MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus litoralis DSM 5473

Total Repeats: 43830

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12004	NC_022084	TCC	2	6	605553	605558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530548164
12005	NC_022084	AGT	2	6	605608	605613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530548164
12006	NC_022084	T	7	7	605643	605649	0 %	100 %	0 %	0 %	530548164
12007	NC_022084	TAA	2	6	605694	605699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530548164
12008	NC_022084	TGG	2	6	605712	605717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530548164
12009	NC_022084	GC	3	6	605732	605737	0 %	0 %	50 %	50 %	530548164
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12011	NC_022084	GA	3	6	605890	605895	50 %	0 %	50 %	0 %	530548164
12012	NC_022084	GGCAA	2	10	605915	605924	40 %	0 %	40 %	20 %	530548164
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12014	NC_022084	T	6	6	606058	606063	0 %	100 %	0 %	0 %	530548164
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12019	NC_022084	AT	3	6	606365	606370	50 %	50 %	0 %	0 %	530548165
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12121	NC_022084	G	6	6	611050	611055	0 %	0 %	100 %	0 %	530548171
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12127	NC_022084	GGA	2	6	611301	611306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530548171
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12146	NC_022084	ATTT	2	8	612222	612229	25 %	75 %	0 %	0 %	530548172
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12224	NC_022084	TC	3	6	616189	616194	0 %	50 %	0 %	50 %	530548176
12225	NC_022084	GCAATA	2	12	616220	616231	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	530548176
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12227	NC_022084	AAC	2	6	616259	616264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530548176
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12231	NC_022084	TCAT	2	8	616584	616591	25 %	50 %	0 %	25 %	530548176
12232	NC_022084	CGATA	2	10	616666	616675	40 %	20 %	20 %	20 %	530548176
12233	NC_022084	T	6	6	616740	616745	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12234	NC_022084	ACTC	2	8	616784	616791	25 %	25 %	0 %	50 %	530548177
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12239	NC_022084	CTT	2	6	617047	617052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530548177
12240	NC_022084	TCCACT	2	12	617076	617087	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	530548177
12241	NC_022084	CT	3	6	617109	617114	0 %	50 %	0 %	50 %	530548177
12242	NC_022084	ATC	2	6	617155	617160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530548177
12243	NC_022084	TCC	2	6	617180	617185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530548177
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12245	NC_022084	CCA	2	6	617206	617211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530548177
12246	NC_022084	TTC	2	6	617212	617217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530548177
12247	NC_022084	CCA	2	6	617258	617263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530548177
12248	NC_022084	TG	3	6	617289	617294	0 %	50 %	50 %	0 %	530548177
12249	NC_022084	TCA	2	6	617360	617365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530548177
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12251	NC_022084	TCC	2	6	617453	617458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530548177
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12253	NC_022084	CTC	2	6	617612	617617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530548177
12254	NC_022084	CTTGCT	2	12	617722	617733	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	530548177
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12258	NC_022084	GCT	2	6	617949	617954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530548177
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12260	NC_022084	GTA	2	6	618058	618063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530548177
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12262	NC_022084	TAT	2	6	618175	618180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530548177
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12264	NC_022084	CT	3	6	618235	618240	0 %	50 %	0 %	50 %	530548177
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12267	NC_022084	T	6	6	618479	618484	0 %	100 %	0 %	0 %	530548177
12268	NC_022084	CT	3	6	618539	618544	0 %	50 %	0 %	50 %	530548177
12269	NC_022084	TTC	2	6	618650	618655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530548177
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12273	NC_022084	TTA	2	6	618879	618884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530548177
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12276	NC_022084	TCT	2	6	619067	619072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530548177
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12284	NC_022084	CTG	2	6	619624	619629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530548177
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12288	NC_022084	ATG	2	6	619854	619859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12313	NC_022084	TC	3	6	621136	621141	0 %	50 %	0 %	50 %	530548180
12314	NC_022084	TCAAT	2	10	621174	621183	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12315	NC_022084	T	6	6	621231	621236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12316	NC_022084	TAC	2	6	621302	621307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530548181
