MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 23984

< Previous12...3132333435363738394041...4748Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17502	NC_021508	ACC	2	6	830047	830052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444212
17503	NC_021508	CG	3	6	830075	830080	0 %	0 %	50 %	50 %	512444212
17504	NC_021508	TCA	2	6	830089	830094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444212
17505	NC_021508	CTG	2	6	830100	830105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444212
17506	NC_021508	TG	3	6	830104	830109	0 %	50 %	50 %	0 %	512444212
17507	NC_021508	CG	3	6	830123	830128	0 %	0 %	50 %	50 %	512444212
17508	NC_021508	ATC	2	6	830212	830217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444212
17509	NC_021508	AGC	2	6	830308	830313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444212
17510	NC_021508	CAA	2	6	830328	830333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444212
17511	NC_021508	CTG	2	6	830334	830339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444212
17512	NC_021508	AAT	2	6	830409	830414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512444212
17513	NC_021508	AAT	2	6	830487	830492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512444212
17514	NC_021508	CTT	2	6	830501	830506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444212
17515	NC_021508	T	7	7	830522	830528	0 %	100 %	0 %	0 %	512444212
17516	NC_021508	CAC	2	6	830625	830630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444212
17517	NC_021508	GC	3	6	830667	830672	0 %	0 %	50 %	50 %	512444212
17518	NC_021508	CT	3	6	830736	830741	0 %	50 %	0 %	50 %	512444212
17519	NC_021508	AGC	2	6	830832	830837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444212
17520	NC_021508	GGT	2	6	830853	830858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512444212
17521	NC_021508	CCAT	2	8	830869	830876	25 %	25 %	0 %	50 %	512444212
17522	NC_021508	GGC	2	6	830936	830941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444212
17523	NC_021508	AAT	2	6	830973	830978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512444212
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17525	NC_021508	GCAA	2	8	831112	831119	50 %	0 %	25 %	25 %	512444212
17526	NC_021508	GACC	2	8	831140	831147	25 %	0 %	25 %	50 %	512444212
17527	NC_021508	C	6	6	831171	831176	0 %	0 %	0 %	100 %	512444212
17528	NC_021508	ACT	2	6	831214	831219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444212
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17530	NC_021508	GTG	2	6	831271	831276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512444212
17531	NC_021508	CTT	2	6	831284	831289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444212
17532	NC_021508	CCG	2	6	831293	831298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444212
17533	NC_021508	GC	3	6	831303	831308	0 %	0 %	50 %	50 %	512444212
17534	NC_021508	A	6	6	831384	831389	100 %	0 %	0 %	0 %	512444212
17535	NC_021508	AGC	2	6	831397	831402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444212
17536	NC_021508	CG	3	6	831443	831448	0 %	0 %	50 %	50 %	512444212
17537	NC_021508	ACC	2	6	831463	831468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444212
17538	NC_021508	TAGG	2	8	831523	831530	25 %	25 %	50 %	0 %	512444212
17539	NC_021508	AG	3	6	831543	831548	50 %	0 %	50 %	0 %	512444212
17540	NC_021508	GC	3	6	831579	831584	0 %	0 %	50 %	50 %	512444212
17541	NC_021508	ACA	2	6	831616	831621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444212
17542	NC_021508	GAT	2	6	831672	831677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444212
17543	NC_021508	AGCA	2	8	831714	831721	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17544	NC_021508	CGAG	2	8	831743	831750	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17545	NC_021508	GAC	2	6	831790	831795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17546	NC_021508	G	6	6	831815	831820	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
17547	NC_021508	A	6	6	831828	831833	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17548	NC_021508	GAA	2	6	831847	831852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17549	NC_021508	GC	3	6	831907	831912	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17550	NC_021508	AAG	2	6	831939	831944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17551	NC_021508	TG	3	6	831962	831967	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17552	NC_021508	TGC	2	6	832017	832022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17553	NC_021508	A	7	7	832023	832029	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17554	NC_021508	CG	4	8	832034	832041	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17555	NC_021508	GC	3	6	832060	832065	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17556	NC_021508	ACCT	2	8	832091	832098	25 %	25 %	0 %	50 %	512444213
17557	NC_021508	CGC	2	6	832136	832141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444213
17558	NC_021508	GC	3	6	832224	832229	0 %	0 %	50 %	50 %	512444213
17559	NC_021508	GCAC	2	8	832257	832264	25 %	0 %	25 %	50 %	512444213
17560	NC_021508	CGA	2	6	832319	832324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444213
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17563	NC_021508	CTCC	2	8	832398	832405	0 %	25 %	0 %	75 %	512444213
17564	NC_021508	GCCC	2	8	832411	832418	0 %	0 %	25 %	75 %	512444213
