MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga maritima MSB8 chromosome

Total Repeats: 38422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_000853	CTG	2	6	489784	489789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15643227
10002	NC_000853	CTG	2	6	489852	489857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15643227
10003	NC_000853	T	6	6	489868	489873	0 %	100 %	0 %	0 %	15643227
10004	NC_000853	GGA	2	6	489978	489983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15643227
10005	NC_000853	GAA	2	6	490044	490049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643227
10006	NC_000853	TTC	2	6	490076	490081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643227
10007	NC_000853	GAT	2	6	490084	490089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15643227
10008	NC_000853	ATGTG	2	10	490114	490123	20 %	40 %	40 %	0 %	15643227
10009	NC_000853	TTG	2	6	490146	490151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15643227
10010	NC_000853	AGG	2	6	490173	490178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15643227
10011	NC_000853	AAG	2	6	490217	490222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643227
10012	NC_000853	T	6	6	490226	490231	0 %	100 %	0 %	0 %	15643227
10013	NC_000853	T	6	6	490255	490260	0 %	100 %	0 %	0 %	15643227
10014	NC_000853	CTTT	3	12	490263	490274	0 %	75 %	0 %	25 %	15643227
10015	NC_000853	TTC	2	6	490407	490412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643227
10016	NC_000853	GA	3	6	490501	490506	50 %	0 %	50 %	0 %	15643227
10017	NC_000853	TTC	2	6	490507	490512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643227
10018	NC_000853	AC	3	6	490549	490554	50 %	0 %	0 %	50 %	15643227
10019	NC_000853	GAGAT	2	10	490572	490581	40 %	20 %	40 %	0 %	15643227
10020	NC_000853	T	6	6	490588	490593	0 %	100 %	0 %	0 %	15643227
10021	NC_000853	T	6	6	490616	490621	0 %	100 %	0 %	0 %	15643227
10022	NC_000853	TCT	3	9	490722	490730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643227
10023	NC_000853	GTAG	2	8	490737	490744	25 %	25 %	50 %	0 %	15643227
10024	NC_000853	GTG	2	6	490793	490798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15643227
10025	NC_000853	GAA	2	6	490855	490860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643227
10026	NC_000853	TCT	2	6	490961	490966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643227
10027	NC_000853	TCCACA	2	12	490974	490985	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	15643227
10028	NC_000853	GGT	2	6	490995	491000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15643227
10029	NC_000853	TTC	2	6	491009	491014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643227
10030	NC_000853	AAG	2	6	491019	491024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643227
10031	NC_000853	GA	3	6	491087	491092	50 %	0 %	50 %	0 %	15643227
10032	NC_000853	CTTT	2	8	491189	491196	0 %	75 %	0 %	25 %	15643227
10033	NC_000853	T	6	6	491256	491261	0 %	100 %	0 %	0 %	15643227
10034	NC_000853	AGG	2	6	491285	491290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15643227
10035	NC_000853	TCG	2	6	491385	491390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15643227
10036	NC_000853	T	7	7	491424	491430	0 %	100 %	0 %	0 %	15643227
10037	NC_000853	GTA	2	6	491513	491518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15643227
10038	NC_000853	CT	3	6	491540	491545	0 %	50 %	0 %	50 %	15643227
10039	NC_000853	CGA	2	6	491554	491559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15643227
10040	NC_000853	CGG	2	6	491632	491637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15643227
10041	NC_000853	CTTT	2	8	491678	491685	0 %	75 %	0 %	25 %	15643227
10042	NC_000853	TCGAA	2	10	491706	491715	40 %	20 %	20 %	20 %	15643227
10043	NC_000853	CTT	2	6	491799	491804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643228
10044	NC_000853	TCC	2	6	491810	491815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15643228
10045	NC_000853	TCCA	2	8	491834	491841	25 %	25 %	0 %	50 %	15643228
10046	NC_000853	GAA	2	6	491860	491865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643228
10047	NC_000853	GT	3	6	491989	491994	0 %	50 %	50 %	0 %	15643228
10048	NC_000853	CAT	2	6	492033	492038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15643228
10049	NC_000853	CTT	2	6	492072	492077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643228
10050	NC_000853	TCA	2	6	492149	492154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15643228
10051	NC_000853	TCT	2	6	492189	492194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643228
10052	NC_000853	CGGA	2	8	492301	492308	25 %	0 %	50 %	25 %	15643228
10053	NC_000853	TGA	2	6	492341	492346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15643228
10054	NC_000853	ATG	2	6	492425	492430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15643228
10055	NC_000853	CTA	2	6	492513	492518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15643228
10056	NC_000853	T	6	6	492547	492552	0 %	100 %	0 %	0 %	15643228
10057	NC_000853	ATG	2	6	492618	492623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15643228
10058	NC_000853	TCT	2	6	492627	492632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643228
10059	NC_000853	CTCTT	2	10	492661	492670	0 %	60 %	0 %	40 %	15643228
10060	NC_000853	T	6	6	492669	492674	0 %	100 %	0 %	0 %	15643228
10061	NC_000853	CTC	2	6	492730	492735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15643229
10062	NC_000853	ATG	2	6	492741	492746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15643229
10063	NC_000853	CTG	2	6	492882	492887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15643229
10064	NC_000853	GA	3	6	492912	492917	50 %	0 %	50 %	0 %	15643229
10065	NC_000853	ACA	2	6	492921	492926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15643229
