MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus litoralis DSM 5473

Total Repeats: 43830

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_022084	TGA	2	6	655634	655639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530548216
13002	NC_022084	AG	3	6	655756	655761	50 %	0 %	50 %	0 %	530548216
13003	NC_022084	TACA	2	8	655809	655816	50 %	25 %	0 %	25 %	530548216
13004	NC_022084	TAC	2	6	655921	655926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530548216
13005	NC_022084	CAAA	2	8	656067	656074	75 %	0 %	0 %	25 %	530548216
13006	NC_022084	T	7	7	656088	656094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13007	NC_022084	TCC	2	6	656146	656151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530548217
13008	NC_022084	ACA	2	6	656154	656159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530548217
13009	NC_022084	TCC	2	6	656266	656271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530548217
13010	NC_022084	AAG	2	6	656361	656366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530548217
13011	NC_022084	ATT	2	6	656489	656494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530548217
13012	NC_022084	CTC	2	6	656500	656505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530548217
13013	NC_022084	GGA	2	6	656646	656651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530548217
13014	NC_022084	GA	3	6	656650	656655	50 %	0 %	50 %	0 %	530548217
13015	NC_022084	AGA	2	6	656668	656673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530548217
13016	NC_022084	TTGCAG	2	12	656683	656694	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	530548217
13017	NC_022084	T	6	6	656728	656733	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13018	NC_022084	CTA	2	6	656748	656753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13019	NC_022084	GA	3	6	656903	656908	50 %	0 %	50 %	0 %	530548218
13020	NC_022084	AAG	2	6	656927	656932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530548218
13021	NC_022084	ATA	2	6	657010	657015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530548218
13022	NC_022084	CTTC	2	8	657054	657061	0 %	50 %	0 %	50 %	530548218
13023	NC_022084	CAAA	2	8	657071	657078	75 %	0 %	0 %	25 %	530548218
13024	NC_022084	AGT	2	6	657084	657089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530548218
13025	NC_022084	CA	3	6	657143	657148	50 %	0 %	0 %	50 %	530548218
13026	NC_022084	TCCAC	2	10	657258	657267	20 %	20 %	0 %	60 %	530548218
13027	NC_022084	ACA	2	6	657311	657316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530548218
13028	NC_022084	TAA	2	6	657329	657334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530548218
13029	NC_022084	GTT	2	6	657346	657351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530548218
13030	NC_022084	ATA	2	6	657430	657435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530548218
13031	NC_022084	GAT	2	6	657451	657456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530548218
13032	NC_022084	CCA	2	6	657457	657462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530548218
13033	NC_022084	ATT	2	6	657464	657469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530548218
13034	NC_022084	ATGG	2	8	657579	657586	25 %	25 %	50 %	0 %	530548218
13035	NC_022084	CTC	2	6	657656	657661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530548218
13036	NC_022084	GGA	2	6	657673	657678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530548218
13037	NC_022084	GAC	2	6	657703	657708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530548218
13038	NC_022084	CTA	2	6	657741	657746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530548218
13039	NC_022084	A	6	6	657764	657769	100 %	0 %	0 %	0 %	530548218
13040	NC_022084	TCC	2	6	657794	657799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530548218
13041	NC_022084	ACA	2	6	657815	657820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530548218
13042	NC_022084	CAC	2	6	657847	657852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530548218
13043	NC_022084	AACATC	2	12	657903	657914	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	530548218
13044	NC_022084	AAAC	2	8	657935	657942	75 %	0 %	0 %	25 %	530548218
13045	NC_022084	C	6	6	657942	657947	0 %	0 %	0 %	100 %	530548218
13046	NC_022084	AG	3	6	658152	658157	50 %	0 %	50 %	0 %	530548218
13047	NC_022084	CTT	2	6	658228	658233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530548218
13048	NC_022084	GAAA	2	8	658237	658244	75 %	0 %	25 %	0 %	530548218
13049	NC_022084	TAA	2	6	658307	658312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530548218
13050	NC_022084	GAAAG	2	10	658377	658386	60 %	0 %	40 %	0 %	530548218
