MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus litoralis DSM 5473

Total Repeats: 43830

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_022084	GGA	2	6	860186	860191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530548424
17003	NC_022084	TCA	2	6	860220	860225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530548424
17004	NC_022084	GTG	2	6	860243	860248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530548424
17005	NC_022084	AG	3	6	860357	860362	50 %	0 %	50 %	0 %	530548424
17006	NC_022084	AGGC	2	8	860366	860373	25 %	0 %	50 %	25 %	530548424
17007	NC_022084	GAA	2	6	860378	860383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530548424
17008	NC_022084	TCC	2	6	860494	860499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17009	NC_022084	AAG	2	6	860541	860546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17010	NC_022084	AAC	2	6	860883	860888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17011	NC_022084	AAGG	2	8	860949	860956	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17012	NC_022084	CT	3	6	861026	861031	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17013	NC_022084	TTA	2	6	861098	861103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530548425
17014	NC_022084	GGT	2	6	861126	861131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530548425
17015	NC_022084	GAA	2	6	861231	861236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530548425
17016	NC_022084	A	6	6	861250	861255	100 %	0 %	0 %	0 %	530548425
17017	NC_022084	CTC	2	6	861283	861288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530548425
17018	NC_022084	TAC	2	6	861298	861303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530548425
17019	NC_022084	TTC	2	6	861343	861348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530548425
17020	NC_022084	ACT	2	6	861362	861367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530548425
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17022	NC_022084	ACC	2	6	861416	861421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530548425
17023	NC_022084	A	6	6	861427	861432	100 %	0 %	0 %	0 %	530548425
17024	NC_022084	A	7	7	861487	861493	100 %	0 %	0 %	0 %	530548425
17025	NC_022084	AAAG	2	8	861641	861648	75 %	0 %	25 %	0 %	530548426
17026	NC_022084	TGG	2	6	861661	861666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530548426
17027	NC_022084	GGT	2	6	861711	861716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530548426
17028	NC_022084	GTA	2	6	861721	861726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530548426
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17030	NC_022084	GA	3	6	861731	861736	50 %	0 %	50 %	0 %	530548426
17031	NC_022084	GAA	2	6	861750	861755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530548426
17032	NC_022084	ACT	2	6	861844	861849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530548426
17033	NC_022084	TCC	2	6	861893	861898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530548426
17034	NC_022084	ATA	2	6	861985	861990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17035	NC_022084	TTA	2	6	862108	862113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17036	NC_022084	ACAA	2	8	862265	862272	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
17037	NC_022084	ATC	2	6	862317	862322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17038	NC_022084	ACC	2	6	862451	862456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17039	NC_022084	ATT	2	6	862524	862529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17040	NC_022084	TTTC	2	8	862542	862549	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
17041	NC_022084	GGT	2	6	862646	862651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17042	NC_022084	CAA	2	6	862726	862731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17043	NC_022084	CAA	2	6	862867	862872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17044	NC_022084	CTTT	2	8	862882	862889	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
17045	NC_022084	TGTT	2	8	862996	863003	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17046	NC_022084	CAA	2	6	863268	863273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17047	NC_022084	AAG	2	6	863472	863477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17048	NC_022084	ACC	2	6	863683	863688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17049	NC_022084	G	7	7	863755	863761	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
17050	NC_022084	TA	3	6	863831	863836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17051	NC_022084	ACC	2	6	864212	864217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17052	NC_022084	GAA	2	6	864231	864236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17053	NC_022084	TTA	2	6	864350	864355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17054	NC_022084	TA	3	6	864427	864432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17055	NC_022084	ATT	2	6	864498	864503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17056	NC_022084	TAC	2	6	864702	864707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17057	NC_022084	CGA	2	6	864792	864797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17058	NC_022084	AGC	2	6	864865	864870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17059	NC_022084	TTG	2	6	864910	864915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17060	NC_022084	TGCT	2	8	864922	864929	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17061	NC_022084	ATTT	2	8	864996	865003	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17062	NC_022084	TTG	2	6	865055	865060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17063	NC_022084	GAT	2	6	865113	865118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17064	NC_022084	TTTC	2	8	865141	865148	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
