MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 23984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_021508	GC	4	8	805585	805592	0 %	0 %	50 %	50 %	512444186
17003	NC_021508	AC	3	6	805602	805607	50 %	0 %	0 %	50 %	512444186
17004	NC_021508	TCC	2	6	805613	805618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444186
17005	NC_021508	GC	4	8	805619	805626	0 %	0 %	50 %	50 %	512444186
17006	NC_021508	CA	3	6	805629	805634	50 %	0 %	0 %	50 %	512444186
17007	NC_021508	AGC	2	6	805654	805659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444186
17008	NC_021508	CCT	2	6	805679	805684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444187
17009	NC_021508	TCA	2	6	805753	805758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444187
17010	NC_021508	CCA	2	6	805805	805810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444187
17011	NC_021508	CGA	2	6	805841	805846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444187
17012	NC_021508	CGT	2	6	805895	805900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444187
17013	NC_021508	CGT	2	6	805926	805931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444187
17014	NC_021508	GC	3	6	805932	805937	0 %	0 %	50 %	50 %	512444187
17015	NC_021508	AC	3	6	805979	805984	50 %	0 %	0 %	50 %	512444187
17016	NC_021508	T	6	6	806167	806172	0 %	100 %	0 %	0 %	512444187
17017	NC_021508	TGAA	2	8	806229	806236	50 %	25 %	25 %	0 %	512444187
17018	NC_021508	A	6	6	806238	806243	100 %	0 %	0 %	0 %	512444187
17019	NC_021508	CAA	2	6	806268	806273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444187
17020	NC_021508	TG	3	6	806412	806417	0 %	50 %	50 %	0 %	512444187
17021	NC_021508	AG	3	6	806454	806459	50 %	0 %	50 %	0 %	512444187
17022	NC_021508	CTC	2	6	806550	806555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444187
17023	NC_021508	CGCT	2	8	806563	806570	0 %	25 %	25 %	50 %	512444187
17024	NC_021508	CG	3	6	806649	806654	0 %	0 %	50 %	50 %	512444187
17025	NC_021508	ATA	2	6	806667	806672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512444187
17026	NC_021508	CAA	2	6	806675	806680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444187
17027	NC_021508	ACAA	2	8	806716	806723	75 %	0 %	0 %	25 %	512444187
17028	NC_021508	AGA	2	6	806783	806788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444187
17029	NC_021508	A	8	8	806814	806821	100 %	0 %	0 %	0 %	512444187
17030	NC_021508	GAG	2	6	806823	806828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444187
17031	NC_021508	A	7	7	806830	806836	100 %	0 %	0 %	0 %	512444187
17032	NC_021508	TCG	2	6	806886	806891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17033	NC_021508	AC	4	8	806905	806912	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17034	NC_021508	CA	3	6	807026	807031	50 %	0 %	0 %	50 %	512444188
17035	NC_021508	CACT	2	8	807039	807046	25 %	25 %	0 %	50 %	512444188
17036	NC_021508	GCA	2	6	807053	807058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444188
17037	NC_021508	TAACGT	2	12	807067	807078	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	512444188
17038	NC_021508	CGC	2	6	807100	807105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444188
17039	NC_021508	AC	3	6	807156	807161	50 %	0 %	0 %	50 %	512444188
17040	NC_021508	ACA	3	9	807201	807209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444188
17041	NC_021508	AC	4	8	807240	807247	50 %	0 %	0 %	50 %	512444188
17042	NC_021508	GC	3	6	807254	807259	0 %	0 %	50 %	50 %	512444188
17043	NC_021508	CGCA	2	8	807312	807319	25 %	0 %	25 %	50 %	512444188
17044	NC_021508	GCA	3	9	807317	807325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444188
17045	NC_021508	CAA	2	6	807328	807333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444188
17046	NC_021508	CCG	2	6	807418	807423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444188
17047	NC_021508	ACG	2	6	807451	807456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444188
17048	NC_021508	GC	4	8	807488	807495	0 %	0 %	50 %	50 %	512444188
17049	NC_021508	GAAA	3	12	807574	807585	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17050	NC_021508	GAA	2	6	807590	807595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17051	NC_021508	GAA	2	6	807599	807604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17052	NC_021508	AAG	2	6	807621	807626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17053	NC_021508	CG	3	6	807654	807659	0 %	0 %	50 %	50 %	512444189
17054	NC_021508	ATA	2	6	807660	807665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512444189
17055	NC_021508	CCG	2	6	807763	807768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444189
