MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 23984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_021508	ATC	2	6	1019963	1019968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444375
21502	NC_021508	GC	4	8	1019990	1019997	0 %	0 %	50 %	50 %	512444375
21503	NC_021508	AC	3	6	1020055	1020060	50 %	0 %	0 %	50 %	512444375
21504	NC_021508	GCA	2	6	1020084	1020089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444375
21505	NC_021508	GCGCGT	2	12	1020095	1020106	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	512444375
21506	NC_021508	A	6	6	1020138	1020143	100 %	0 %	0 %	0 %	512444375
21507	NC_021508	TAA	2	6	1020192	1020197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512444375
21508	NC_021508	GC	3	6	1020257	1020262	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21509	NC_021508	AGC	2	6	1020295	1020300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21510	NC_021508	CAAC	2	8	1020365	1020372	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21511	NC_021508	CTAC	2	8	1020392	1020399	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
21512	NC_021508	GCC	2	6	1020447	1020452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444376
21513	NC_021508	CGTG	2	8	1020469	1020476	0 %	25 %	50 %	25 %	512444376
21514	NC_021508	TG	4	8	1020475	1020482	0 %	50 %	50 %	0 %	512444376
21515	NC_021508	TGCG	2	8	1020514	1020521	0 %	25 %	50 %	25 %	512444376
21516	NC_021508	GATT	2	8	1020552	1020559	25 %	50 %	25 %	0 %	512444376
21517	NC_021508	AC	3	6	1020578	1020583	50 %	0 %	0 %	50 %	512444376
21518	NC_021508	TAC	2	6	1020618	1020623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444376
21519	NC_021508	CGT	2	6	1020815	1020820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444376
21520	NC_021508	ACA	2	6	1020837	1020842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444376
21521	NC_021508	AAG	2	6	1020868	1020873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444376
21522	NC_021508	ACC	2	6	1020902	1020907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444376
21523	NC_021508	CAA	2	6	1020949	1020954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444376
21524	NC_021508	CCA	2	6	1021075	1021080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444377
21525	NC_021508	GCAC	2	8	1021138	1021145	25 %	0 %	25 %	50 %	512444377
21526	NC_021508	CATAG	2	10	1021173	1021182	40 %	20 %	20 %	20 %	512444377
21527	NC_021508	GGA	2	6	1021185	1021190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444377
21528	NC_021508	A	6	6	1021190	1021195	100 %	0 %	0 %	0 %	512444377
21529	NC_021508	CG	3	6	1021273	1021278	0 %	0 %	50 %	50 %	512444377
21530	NC_021508	TGC	2	6	1021305	1021310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444377
21531	NC_021508	TCT	2	6	1021372	1021377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444377
21532	NC_021508	CCTG	2	8	1021408	1021415	0 %	25 %	25 %	50 %	512444377
21533	NC_021508	ACC	2	6	1021497	1021502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444377
21534	NC_021508	CCA	2	6	1021613	1021618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444377
21535	NC_021508	CG	4	8	1021621	1021628	0 %	0 %	50 %	50 %	512444377
21536	NC_021508	T	6	6	1021690	1021695	0 %	100 %	0 %	0 %	512444377
21537	NC_021508	CTG	2	6	1021716	1021721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444377
21538	NC_021508	AGGA	2	8	1021724	1021731	50 %	0 %	50 %	0 %	512444377
21539	NC_021508	GA	3	6	1021730	1021735	50 %	0 %	50 %	0 %	512444377
21540	NC_021508	GA	3	6	1021788	1021793	50 %	0 %	50 %	0 %	512444377
21541	NC_021508	AC	3	6	1021800	1021805	50 %	0 %	0 %	50 %	512444377
21542	NC_021508	CG	3	6	1021816	1021821	0 %	0 %	50 %	50 %	512444377
21543	NC_021508	TTCA	2	8	1021861	1021868	25 %	50 %	0 %	25 %	512444377
21544	NC_021508	CTC	2	6	1021893	1021898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21545	NC_021508	GC	3	6	1021917	1021922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21546	NC_021508	ACGG	2	8	1021935	1021942	25 %	0 %	50 %	25 %	512444378
21547	NC_021508	CTTCT	2	10	1021981	1021990	0 %	60 %	0 %	40 %	512444378
21548	NC_021508	GC	3	6	1021991	1021996	0 %	0 %	50 %	50 %	512444378
21549	NC_021508	AGC	2	6	1022000	1022005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444378
21550	NC_021508	GCTC	2	8	1022012	1022019	0 %	25 %	25 %	50 %	512444378
21551	NC_021508	CTT	2	6	1022052	1022057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444378
21552	NC_021508	T	6	6	1022114	1022119	0 %	100 %	0 %	0 %	512444378
21553	NC_021508	CAT	2	6	1022259	1022264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444378
21554	NC_021508	CT	3	6	1022275	1022280	0 %	50 %	0 %	50 %	512444378
21555	NC_021508	CGC	2	6	1022392	1022397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444378
21556	NC_021508	ACC	2	6	1022443	1022448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444378
21557	NC_021508	ACC	2	6	1022521	1022526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444378
21558	NC_021508	GGT	2	6	1022586	1022591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512444378
21559	NC_021508	GA	3	6	1022596	1022601	50 %	0 %	50 %	0 %	512444378
21560	NC_021508	GCT	2	6	1022670	1022675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444378
21561	NC_021508	CTG	2	6	1022698	1022703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444378
21562	NC_021508	A	6	6	1022709	1022714	100 %	0 %	0 %	0 %	512444378
21563	NC_021508	GCC	2	6	1022732	1022737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444378
