MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus litoralis DSM 5473

Total Repeats: 43830

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_022084	CTT	2	6	553350	553355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530548095
11002	NC_022084	AGC	2	6	553375	553380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530548095
11003	NC_022084	TC	3	6	553392	553397	0 %	50 %	0 %	50 %	530548095
11004	NC_022084	CAA	2	6	553404	553409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530548095
11005	NC_022084	ATA	2	6	553414	553419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530548095
11006	NC_022084	TG	3	6	553447	553452	0 %	50 %	50 %	0 %	530548095
11007	NC_022084	GGA	2	6	553493	553498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530548095
11008	NC_022084	AAG	2	6	553516	553521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530548095
11009	NC_022084	T	6	6	553534	553539	0 %	100 %	0 %	0 %	530548095
11010	NC_022084	TTCCA	2	10	553557	553566	20 %	40 %	0 %	40 %	530548095
11011	NC_022084	A	6	6	553642	553647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11012	NC_022084	AGA	2	6	553679	553684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11013	NC_022084	GGC	2	6	553723	553728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530548096
11014	NC_022084	TCG	3	9	553739	553747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530548096
11015	NC_022084	CT	3	6	553752	553757	0 %	50 %	0 %	50 %	530548096
11016	NC_022084	CTT	2	6	553805	553810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530548096
11017	NC_022084	CAA	3	9	553869	553877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530548096
11018	NC_022084	CTT	2	6	553895	553900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530548096
11019	NC_022084	AAC	2	6	553909	553914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530548096
11020	NC_022084	T	6	6	553961	553966	0 %	100 %	0 %	0 %	530548097
11021	NC_022084	GGT	2	6	553994	553999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530548097
11022	NC_022084	GGC	2	6	554004	554009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530548097
11023	NC_022084	TAA	2	6	554054	554059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530548097
11024	NC_022084	GA	3	6	554074	554079	50 %	0 %	50 %	0 %	530548097
11025	NC_022084	CCT	2	6	554156	554161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530548097
11026	NC_022084	CT	4	8	554175	554182	0 %	50 %	0 %	50 %	530548097
11027	NC_022084	T	6	6	554242	554247	0 %	100 %	0 %	0 %	530548097
11028	NC_022084	CCAT	2	8	554249	554256	25 %	25 %	0 %	50 %	530548097
11029	NC_022084	TCT	2	6	554310	554315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530548097
11030	NC_022084	AG	3	6	554459	554464	50 %	0 %	50 %	0 %	530548097
11031	NC_022084	CTT	3	9	554722	554730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530548098
11032	NC_022084	TCT	2	6	554776	554781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530548098
11033	NC_022084	T	6	6	554831	554836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11034	NC_022084	GCA	2	6	554839	554844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11035	NC_022084	ACC	2	6	555028	555033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530548099
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11037	NC_022084	GCT	2	6	555136	555141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530548099
11038	NC_022084	TTG	2	6	555143	555148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530548099
11039	NC_022084	TCT	2	6	555163	555168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530548099
11040	NC_022084	T	6	6	555220	555225	0 %	100 %	0 %	0 %	530548099
11041	NC_022084	T	6	6	555230	555235	0 %	100 %	0 %	0 %	530548099
11042	NC_022084	T	6	6	555238	555243	0 %	100 %	0 %	0 %	530548099
11043	NC_022084	TAC	2	6	555308	555313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530548099
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11045	NC_022084	TGCAT	2	10	555487	555496	20 %	40 %	20 %	20 %	530548100
11046	NC_022084	TCT	2	6	555585	555590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530548100
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11050	NC_022084	TTC	2	6	555726	555731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530548100
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11052	NC_022084	AG	3	6	556000	556005	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11053	NC_022084	T	6	6	556031	556036	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11054	NC_022084	ATGA	2	8	556042	556049	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11055	NC_022084	A	7	7	556051	556057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11056	NC_022084	GAA	2	6	556068	556073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530548101
11057	NC_022084	CT	3	6	556107	556112	0 %	50 %	0 %	50 %	530548101
11058	NC_022084	TTC	2	6	556119	556124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530548101
11059	NC_022084	TTCCAG	2	12	556160	556171	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	530548101
11060	NC_022084	CAA	2	6	556205	556210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530548101
11061	NC_022084	TA	3	6	556248	556253	50 %	50 %	0 %	0 %	530548101
11062	NC_022084	AT	3	6	556451	556456	50 %	50 %	0 %	0 %	530548101
11063	NC_022084	GGT	2	6	556462	556467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530548101
11064	NC_022084	ACAT	2	8	556612	556619	50 %	25 %	0 %	25 %	530548101
