MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga maritima MSB8 chromosome

Total Repeats: 38422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_000853	GAA	2	6	608665	608670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643342
12502	NC_000853	AAG	2	6	608724	608729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643342
12503	NC_000853	AAG	2	6	608770	608775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643342
12504	NC_000853	ACG	2	6	608830	608835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15643342
12505	NC_000853	G	6	6	608848	608853	0 %	0 %	100 %	0 %	15643342
12506	NC_000853	AAG	2	6	608876	608881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643342
12507	NC_000853	GT	3	6	608930	608935	0 %	50 %	50 %	0 %	15643342
12508	NC_000853	CAC	2	6	608937	608942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15643342
12509	NC_000853	ATG	2	6	608966	608971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15643342
12510	NC_000853	AGAT	2	8	608981	608988	50 %	25 %	25 %	0 %	15643342
12511	NC_000853	GAT	2	6	609001	609006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15643342
12512	NC_000853	TCA	2	6	609014	609019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15643342
12513	NC_000853	AAC	2	6	609271	609276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15643342
12514	NC_000853	GAC	2	6	609334	609339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15643342
12515	NC_000853	AGA	2	6	609426	609431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643342
12516	NC_000853	AAG	2	6	609647	609652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643342
12517	NC_000853	GA	3	6	609669	609674	50 %	0 %	50 %	0 %	15643342
12518	NC_000853	TGCC	2	8	609686	609693	0 %	25 %	25 %	50 %	15643342
12519	NC_000853	AGA	2	6	609704	609709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643342
12520	NC_000853	AGTG	2	8	609717	609724	25 %	25 %	50 %	0 %	15643342
12521	NC_000853	TCCT	2	8	609763	609770	0 %	50 %	0 %	50 %	15643342
12522	NC_000853	GAA	2	6	609798	609803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643342
12523	NC_000853	CAA	2	6	609840	609845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15643342
12524	NC_000853	GAA	2	6	609895	609900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643342
12525	NC_000853	CAA	2	6	609945	609950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15643342
12526	NC_000853	TGA	2	6	609965	609970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15643342
12527	NC_000853	AGA	2	6	610030	610035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643343
12528	NC_000853	TCT	2	6	610074	610079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643343
12529	NC_000853	TTCG	2	8	610143	610150	0 %	50 %	25 %	25 %	15643343
12530	NC_000853	TCT	2	6	610250	610255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643343
12531	NC_000853	TTC	2	6	610295	610300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643343
12532	NC_000853	CAG	2	6	610317	610322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15643343
12533	NC_000853	CGGG	2	8	610428	610435	0 %	0 %	75 %	25 %	15643343
12534	NC_000853	CTT	2	6	610463	610468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643343
12535	NC_000853	TTC	2	6	610484	610489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643343
12536	NC_000853	TCC	2	6	610570	610575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15643344
12537	NC_000853	AAG	2	6	610595	610600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643344
12538	NC_000853	TGA	2	6	610649	610654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15643344
12539	NC_000853	GTT	2	6	610666	610671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15643344
12540	NC_000853	CAGCG	2	10	610800	610809	20 %	0 %	40 %	40 %	15643344
12541	NC_000853	CCA	2	6	610823	610828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15643344
12542	NC_000853	CGA	2	6	610829	610834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15643344
12543	NC_000853	ACG	2	6	610900	610905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15643344
12544	NC_000853	TCTT	2	8	610941	610948	0 %	75 %	0 %	25 %	15643344
12545	NC_000853	GGA	2	6	611203	611208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15643344
12546	NC_000853	GA	3	6	611219	611224	50 %	0 %	50 %	0 %	15643344
12547	NC_000853	CAA	2	6	611243	611248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15643344
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12549	NC_000853	CGA	2	6	611312	611317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15643344
12550	NC_000853	GAA	2	6	611580	611585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643345
12551	NC_000853	TTG	2	6	611599	611604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15643345
12552	NC_000853	CGG	2	6	611612	611617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15643345
12553	NC_000853	CCT	2	6	611633	611638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15643345
12554	NC_000853	C	6	6	611659	611664	0 %	0 %	0 %	100 %	15643345
12555	NC_000853	AAGATC	2	12	611670	611681	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15643345