21564	NC_021508	CTG	2	6	1022823	1022828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444378
21565	NC_021508	CGT	2	6	1022878	1022883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444378
21566	NC_021508	AT	3	6	1022911	1022916	50 %	50 %	0 %	0 %	512444378
21567	NC_021508	GAA	2	6	1022918	1022923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444378
21568	NC_021508	CAA	2	6	1022958	1022963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444378
21569	NC_021508	TCA	2	6	1022970	1022975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444378
21570	NC_021508	GGCA	2	8	1023006	1023013	25 %	0 %	50 %	25 %	512444378
21571	NC_021508	CTT	2	6	1023073	1023078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444378
21572	NC_021508	AAG	2	6	1023104	1023109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444378
21573	NC_021508	T	6	6	1023188	1023193	0 %	100 %	0 %	0 %	512444378
21574	NC_021508	TGC	2	6	1023203	1023208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444378
21575	NC_021508	AC	3	6	1023367	1023372	50 %	0 %	0 %	50 %	512444378
21576	NC_021508	GAC	2	6	1023579	1023584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444378
21577	NC_021508	CCA	2	6	1023618	1023623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444378
21578	NC_021508	AGCG	2	8	1023634	1023641	25 %	0 %	50 %	25 %	512444378
21579	NC_021508	GTG	2	6	1023653	1023658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512444378
21580	NC_021508	A	6	6	1023764	1023769	100 %	0 %	0 %	0 %	512444378
21581	NC_021508	CAC	2	6	1023781	1023786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444378
21582	NC_021508	CCT	2	6	1023852	1023857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444378
21583	NC_021508	TCT	2	6	1024041	1024046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444378
21584	NC_021508	ACC	2	6	1024078	1024083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444378
21585	NC_021508	CTT	2	6	1024087	1024092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444378
21586	NC_021508	TTA	2	6	1024121	1024126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512444378
21587	NC_021508	AAT	2	6	1024141	1024146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512444378
21588	NC_021508	AC	3	6	1024210	1024215	50 %	0 %	0 %	50 %	512444378
21589	NC_021508	ATC	2	6	1024222	1024227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444378
21590	NC_021508	GCT	2	6	1024255	1024260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444378
21591	NC_021508	CAT	2	6	1024269	1024274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444378
21592	NC_021508	ACCG	2	8	1024282	1024289	25 %	0 %	25 %	50 %	512444378
21593	NC_021508	TCT	2	6	1024302	1024307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444378
21594	NC_021508	ACC	2	6	1024378	1024383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444378
21595	NC_021508	CTT	2	6	1024414	1024419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444378
21596	NC_021508	AG	3	6	1024461	1024466	50 %	0 %	50 %	0 %	512444378
21597	NC_021508	TCGA	2	8	1024495	1024502	25 %	25 %	25 %	25 %	512444378
21598	NC_021508	TCC	2	6	1024597	1024602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444378
21599	NC_021508	GTA	2	6	1024690	1024695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444378
21600	NC_021508	CTGTG	2	10	1024822	1024831	0 %	40 %	40 %	20 %	512444378
21601	NC_021508	AGTC	2	8	1024855	1024862	25 %	25 %	25 %	25 %	512444378
21602	NC_021508	TCG	3	9	1024889	1024897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444378
21603	NC_021508	CTT	2	6	1024926	1024931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444378
21604	NC_021508	A	7	7	1024969	1024975	100 %	0 %	0 %	0 %	512444378
21605	NC_021508	CG	3	6	1024989	1024994	0 %	0 %	50 %	50 %	512444378
21606	NC_021508	GCA	2	6	1025006	1025011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444378
21607	NC_021508	CCT	2	6	1025037	1025042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444378
21608	NC_021508	GGC	2	6	1025079	1025084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444378
21609	NC_021508	TGA	2	6	1025099	1025104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444378
21610	NC_021508	GCA	2	6	1025144	1025149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444378
21611	NC_021508	AGC	2	6	1025207	1025212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444378
21612	NC_021508	AGA	2	6	1025236	1025241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444378
21613	NC_021508	CGT	2	6	1025251	1025256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444378
21614	NC_021508	GCCT	2	8	1025284	1025291	0 %	25 %	25 %	50 %	512444378
21615	NC_021508	GGAG	2	8	1025383	1025390	25 %	0 %	75 %	0 %	512444378
21616	NC_021508	CCAT	2	8	1025453	1025460	25 %	25 %	0 %	50 %	512444378
21617	NC_021508	TTC	2	6	1025471	1025476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444378
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21619	NC_021508	TAG	2	6	1025574	1025579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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21856	NC_021508	A	6	6	1036951	1036956	100 %	0 %	0 %	0 %	512444393
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21979	NC_021508	CTT	2	6	1042516	1042521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444397
21980	NC_021508	CTT	3	9	1042541	1042549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444397
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