13051	NC_022084	CAG	2	6	658478	658483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530548218
13052	NC_022084	ACT	2	6	658508	658513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530548218
13053	NC_022084	ACA	2	6	658636	658641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530548218
13054	NC_022084	AG	3	6	658650	658655	50 %	0 %	50 %	0 %	530548218
13055	NC_022084	GCA	2	6	658675	658680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530548218
13056	NC_022084	TC	4	8	658691	658698	0 %	50 %	0 %	50 %	530548218
13057	NC_022084	AGA	2	6	658717	658722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530548218
13058	NC_022084	CT	3	6	658735	658740	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13059	NC_022084	T	6	6	658740	658745	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13060	NC_022084	AGA	2	6	658768	658773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13061	NC_022084	TTAG	2	8	658846	658853	25 %	50 %	25 %	0 %	530548219
13062	NC_022084	CTT	2	6	658946	658951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530548219
13063	NC_022084	AAAG	2	8	659010	659017	75 %	0 %	25 %	0 %	530548219
13064	NC_022084	AG	3	6	659025	659030	50 %	0 %	50 %	0 %	530548219
13065	NC_022084	GA	3	6	659040	659045	50 %	0 %	50 %	0 %	530548219
13066	NC_022084	GA	3	6	659077	659082	50 %	0 %	50 %	0 %	530548219
13067	NC_022084	A	6	6	659154	659159	100 %	0 %	0 %	0 %	530548219
13068	NC_022084	GTT	2	6	659182	659187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530548219
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13070	NC_022084	TTA	2	6	659207	659212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530548219
13071	NC_022084	AAG	2	6	659236	659241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530548219
13072	NC_022084	CTT	2	6	659265	659270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530548219
13073	NC_022084	AGACGT	2	12	659274	659285	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	530548219
13074	NC_022084	AAG	2	6	659324	659329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530548219
13075	NC_022084	AG	3	6	659328	659333	50 %	0 %	50 %	0 %	530548219
13076	NC_022084	TAA	2	6	659339	659344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530548219
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13078	NC_022084	TAG	2	6	659384	659389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530548219
13079	NC_022084	TGA	2	6	659417	659422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530548219
13080	NC_022084	TCC	2	6	659498	659503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530548220
13081	NC_022084	CTA	2	6	659556	659561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530548220
13082	NC_022084	TA	3	6	659641	659646	50 %	50 %	0 %	0 %	530548220
13083	NC_022084	CTC	2	6	659659	659664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530548220
13084	NC_022084	TCAG	2	8	659675	659682	25 %	25 %	25 %	25 %	530548220
13085	NC_022084	TCT	2	6	659744	659749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530548220
13086	NC_022084	ACC	2	6	659846	659851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530548220
13087	NC_022084	TCTA	2	8	659866	659873	25 %	50 %	0 %	25 %	530548220
13088	NC_022084	TTCTCC	2	12	659957	659968	0 %	50 %	0 %	50 %	530548220
13089	NC_022084	CTT	2	6	659971	659976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530548220
13090	NC_022084	GGA	2	6	660000	660005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530548220
13091	NC_022084	TC	3	6	660009	660014	0 %	50 %	0 %	50 %	530548220
13092	NC_022084	TAT	2	6	660049	660054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530548220
13093	NC_022084	CAA	2	6	660147	660152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530548220
13094	NC_022084	AGG	2	6	660224	660229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530548220
13095	NC_022084	ACT	2	6	660236	660241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530548220
13096	NC_022084	TCA	2	6	660294	660299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530548220
13097	NC_022084	CTA	2	6	660303	660308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530548220
13098	NC_022084	TCA	2	6	660326	660331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530548220
13099	NC_022084	CTTT	2	8	660403	660410	0 %	75 %	0 %	25 %	530548220
13100	NC_022084	AAAC	2	8	660450	660457	75 %	0 %	0 %	25 %	530548220
13101	NC_022084	TCT	2	6	660512	660517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530548220
13102	NC_022084	TC	3	6	660522	660527	0 %	50 %	0 %	50 %	530548220
13103	NC_022084	GA	3	6	660529	660534	50 %	0 %	50 %	0 %	530548220
13104	NC_022084	T	6	6	660535	660540	0 %	100 %	0 %	0 %	530548220
13105	NC_022084	CCTT	2	8	660687	660694	0 %	50 %	0 %	50 %	530548220