17065	NC_022084	AG	3	6	865212	865217	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17066	NC_022084	AAG	2	6	865264	865269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17067	NC_022084	CACT	2	8	865304	865311	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17068	NC_022084	TAC	2	6	865322	865327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17069	NC_022084	TTTC	2	8	865329	865336	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
17070	NC_022084	ACAAA	2	10	865368	865377	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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17072	NC_022084	TAA	2	6	865462	865467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17073	NC_022084	A	6	6	865487	865492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17074	NC_022084	CCT	2	6	865523	865528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17075	NC_022084	CTG	2	6	865566	865571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17076	NC_022084	TTTGA	2	10	865579	865588	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
17077	NC_022084	TCAT	2	8	865693	865700	25 %	50 %	0 %	25 %	530548427
17078	NC_022084	GAG	3	9	865770	865778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530548427
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17082	NC_022084	AGA	2	6	866079	866084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530548428
17083	NC_022084	TGA	2	6	866243	866248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530548428
17084	NC_022084	GAAG	2	8	866250	866257	50 %	0 %	50 %	0 %	530548428
17085	NC_022084	ATAG	2	8	866320	866327	50 %	25 %	25 %	0 %	530548428
17086	NC_022084	ATT	2	6	866506	866511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530548428
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17088	NC_022084	GAAA	2	8	866559	866566	75 %	0 %	25 %	0 %	530548428
17089	NC_022084	GAT	2	6	866589	866594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530548428
17090	NC_022084	GAC	2	6	866626	866631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530548428
17091	NC_022084	GGAGTT	2	12	866701	866712	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	530548428
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17093	NC_022084	GGT	2	6	866782	866787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530548428
17094	NC_022084	GGAAG	2	10	866881	866890	40 %	0 %	60 %	0 %	530548428
17095	NC_022084	GGAA	2	8	866902	866909	50 %	0 %	50 %	0 %	530548428
17096	NC_022084	ATG	2	6	866947	866952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530548428
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17098	NC_022084	TAC	2	6	866971	866976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530548428
17099	NC_022084	AAGTG	2	10	867051	867060	40 %	20 %	40 %	0 %	530548428
17100	NC_022084	TGGG	2	8	867074	867081	0 %	25 %	75 %	0 %	530548428
17101	NC_022084	GAA	2	6	867121	867126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530548428
17102	NC_022084	ATA	2	6	867151	867156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530548428
17103	NC_022084	CAGG	2	8	867160	867167	25 %	0 %	50 %	25 %	530548428
17104	NC_022084	ATG	2	6	867188	867193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530548428
17105	NC_022084	AG	3	6	867351	867356	50 %	0 %	50 %	0 %	530548429
17106	NC_022084	AAT	2	6	867377	867382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530548429
17107	NC_022084	GTGGA	2	10	867394	867403	20 %	20 %	60 %	0 %	530548429
17108	NC_022084	AG	3	6	867560	867565	50 %	0 %	50 %	0 %	530548429
17109	NC_022084	T	6	6	867567	867572	0 %	100 %	0 %	0 %	530548429
17110	NC_022084	GA	3	6	867656	867661	50 %	0 %	50 %	0 %	530548429
17111	NC_022084	CCA	2	6	867734	867739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530548429
17112	NC_022084	GGC	2	6	867747	867752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530548429
17113	NC_022084	AG	3	6	867758	867763	50 %	0 %	50 %	0 %	530548429
17114	NC_022084	GA	3	6	867815	867820	50 %	0 %	50 %	0 %	530548429
17115	NC_022084	GGA	2	6	867956	867961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530548429
17116	NC_022084	TAAC	2	8	868198	868205	50 %	25 %	0 %	25 %	530548429
17117	NC_022084	TTGAGT	2	12	868222	868233	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	530548429
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17120	NC_022084	ATC	2	6	868377	868382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530548430
17121	NC_022084	GGC	2	6	868506	868511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530548430
17122	NC_022084	TTG	2	6	868546	868551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530548430
17123	NC_022084	CA	4	8	868747	868754	50 %	0 %	0 %	50 %	530548430
17124	NC_022084	TTA	2	6	868812	868817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17125	NC_022084	A	6	6	868871	868876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17126	NC_022084	GAGG	2	8	868880	868887	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
17127	NC_022084	CAAA	2	8	868896	868903	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
17128	NC_022084	AAG	2	6	868918	868923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17129	NC_022084	GGA	2	6	868944	868949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17130	NC_022084	GGA	2	6	868982	868987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17131	NC_022084	GAA	2	6	869035	869040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17132	NC_022084	T	6	6	869054	869059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17133	NC_022084	T	6	6	869094	869099	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17136	NC_022084	TGGG	2	8	869227	869234	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
17137	NC_022084	AG	3	6	869246	869251	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17138	NC_022084	AAT	2	6	869257	869262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17142	NC_022084	ATTT	2	8	869354	869361	25 %	75 %	0 %	0 %	530548431
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17264	NC_022084	ATC	2	6	875752	875757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530548435