11065	NC_022084	AAC	2	6	556698	556703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530548101
11066	NC_022084	AAG	2	6	556708	556713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530548101
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11068	NC_022084	TAT	2	6	556821	556826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530548101
11069	NC_022084	ACC	2	6	556833	556838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530548101
11070	NC_022084	TGT	2	6	556863	556868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530548101
11071	NC_022084	GCA	2	6	556912	556917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530548101
11072	NC_022084	ATT	2	6	556981	556986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530548101
11073	NC_022084	CCA	2	6	556987	556992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530548101
11074	NC_022084	GAG	2	6	557010	557015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530548101
11075	NC_022084	GCC	2	6	557068	557073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530548101
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11078	NC_022084	TAT	2	6	557157	557162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530548101
11079	NC_022084	AC	3	6	557228	557233	50 %	0 %	0 %	50 %	530548101
11080	NC_022084	ACT	2	6	557254	557259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530548101
11081	NC_022084	ACA	2	6	557330	557335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530548101
11082	NC_022084	ATGC	2	8	557408	557415	25 %	25 %	25 %	25 %	530548101
11083	NC_022084	ATT	2	6	557428	557433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530548101
11084	NC_022084	ATT	2	6	557467	557472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11085	NC_022084	A	7	7	557480	557486	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11086	NC_022084	CAAG	2	8	557488	557495	50 %	0 %	25 %	25 %	530547451
11087	NC_022084	ATT	2	6	557518	557523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530547451
11088	NC_022084	AAT	2	6	557625	557630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530547451
11089	NC_022084	CTTC	2	8	557632	557639	0 %	50 %	0 %	50 %	530547451
11090	NC_022084	TC	3	6	557714	557719	0 %	50 %	0 %	50 %	530547451
11091	NC_022084	TGA	2	6	557777	557782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530547451
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11094	NC_022084	CTT	2	6	557859	557864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530547451
11095	NC_022084	CCAT	2	8	557874	557881	25 %	25 %	0 %	50 %	530547451
11096	NC_022084	TTTC	2	8	557913	557920	0 %	75 %	0 %	25 %	530547451
11097	NC_022084	ATC	2	6	557926	557931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530547451
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11099	NC_022084	TCT	2	6	558015	558020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530548102
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11101	NC_022084	CTC	2	6	558157	558162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530548102
11102	NC_022084	CT	3	6	558168	558173	0 %	50 %	0 %	50 %	530548102
11103	NC_022084	CT	3	6	558192	558197	0 %	50 %	0 %	50 %	530548102
11104	NC_022084	GTC	2	6	558289	558294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530548102
11105	NC_022084	GGT	2	6	558306	558311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530548102
11106	NC_022084	CTCAC	2	10	558411	558420	20 %	20 %	0 %	60 %	530548103
11107	NC_022084	ACCA	2	8	558447	558454	50 %	0 %	0 %	50 %	530548103
11108	NC_022084	ATC	2	6	558472	558477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530548103
11109	NC_022084	TCT	2	6	558605	558610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530548103
11110	NC_022084	CCTT	2	8	558788	558795	0 %	50 %	0 %	50 %	530548103
11111	NC_022084	GTCA	2	8	558897	558904	25 %	25 %	25 %	25 %	530548103
11112	NC_022084	AGGA	2	8	558960	558967	50 %	0 %	50 %	0 %	530548103
11113	NC_022084	CTT	2	6	559040	559045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530548103
11114	NC_022084	TG	3	6	559327	559332	0 %	50 %	50 %	0 %	530547452
11115	NC_022084	GAG	2	6	559469	559474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530547452
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11117	NC_022084	TCCA	2	8	559507	559514	25 %	25 %	0 %	50 %	530547452
11118	NC_022084	CT	3	6	559529	559534	0 %	50 %	0 %	50 %	530547452
11119	NC_022084	TG	3	6	559535	559540	0 %	50 %	50 %	0 %	530547452
11120	NC_022084	AAC	2	6	559547	559552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530547452
11121	NC_022084	TGG	2	6	559596	559601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530547452
11122	NC_022084	TAGT	2	8	559665	559672	25 %	50 %	25 %	0 %	530547452
11123	NC_022084	CCTTC	2	10	559677	559686	0 %	40 %	0 %	60 %	530547452
11124	NC_022084	TTC	3	9	559684	559692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530547452
11125	NC_022084	TCC	2	6	559754	559759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530548104
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11127	NC_022084	TCA	2	6	559835	559840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530548104
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11131	NC_022084	TCT	2	6	559929	559934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530548104
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11142	NC_022084	CCTTT	2	10	560402	560411	0 %	60 %	0 %	40 %	530548105
11143	NC_022084	CTGT	2	8	560431	560438	0 %	50 %	25 %	25 %	530548105
11144	NC_022084	TCC	2	6	560450	560455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530548105
