MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 23984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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22002	NC_021508	TCT	2	6	1043896	1043901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22003	NC_021508	ACT	2	6	1043927	1043932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444400
22004	NC_021508	GCAC	2	8	1043935	1043942	25 %	0 %	25 %	50 %	512444400
22005	NC_021508	CAT	2	6	1043964	1043969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444400
22006	NC_021508	TCT	2	6	1043974	1043979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444400
22007	NC_021508	T	6	6	1043990	1043995	0 %	100 %	0 %	0 %	512444400
22008	NC_021508	CG	3	6	1044009	1044014	0 %	0 %	50 %	50 %	512444400
22009	NC_021508	CAA	2	6	1044068	1044073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444400
22010	NC_021508	CTGCA	2	10	1044078	1044087	20 %	20 %	20 %	40 %	512444400
22011	NC_021508	GCA	2	6	1044109	1044114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444400
22012	NC_021508	CTT	2	6	1044159	1044164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444400
22013	NC_021508	A	9	9	1044211	1044219	100 %	0 %	0 %	0 %	512444400
22014	NC_021508	CTAT	2	8	1044235	1044242	25 %	50 %	0 %	25 %	512444400
22015	NC_021508	TGAT	2	8	1044268	1044275	25 %	50 %	25 %	0 %	512444400
22016	NC_021508	A	7	7	1044417	1044423	100 %	0 %	0 %	0 %	512444400
22017	NC_021508	GTTT	2	8	1044460	1044467	0 %	75 %	25 %	0 %	512444400
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22063	NC_021508	CTGCG	2	10	1046778	1046787	0 %	20 %	40 %	40 %	512444402
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22093	NC_021508	AAAC	2	8	1047987	1047994	75 %	0 %	0 %	25 %	512444403
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22102	NC_021508	CGAT	2	8	1048543	1048550	25 %	25 %	25 %	25 %	512444404
22103	NC_021508	GA	3	6	1048592	1048597	50 %	0 %	50 %	0 %	512444404
22104	NC_021508	CAA	2	6	1048610	1048615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444404
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22117	NC_021508	TGA	2	6	1049159	1049164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444405
22118	NC_021508	GC	3	6	1049204	1049209	0 %	0 %	50 %	50 %	512444405
22119	NC_021508	CTC	2	6	1049216	1049221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444405
22120	NC_021508	GCC	2	6	1049281	1049286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444405
22121	NC_021508	CGG	2	6	1049309	1049314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444405
22122	NC_021508	CGGTA	2	10	1049482	1049491	20 %	20 %	40 %	20 %	512444405
22123	NC_021508	CCG	2	6	1049515	1049520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444405
22124	NC_021508	ACCCC	2	10	1049573	1049582	20 %	0 %	0 %	80 %	512444405
22125	NC_021508	AGA	2	6	1049700	1049705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444405
22126	NC_021508	GC	3	6	1049820	1049825	0 %	0 %	50 %	50 %	512444405
22127	NC_021508	ACG	2	6	1049826	1049831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444405
22128	NC_021508	CT	4	8	1049837	1049844	0 %	50 %	0 %	50 %	512444405
22129	NC_021508	GCGT	2	8	1049847	1049854	0 %	25 %	50 %	25 %	512444405
22130	NC_021508	AGC	2	6	1049959	1049964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444405
22131	NC_021508	AGC	2	6	1049980	1049985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444405
22132	NC_021508	TGC	2	6	1050022	1050027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444405
22133	NC_021508	GC	3	6	1050066	1050071	0 %	0 %	50 %	50 %	512444405
22134	NC_021508	CGC	2	6	1050073	1050078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444405
22135	NC_021508	TGC	2	6	1050091	1050096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444405
22136	NC_021508	CGC	2	6	1050097	1050102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444405
22137	NC_021508	TTGATC	2	12	1050157	1050168	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	512444405
22138	NC_021508	A	8	8	1050207	1050214	100 %	0 %	0 %	0 %	512444405
22139	NC_021508	TGC	2	6	1050397	1050402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444405
22140	NC_021508	GCA	2	6	1050413	1050418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444405
22141	NC_021508	GCT	2	6	1050419	1050424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444405
22142	NC_021508	GCT	2	6	1050515	1050520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444405
22143	NC_021508	AGG	2	6	1050546	1050551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444405
22144	NC_021508	GT	3	6	1050568	1050573	0 %	50 %	50 %	0 %	512444405
22145	NC_021508	GAG	2	6	1050578	1050583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444405
22146	NC_021508	CTG	2	6	1050626	1050631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444405
