MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 23984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
22501	NC_021508	TG	3	6	1066463	1066468	0 %	50 %	50 %	0 %	512444418
22502	NC_021508	ATT	2	6	1066498	1066503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512444418
22503	NC_021508	GAA	2	6	1066549	1066554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444418
22504	NC_021508	CAA	2	6	1066572	1066577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444418
22505	NC_021508	CCG	2	6	1066712	1066717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444418
22506	NC_021508	CAAA	2	8	1066758	1066765	75 %	0 %	0 %	25 %	512444418
22507	NC_021508	GTC	2	6	1066780	1066785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444418
22508	NC_021508	GGC	2	6	1066831	1066836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22509	NC_021508	CGT	2	6	1066925	1066930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444419
22510	NC_021508	TA	3	6	1066947	1066952	50 %	50 %	0 %	0 %	512444419
22511	NC_021508	ACC	2	6	1066982	1066987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444419
22512	NC_021508	GTAT	2	8	1066988	1066995	25 %	50 %	25 %	0 %	512444419
22513	NC_021508	GCG	2	6	1067027	1067032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444419
22514	NC_021508	AGA	2	6	1067090	1067095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444419
22515	NC_021508	TCT	2	6	1067101	1067106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444419
22516	NC_021508	TGT	2	6	1067114	1067119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512444419
22517	NC_021508	GGTGCG	2	12	1067146	1067157	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	512444419
22518	NC_021508	TG	3	6	1067171	1067176	0 %	50 %	50 %	0 %	512444419
22519	NC_021508	TCGG	2	8	1067177	1067184	0 %	25 %	50 %	25 %	512444419
22520	NC_021508	CTG	2	6	1067194	1067199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444419
22521	NC_021508	T	7	7	1067231	1067237	0 %	100 %	0 %	0 %	512444419
22522	NC_021508	CTC	2	6	1067297	1067302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444419
22523	NC_021508	TTTG	2	8	1067322	1067329	0 %	75 %	25 %	0 %	512444419
22524	NC_021508	TC	3	6	1067348	1067353	0 %	50 %	0 %	50 %	512444419
22525	NC_021508	AT	3	6	1067406	1067411	50 %	50 %	0 %	0 %	512444419
22526	NC_021508	TCG	2	6	1067490	1067495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444420
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22528	NC_021508	CAG	2	6	1067627	1067632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444420
22529	NC_021508	AAAAG	2	10	1067731	1067740	80 %	0 %	20 %	0 %	512444420
22530	NC_021508	GC	3	6	1067743	1067748	0 %	0 %	50 %	50 %	512444420
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22532	NC_021508	AGAGGA	2	12	1067933	1067944	50 %	0 %	50 %	0 %	512444420
22533	NC_021508	CG	3	6	1067987	1067992	0 %	0 %	50 %	50 %	512444420
22534	NC_021508	AAG	2	6	1068045	1068050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444420
22535	NC_021508	CTCA	2	8	1068121	1068128	25 %	25 %	0 %	50 %	512444420
22536	NC_021508	TAG	2	6	1068167	1068172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444420
22537	NC_021508	CGA	2	6	1068238	1068243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444421
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22539	NC_021508	CTTT	2	8	1068323	1068330	0 %	75 %	0 %	25 %	512444421
22540	NC_021508	GC	3	6	1068407	1068412	0 %	0 %	50 %	50 %	512444421
22541	NC_021508	CTTC	2	8	1068498	1068505	0 %	50 %	0 %	50 %	512444421
22542	NC_021508	TAG	2	6	1068538	1068543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444421
22543	NC_021508	GCG	3	9	1068569	1068577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444421
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22545	NC_021508	CTC	3	9	1068601	1068609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444421
22546	NC_021508	GTC	2	6	1068685	1068690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444421
22547	NC_021508	GCA	2	6	1068750	1068755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444421
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22549	NC_021508	GTA	2	6	1068778	1068783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444421
22550	NC_021508	TCT	2	6	1068842	1068847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444421
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22552	NC_021508	CCT	2	6	1068924	1068929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444421
22553	NC_021508	TGC	2	6	1069036	1069041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444421
22554	NC_021508	TTG	2	6	1069054	1069059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512444421
