MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus litoralis DSM 5473

Total Repeats: 43830

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_022084	CTC	2	6	678720	678725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13502	NC_022084	CTT	3	9	678823	678831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530548244
13503	NC_022084	A	6	6	678852	678857	100 %	0 %	0 %	0 %	530548244
13504	NC_022084	CTG	2	6	678861	678866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530548244
13505	NC_022084	CAA	2	6	678893	678898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530548244
13506	NC_022084	TTG	2	6	678952	678957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530548244
13507	NC_022084	CT	3	6	679034	679039	0 %	50 %	0 %	50 %	530548244
13508	NC_022084	AACA	2	8	679077	679084	75 %	0 %	0 %	25 %	530548244
13509	NC_022084	T	6	6	679099	679104	0 %	100 %	0 %	0 %	530548244
13510	NC_022084	CTA	2	6	679118	679123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530548244
13511	NC_022084	TCC	2	6	679126	679131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530548244
13512	NC_022084	CCA	2	6	679148	679153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530548244
13513	NC_022084	CAC	2	6	679208	679213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530548245
13514	NC_022084	GA	4	8	679425	679432	50 %	0 %	50 %	0 %	530548245
13515	NC_022084	T	6	6	679494	679499	0 %	100 %	0 %	0 %	530548246
13516	NC_022084	C	6	6	679564	679569	0 %	0 %	0 %	100 %	530548246
13517	NC_022084	TATC	2	8	679571	679578	25 %	50 %	0 %	25 %	530548246
13518	NC_022084	T	6	6	679596	679601	0 %	100 %	0 %	0 %	530548246
13519	NC_022084	TTC	2	6	679632	679637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530548246
13520	NC_022084	TC	3	6	679644	679649	0 %	50 %	0 %	50 %	530548246
13521	NC_022084	T	6	6	679652	679657	0 %	100 %	0 %	0 %	530548246
13522	NC_022084	ACT	2	6	679831	679836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530548246
13523	NC_022084	TCC	2	6	679841	679846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530548246
13524	NC_022084	GCA	2	6	679855	679860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530548246
13525	NC_022084	TTCTT	2	10	679867	679876	0 %	80 %	0 %	20 %	530548246
13526	NC_022084	TCA	2	6	679939	679944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530548246
13527	NC_022084	TTC	2	6	679974	679979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530548246
13528	NC_022084	TCA	2	6	680032	680037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530548246
13529	NC_022084	TCT	2	6	680125	680130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530548246
13530	NC_022084	T	7	7	680130	680136	0 %	100 %	0 %	0 %	530548246
13531	NC_022084	GTT	2	6	680384	680389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13532	NC_022084	T	6	6	680391	680396	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13533	NC_022084	ATA	2	6	680483	680488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530548247
13534	NC_022084	T	6	6	680505	680510	0 %	100 %	0 %	0 %	530548247
13535	NC_022084	AGA	2	6	680587	680592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530548247
13536	NC_022084	A	6	6	680592	680597	100 %	0 %	0 %	0 %	530548247
13537	NC_022084	TTG	2	6	680673	680678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530548247
13538	NC_022084	CATT	2	8	680715	680722	25 %	50 %	0 %	25 %	530548247
13539	NC_022084	A	6	6	680737	680742	100 %	0 %	0 %	0 %	530548247
13540	NC_022084	A	7	7	680752	680758	100 %	0 %	0 %	0 %	530548247
13541	NC_022084	GAA	2	6	680801	680806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530548247
13542	NC_022084	CTA	2	6	680827	680832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530548247
13543	NC_022084	TTTC	2	8	680909	680916	0 %	75 %	0 %	25 %	530548247
13544	NC_022084	GAA	2	6	680936	680941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530548247
13545	NC_022084	AGA	2	6	680968	680973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530548247
13546	NC_022084	GA	3	6	680980	680985	50 %	0 %	50 %	0 %	530548247
13547	NC_022084	GA	3	6	680990	680995	50 %	0 %	50 %	0 %	530548247
13548	NC_022084	AGC	2	6	681007	681012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530548247
13549	NC_022084	TCC	2	6	681073	681078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530548248
13550	NC_022084	TAACT	2	10	681147	681156	40 %	40 %	0 %	20 %	530548248
13551	NC_022084	TAC	2	6	681175	681180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530548248
13552	NC_022084	CAC	2	6	681194	681199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530548248
13553	NC_022084	T	6	6	681208	681213	0 %	100 %	0 %	0 %	530548248
13554	NC_022084	CCT	2	6	681278	681283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530548248
13555	NC_022084	TAC	2	6	681295	681300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530548248
13556	NC_022084	GGGGGA	2	12	681302	681313	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	530548248
13557	NC_022084	G	6	6	681365	681370	0 %	0 %	100 %	0 %	530548248
13558	NC_022084	CTC	2	6	681412	681417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530548248
13559	NC_022084	ATT	2	6	681461	681466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530548248
13560	NC_022084	TTC	2	6	681480	681485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530548248
13561	NC_022084	AACA	2	8	681552	681559	75 %	0 %	0 %	25 %	530548248
13562	NC_022084	TTG	2	6	681629	681634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530548248
13563	NC_022084	ATA	2	6	681706	681711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530548248
13564	NC_022084	CTA	3	9	681726	681734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530548248
13565	NC_022084	AG	3	6	681786	681791	50 %	0 %	50 %	0 %	530548248
13566	NC_022084	AG	3	6	681797	681802	50 %	0 %	50 %	0 %	530548248
13567	NC_022084	CGAG	2	8	681860	681867	25 %	0 %	50 %	25 %	530548248
13568	NC_022084	GGA	2	6	681987	681992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530548248
13569	NC_022084	CT	3	6	682022	682027	0 %	50 %	0 %	50 %	530548249
13570	NC_022084	TCC	2	6	682039	682044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530548249
13571	NC_022084	ATA	2	6	682092	682097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530548249
