MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus litoralis DSM 5473

Total Repeats: 43830

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_022084	A	6	6	379327	379332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7502	NC_022084	AGTGG	2	10	379337	379346	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
7503	NC_022084	GAA	2	6	379360	379365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530547881
7504	NC_022084	AGA	2	6	379368	379373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530547881
7505	NC_022084	GAA	2	6	379393	379398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530547881
7506	NC_022084	A	6	6	379397	379402	100 %	0 %	0 %	0 %	530547881
7507	NC_022084	GTTG	2	8	379479	379486	0 %	50 %	50 %	0 %	530547881
7508	NC_022084	CCA	2	6	379529	379534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530547881
7509	NC_022084	TAA	2	6	379685	379690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530547881
7510	NC_022084	TCAC	2	8	379691	379698	25 %	25 %	0 %	50 %	530547881
7511	NC_022084	TTC	2	6	379704	379709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530547881
7512	NC_022084	AAAG	2	8	379728	379735	75 %	0 %	25 %	0 %	530547881
7513	NC_022084	ATT	2	6	379797	379802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530547881
7514	NC_022084	GAA	2	6	379819	379824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530547881
7515	NC_022084	AAAG	2	8	379875	379882	75 %	0 %	25 %	0 %	530547881
7516	NC_022084	TTGG	2	8	379894	379901	0 %	50 %	50 %	0 %	530547881
7517	NC_022084	ACA	2	6	379907	379912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530547881
7518	NC_022084	TGCC	2	8	379965	379972	0 %	25 %	25 %	50 %	530547881
7519	NC_022084	GCG	2	6	379999	380004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530547881
7520	NC_022084	CA	3	6	380077	380082	50 %	0 %	0 %	50 %	530547881
7521	NC_022084	ATA	2	6	380083	380088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530547881
7522	NC_022084	AAT	2	6	380133	380138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530547881
7523	NC_022084	CTC	2	6	380375	380380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530547882
7524	NC_022084	TTC	2	6	380399	380404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530547882
7525	NC_022084	TG	3	6	380602	380607	0 %	50 %	50 %	0 %	530547882
7526	NC_022084	CCAT	2	8	380693	380700	25 %	25 %	0 %	50 %	530547882
7527	NC_022084	GAAA	2	8	380752	380759	75 %	0 %	25 %	0 %	530547882
7528	NC_022084	GTA	3	9	380801	380809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530547882
7529	NC_022084	TAT	2	6	380837	380842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530547882
7530	NC_022084	TCT	2	6	380848	380853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530547882
7531	NC_022084	CAC	2	6	380860	380865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7532	NC_022084	A	6	6	380871	380876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7533	NC_022084	CTA	2	6	380916	380921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7534	NC_022084	GAG	2	6	381035	381040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530635852
7535	NC_022084	CGAGGG	2	12	381248	381259	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	530635852
7536	NC_022084	TCA	2	6	381283	381288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530635852
7537	NC_022084	ATACC	2	10	381304	381313	40 %	20 %	0 %	40 %	530635852
7538	NC_022084	GTT	2	6	381375	381380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530635852
7539	NC_022084	CCT	2	6	381381	381386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530635852
7540	NC_022084	GAC	2	6	381429	381434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530635852
7541	NC_022084	AGT	2	6	381458	381463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530635852
7542	NC_022084	CAC	2	6	381501	381506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530547884
7543	NC_022084	TTC	2	6	381508	381513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530547884
7544	NC_022084	CTT	2	6	381517	381522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530547884
7545	NC_022084	CCA	2	6	381601	381606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530547884
7546	NC_022084	GTG	2	6	381656	381661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530547884
7547	NC_022084	AC	3	6	381665	381670	50 %	0 %	0 %	50 %	530547884
7548	NC_022084	GAA	2	6	381789	381794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530547884
7549	NC_022084	TGT	2	6	381990	381995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530547884
7550	NC_022084	CTT	2	6	382003	382008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530547884
7551	NC_022084	TC	3	6	382009	382014	0 %	50 %	0 %	50 %	530547884
7552	NC_022084	TC	3	6	382045	382050	0 %	50 %	0 %	50 %	530547884
7553	NC_022084	TTGT	2	8	382062	382069	0 %	75 %	25 %	0 %	530547884
7554	NC_022084	CTTGG	2	10	382077	382086	0 %	40 %	40 %	20 %	530547884