17565	NC_021508	TTC	3	9	832433	832441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444213
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17568	NC_021508	CT	3	6	832672	832677	0 %	50 %	0 %	50 %	512444213
17569	NC_021508	GCA	2	6	832691	832696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444213
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17571	NC_021508	TCAT	2	8	832729	832736	25 %	50 %	0 %	25 %	512444213
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17574	NC_021508	GATT	2	8	832790	832797	25 %	50 %	25 %	0 %	512444213
17575	NC_021508	CTCA	2	8	832895	832902	25 %	25 %	0 %	50 %	512444213
17576	NC_021508	GCG	2	6	832912	832917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444213
17577	NC_021508	TCT	2	6	832935	832940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444213
17578	NC_021508	AGG	2	6	832950	832955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444213
17579	NC_021508	GC	3	6	833013	833018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17580	NC_021508	GGCG	2	8	833049	833056	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17581	NC_021508	CTG	2	6	833099	833104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17582	NC_021508	GC	3	6	833146	833151	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17583	NC_021508	GAA	2	6	833163	833168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17584	NC_021508	GC	3	6	833218	833223	0 %	0 %	50 %	50 %	512444214
17585	NC_021508	CCAT	2	8	833287	833294	25 %	25 %	0 %	50 %	512444214
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17589	NC_021508	CCAGTC	2	12	833516	833527	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	512444214
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17591	NC_021508	GC	3	6	833752	833757	0 %	0 %	50 %	50 %	512444214
17592	NC_021508	CGTG	2	8	833759	833766	0 %	25 %	50 %	25 %	512444214
17593	NC_021508	GCG	2	6	833829	833834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444214
17594	NC_021508	T	6	6	833944	833949	0 %	100 %	0 %	0 %	512444214
17595	NC_021508	TAC	2	6	834003	834008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444214
17596	NC_021508	GAG	2	6	834060	834065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444214
17597	NC_021508	A	6	6	834177	834182	100 %	0 %	0 %	0 %	512444214
17598	NC_021508	CG	4	8	834204	834211	0 %	0 %	50 %	50 %	512444214
17599	NC_021508	TGTT	2	8	834370	834377	0 %	75 %	25 %	0 %	512444214
17600	NC_021508	ATC	2	6	834513	834518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444214
17601	NC_021508	GC	4	8	834630	834637	0 %	0 %	50 %	50 %	512444214
17602	NC_021508	CGG	2	6	834668	834673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444214
17603	NC_021508	ATCAA	2	10	834742	834751	60 %	20 %	0 %	20 %	512444214
17604	NC_021508	GAG	2	6	834754	834759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444214
17605	NC_021508	AAAG	2	8	834812	834819	75 %	0 %	25 %	0 %	512444214
17606	NC_021508	CTC	2	6	834890	834895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444214
17607	NC_021508	GGC	2	6	834911	834916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444214
17608	NC_021508	AGT	2	6	834959	834964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444214
17609	NC_021508	TTAA	2	8	835029	835036	50 %	50 %	0 %	0 %	512444214
17610	NC_021508	GCG	2	6	835040	835045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444214
17611	NC_021508	TTC	2	6	835142	835147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444214
17612	NC_021508	CA	3	6	835148	835153	50 %	0 %	0 %	50 %	512444214
17613	NC_021508	GGC	2	6	835279	835284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17614	NC_021508	CTC	2	6	835360	835365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17615	NC_021508	GAG	2	6	835375	835380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17616	NC_021508	CAT	2	6	835400	835405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444215
17617	NC_021508	AGG	2	6	835483	835488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444215
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17619	NC_021508	AGC	2	6	835510	835515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444215
17620	NC_021508	GC	3	6	835573	835578	0 %	0 %	50 %	50 %	512444215
17621	NC_021508	ACG	2	6	835786	835791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444215
17622	NC_021508	GAA	2	6	835812	835817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444215
17623	NC_021508	GAA	2	6	835823	835828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444215
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17625	NC_021508	TAC	2	6	835930	835935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444215
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17994	NC_021508	A	9	9	853046	853054	100 %	0 %	0 %	0 %	512444231
17995	NC_021508	TAC	2	6	853107	853112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444231
17996	NC_021508	ACT	2	6	853116	853121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444231
17997	NC_021508	TGC	2	6	853125	853130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444231
17998	NC_021508	A	7	7	853190	853196	100 %	0 %	0 %	0 %	512444231
17999	NC_021508	TACC	2	8	853230	853237	25 %	25 %	0 %	50 %	512444231
18000	NC_021508	GTAT	2	8	853265	853272	25 %	50 %	25 %	0 %	512444231

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