MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 23984

< Previous12...36373839404142434445464748Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_021508	GAA	2	6	877077	877082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444251
18502	NC_021508	CACGCG	2	12	877115	877126	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	512444251
18503	NC_021508	CTCG	2	8	877171	877178	0 %	25 %	25 %	50 %	512444251
18504	NC_021508	AC	3	6	877188	877193	50 %	0 %	0 %	50 %	512444251
18505	NC_021508	ACC	2	6	877338	877343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444252
18506	NC_021508	GCA	2	6	877376	877381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444252
18507	NC_021508	CG	3	6	877527	877532	0 %	0 %	50 %	50 %	512444252
18508	NC_021508	CTT	2	6	877539	877544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444252
18509	NC_021508	ACA	2	6	877638	877643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444252
18510	NC_021508	TCA	2	6	877667	877672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444252
18511	NC_021508	TTC	2	6	877724	877729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444252
18512	NC_021508	GT	3	6	877731	877736	0 %	50 %	50 %	0 %	512444252
18513	NC_021508	TGC	2	6	877762	877767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444252
18514	NC_021508	TGC	2	6	877807	877812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444252
18515	NC_021508	ATA	2	6	877834	877839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512444252
18516	NC_021508	CGC	2	6	877870	877875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444252
18517	NC_021508	T	6	6	877878	877883	0 %	100 %	0 %	0 %	512444252
18518	NC_021508	CCG	2	6	877908	877913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444252
18519	NC_021508	CG	3	6	877912	877917	0 %	0 %	50 %	50 %	512444252
18520	NC_021508	CCT	2	6	877935	877940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444252
18521	NC_021508	AGC	2	6	878020	878025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444252
18522	NC_021508	CG	3	6	878039	878044	0 %	0 %	50 %	50 %	512444252
18523	NC_021508	AGC	2	6	878089	878094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444252
18524	NC_021508	GC	3	6	878093	878098	0 %	0 %	50 %	50 %	512444252
18525	NC_021508	AGG	2	6	878166	878171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444252
18526	NC_021508	GAGC	2	8	878185	878192	25 %	0 %	50 %	25 %	512444252
18527	NC_021508	GCA	2	6	878198	878203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444252
18528	NC_021508	GC	3	6	878265	878270	0 %	0 %	50 %	50 %	512444252
18529	NC_021508	GC	4	8	878300	878307	0 %	0 %	50 %	50 %	512444252
18530	NC_021508	ACGT	2	8	878465	878472	25 %	25 %	25 %	25 %	512444252
18531	NC_021508	CGCT	2	8	878485	878492	0 %	25 %	25 %	50 %	512444252
18532	NC_021508	CT	3	6	878683	878688	0 %	50 %	0 %	50 %	512444252
18533	NC_021508	CA	3	6	878719	878724	50 %	0 %	0 %	50 %	512444252
18534	NC_021508	AAG	2	6	878748	878753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18535	NC_021508	CA	3	6	878754	878759	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18536	NC_021508	GAA	2	6	878782	878787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18537	NC_021508	TG	3	6	878806	878811	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18538	NC_021508	GCAC	2	8	878895	878902	25 %	0 %	25 %	50 %	512444253
18539	NC_021508	TTG	2	6	878947	878952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512444253
18540	NC_021508	GT	4	8	878989	878996	0 %	50 %	50 %	0 %	512444253
18541	NC_021508	TGA	2	6	879038	879043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444253
18542	NC_021508	AGG	2	6	879101	879106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18543	NC_021508	GTT	2	6	879122	879127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512444254
18544	NC_021508	GGA	2	6	879167	879172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444254
18545	NC_021508	TCC	2	6	879192	879197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444254
18546	NC_021508	GAG	2	6	879202	879207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444254
18547	NC_021508	CGA	2	6	879281	879286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444254
18548	NC_021508	TCA	2	6	879328	879333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444254
18549	NC_021508	T	6	6	879369	879374	0 %	100 %	0 %	0 %	512444255
18550	NC_021508	TC	3	6	879413	879418	0 %	50 %	0 %	50 %	512444255
18551	NC_021508	GCC	2	6	879578	879583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444255
18552	NC_021508	GAG	2	6	879722	879727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444255
18553	NC_021508	AGG	2	6	879733	879738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444255
18554	NC_021508	A	6	6	879746	879751	100 %	0 %	0 %	0 %	512444255
18555	NC_021508	T	7	7	879792	879798	0 %	100 %	0 %	0 %	512444255
18556	NC_021508	GGC	2	6	879814	879819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444255
18557	NC_021508	GA	3	6	879867	879872	50 %	0 %	50 %	0 %	512444255