7555	NC_022084	GTT	2	6	382167	382172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530547884
7556	NC_022084	GT	3	6	382213	382218	0 %	50 %	50 %	0 %	530547884
7557	NC_022084	GAG	2	6	382228	382233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530547884
7558	NC_022084	GGT	2	6	382260	382265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7559	NC_022084	ACC	2	6	382290	382295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7560	NC_022084	TAT	2	6	382296	382301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7561	NC_022084	CCCT	2	8	382343	382350	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
7562	NC_022084	CCCG	2	8	382366	382373	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7563	NC_022084	TGA	2	6	382427	382432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530547885
7564	NC_022084	GA	3	6	382549	382554	50 %	0 %	50 %	0 %	530547885
7565	NC_022084	GAA	2	6	382629	382634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530547885
7566	NC_022084	GAG	2	6	382683	382688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530547885
7567	NC_022084	AATG	2	8	382715	382722	50 %	25 %	25 %	0 %	530547885
7568	NC_022084	A	6	6	382795	382800	100 %	0 %	0 %	0 %	530547885
7569	NC_022084	TCC	2	6	382810	382815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530547885
7570	NC_022084	CAACT	2	10	382847	382856	40 %	20 %	0 %	40 %	530547885
7571	NC_022084	CCT	2	6	382859	382864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530547885
7572	NC_022084	A	6	6	382891	382896	100 %	0 %	0 %	0 %	530547885
7573	NC_022084	TCG	2	6	382918	382923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530547885
7574	NC_022084	GTT	2	6	382932	382937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530547885
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7577	NC_022084	GAATT	2	10	383050	383059	40 %	40 %	20 %	0 %	530547885
7578	NC_022084	AG	3	6	383080	383085	50 %	0 %	50 %	0 %	530547885
7579	NC_022084	GGA	2	6	383151	383156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530547885
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7581	NC_022084	GAA	2	6	383251	383256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530547885
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7583	NC_022084	ATA	2	6	383295	383300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530547885
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7586	NC_022084	ATA	2	6	383418	383423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530547885
7587	NC_022084	GAA	2	6	383424	383429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530547885
7588	NC_022084	GCA	2	6	383474	383479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530547885
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7590	NC_022084	ACTT	2	8	383550	383557	25 %	50 %	0 %	25 %	530547885
7591	NC_022084	GAGC	2	8	383602	383609	25 %	0 %	50 %	25 %	530547885
7592	NC_022084	A	6	6	383648	383653	100 %	0 %	0 %	0 %	530547885
7593	NC_022084	GAA	2	6	383767	383772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530547886
7594	NC_022084	AG	3	6	383803	383808	50 %	0 %	50 %	0 %	530547886
7595	NC_022084	AAAC	2	8	383964	383971	75 %	0 %	0 %	25 %	530547886
7596	NC_022084	AGGA	2	8	383990	383997	50 %	0 %	50 %	0 %	530547886
7597	NC_022084	GGA	2	6	384012	384017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530547886
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7600	NC_022084	TAA	2	6	384192	384197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530547887
7601	NC_022084	TCT	2	6	384328	384333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530547887
7602	NC_022084	CAAAA	2	10	384337	384346	80 %	0 %	0 %	20 %	530547887
7603	NC_022084	TC	3	6	384487	384492	0 %	50 %	0 %	50 %	530547887
7604	NC_022084	ACA	2	6	384504	384509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530547887
7605	NC_022084	AAAG	2	8	384624	384631	75 %	0 %	25 %	0 %	530547887
7606	NC_022084	TCG	2	6	384654	384659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530547887
7607	NC_022084	TGCC	2	8	384714	384721	0 %	25 %	25 %	50 %	530547887
7608	NC_022084	CCTT	2	8	384819	384826	0 %	50 %	0 %	50 %	530547888
7609	NC_022084	TTCAC	2	10	384846	384855	20 %	40 %	0 %	40 %	530547888
7610	NC_022084	CAC	2	6	384887	384892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530547888
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7615	NC_022084	T	6	6	385133	385138	0 %	100 %	0 %	0 %	530547888
7616	NC_022084	TAA	2	6	385312	385317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530547888
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7623	NC_022084	ACT	2	6	385590	385595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530547888
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7999	NC_022084	A	6	6	404434	404439	100 %	0 %	0 %	0 %	530547912
8000	NC_022084	GCA	2	6	404447	404452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530547912

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