22147	NC_021508	GGC	2	6	1050639	1050644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444405
22148	NC_021508	CA	3	6	1050653	1050658	50 %	0 %	0 %	50 %	512444405
22149	NC_021508	CAC	2	6	1050666	1050671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444405
22150	NC_021508	ACG	2	6	1050674	1050679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444405
22151	NC_021508	GC	4	8	1050690	1050697	0 %	0 %	50 %	50 %	512444405
22152	NC_021508	TGCG	2	8	1050707	1050714	0 %	25 %	50 %	25 %	512444405
22153	NC_021508	C	6	6	1050724	1050729	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
22154	NC_021508	GCA	2	6	1050738	1050743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22155	NC_021508	CATGTT	2	12	1050761	1050772	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	512444406
22156	NC_021508	AGA	2	6	1050781	1050786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444406
22157	NC_021508	CG	4	8	1050798	1050805	0 %	0 %	50 %	50 %	512444406
22158	NC_021508	TTCGCC	2	12	1050833	1050844	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	512444406
22159	NC_021508	CGTA	2	8	1050860	1050867	25 %	25 %	25 %	25 %	512444406
22160	NC_021508	CG	3	6	1050893	1050898	0 %	0 %	50 %	50 %	512444406
22161	NC_021508	GC	3	6	1050930	1050935	0 %	0 %	50 %	50 %	512444406
22162	NC_021508	CTG	2	6	1051033	1051038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444406
22163	NC_021508	T	6	6	1051091	1051096	0 %	100 %	0 %	0 %	512444406
22164	NC_021508	CTG	2	6	1051314	1051319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444406
22165	NC_021508	CG	3	6	1051325	1051330	0 %	0 %	50 %	50 %	512444406
22166	NC_021508	CAGC	2	8	1051401	1051408	25 %	0 %	25 %	50 %	512444406
22167	NC_021508	CAG	2	6	1051458	1051463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444406
22168	NC_021508	GAT	2	6	1051465	1051470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444406
22169	NC_021508	CCCGCT	2	12	1051527	1051538	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	512444406
22170	NC_021508	GCT	2	6	1051544	1051549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444406
22171	NC_021508	CTT	2	6	1051722	1051727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444406
22172	NC_021508	CGA	2	6	1051786	1051791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444406
22173	NC_021508	TGCC	2	8	1051803	1051810	0 %	25 %	25 %	50 %	512444406
22174	NC_021508	CCT	2	6	1051838	1051843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444406
22175	NC_021508	CTC	2	6	1051848	1051853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444406
22176	NC_021508	CTC	2	6	1051857	1051862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444406
22177	NC_021508	CGG	2	6	1051866	1051871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444406
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22179	NC_021508	AAG	2	6	1051923	1051928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444406
22180	NC_021508	GCT	2	6	1052031	1052036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444406
22181	NC_021508	GCC	3	9	1052081	1052089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444406
22182	NC_021508	CAC	2	6	1052113	1052118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444406
22183	NC_021508	GCC	2	6	1052153	1052158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444406
22184	NC_021508	GCC	2	6	1052168	1052173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444406
22185	NC_021508	AGCGC	2	10	1052207	1052216	20 %	0 %	40 %	40 %	512444406
22186	NC_021508	CCCA	2	8	1052224	1052231	25 %	0 %	0 %	75 %	512444406
22187	NC_021508	ATG	2	6	1052239	1052244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444406
22188	NC_021508	AC	3	6	1052265	1052270	50 %	0 %	0 %	50 %	512444406
22189	NC_021508	GCC	2	6	1052276	1052281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444406
22190	NC_021508	ACC	2	6	1052299	1052304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444406
22191	NC_021508	CGC	2	6	1052394	1052399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444407
22192	NC_021508	CG	3	6	1052434	1052439	0 %	0 %	50 %	50 %	512444407
22193	NC_021508	TCC	2	6	1052448	1052453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444407
22194	NC_021508	CG	3	6	1052462	1052467	0 %	0 %	50 %	50 %	512444407
22195	NC_021508	GC	3	6	1052473	1052478	0 %	0 %	50 %	50 %	512444407
22196	NC_021508	CG	3	6	1052510	1052515	0 %	0 %	50 %	50 %	512444407
22197	NC_021508	TGC	2	6	1052535	1052540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444407
22198	NC_021508	TCTTGC	2	12	1052623	1052634	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	512444407
22199	NC_021508	CTC	2	6	1052640	1052645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444407