18558	NC_021508	GTA	2	6	879930	879935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444255
18559	NC_021508	GTC	2	6	879950	879955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444255
18560	NC_021508	A	7	7	880043	880049	100 %	0 %	0 %	0 %	512444255
18561	NC_021508	TGC	2	6	880118	880123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18562	NC_021508	CCGC	2	8	880158	880165	0 %	0 %	25 %	75 %	512444256
18563	NC_021508	AGG	2	6	880183	880188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444256
18564	NC_021508	GC	3	6	880192	880197	0 %	0 %	50 %	50 %	512444256
18565	NC_021508	ATCT	3	12	880319	880330	25 %	50 %	0 %	25 %	512444256
18566	NC_021508	CTG	2	6	880346	880351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444256
18567	NC_021508	TG	3	6	880350	880355	0 %	50 %	50 %	0 %	512444256
18568	NC_021508	AGA	2	6	880381	880386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444256
18569	NC_021508	CCTA	2	8	880427	880434	25 %	25 %	0 %	50 %	512444256
18570	NC_021508	GCG	2	6	880447	880452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444256
18571	NC_021508	GCT	2	6	880515	880520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444256
18572	NC_021508	TCAAT	2	10	880552	880561	40 %	40 %	0 %	20 %	512444256
18573	NC_021508	ACC	2	6	880604	880609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444256
18574	NC_021508	GCG	2	6	880637	880642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444256
18575	NC_021508	TGA	2	6	880669	880674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444256
18576	NC_021508	GC	3	6	880692	880697	0 %	0 %	50 %	50 %	512444256
18577	NC_021508	GAG	2	6	880755	880760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444256
18578	NC_021508	AGC	2	6	880828	880833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444256
18579	NC_021508	TGC	2	6	880846	880851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444256
18580	NC_021508	TGCA	2	8	880856	880863	25 %	25 %	25 %	25 %	512444256
18581	NC_021508	CG	3	6	880870	880875	0 %	0 %	50 %	50 %	512444256
18582	NC_021508	CAA	2	6	880946	880951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444256
18583	NC_021508	ATCGC	2	10	881076	881085	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
18584	NC_021508	GCG	2	6	881091	881096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18585	NC_021508	AC	3	6	881173	881178	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18586	NC_021508	GTA	2	6	881191	881196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18587	NC_021508	TGC	2	6	881374	881379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18588	NC_021508	GC	3	6	881445	881450	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18589	NC_021508	GCT	2	6	881668	881673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18590	NC_021508	ACGG	2	8	881770	881777	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18591	NC_021508	GAA	2	6	881811	881816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18592	NC_021508	GTG	2	6	881848	881853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18593	NC_021508	CTC	2	6	881879	881884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18594	NC_021508	CG	3	6	881925	881930	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18595	NC_021508	ACGC	2	8	881955	881962	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18596	NC_021508	T	6	6	881972	881977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18597	NC_021508	CTC	2	6	881980	881985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18598	NC_021508	GT	3	6	882010	882015	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18599	NC_021508	T	8	8	882029	882036	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18600	NC_021508	GCA	2	6	882091	882096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18601	NC_021508	AGC	2	6	882156	882161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18602	NC_021508	CGC	2	6	882170	882175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18603	NC_021508	GGA	2	6	882206	882211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18604	NC_021508	AC	3	6	882253	882258	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18605	NC_021508	AAAGAC	2	12	882353	882364	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18606	NC_021508	GGCT	2	8	882530	882537	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18607	NC_021508	TCC	2	6	882579	882584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18608	NC_021508	GCA	2	6	882588	882593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18609	NC_021508	GC	3	6	882617	882622	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18610	NC_021508	TTGT	2	8	882648	882655	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18611	NC_021508	CGTG	2	8	882672	882679	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18612	NC_021508	GCAC	2	8	882682	882689	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18613	NC_021508	CGAA	2	8	882748	882755	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18614	NC_021508	A	6	6	882840	882845	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18615	NC_021508	AC	3	6	882876	882881	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18616	NC_021508	A	7	7	882956	882962	100 %	0 %	0 %	0 %	512444257
