210819	1210826	25 %	50 %	25 %	0 %	15643949
25053	NC_000853	CTT	2	6	1210839	1210844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643949
25054	NC_000853	CTTC	2	8	1210871	1210878	0 %	50 %	0 %	50 %	15643949
25055	NC_000853	CAC	2	6	1210893	1210898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15643949
25056	NC_000853	CAA	2	6	1210925	1210930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15643949
25057	NC_000853	ACC	2	6	1210936	1210941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15643949
25058	NC_000853	TCT	2	6	1211017	1211022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643949
25059	NC_000853	CGC	2	6	1211055	1211060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15643949
25060	NC_000853	GAAA	2	8	1211103	1211110	75 %	0 %	25 %	0 %	15643949
25061	NC_000853	GTC	2	6	1211166	1211171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15643949
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25063	NC_000853	TCTG	2	8	1211186	1211193	0 %	50 %	25 %	25 %	15643949
25064	NC_000853	TCC	2	6	1211260	1211265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15643949
25065	NC_000853	CAT	2	6	1211397	1211402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15643949
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25067	NC_000853	TGT	2	6	1211610	1211615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15643949
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25069	NC_000853	TC	3	6	1211703	1211708	0 %	50 %	0 %	50 %	15643949
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25085	NC_000853	GTA	2	6	1212606	1212611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15643949
25086	NC_000853	TTG	2	6	1212626	1212631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15643949
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25088	NC_000853	AG	3	6	1212677	1212682	50 %	0 %	50 %	0 %	15643949
25089	NC_000853	GA	3	6	1212723	1212728	50 %	0 %	50 %	0 %	15643949
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25093	NC_000853	AGT	2	6	1212890	1212895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15643949
25094	NC_000853	CA	3	6	1212896	1212901	50 %	0 %	0 %	50 %	15643949
25095	NC_000853	TGT	2	6	1212953	1212958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15643949
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25098	NC_000853	AG	3	6	1213055	1213060	50 %	0 %	50 %	0 %	15643949
25099	NC_000853	AAG	2	6	1213074	1213079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643949
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25101	NC_000853	AGGTG	2	10	1213162	1213171	20 %	20 %	60 %	0 %	15643949
25102	NC_000853	CTT	2	6	1213185	1213190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643949
25103	NC_000853	CAAAGG	2	12	1213205	1213216	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	15643949
25104	NC_000853	TCC	2	6	1213228	1213233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15643949
25105	NC_000853	T	6	6	1213259	1213264	0 %	100 %	0 %	0 %	15643949
25106	NC_000853	TGA	2	6	1213280	1213285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15643949
25107	NC_000853	TCT	2	6	1213306	1213311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643949
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25110	NC_000853	TCT	2	6	1213592	1213597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643949
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25115	NC_000853	TCC	2	6	1213858	1213863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15643949
25116	NC_000853	GAAG	2	8	1213971	1213978	50 %	0 %	50 %	0 %	15643949
25117	NC_000853	TCAC	2	8	1213999	1214006	25 %	25 %	0 %	50 %	15643949
25118	NC_000853	TTC	2	6	1214038	1214043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643949
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25120	NC_000853	TTC	3	9	1214102	1214110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643950
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25240	NC_000853	ATG	3	9	1220454	1220462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15643955
25241	NC_000853	TTC	2	6	1220565	1220570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643955
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25244	NC_000853	TCT	2	6	1220671	1220676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643955
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25279	NC_000853	CCT	2	6	1222501	1222506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15643956
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25343	NC_000853	CTG	2	6	1225891	1225896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15643958
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25351	NC_000853	TGA	2	6	1226234	1226239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15643958
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25353	NC_000853	TTC	2	6	1226445	1226450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643958
25354	NC_000853	TTG	2	6	1226506	1226511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15643958
25355	NC_000853	TAT	2	6	1226550	1226555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15643958
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25477	NC_000853	ATC	2	6	1232754	1232759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15643966
25478	NC_000853	ATA	2	6	1232781	1232786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15643966
25479	NC_000853	ACAG	2	8	1232823	1232830	50 %	0 %	25 %	25 %	15643966
25480	NC_000853	CTTCT	2	10	1232926	1232935	0 %	60 %	0 %	40 %	15643966
25481	NC_000853	CTC	2	6	1232957	1232962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15643966
25482	NC_000853	CTC	2	6	1233023	1233028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15643967
25483	NC_000853	TTTCG	2	10	1233034	1233043	0 %	60 %	20 %	20 %	15643967
25484	NC_000853	TGTTC	2	10	1233067	1233076	0 %	60 %	20 %	20 %	15643967
25485	NC_000853	TGG	2	6	1233081	1233086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15643967
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25487	NC_000853	CCG	2	6	1233164	1233169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15643967
25488	NC_000853	GCT	2	6	1233209	1233214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15643967
25489	NC_000853	GTTTC	2	10	1233242	1233251	0 %	60 %	20 %	20 %	15643967
25490	NC_000853	AAAG	2	8	1233265	1233272	75 %	0 %	25 %	0 %	15643967
25491	NC_000853	CT	3	6	1233283	1233288	0 %	50 %	0 %	50 %	15643967
25492	NC_000853	TCGT	2	8	1233344	1233351	0 %	50 %	25 %	25 %	15643967
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25496	NC_000853	TCT	2	6	1233460	1233465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643967
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25499	NC_000853	TGG	2	6	1233631	1233636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15643967
25500	NC_000853	TC	3	6	1233645	1233650	0 %	50 %	0 %	50 %	15643967

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