17056	NC_021508	GGGAA	2	10	807777	807786	40 %	0 %	60 %	0 %	512444189
17057	NC_021508	C	6	6	807821	807826	0 %	0 %	0 %	100 %	512444189
17058	NC_021508	GC	3	6	807845	807850	0 %	0 %	50 %	50 %	512444189
17059	NC_021508	GT	3	6	807869	807874	0 %	50 %	50 %	0 %	512444189
17060	NC_021508	GC	3	6	807911	807916	0 %	0 %	50 %	50 %	512444189
17061	NC_021508	TGC	2	6	807981	807986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444189
17062	NC_021508	GCACTT	2	12	808095	808106	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	512444189
17063	NC_021508	CCTT	2	8	808107	808114	0 %	50 %	0 %	50 %	512444189
17064	NC_021508	ATC	2	6	808294	808299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444190
17065	NC_021508	AC	3	6	808309	808314	50 %	0 %	0 %	50 %	512444190
17066	NC_021508	CA	3	6	808361	808366	50 %	0 %	0 %	50 %	512444190
17067	NC_021508	AACGC	2	10	808371	808380	40 %	0 %	20 %	40 %	512444190
17068	NC_021508	AG	3	6	808396	808401	50 %	0 %	50 %	0 %	512444190
17069	NC_021508	CCT	2	6	808413	808418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444190
17070	NC_021508	GCT	2	6	808491	808496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444190
17071	NC_021508	CG	3	6	808545	808550	0 %	0 %	50 %	50 %	512444190
17072	NC_021508	GCAAA	2	10	808591	808600	60 %	0 %	20 %	20 %	512444190
17073	NC_021508	GTAT	2	8	808603	808610	25 %	50 %	25 %	0 %	512444190
17074	NC_021508	GCA	2	6	808767	808772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444190
17075	NC_021508	CG	3	6	808815	808820	0 %	0 %	50 %	50 %	512444190
17076	NC_021508	CG	3	6	808823	808828	0 %	0 %	50 %	50 %	512444190
17077	NC_021508	A	7	7	808834	808840	100 %	0 %	0 %	0 %	512444190
17078	NC_021508	AGA	2	6	808849	808854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444190
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17080	NC_021508	GC	3	6	808947	808952	0 %	0 %	50 %	50 %	512444190
17081	NC_021508	CTG	2	6	808963	808968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444190
17082	NC_021508	ACC	2	6	808999	809004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444190
17083	NC_021508	GCG	2	6	809140	809145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444190
17084	NC_021508	CGC	2	6	809247	809252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444190
17085	NC_021508	C	6	6	809264	809269	0 %	0 %	0 %	100 %	512444190
17086	NC_021508	GCC	2	6	809275	809280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444190
17087	NC_021508	CCG	2	6	809299	809304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444190
17088	NC_021508	CA	3	6	809311	809316	50 %	0 %	0 %	50 %	512444190
17089	NC_021508	TCA	2	6	809357	809362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444190
17090	NC_021508	CT	3	6	809378	809383	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17091	NC_021508	CTT	2	6	809439	809444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17092	NC_021508	AGG	2	6	809465	809470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17093	NC_021508	AAG	2	6	809496	809501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444191
17094	NC_021508	CA	3	6	809516	809521	50 %	0 %	0 %	50 %	512444191
17095	NC_021508	CCTT	2	8	809538	809545	0 %	50 %	0 %	50 %	512444191
17096	NC_021508	GAGCAA	2	12	809568	809579	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	512444191
17097	NC_021508	ACC	2	6	809674	809679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444191
17098	NC_021508	AAC	2	6	809681	809686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444191
17099	NC_021508	CT	3	6	809742	809747	0 %	50 %	0 %	50 %	512444191
17100	NC_021508	TAC	2	6	809757	809762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444191
17101	NC_021508	C	6	6	809762	809767	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
17102	NC_021508	CA	3	6	809793	809798	50 %	0 %	0 %	50 %	512444192
17103	NC_021508	CGCA	2	8	809810	809817	25 %	0 %	25 %	50 %	512444192
17104	NC_021508	ACGT	2	8	809850	809857	25 %	25 %	25 %	25 %	512444192
17105	NC_021508	AG	3	6	809892	809897	50 %	0 %	50 %	0 %	512444192
17106	NC_021508	C	7	7	809917	809923	0 %	0 %	0 %	100 %	512444192
17107	NC_021508	GA	3	6	809933	809938	50 %	0 %	50 %	0 %	512444192
17108	NC_021508	CCG	2	6	809949	809954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444192
17109	NC_021508	CA	4	8	810021	810028	50 %	0 %	0 %	50 %	512444192
17110	NC_021508	GCA	2	6	810053	810058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444192
17111	NC_021508	GGT	2	6	810189	810194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512444193
17112	NC_021508	CTT	2	6	810199	810204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444193