12556	NC_000853	AG	3	6	611709	611714	50 %	0 %	50 %	0 %	15643345
12557	NC_000853	AGA	2	6	611721	611726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643345
12558	NC_000853	TC	3	6	611799	611804	0 %	50 %	0 %	50 %	15643345
12559	NC_000853	AG	3	6	611841	611846	50 %	0 %	50 %	0 %	15643345
12560	NC_000853	AAAG	2	8	611876	611883	75 %	0 %	25 %	0 %	15643345
12561	NC_000853	TC	3	6	611986	611991	0 %	50 %	0 %	50 %	15643345
12562	NC_000853	AGA	2	6	611999	612004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643345
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12566	NC_000853	GTT	2	6	612078	612083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15643345
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12569	NC_000853	TTG	2	6	612244	612249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15643345
12570	NC_000853	TCTTTT	2	12	612302	612313	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	15643345
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12572	NC_000853	A	6	6	612474	612479	100 %	0 %	0 %	0 %	15643345
12573	NC_000853	GTG	2	6	612534	612539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15643345
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12577	NC_000853	A	6	6	612642	612647	100 %	0 %	0 %	0 %	15643345
12578	NC_000853	TCCTC	2	10	612674	612683	0 %	40 %	0 %	60 %	15643345
12579	NC_000853	GAA	2	6	612690	612695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643345
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12584	NC_000853	GAC	2	6	612979	612984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15643346
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12588	NC_000853	TCA	2	6	613184	613189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15643346
12589	NC_000853	GAG	2	6	613191	613196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15643346
12590	NC_000853	CT	3	6	613198	613203	0 %	50 %	0 %	50 %	15643346
12591	NC_000853	GGAA	2	8	613204	613211	50 %	0 %	50 %	0 %	15643346
12592	NC_000853	CGTTCA	2	12	613220	613231	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15643346
12593	NC_000853	CAA	2	6	613244	613249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15643346
12594	NC_000853	GGA	2	6	613294	613299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15643346
12595	NC_000853	GAA	2	6	613303	613308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643346
12596	NC_000853	TCC	2	6	613394	613399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15643346
12597	NC_000853	GCGAA	2	10	613451	613460	40 %	0 %	40 %	20 %	15643346
12598	NC_000853	TTC	2	6	613468	613473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643346
12599	NC_000853	GA	3	6	613530	613535	50 %	0 %	50 %	0 %	15643346
12600	NC_000853	GGA	3	9	613624	613632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15643346
12601	NC_000853	AG	3	6	613642	613647	50 %	0 %	50 %	0 %	15643346
12602	NC_000853	GATG	2	8	613674	613681	25 %	25 %	50 %	0 %	15643346
12603	NC_000853	GATTC	2	10	613682	613691	20 %	40 %	20 %	20 %	15643346
12604	NC_000853	CAT	2	6	613701	613706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15643346
12605	NC_000853	GGC	2	6	613713	613718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15643346
12606	NC_000853	GAA	2	6	613808	613813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643346
12607	NC_000853	AGA	2	6	613814	613819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643346
12608	NC_000853	AAAC	2	8	613839	613846	75 %	0 %	0 %	25 %	15643346
12609	NC_000853	TCG	2	6	613898	613903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15643346
12610	NC_000853	GGC	2	6	613932	613937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15643346
12611	NC_000853	CTT	2	6	613939	613944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643346
12612	NC_000853	GCG	2	6	613945	613950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15643346
12613	NC_000853	CAT	2	6	614058	614063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15643346
12614	NC_000853	GAG	2	6	614185	614190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15643346
12615	NC_000853	GAAC	2	8	614211	614218	50 %	0 %	25 %	25 %	15643346
12616	NC_000853	AGC	2	6	614253	614258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15643346
12617	NC_000853	AGA	2	6	614259	614264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643346
12618	NC_000853	GGT	2	6	614265	614270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15643346
12619	NC_000853	GT	3	6	614338	614343	0 %	50 %	50 %	0 %	15643346
12620	NC_000853	GAAG	2	8	614385	614392	50 %	0 %	50 %	0 %	15643346
12621	NC_000853	TCTT	2	8	614402	614409	0 %	75 %	0 %	25 %	15643346
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12990	NC_000853	TC	3	6	631284	631289	0 %	50 %	0 %	50 %	15643362
12991	NC_000853	CTT	2	6	631299	631304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643362
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12993	NC_000853	TC	3	6	631383	631388	0 %	50 %	0 %	50 %	15643362
12994	NC_000853	ACG	2	6	631408	631413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15643362
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