13106	NC_022084	TAGA	2	8	660703	660710	50 %	25 %	25 %	0 %	530548220
13107	NC_022084	TTTC	2	8	660851	660858	0 %	75 %	0 %	25 %	530548220
13108	NC_022084	CTT	2	6	660891	660896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530548220
13109	NC_022084	CCT	2	6	660927	660932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530548220
13110	NC_022084	T	6	6	660940	660945	0 %	100 %	0 %	0 %	530548220
13111	NC_022084	TA	3	6	660961	660966	50 %	50 %	0 %	0 %	530548220
13112	NC_022084	GTTTT	2	10	661014	661023	0 %	80 %	20 %	0 %	530548220
13113	NC_022084	CTT	2	6	661124	661129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530548220
13114	NC_022084	CTT	3	9	661137	661145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530548220
13115	NC_022084	AACT	2	8	661174	661181	50 %	25 %	0 %	25 %	530548220
13116	NC_022084	CT	3	6	661226	661231	0 %	50 %	0 %	50 %	530548220
13117	NC_022084	ATT	2	6	661244	661249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530548220
13118	NC_022084	TC	3	6	661262	661267	0 %	50 %	0 %	50 %	530548220
13119	NC_022084	AGAA	2	8	661306	661313	75 %	0 %	25 %	0 %	530548220
13120	NC_022084	ATG	2	6	661340	661345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530548220
13121	NC_022084	TTC	2	6	661357	661362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530548220
13122	NC_022084	AGA	2	6	661372	661377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530548220
13123	NC_022084	CT	3	6	661479	661484	0 %	50 %	0 %	50 %	530548220
13124	NC_022084	CTT	2	6	661488	661493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530548220
13125	NC_022084	TCA	2	6	661541	661546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530548220
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13128	NC_022084	ATA	2	6	661633	661638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13129	NC_022084	AAT	2	6	661662	661667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13130	NC_022084	TC	3	6	661692	661697	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13131	NC_022084	T	6	6	661750	661755	0 %	100 %	0 %	0 %	530548221
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13203	NC_022084	TTTC	2	8	665171	665178	0 %	75 %	0 %	25 %	530548224
13204	NC_022084	AT	3	6	665183	665188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13205	NC_022084	AT	3	6	665195	665200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13219	NC_022084	A	6	6	665784	665789	100 %	0 %	0 %	0 %	530548226
13220	NC_022084	GGAG	2	8	665871	665878	25 %	0 %	75 %	0 %	530548226
13221	NC_022084	AC	3	6	665916	665921	50 %	0 %	0 %	50 %	530548226
13222	NC_022084	GAA	2	6	665950	665955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530548226
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13228	NC_022084	AT	3	6	666245	666250	50 %	50 %	0 %	0 %	530548226
13229	NC_022084	AG	3	6	666363	666368	50 %	0 %	50 %	0 %	530548226
13230	NC_022084	TA	3	6	666387	666392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13231	NC_022084	ATT	2	6	666437	666442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530548227
13232	NC_022084	GGA	2	6	666478	666483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530548227
13233	NC_022084	TAGAAA	2	12	666537	666548	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	530548227
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13235	NC_022084	CCG	2	6	666659	666664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530548227
13236	NC_022084	CGG	2	6	666766	666771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530548227
13237	NC_022084	AACT	2	8	666813	666820	50 %	25 %	0 %	25 %	530548227
13238	NC_022084	AT	3	6	666857	666862	50 %	50 %	0 %	0 %	530548227
13239	NC_022084	ATA	2	6	666890	666895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530548227
13240	NC_022084	AAG	2	6	666943	666948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530548227
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13243	NC_022084	TACA	2	8	667022	667029	50 %	25 %	0 %	25 %	530548227
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13360	NC_022084	AGA	2	6	672152	672157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13362	NC_022084	T	9	9	672179	672187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13363	NC_022084	AATA	2	8	672234	672241	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13365	NC_022084	TCCC	2	8	672306	672313	0 %	25 %	0 %	75 %	530548234
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13487	NC_022084	GA	4	8	677929	677936	50 %	0 %	50 %	0 %	530548242
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13492	NC_022084	T	6	6	678279	678284	0 %	100 %	0 %	0 %	530548243
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