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11150	NC_022084	CTT	2	6	561099	561104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530548106
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11152	NC_022084	CCA	2	6	561165	561170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530548107
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11195	NC_022084	ATACT	2	10	563407	563416	40 %	40 %	0 %	20 %	530548112
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11229	NC_022084	CTT	2	6	564945	564950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530548117
11230	NC_022084	TGG	2	6	564997	565002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530548117
11231	NC_022084	CAG	2	6	565077	565082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530548117
11232	NC_022084	AT	3	6	565100	565105	50 %	50 %	0 %	0 %	530548117
11233	NC_022084	CCAAA	2	10	565326	565335	60 %	0 %	0 %	40 %	530548117
11234	NC_022084	TC	3	6	565339	565344	0 %	50 %	0 %	50 %	530548117
11235	NC_022084	TTC	2	6	565371	565376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530548117
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11237	NC_022084	AAC	2	6	565417	565422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530548117
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11239	NC_022084	TCC	2	6	565456	565461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530548117
11240	NC_022084	TC	3	6	565537	565542	0 %	50 %	0 %	50 %	530548117
11241	NC_022084	CCT	2	6	565559	565564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530548118
11242	NC_022084	CAA	2	6	565573	565578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530548118
11243	NC_022084	TG	3	6	565588	565593	0 %	50 %	50 %	0 %	530548118
11244	NC_022084	GTAT	2	8	565636	565643	25 %	50 %	25 %	0 %	530548118
11245	NC_022084	GAT	2	6	565679	565684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530548118
11246	NC_022084	TCTGC	2	10	565711	565720	0 %	40 %	20 %	40 %	530548118
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11249	NC_022084	TCT	2	6	565744	565749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530548118
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11257	NC_022084	TACC	2	8	566021	566028	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11258	NC_022084	TGA	2	6	566053	566058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530548119
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11265	NC_022084	ACC	2	6	566435	566440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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11345	NC_022084	AT	3	6	570531	570536	50 %	50 %	0 %	0 %	530548125
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11348	NC_022084	A	7	7	570683	570689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11349	NC_022084	GAACA	2	10	570707	570716	60 %	0 %	20 %	20 %	530548126
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11351	NC_022084	CT	3	6	570769	570774	0 %	50 %	0 %	50 %	530548126
11352	NC_022084	CAT	2	6	570801	570806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530548126
11353	NC_022084	ACTC	2	8	570930	570937	25 %	25 %	0 %	50 %	530548126
11354	NC_022084	CT	3	6	570967	570972	0 %	50 %	0 %	50 %	530548126
11355	NC_022084	GTT	2	6	571071	571076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530548126
11356	NC_022084	TAG	2	6	571083	571088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530548126
11357	NC_022084	TTGCC	2	10	571115	571124	0 %	40 %	20 %	40 %	530548126
11358	NC_022084	GTT	2	6	571140	571145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530548126
11359	NC_022084	CACC	2	8	571163	571170	25 %	0 %	0 %	75 %	530548126
11360	NC_022084	ACT	2	6	571219	571224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530548126
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11362	NC_022084	ACTT	2	8	571275	571282	25 %	50 %	0 %	25 %	530548126
11363	NC_022084	TA	3	6	571297	571302	50 %	50 %	0 %	0 %	530548126
11364	NC_022084	CAT	2	6	571310	571315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530548126
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11487	NC_022084	TGG	2	6	578095	578100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530548132
11488	NC_022084	CAGCGT	2	12	578110	578121	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	530548132
11489	NC_022084	TTC	2	6	578122	578127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530548132
11490	NC_022084	GGC	2	6	578132	578137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530548132
11491	NC_022084	CTA	2	6	578160	578165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530548132
11492	NC_022084	GTC	2	6	578172	578177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530548132
11493	NC_022084	CCCA	2	8	578189	578196	25 %	0 %	0 %	75 %	530548132
11494	NC_022084	ATGT	2	8	578322	578329	25 %	50 %	25 %	0 %	530548132
11495	NC_022084	CTTA	2	8	578401	578408	25 %	50 %	0 %	25 %	530548132
11496	NC_022084	CAG	2	6	578428	578433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530548132
11497	NC_022084	TAT	2	6	578448	578453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530548132
11498	NC_022084	TTC	2	6	578562	578567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530548132
11499	NC_022084	CTG	3	9	578625	578633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530548132
11500	NC_022084	TGG	2	6	578644	578649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530548132

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