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17366	NC_022084	GT	3	6	881343	881348	0 %	50 %	50 %	0 %	530548441
17367	NC_022084	CCAT	2	8	881362	881369	25 %	25 %	0 %	50 %	530548441
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17370	NC_022084	TCT	2	6	881654	881659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530548441
17371	NC_022084	TTC	2	6	881674	881679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530548441
17372	NC_022084	GAA	2	6	881685	881690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530548441
17373	NC_022084	TGA	2	6	881701	881706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530548441
17374	NC_022084	ATC	3	9	881741	881749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530548441
17375	NC_022084	ACA	2	6	881750	881755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530548441
17376	NC_022084	AAC	2	6	881767	881772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530548441
17377	NC_022084	ACTC	2	8	881829	881836	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17378	NC_022084	GAA	2	6	881856	881861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17379	NC_022084	AAC	2	6	881916	881921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530548442
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17381	NC_022084	TCT	2	6	881941	881946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530548442
17382	NC_022084	TGT	2	6	882014	882019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530548442
17383	NC_022084	CATC	2	8	882214	882221	25 %	25 %	0 %	50 %	530548442
17384	NC_022084	TTC	2	6	882255	882260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530548442
17385	NC_022084	ATC	2	6	882313	882318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530548442
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17389	NC_022084	TGA	2	6	882766	882771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530548442
17390	NC_022084	AG	4	8	882866	882873	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17391	NC_022084	AG	3	6	883027	883032	50 %	0 %	50 %	0 %	530548443
17392	NC_022084	TC	3	6	883128	883133	0 %	50 %	0 %	50 %	530548444
17393	NC_022084	T	6	6	883174	883179	0 %	100 %	0 %	0 %	530548444
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17396	NC_022084	CT	3	6	883288	883293	0 %	50 %	0 %	50 %	530548444
17397	NC_022084	CCAA	2	8	883297	883304	50 %	0 %	0 %	50 %	530548444
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17401	NC_022084	T	6	6	883500	883505	0 %	100 %	0 %	0 %	530548444
17402	NC_022084	TAT	2	6	883521	883526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530548444
17403	NC_022084	CTT	2	6	883562	883567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530548444
17404	NC_022084	A	6	6	883591	883596	100 %	0 %	0 %	0 %	530548444
17405	NC_022084	AAAAG	2	10	883670	883679	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
17406	NC_022084	CTT	2	6	883686	883691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530548445
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17412	NC_022084	CTT	2	6	883980	883985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530548446
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17425	NC_022084	TAAG	2	8	884583	884590	50 %	25 %	25 %	0 %	530548447
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17427	NC_022084	TCCT	2	8	884638	884645	0 %	50 %	0 %	50 %	530548447
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17432	NC_022084	TCTCT	2	10	884895	884904	0 %	60 %	0 %	40 %	530548449
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17450	NC_022084	ATC	2	6	885803	885808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530548450
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17454	NC_022084	AGA	2	6	886111	886116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17455	NC_022084	ATG	2	6	886122	886127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17456	NC_022084	TCTGGT	2	12	886131	886142	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17457	NC_022084	TTG	2	6	886155	886160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17458	NC_022084	AGG	2	6	886176	886181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17459	NC_022084	AT	3	6	886183	886188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17460	NC_022084	TACT	2	8	886293	886300	25 %	50 %	0 %	25 %	530548451
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17471	NC_022084	GAA	2	6	886722	886727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530548452
17472	NC_022084	CACT	2	8	886839	886846	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17473	NC_022084	ATT	2	6	886946	886951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530548453
17474	NC_022084	AG	3	6	887009	887014	50 %	0 %	50 %	0 %	530548453
17475	NC_022084	ATT	2	6	887023	887028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530548453
17476	NC_022084	ACTT	2	8	887050	887057	25 %	50 %	0 %	25 %	530548453
17477	NC_022084	AGACG	2	10	887103	887112	40 %	0 %	40 %	20 %	530548453
17478	NC_022084	GGA	2	6	887127	887132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530548453
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17480	NC_022084	CTG	2	6	887164	887169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530548453
17481	NC_022084	TAC	2	6	887185	887190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530548453
17482	NC_022084	AAG	2	6	887212	887217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530548453
17483	NC_022084	T	6	6	887226	887231	0 %	100 %	0 %	0 %	530548453
17484	NC_022084	CAG	2	6	887296	887301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530548453
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17487	NC_022084	TTCA	2	8	887394	887401	25 %	50 %	0 %	25 %	530548453
17488	NC_022084	AAG	2	6	887402	887407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530548453
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