17113	NC_021508	CAC	2	6	810253	810258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444193
17114	NC_021508	CG	3	6	810259	810264	0 %	0 %	50 %	50 %	512444193
17115	NC_021508	CCA	2	6	810314	810319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444193
17116	NC_021508	ATC	2	6	810320	810325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444193
17117	NC_021508	CCCG	2	8	810349	810356	0 %	0 %	25 %	75 %	512444193
17118	NC_021508	TAT	2	6	810372	810377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512444193
17119	NC_021508	TAC	3	9	810387	810395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444193
17120	NC_021508	A	6	6	810454	810459	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17121	NC_021508	ACGCAG	2	12	810481	810492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17122	NC_021508	ACGA	2	8	810539	810546	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17123	NC_021508	GC	3	6	810558	810563	0 %	0 %	50 %	50 %	512444194
17124	NC_021508	CCTT	2	8	810612	810619	0 %	50 %	0 %	50 %	512444194
17125	NC_021508	CA	3	6	810751	810756	50 %	0 %	0 %	50 %	512444194
17126	NC_021508	CG	3	6	810823	810828	0 %	0 %	50 %	50 %	512444194
17127	NC_021508	GC	3	6	810968	810973	0 %	0 %	50 %	50 %	512444194
17128	NC_021508	GCAG	2	8	810999	811006	25 %	0 %	50 %	25 %	512444194
17129	NC_021508	CACC	2	8	811018	811025	25 %	0 %	0 %	75 %	512444194
17130	NC_021508	CCT	2	6	811036	811041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444194
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17132	NC_021508	GC	3	6	811224	811229	0 %	0 %	50 %	50 %	512444194
17133	NC_021508	CTC	2	6	811331	811336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444194
17134	NC_021508	CTC	2	6	811532	811537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444194
17135	NC_021508	CGG	2	6	811560	811565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444194
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17138	NC_021508	GCGAGC	2	12	811638	811649	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	512444194
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17140	NC_021508	GTA	2	6	811796	811801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444194
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17144	NC_021508	AGAA	2	8	811955	811962	75 %	0 %	25 %	0 %	512444194
17145	NC_021508	CACGC	2	10	812056	812065	20 %	0 %	20 %	60 %	512444194
17146	NC_021508	CCG	2	6	812104	812109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444194
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17148	NC_021508	C	7	7	812129	812135	0 %	0 %	0 %	100 %	512444194
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17158	NC_021508	CAG	2	6	812621	812626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444194
17159	NC_021508	CTT	2	6	812647	812652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444194
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17169	NC_021508	CCT	2	6	813331	813336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444195
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17171	NC_021508	AG	3	6	813430	813435	50 %	0 %	50 %	0 %	512444195
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17174	NC_021508	ATA	2	6	813513	813518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512444195
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17178	NC_021508	CTT	2	6	813704	813709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444195
17179	NC_021508	TCA	2	6	813855	813860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444195
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17182	NC_021508	TGA	2	6	813981	813986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444195
17183	NC_021508	CCTT	2	8	814057	814064	0 %	50 %	0 %	50 %	512444195
17184	NC_021508	AGC	2	6	814158	814163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444195
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17186	NC_021508	TTC	3	9	814254	814262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444195
17187	NC_021508	CAC	2	6	814295	814300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444195
17188	NC_021508	TGA	2	6	814313	814318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17189	NC_021508	TCTA	2	8	814373	814380	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17190	NC_021508	GCAC	2	8	814615	814622	25 %	0 %	25 %	50 %	512444196
17191	NC_021508	ACG	3	9	814629	814637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444196
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17193	NC_021508	CTC	2	6	814842	814847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444196