22200	NC_021508	GCGCG	2	10	1052915	1052924	0 %	0 %	60 %	40 %	512444407
22201	NC_021508	GCC	2	6	1052947	1052952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444407
22202	NC_021508	CGAG	2	8	1052987	1052994	25 %	0 %	50 %	25 %	512444407
22203	NC_021508	CG	3	6	1053005	1053010	0 %	0 %	50 %	50 %	512444407
22204	NC_021508	GCA	2	6	1053029	1053034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444407
22205	NC_021508	TC	3	6	1053040	1053045	0 %	50 %	0 %	50 %	512444407
22206	NC_021508	CA	3	6	1053092	1053097	50 %	0 %	0 %	50 %	512444407
22207	NC_021508	CTT	2	6	1053116	1053121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444407
22208	NC_021508	TG	3	6	1053136	1053141	0 %	50 %	50 %	0 %	512444407
22209	NC_021508	CGC	2	6	1053247	1053252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444407
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22212	NC_021508	TTC	2	6	1053351	1053356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444407
22213	NC_021508	ACG	2	6	1053366	1053371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444407
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22215	NC_021508	CCG	2	6	1053557	1053562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444407
22216	NC_021508	ACGT	2	8	1053595	1053602	25 %	25 %	25 %	25 %	512444407
22217	NC_021508	CTG	2	6	1053605	1053610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444407
22218	NC_021508	GC	3	6	1053618	1053623	0 %	0 %	50 %	50 %	512444407
22219	NC_021508	GC	3	6	1053662	1053667	0 %	0 %	50 %	50 %	512444407
22220	NC_021508	GCT	2	6	1053707	1053712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444407
22221	NC_021508	GCC	2	6	1053724	1053729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444407
22222	NC_021508	CG	4	8	1053734	1053741	0 %	0 %	50 %	50 %	512444407
22223	NC_021508	AC	3	6	1053743	1053748	50 %	0 %	0 %	50 %	512444407
22224	NC_021508	GCC	2	6	1053763	1053768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444407
22225	NC_021508	CGC	2	6	1053778	1053783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444407
22226	NC_021508	TGC	2	6	1053883	1053888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444407
22227	NC_021508	ACGA	2	8	1053898	1053905	50 %	0 %	25 %	25 %	512444407
22228	NC_021508	ACC	2	6	1053908	1053913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444407
22229	NC_021508	CT	3	6	1053945	1053950	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22230	NC_021508	TTCTT	2	10	1053951	1053960	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
22231	NC_021508	ACC	2	6	1053981	1053986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22232	NC_021508	GCG	4	12	1054008	1054019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22233	NC_021508	CACC	2	8	1054024	1054031	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
22234	NC_021508	AAT	2	6	1054061	1054066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22235	NC_021508	AAGC	2	8	1054093	1054100	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
22236	NC_021508	AGA	2	6	1054104	1054109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22237	NC_021508	GAT	2	6	1054145	1054150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22238	NC_021508	TTCT	2	8	1054166	1054173	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22239	NC_021508	CTT	2	6	1054184	1054189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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22241	NC_021508	GCA	2	6	1054225	1054230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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22243	NC_021508	GC	3	6	1054326	1054331	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22244	NC_021508	AGCG	2	8	1054347	1054354	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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22359	NC_021508	GC	3	6	1059101	1059106	0 %	0 %	50 %	50 %	512444410
22360	NC_021508	GCT	2	6	1059153	1059158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444410
22361	NC_021508	AGG	2	6	1059294	1059299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444410
22362	NC_021508	GAG	2	6	1059387	1059392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444410
22363	NC_021508	CCT	2	6	1059397	1059402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444410
22364	NC_021508	GACC	2	8	1059415	1059422	25 %	0 %	25 %	50 %	512444410
22365	NC_021508	ACA	2	6	1059556	1059561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22366	NC_021508	GCCT	2	8	1059591	1059598	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
22367	NC_021508	CTC	2	6	1059617	1059622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444411
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22370	NC_021508	ATC	2	6	1059879	1059884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444411
