MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus litoralis DSM 5473

Total Repeats: 43830

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_022084	CTC	2	6	431456	431461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530547941
8502	NC_022084	CCA	2	6	431560	431565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530547941
8503	NC_022084	TGG	2	6	431584	431589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530547941
8504	NC_022084	GTTAT	2	10	431603	431612	20 %	60 %	20 %	0 %	530547941
8505	NC_022084	TGT	2	6	431643	431648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530547941
8506	NC_022084	GGGA	2	8	431735	431742	25 %	0 %	75 %	0 %	530547941
8507	NC_022084	TTA	2	6	431817	431822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530547941
8508	NC_022084	CAA	2	6	431892	431897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530547941
8509	NC_022084	T	6	6	431951	431956	0 %	100 %	0 %	0 %	530547941
8510	NC_022084	TG	4	8	432023	432030	0 %	50 %	50 %	0 %	530547941
8511	NC_022084	AG	3	6	432073	432078	50 %	0 %	50 %	0 %	530547941
8512	NC_022084	GAT	2	6	432097	432102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530547941
8513	NC_022084	CTT	2	6	432130	432135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530547941
8514	NC_022084	TAA	2	6	432152	432157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530547941
8515	NC_022084	CTG	2	6	432165	432170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530547941
8516	NC_022084	CAA	2	6	432306	432311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530547941
8517	NC_022084	TGCCT	2	10	432325	432334	0 %	40 %	20 %	40 %	530547941
8518	NC_022084	TAT	2	6	432364	432369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530547941
8519	NC_022084	TAA	2	6	432435	432440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530547941
8520	NC_022084	AT	3	6	432469	432474	50 %	50 %	0 %	0 %	530547941
8521	NC_022084	GGA	2	6	432515	432520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530547941
8522	NC_022084	TGT	2	6	432594	432599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530547941
8523	NC_022084	AAT	2	6	432624	432629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530547941
8524	NC_022084	AT	3	6	432705	432710	50 %	50 %	0 %	0 %	530547941
8525	NC_022084	CTT	2	6	432732	432737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530547941
8526	NC_022084	GTC	2	6	432740	432745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530547941
8527	NC_022084	GAA	2	6	432749	432754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530547941
8528	NC_022084	ATC	2	6	432982	432987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530547941
8529	NC_022084	ATCT	2	8	432991	432998	25 %	50 %	0 %	25 %	530547941
8530	NC_022084	TTC	2	6	433045	433050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530547941
8531	NC_022084	TACA	2	8	433093	433100	50 %	25 %	0 %	25 %	530547941
8532	NC_022084	T	6	6	433103	433108	0 %	100 %	0 %	0 %	530547941
8533	NC_022084	AAT	2	6	433119	433124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530547941
8534	NC_022084	ATC	2	6	433162	433167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530547941
8535	NC_022084	ATC	2	6	433201	433206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530547941
8536	NC_022084	ATTTT	2	10	433302	433311	20 %	80 %	0 %	0 %	530547941
8537	NC_022084	CTT	2	6	433341	433346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530547941
8538	NC_022084	TCCA	2	8	433348	433355	25 %	25 %	0 %	50 %	530547941
8539	NC_022084	GATC	2	8	433362	433369	25 %	25 %	25 %	25 %	530547941
8540	NC_022084	TCA	2	6	433458	433463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530547941
8541	NC_022084	TCC	3	9	433466	433474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8542	NC_022084	CTT	2	6	433536	433541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530547942
8543	NC_022084	CT	3	6	433605	433610	0 %	50 %	0 %	50 %	530547942
8544	NC_022084	TCC	2	6	433625	433630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530547942
8545	NC_022084	GGC	2	6	433635	433640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530547942
8546	NC_022084	TC	3	6	433734	433739	0 %	50 %	0 %	50 %	530547942
8547	NC_022084	ATC	2	6	433805	433810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530547942
8548	NC_022084	TCA	2	6	433872	433877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530547942
8549	NC_022084	AT	3	6	433890	433895	50 %	50 %	0 %	0 %	530547942
8550	NC_022084	AGC	2	6	433902	433907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530547942
8551	NC_022084	TC	3	6	433909	433914	0 %	50 %	0 %	50 %	530547942
8552	NC_022084	TTC	2	6	434015	434020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530547942
8553	NC_022084	CT	3	6	434060	434065	0 %	50 %	0 %	50 %	530547942
8554	NC_022084	TAAT	2	8	434070	434077	50 %	50 %	0 %	0 %	530547942
8555	NC_022084	TC	3	6	434093	434098	0 %	50 %	0 %	50 %	530547942
8556	NC_022084	CT	3	6	434124	434129	0 %	50 %	0 %	50 %	530547942
8557	NC_022084	CTCTG	2	10	434192	434201	0 %	40 %	20 %	40 %	530547942
8558	NC_022084	CAT	2	6	434243	434248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530547942
8559	NC_022084	CTGTGG	2	12	434332	434343	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	530547942
8560	NC_022084	TAT	2	6	434345	434350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530547942
8561	NC_022084	CTT	2	6	434377	434382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530547942
8562	NC_022084	AGA	2	6	434386	434391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530547942