17194	NC_021508	CATA	2	8	814880	814887	50 %	25 %	0 %	25 %	512444196
17195	NC_021508	CTTC	2	8	814917	814924	0 %	50 %	0 %	50 %	512444196
17196	NC_021508	CAG	2	6	814979	814984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444196
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17199	NC_021508	TCA	2	6	815095	815100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444196
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17207	NC_021508	CG	3	6	815502	815507	0 %	0 %	50 %	50 %	512444196
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17213	NC_021508	CGT	2	6	815745	815750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444196
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17215	NC_021508	TC	3	6	815876	815881	0 %	50 %	0 %	50 %	512444196
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17218	NC_021508	CTT	2	6	816123	816128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444196
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17221	NC_021508	CCT	2	6	816245	816250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444196
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17229	NC_021508	T	6	6	816522	816527	0 %	100 %	0 %	0 %	512444197
17230	NC_021508	T	6	6	816534	816539	0 %	100 %	0 %	0 %	512444197
17231	NC_021508	A	6	6	816603	816608	100 %	0 %	0 %	0 %	512444197
17232	NC_021508	TGCA	2	8	816652	816659	25 %	25 %	25 %	25 %	512444198
17233	NC_021508	TGA	2	6	816691	816696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444198
17234	NC_021508	CAG	2	6	816734	816739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444198
17235	NC_021508	TCC	2	6	816771	816776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444198
17236	NC_021508	ATT	2	6	816876	816881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512444198
17237	NC_021508	A	6	6	816961	816966	100 %	0 %	0 %	0 %	512444198
17238	NC_021508	ACA	2	6	816973	816978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444198
17239	NC_021508	GTTA	2	8	816998	817005	25 %	50 %	25 %	0 %	512444198
17240	NC_021508	ACG	2	6	817018	817023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444198
17241	NC_021508	GCA	2	6	817177	817182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444198
17242	NC_021508	CTC	2	6	817216	817221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444198
17243	NC_021508	AG	3	6	817229	817234	50 %	0 %	50 %	0 %	512444198
17244	NC_021508	GTT	2	6	817334	817339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512444199
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17246	NC_021508	TCC	2	6	817391	817396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444199
17247	NC_021508	CTG	2	6	817438	817443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444199
17248	NC_021508	CG	3	6	817457	817462	0 %	0 %	50 %	50 %	512444199
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17255	NC_021508	CTG	2	6	817725	817730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444199
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17259	NC_021508	CCG	3	9	817862	817870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444199
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17263	NC_021508	CAA	2	6	818200	818205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444200
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17334	NC_021508	CAT	2	6	821769	821774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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17357	NC_021508	CAT	2	6	822815	822820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444205
17358	NC_021508	A	7	7	822847	822853	100 %	0 %	0 %	0 %	512444205
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17491	NC_021508	GCA	2	6	829525	829530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444211
17492	NC_021508	CGC	2	6	829563	829568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444211
17493	NC_021508	TCG	2	6	829577	829582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444211
17494	NC_021508	CG	4	8	829625	829632	0 %	0 %	50 %	50 %	512444211
17495	NC_021508	GGT	2	6	829701	829706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512444211
17496	NC_021508	CGA	2	6	829719	829724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444211
17497	NC_021508	CAT	2	6	829779	829784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444211
17498	NC_021508	CTG	3	9	829899	829907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444212
17499	NC_021508	T	6	6	829918	829923	0 %	100 %	0 %	0 %	512444212
17500	NC_021508	TCG	2	6	829966	829971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444212

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