13572	NC_022084	GTT	2	6	682143	682148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530548249
13573	NC_022084	CAC	2	6	682175	682180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530548249
13574	NC_022084	CAA	2	6	682222	682227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530548249
13575	NC_022084	GGAA	2	8	682253	682260	50 %	0 %	50 %	0 %	530548249
13576	NC_022084	TGC	2	6	682285	682290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530548249
13577	NC_022084	CAA	2	6	682307	682312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530548249
13578	NC_022084	TAT	2	6	682317	682322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530548249
13579	NC_022084	AAG	2	6	682343	682348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530548249
13580	NC_022084	TCCCT	2	10	682422	682431	0 %	40 %	0 %	60 %	530548249
13581	NC_022084	AGA	2	6	682517	682522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530548249
13582	NC_022084	AGAA	2	8	682566	682573	75 %	0 %	25 %	0 %	530548249
13583	NC_022084	ATT	2	6	682603	682608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530548249
13584	NC_022084	TTC	2	6	682622	682627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530548249
13585	NC_022084	CTC	3	9	682728	682736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530548249
13586	NC_022084	AGG	3	9	682760	682768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530548249
13587	NC_022084	CTA	3	9	682868	682876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530548249
13588	NC_022084	AAGG	2	8	682962	682969	50 %	0 %	50 %	0 %	530548249
13589	NC_022084	A	6	6	683053	683058	100 %	0 %	0 %	0 %	530548249
13590	NC_022084	TAA	2	6	683129	683134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530548250
13591	NC_022084	CGA	2	6	683144	683149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530548250
13592	NC_022084	ACA	2	6	683161	683166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530548250
13593	NC_022084	TAG	3	9	683287	683295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530548250
13594	NC_022084	TC	4	8	683368	683375	0 %	50 %	0 %	50 %	530548250
13595	NC_022084	CCAA	2	8	683471	683478	50 %	0 %	0 %	50 %	530548250
13596	NC_022084	AAT	2	6	683512	683517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530548250
13597	NC_022084	CAA	2	6	683547	683552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530548250
13598	NC_022084	CAG	3	9	683652	683660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530548250
13599	NC_022084	ACC	2	6	683695	683700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530548251
13600	NC_022084	AAGCA	2	10	683772	683781	60 %	0 %	20 %	20 %	530548251
13601	NC_022084	AAAT	2	8	683798	683805	75 %	25 %	0 %	0 %	530548251
13602	NC_022084	GGT	2	6	683811	683816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530548251
13603	NC_022084	AGG	2	6	683864	683869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530548252
13604	NC_022084	AT	3	6	683872	683877	50 %	50 %	0 %	0 %	530548252
13605	NC_022084	ACA	2	6	683882	683887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530548252
13606	NC_022084	GTT	2	6	683914	683919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530548252
13607	NC_022084	TAT	2	6	683935	683940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530548252
13608	NC_022084	CT	3	6	683980	683985	0 %	50 %	0 %	50 %	530548252
13609	NC_022084	GAG	2	6	684052	684057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530548252
13610	NC_022084	A	6	6	684196	684201	100 %	0 %	0 %	0 %	530548252
13611	NC_022084	GAA	2	6	684267	684272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530548252
13612	NC_022084	AGA	2	6	684339	684344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530548252
13613	NC_022084	AGGA	2	8	684365	684372	50 %	0 %	50 %	0 %	530548252
13614	NC_022084	TGT	2	6	684381	684386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530548252
13615	NC_022084	GTTAAC	2	12	684418	684429	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	530548252
13616	NC_022084	CTT	2	6	684444	684449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530548252
13617	NC_022084	TTC	2	6	684517	684522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530548252
13618	NC_022084	ACC	2	6	684597	684602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530548252
13619	NC_022084	TGC	2	6	684651	684656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530548252
13620	NC_022084	A	6	6	684674	684679	100 %	0 %	0 %	0 %	530548252
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13622	NC_022084	ACG	2	6	684830	684835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530548252
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13743	NC_022084	A	7	7	690572	690578	100 %	0 %	0 %	0 %	530548259
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13986	NC_022084	GTC	2	6	703391	703396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530548273
13987	NC_022084	AAG	2	6	703399	703404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530548273
13988	NC_022084	CTT	2	6	703421	703426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530548273
13989	NC_022084	TAA	2	6	703448	703453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530548274
13990	NC_022084	GAA	2	6	703478	703483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530548274
13991	NC_022084	ACAT	2	8	703485	703492	50 %	25 %	0 %	25 %	530548274
13992	NC_022084	TGGAAG	2	12	703509	703520	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	530548274
13993	NC_022084	GTC	2	6	703521	703526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530548274
13994	NC_022084	AGA	2	6	703635	703640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530548275
13995	NC_022084	GAG	2	6	703667	703672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530548275
13996	NC_022084	AGG	2	6	703683	703688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530548275
13997	NC_022084	GAA	2	6	703690	703695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530548275
13998	NC_022084	GAG	2	6	703739	703744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530548275
13999	NC_022084	AGA	2	6	703758	703763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530548275
14000	NC_022084	CTTTA	2	10	703814	703823	20 %	60 %	0 %	20 %	530548276

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