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12319	NC_022084	A	6	6	621546	621551	100 %	0 %	0 %	0 %	530548181
12320	NC_022084	TCT	3	9	621670	621678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12321	NC_022084	AATT	2	8	621683	621690	50 %	50 %	0 %	0 %	530548182
12322	NC_022084	TCT	2	6	621708	621713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530548182
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12325	NC_022084	T	6	6	621787	621792	0 %	100 %	0 %	0 %	530548182
12326	NC_022084	ATT	2	6	621810	621815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530548182
12327	NC_022084	AAAC	2	8	621871	621878	75 %	0 %	0 %	25 %	530548182
12328	NC_022084	GGAT	2	8	621888	621895	25 %	25 %	50 %	0 %	530548182
12329	NC_022084	TAA	2	6	621928	621933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530548182
12330	NC_022084	CAT	2	6	621943	621948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530548182
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12334	NC_022084	CTCC	2	8	622117	622124	0 %	25 %	0 %	75 %	530548182
12335	NC_022084	CTT	2	6	622139	622144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530548182
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12337	NC_022084	TCA	2	6	622290	622295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530548182
12338	NC_022084	CTG	2	6	622333	622338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530548182
12339	NC_022084	GCTTT	2	10	622345	622354	0 %	60 %	20 %	20 %	530548182
12340	NC_022084	CT	3	6	622374	622379	0 %	50 %	0 %	50 %	530548182
12341	NC_022084	T	6	6	622409	622414	0 %	100 %	0 %	0 %	530548182
12342	NC_022084	TGA	2	6	622508	622513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530548182
12343	NC_022084	ATC	3	9	622539	622547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530548182
12344	NC_022084	TTA	2	6	622592	622597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12345	NC_022084	TGTA	2	8	622677	622684	25 %	50 %	25 %	0 %	530548183
12346	NC_022084	TTC	2	6	622731	622736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530548183
12347	NC_022084	AG	3	6	622794	622799	50 %	0 %	50 %	0 %	530548183
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12350	NC_022084	CTT	2	6	622874	622879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530548183
12351	NC_022084	GAG	2	6	622891	622896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530548183
12352	NC_022084	AG	3	6	622930	622935	50 %	0 %	50 %	0 %	530548183
12353	NC_022084	GAG	2	6	622945	622950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530548183
12354	NC_022084	GGGAT	2	10	622966	622975	20 %	20 %	60 %	0 %	530548183
12355	NC_022084	AGG	2	6	622987	622992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530548183
12356	NC_022084	GCAG	2	8	622993	623000	25 %	0 %	50 %	25 %	530548183
12357	NC_022084	CTT	2	6	623015	623020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530548183
12358	NC_022084	GTT	2	6	623083	623088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530548183
12359	NC_022084	GAA	2	6	623168	623173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530548183
12360	NC_022084	AT	3	6	623189	623194	50 %	50 %	0 %	0 %	530548183
12361	NC_022084	AG	3	6	623237	623242	50 %	0 %	50 %	0 %	530548183
12362	NC_022084	ATA	2	6	623345	623350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530548183
12363	NC_022084	AAC	2	6	623389	623394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530548183
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12365	NC_022084	ATA	2	6	623576	623581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530548183
12366	NC_022084	GAG	2	6	623588	623593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530548183
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12481	NC_022084	AT	3	6	629473	629478	50 %	50 %	0 %	0 %	530548189
12482	NC_022084	AAT	2	6	629515	629520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530548189
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12485	NC_022084	TTTC	2	8	629974	629981	0 %	75 %	0 %	25 %	530548189
12486	NC_022084	TTC	2	6	630128	630133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530548189
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12490	NC_022084	GCG	2	6	630270	630275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530548189
12491	NC_022084	CTT	2	6	630341	630346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530548189
12492	NC_022084	CCA	2	6	630351	630356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530548189
12493	NC_022084	TTC	2	6	630401	630406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530548189
12494	NC_022084	TGG	2	6	630444	630449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530548189
12495	NC_022084	CTT	2	6	630473	630478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530548189
12496	NC_022084	CAA	2	6	630498	630503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530548189
12497	NC_022084	TA	3	6	630546	630551	50 %	50 %	0 %	0 %	530548189
12498	NC_022084	TGT	2	6	630598	630603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530548189
12499	NC_022084	AG	3	6	630623	630628	50 %	0 %	50 %	0 %	530548189
12500	NC_022084	GGA	2	6	630682	630687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530548189

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