18617	NC_021508	TTC	2	6	882979	882984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444257
18618	NC_021508	TAT	2	6	883045	883050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512444257
18619	NC_021508	TGCG	2	8	883093	883100	0 %	25 %	50 %	25 %	512444257
18620	NC_021508	CTC	2	6	883234	883239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444257
18621	NC_021508	AAC	2	6	883322	883327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444257
18622	NC_021508	CACAC	2	10	883377	883386	40 %	0 %	0 %	60 %	512444257
18623	NC_021508	GC	3	6	883406	883411	0 %	0 %	50 %	50 %	512444257
18624	NC_021508	CAG	2	6	883464	883469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444257
18625	NC_021508	CG	3	6	883478	883483	0 %	0 %	50 %	50 %	512444257
18626	NC_021508	TGCTCC	2	12	883490	883501	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	512444257
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18881	NC_021508	ACA	2	6	896577	896582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444271
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18894	NC_021508	ATGG	2	8	897087	897094	25 %	25 %	50 %	0 %	512444272
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18909	NC_021508	GCA	2	6	897706	897711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444273
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18917	NC_021508	ATGA	2	8	898110	898117	50 %	25 %	25 %	0 %	512444273
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18930	NC_021508	CT	3	6	898727	898732	0 %	50 %	0 %	50 %	512444274
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18939	NC_021508	CGTG	2	8	899226	899233	0 %	25 %	50 %	25 %	512444275
18940	NC_021508	CTT	2	6	899293	899298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444275
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18962	NC_021508	GCG	2	6	900483	900488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444275
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18965	NC_021508	CTG	2	6	900535	900540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444275
18966	NC_021508	CGG	2	6	900619	900624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444275
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18968	NC_021508	GCC	2	6	900705	900710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444275
18969	NC_021508	CA	3	6	900717	900722	50 %	0 %	0 %	50 %	512444275
18970	NC_021508	CCTCA	2	10	900735	900744	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
18971	NC_021508	GAAC	2	8	900758	900765	50 %	0 %	25 %	25 %	512444276
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18976	NC_021508	GC	3	6	901059	901064	0 %	0 %	50 %	50 %	512444276
18977	NC_021508	CCT	2	6	901111	901116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444276
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18979	NC_021508	AGCCG	2	10	901322	901331	20 %	0 %	40 %	40 %	512444276
18980	NC_021508	ACG	2	6	901340	901345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444276
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18982	NC_021508	TCT	2	6	901427	901432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444276
18983	NC_021508	GAAA	2	8	901438	901445	75 %	0 %	25 %	0 %	512444276
18984	NC_021508	TGA	2	6	901493	901498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444276
18985	NC_021508	TGC	2	6	901561	901566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444276
18986	NC_021508	AC	3	6	901567	901572	50 %	0 %	0 %	50 %	512444276
18987	NC_021508	A	6	6	901593	901598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18988	NC_021508	AGC	2	6	901619	901624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18989	NC_021508	CG	3	6	901705	901710	0 %	0 %	50 %	50 %	512444277
18990	NC_021508	CTG	2	6	901712	901717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444277
18991	NC_021508	TATCAG	2	12	901792	901803	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	512444277
18992	NC_021508	CCT	2	6	901808	901813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444277
18993	NC_021508	TTC	2	6	901826	901831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444277
18994	NC_021508	TAC	2	6	901963	901968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444277
18995	NC_021508	GCG	2	6	901974	901979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444277
18996	NC_021508	CG	3	6	901982	901987	0 %	0 %	50 %	50 %	512444277
18997	NC_021508	AC	4	8	902060	902067	50 %	0 %	0 %	50 %	512444277
18998	NC_021508	GCG	2	6	902070	902075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444277
18999	NC_021508	GCG	2	6	902090	902095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444277
19000	NC_021508	CG	3	6	902157	902162	0 %	0 %	50 %	50 %	512444277

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