22555	NC_021508	TCA	2	6	1069151	1069156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444421
22556	NC_021508	TGA	2	6	1069158	1069163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444421
22557	NC_021508	GT	3	6	1069280	1069285	0 %	50 %	50 %	0 %	512444421
22558	NC_021508	AG	3	6	1069293	1069298	50 %	0 %	50 %	0 %	512444421
22559	NC_021508	GAT	2	6	1069335	1069340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444421
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22561	NC_021508	TCT	2	6	1069410	1069415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444421
22562	NC_021508	AGAT	2	8	1069466	1069473	50 %	25 %	25 %	0 %	512444421
22563	NC_021508	CTT	2	6	1069498	1069503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444421
22564	NC_021508	TCT	2	6	1069856	1069861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444421
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22567	NC_021508	GTAC	2	8	1069954	1069961	25 %	25 %	25 %	25 %	512444421
22568	NC_021508	CAA	2	6	1069965	1069970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444421
22569	NC_021508	AG	3	6	1070049	1070054	50 %	0 %	50 %	0 %	512444421
22570	NC_021508	AGC	2	6	1070072	1070077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444421
22571	NC_021508	TCC	2	6	1070116	1070121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22572	NC_021508	A	6	6	1070130	1070135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22573	NC_021508	CGC	2	6	1070146	1070151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22574	NC_021508	CG	4	8	1070160	1070167	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22575	NC_021508	GCA	2	6	1070186	1070191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22576	NC_021508	AACC	2	8	1070197	1070204	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22577	NC_021508	GGT	2	6	1070211	1070216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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22579	NC_021508	ATGG	2	8	1070368	1070375	25 %	25 %	50 %	0 %	512444422
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22585	NC_021508	TTCCG	2	10	1070632	1070641	0 %	40 %	20 %	40 %	512444422
22586	NC_021508	TGA	2	6	1070645	1070650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444422
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22589	NC_021508	C	6	6	1070893	1070898	0 %	0 %	0 %	100 %	512444422
22590	NC_021508	AGC	2	6	1070908	1070913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444422
22591	NC_021508	TGG	2	6	1070920	1070925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512444422
22592	NC_021508	T	6	6	1071114	1071119	0 %	100 %	0 %	0 %	512444422
22593	NC_021508	GAA	2	6	1071240	1071245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444422
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22599	NC_021508	G	6	6	1071398	1071403	0 %	0 %	100 %	0 %	512444422
22600	NC_021508	T	6	6	1071414	1071419	0 %	100 %	0 %	0 %	512444422
22601	NC_021508	TTG	2	6	1071471	1071476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512444422
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22603	NC_021508	GTT	2	6	1071572	1071577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512444422
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22610	NC_021508	CGG	2	6	1071890	1071895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444422
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22612	NC_021508	CTCG	2	8	1072076	1072083	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
22613	NC_021508	TACC	2	8	1072095	1072102	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
22614	NC_021508	G	8	8	1072104	1072111	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
22615	NC_021508	TGA	2	6	1072184	1072189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444423
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22618	NC_021508	CT	3	6	1072420	1072425	0 %	50 %	0 %	50 %	512444423
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22737	NC_021508	GAA	2	6	1078144	1078149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444427
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22739	NC_021508	TG	3	6	1078256	1078261	0 %	50 %	50 %	0 %	512444428
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22751	NC_021508	CT	3	6	1078854	1078859	0 %	50 %	0 %	50 %	512444430
22752	NC_021508	GCA	2	6	1078882	1078887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444430
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22841	NC_021508	CA	3	6	1084054	1084059	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22842	NC_021508	CATGC	2	10	1084100	1084109	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
22843	NC_021508	AAC	2	6	1084163	1084168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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