8563	NC_022084	TGT	2	6	434470	434475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530547942
8564	NC_022084	AAGG	2	8	434521	434528	50 %	0 %	50 %	0 %	530547942
8565	NC_022084	TCT	2	6	434557	434562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530547942
8566	NC_022084	ACA	2	6	434607	434612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530547942
8567	NC_022084	CTT	2	6	434678	434683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530547942
8568	NC_022084	T	6	6	434682	434687	0 %	100 %	0 %	0 %	530547942
8569	NC_022084	CT	3	6	434711	434716	0 %	50 %	0 %	50 %	530547942
8570	NC_022084	ACTTTC	2	12	434778	434789	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	530547942
8571	NC_022084	AAT	2	6	434821	434826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530547942
8572	NC_022084	CTT	2	6	434955	434960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530547943
8573	NC_022084	GAC	2	6	434999	435004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530547943
8574	NC_022084	CT	3	6	435100	435105	0 %	50 %	0 %	50 %	530547943
8575	NC_022084	ATT	2	6	435183	435188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530547943
8576	NC_022084	T	6	6	435215	435220	0 %	100 %	0 %	0 %	530547943
8577	NC_022084	TCC	2	6	435333	435338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530547943
8578	NC_022084	AC	3	6	435347	435352	50 %	0 %	0 %	50 %	530547943
8579	NC_022084	TCA	2	6	435370	435375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530547943
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8582	NC_022084	AAC	2	6	435800	435805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530547944
8583	NC_022084	TCA	2	6	435807	435812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530547944
8584	NC_022084	CAA	2	6	435880	435885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530547944
8585	NC_022084	TCT	2	6	435894	435899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530547944
8586	NC_022084	AGCAG	2	10	435921	435930	40 %	0 %	40 %	20 %	530547944
8587	NC_022084	AAG	2	6	436035	436040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530547944
8588	NC_022084	CAA	2	6	436137	436142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530547945
8589	NC_022084	GAA	2	6	436238	436243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530547945
8590	NC_022084	TTC	2	6	436264	436269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530547945
8591	NC_022084	C	6	6	436338	436343	0 %	0 %	0 %	100 %	530547945
8592	NC_022084	AGAA	2	8	436357	436364	75 %	0 %	25 %	0 %	530547945
8593	NC_022084	TCT	2	6	436395	436400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530547945
8594	NC_022084	ATTTC	2	10	436451	436460	20 %	60 %	0 %	20 %	530547945
8595	NC_022084	TCA	2	6	436517	436522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530547945
8596	NC_022084	AGG	2	6	436525	436530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530547945
8597	NC_022084	AGT	2	6	436557	436562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530547945
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8600	NC_022084	TGG	2	6	436744	436749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530547945
8601	NC_022084	TGG	2	6	436774	436779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530547945
8602	NC_022084	AAC	2	6	436795	436800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530547945
8603	NC_022084	A	6	6	436847	436852	100 %	0 %	0 %	0 %	530547945
8604	NC_022084	TCC	2	6	436896	436901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530547945
8605	NC_022084	TTA	2	6	436917	436922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530547945
8606	NC_022084	ATC	2	6	436931	436936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530547945
8607	NC_022084	T	6	6	436972	436977	0 %	100 %	0 %	0 %	530547946
8608	NC_022084	GAG	2	6	436996	437001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530547946
8609	NC_022084	CCA	2	6	437002	437007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530547946
8610	NC_022084	TCTTT	2	10	437067	437076	0 %	80 %	0 %	20 %	530547946
8611	NC_022084	C	6	6	437125	437130	0 %	0 %	0 %	100 %	530547947
8612	NC_022084	TGA	2	6	437146	437151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530547947
8613	NC_022084	TCC	2	6	437185	437190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530547947
8614	NC_022084	T	6	6	437230	437235	0 %	100 %	0 %	0 %	530547947
8615	NC_022084	ATC	2	6	437269	437274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530547947
8616	NC_022084	TTA	2	6	437435	437440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530547947
8617	NC_022084	TCCT	2	8	437454	437461	0 %	50 %	0 %	50 %	530547947
8618	NC_022084	CT	3	6	437460	437465	0 %	50 %	0 %	50 %	530547947
8619	NC_022084	CTC	2	6	437532	437537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530547947
8620	NC_022084	AAG	2	6	437569	437574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530547947
8621	NC_022084	AG	3	6	437610	437615	50 %	0 %	50 %	0 %	530547947
8622	NC_022084	CT	3	6	437616	437621	0 %	50 %	0 %	50 %	530547947
8623	NC_022084	CTT	2	6	437661	437666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530547947
8624	NC_022084	ACC	2	6	437763	437768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530547948
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8998	NC_022084	TCAC	2	8	455888	455895	25 %	25 %	0 %	50 %	530547968
8999	NC_022084	TCA	2	6	455922	455927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530547968
9000	NC_022084	CAA	2	6	455962	455967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530547968

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