10066	NC_000853	AAC	2	6	492969	492974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15643229
10067	NC_000853	GGTT	2	8	492991	492998	0 %	50 %	50 %	0 %	15643229
10068	NC_000853	A	6	6	493014	493019	100 %	0 %	0 %	0 %	15643229
10069	NC_000853	A	6	6	493032	493037	100 %	0 %	0 %	0 %	15643229
10070	NC_000853	CGA	2	6	493192	493197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15643230
10071	NC_000853	AC	3	6	493286	493291	50 %	0 %	0 %	50 %	15643230
10072	NC_000853	TTC	2	6	493356	493361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643230
10073	NC_000853	TTC	2	6	493448	493453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643230
10074	NC_000853	CTT	2	6	493473	493478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643230
10075	NC_000853	CGATGT	2	12	493486	493497	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15643230
10076	NC_000853	TTC	2	6	493565	493570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643230
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10079	NC_000853	ATCTC	2	10	493635	493644	20 %	40 %	0 %	40 %	15643230
10080	NC_000853	CAC	2	6	493653	493658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15643230
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10082	NC_000853	CTT	2	6	493724	493729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643230
10083	NC_000853	CT	3	6	493754	493759	0 %	50 %	0 %	50 %	15643230
10084	NC_000853	GAA	2	6	493783	493788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643230
10085	NC_000853	GTTCT	2	10	493789	493798	0 %	60 %	20 %	20 %	15643230
10086	NC_000853	AAG	2	6	493822	493827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643230
10087	NC_000853	AG	3	6	493826	493831	50 %	0 %	50 %	0 %	15643230
10088	NC_000853	TTC	2	6	493877	493882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643230
10089	NC_000853	TTCC	2	8	493892	493899	0 %	50 %	0 %	50 %	15643230
10090	NC_000853	TTTTC	2	10	493933	493942	0 %	80 %	0 %	20 %	15643230
10091	NC_000853	TCC	2	6	493950	493955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15643230
10092	NC_000853	CTTC	2	8	493981	493988	0 %	50 %	0 %	50 %	15643231
10093	NC_000853	TGA	2	6	494003	494008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15643231
10094	NC_000853	TCC	2	6	494023	494028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15643231
10095	NC_000853	ACC	2	6	494074	494079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15643231
10096	NC_000853	T	7	7	494081	494087	0 %	100 %	0 %	0 %	15643231
10097	NC_000853	ATC	2	6	494229	494234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15643231
10098	NC_000853	CGAA	2	8	494381	494388	50 %	0 %	25 %	25 %	15643231
10099	NC_000853	ATC	2	6	494391	494396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15643231
10100	NC_000853	AGGA	2	8	494436	494443	50 %	0 %	50 %	0 %	15643231
10101	NC_000853	GA	3	6	494442	494447	50 %	0 %	50 %	0 %	15643231
10102	NC_000853	TCA	2	6	494551	494556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15643231
10103	NC_000853	TCC	2	6	494652	494657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15643232
10104	NC_000853	GTC	2	6	494666	494671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15643232
10105	NC_000853	CGT	2	6	494701	494706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15643232
10106	NC_000853	GAAT	2	8	494782	494789	50 %	25 %	25 %	0 %	15643232
10107	NC_000853	CTT	2	6	494818	494823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643232
10108	NC_000853	TCT	2	6	494880	494885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643232
10109	NC_000853	ATC	2	6	494922	494927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15643232
10110	NC_000853	TC	3	6	494955	494960	0 %	50 %	0 %	50 %	15643232
10111	NC_000853	TC	3	6	494981	494986	0 %	50 %	0 %	50 %	15643232
10112	NC_000853	TTG	2	6	495033	495038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15643232
10113	NC_000853	GTTCT	2	10	495063	495072	0 %	60 %	20 %	20 %	15643232
10114	NC_000853	TGT	2	6	495073	495078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15643232
10115	NC_000853	CTC	2	6	495106	495111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15643232
10116	NC_000853	CTG	2	6	495232	495237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15643232
10117	NC_000853	GTTT	2	8	495251	495258	0 %	75 %	25 %	0 %	15643232
10118	NC_000853	TCC	3	9	495266	495274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15643232
10119	NC_000853	TGC	2	6	495281	495286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15643232
10120	NC_000853	GAT	2	6	495290	495295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15643232
10121	NC_000853	TTC	2	6	495327	495332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643232
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10123	NC_000853	CAT	2	6	495386	495391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15643232
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10243	NC_000853	GGAT	2	8	500545	500552	25 %	25 %	50 %	0 %	15643239
10244	NC_000853	CTT	2	6	500665	500670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643239
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10363	NC_000853	TC	4	8	506147	506154	0 %	50 %	0 %	50 %	15643244
10364	NC_000853	CTT	2	6	506310	506315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643244
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10491	NC_000853	TG	5	10	512003	512012	0 %	50 %	50 %	0 %	15643248
10492	NC_000853	CCA	2	6	512032	512037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15643248
10493	NC_000853	TGA	2	6	512053	512058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15643248
10494	NC_000853	GAT	2	6	512064	512069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15643248
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