MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 23984

< Previous12...36373839404142434445464748Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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20003	NC_021508	CAA	2	6	951121	951126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444315
20004	NC_021508	GAAG	2	8	951139	951146	50 %	0 %	50 %	0 %	512444315
20005	NC_021508	GCGT	2	8	951163	951170	0 %	25 %	50 %	25 %	512444315
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20007	NC_021508	CCCT	2	8	951261	951268	0 %	25 %	0 %	75 %	512444315
20008	NC_021508	A	9	9	951315	951323	100 %	0 %	0 %	0 %	512444315
20009	NC_021508	CAA	2	6	951373	951378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444315
20010	NC_021508	ACTC	2	8	951390	951397	25 %	25 %	0 %	50 %	512444315
20011	NC_021508	CGCTG	2	10	951490	951499	0 %	20 %	40 %	40 %	512444315
20012	NC_021508	CTGCGC	2	12	951509	951520	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	512444315
20013	NC_021508	CG	3	6	951586	951591	0 %	0 %	50 %	50 %	512444315
20014	NC_021508	GC	4	8	951613	951620	0 %	0 %	50 %	50 %	512444315
20015	NC_021508	AGC	2	6	951766	951771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444315
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20018	NC_021508	CGA	2	6	951916	951921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444315
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20020	NC_021508	CCAC	2	8	951966	951973	25 %	0 %	0 %	75 %	512444315
20021	NC_021508	GTC	2	6	951985	951990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444315
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20054	NC_021508	CT	3	6	953489	953494	0 %	50 %	0 %	50 %	512444316
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20097	NC_021508	TCA	2	6	955978	955983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444320
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20101	NC_021508	ATAC	2	8	956195	956202	50 %	25 %	0 %	25 %	512444320
20102	NC_021508	ACG	2	6	956211	956216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444320
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20124	NC_021508	TCA	2	6	957115	957120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444321
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20129	NC_021508	TGCG	2	8	957306	957313	0 %	25 %	50 %	25 %	512444322
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20342	NC_021508	CGG	2	6	966642	966647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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20351	NC_021508	C	6	6	967169	967174	0 %	0 %	0 %	100 %	512444331
20352	NC_021508	CTG	2	6	967178	967183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444331
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20357	NC_021508	GCGCA	2	10	967251	967260	20 %	0 %	40 %	40 %	512444331
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20364	NC_021508	C	7	7	967712	967718	0 %	0 %	0 %	100 %	512444331
20365	NC_021508	TGC	2	6	967727	967732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444331
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20367	NC_021508	CAT	2	6	967816	967821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444332
20368	NC_021508	CGC	2	6	967835	967840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444332
20369	NC_021508	TTA	2	6	967846	967851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512444332
20370	NC_021508	CTGC	2	8	968032	968039	0 %	25 %	25 %	50 %	512444332
20371	NC_021508	CGC	2	6	968095	968100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444332
20372	NC_021508	AAGC	2	8	968133	968140	50 %	0 %	25 %	25 %	512444332
20373	NC_021508	ACGC	2	8	968152	968159	25 %	0 %	25 %	50 %	512444332
20374	NC_021508	CGAGA	2	10	968182	968191	40 %	0 %	40 %	20 %	512444332
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20378	NC_021508	GCAC	2	8	968295	968302	25 %	0 %	25 %	50 %	512444332
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20381	NC_021508	GCAC	2	8	968340	968347	25 %	0 %	25 %	50 %	512444332
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20389	NC_021508	CGCA	2	8	968582	968589	25 %	0 %	25 %	50 %	512444332
20390	NC_021508	CG	3	6	968590	968595	0 %	0 %	50 %	50 %	512444332
20391	NC_021508	TCA	2	6	968701	968706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444332
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20398	NC_021508	AG	3	6	969138	969143	50 %	0 %	50 %	0 %	512444333
20399	NC_021508	ATA	2	6	969181	969186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512444333
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20407	NC_021508	TCC	2	6	969630	969635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444334
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20426	NC_021508	CAC	2	6	970565	970570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444334
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20431	NC_021508	ACT	2	6	970782	970787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444334
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20438	NC_021508	CTG	2	6	971132	971137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444334
20439	NC_021508	GCCG	2	8	971232	971239	0 %	0 %	50 %	50 %	512444334
20440	NC_021508	ACCC	2	8	971266	971273	25 %	0 %	0 %	75 %	512444334
20441	NC_021508	ACGG	2	8	971302	971309	25 %	0 %	50 %	25 %	512444334
20442	NC_021508	CGC	2	6	971319	971324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444334
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20444	NC_021508	CGCTG	2	10	971368	971377	0 %	20 %	40 %	40 %	512444334
20445	NC_021508	GC	4	8	971405	971412	0 %	0 %	50 %	50 %	512444334
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20448	NC_021508	TCC	2	6	971523	971528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444334
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20451	NC_021508	GCA	2	6	971757	971762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444334
20452	NC_021508	CTTT	2	8	971779	971786	0 %	75 %	0 %	25 %	512444334
20453	NC_021508	GC	3	6	971787	971792	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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20455	NC_021508	TTA	2	6	971809	971814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20456	NC_021508	ACTC	2	8	972014	972021	25 %	25 %	0 %	50 %	512444335
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20481	NC_021508	GTA	2	6	972993	972998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444335
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20483	NC_021508	CTT	2	6	973016	973021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444335
20484	NC_021508	GCTCA	2	10	973065	973074	20 %	20 %	20 %	40 %	512444335
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20489	NC_021508	CTC	2	6	973257	973262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444335
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20491	NC_021508	CGA	2	6	973331	973336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444335
20492	NC_021508	TCA	2	6	973354	973359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444335
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20499	NC_021508	CA	3	6	973977	973982	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20500	NC_021508	AC	3	6	974013	974018	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

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