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22372	NC_021508	CG	3	6	1059982	1059987	0 %	0 %	50 %	50 %	512444412
22373	NC_021508	CA	3	6	1060028	1060033	50 %	0 %	0 %	50 %	512444412
22374	NC_021508	CTC	2	6	1060037	1060042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444412
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22383	NC_021508	TGCG	2	8	1060391	1060398	0 %	25 %	50 %	25 %	512444412
22384	NC_021508	CA	3	6	1060405	1060410	50 %	0 %	0 %	50 %	512444412
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22388	NC_021508	GA	4	8	1060522	1060529	50 %	0 %	50 %	0 %	512444412
22389	NC_021508	A	6	6	1060551	1060556	100 %	0 %	0 %	0 %	512444412
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22392	NC_021508	ACC	3	9	1060774	1060782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22393	NC_021508	CAA	2	6	1060795	1060800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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22396	NC_021508	CTT	2	6	1060923	1060928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444413
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22423	NC_021508	TGC	2	6	1062516	1062521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444414
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22444	NC_021508	CG	3	6	1063713	1063718	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22445	NC_021508	TG	3	6	1063719	1063724	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22446	NC_021508	CG	3	6	1063726	1063731	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22447	NC_021508	CG	3	6	1063759	1063764	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22448	NC_021508	GTA	2	6	1063861	1063866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444416
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22452	NC_021508	GATA	2	8	1064022	1064029	50 %	25 %	25 %	0 %	512444416
22453	NC_021508	A	6	6	1064036	1064041	100 %	0 %	0 %	0 %	512444416
22454	NC_021508	ACT	2	6	1064087	1064092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444416
22455	NC_021508	A	7	7	1064163	1064169	100 %	0 %	0 %	0 %	512444416
22456	NC_021508	ATC	2	6	1064176	1064181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444416
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22459	NC_021508	GT	3	6	1064246	1064251	0 %	50 %	50 %	0 %	512444416
22460	NC_021508	TTTC	2	8	1064312	1064319	0 %	75 %	0 %	25 %	512444416
22461	NC_021508	CAA	2	6	1064436	1064441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444416
22462	NC_021508	ACCG	2	8	1064447	1064454	25 %	0 %	25 %	50 %	512444416
22463	NC_021508	CA	3	6	1064458	1064463	50 %	0 %	0 %	50 %	512444416
22464	NC_021508	TGAG	2	8	1064562	1064569	25 %	25 %	50 %	0 %	512444416
22465	NC_021508	CAG	2	6	1064570	1064575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22466	NC_021508	CAA	2	6	1064579	1064584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444417
22467	NC_021508	ATC	2	6	1064595	1064600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444417
22468	NC_021508	TC	3	6	1064621	1064626	0 %	50 %	0 %	50 %	512444417
22469	NC_021508	T	6	6	1064639	1064644	0 %	100 %	0 %	0 %	512444417
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22471	NC_021508	GC	3	6	1064779	1064784	0 %	0 %	50 %	50 %	512444417
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22473	NC_021508	GC	3	6	1064868	1064873	0 %	0 %	50 %	50 %	512444417
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22475	NC_021508	CG	3	6	1065013	1065018	0 %	0 %	50 %	50 %	512444417
22476	NC_021508	TGGG	2	8	1065046	1065053	0 %	25 %	75 %	0 %	512444417
22477	NC_021508	GGAA	2	8	1065072	1065079	50 %	0 %	50 %	0 %	512444417
22478	NC_021508	GC	3	6	1065138	1065143	0 %	0 %	50 %	50 %	512444417
22479	NC_021508	GC	3	6	1065195	1065200	0 %	0 %	50 %	50 %	512444417
22480	NC_021508	GTGG	2	8	1065201	1065208	0 %	25 %	75 %	0 %	512444417
22481	NC_021508	AC	3	6	1065274	1065279	50 %	0 %	0 %	50 %	512444417
22482	NC_021508	TAC	2	6	1065365	1065370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444417
22483	NC_021508	GC	3	6	1065523	1065528	0 %	0 %	50 %	50 %	512444417
22484	NC_021508	CTTC	2	8	1065540	1065547	0 %	50 %	0 %	50 %	512444417
22485	NC_021508	GCA	2	6	1065557	1065562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444417
22486	NC_021508	ACTT	2	8	1065651	1065658	25 %	50 %	0 %	25 %	512444418
22487	NC_021508	AGC	2	6	1065821	1065826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444418
22488	NC_021508	TC	3	6	1065853	1065858	0 %	50 %	0 %	50 %	512444418
22489	NC_021508	A	6	6	1065958	1065963	100 %	0 %	0 %	0 %	512444418
22490	NC_021508	TG	3	6	1065981	1065986	0 %	50 %	50 %	0 %	512444418
22491	NC_021508	CCA	2	6	1066002	1066007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444418
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