MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 23984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16502	NC_021508	CT	3	6	783024	783029	0 %	50 %	0 %	50 %	512444163
16503	NC_021508	TAC	2	6	783038	783043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444163
16504	NC_021508	CTT	2	6	783076	783081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444163
16505	NC_021508	A	7	7	783115	783121	100 %	0 %	0 %	0 %	512444163
16506	NC_021508	CGT	2	6	783152	783157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444163
16507	NC_021508	CCT	2	6	783178	783183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444163
16508	NC_021508	GA	4	8	783239	783246	50 %	0 %	50 %	0 %	512444163
16509	NC_021508	GAG	2	6	783309	783314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444163
16510	NC_021508	AAC	2	6	783495	783500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444163
16511	NC_021508	CAT	2	6	783547	783552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444163
16512	NC_021508	ACC	2	6	783555	783560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444163
16513	NC_021508	GAT	2	6	783587	783592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444163
16514	NC_021508	GAT	2	6	783662	783667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444163
16515	NC_021508	TTC	2	6	783719	783724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444163
16516	NC_021508	CA	3	6	783732	783737	50 %	0 %	0 %	50 %	512444163
16517	NC_021508	CCT	2	6	783781	783786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444163
16518	NC_021508	AAT	2	6	783902	783907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512444163
16519	NC_021508	TAA	2	6	783955	783960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512444163
16520	NC_021508	CAA	2	6	784000	784005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444163
16521	NC_021508	T	6	6	784114	784119	0 %	100 %	0 %	0 %	512444163
16522	NC_021508	AC	3	6	784184	784189	50 %	0 %	0 %	50 %	512444163
16523	NC_021508	A	6	6	784196	784201	100 %	0 %	0 %	0 %	512444163
16524	NC_021508	AATAA	2	10	784259	784268	80 %	20 %	0 %	0 %	512444163
16525	NC_021508	ACA	3	9	784360	784368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444163
16526	NC_021508	AAG	2	6	784369	784374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444163
16527	NC_021508	GCAA	2	8	784383	784390	50 %	0 %	25 %	25 %	512444163
16528	NC_021508	TGC	2	6	784427	784432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444163
16529	NC_021508	CCCT	2	8	784440	784447	0 %	25 %	0 %	75 %	512444163
16530	NC_021508	TAA	2	6	784495	784500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512444163
16531	NC_021508	TCCA	2	8	784541	784548	25 %	25 %	0 %	50 %	512444163
16532	NC_021508	A	7	7	784556	784562	100 %	0 %	0 %	0 %	512444163
16533	NC_021508	CTT	3	9	784600	784608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444163
16534	NC_021508	GCA	2	6	784683	784688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444163
16535	NC_021508	TAA	2	6	784717	784722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512444163
16536	NC_021508	ATG	2	6	784746	784751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444163
16537	NC_021508	TCC	2	6	784790	784795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444163
16538	NC_021508	CAC	2	6	784796	784801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444163
16539	NC_021508	AGTCCA	2	12	784881	784892	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	512444163
16540	NC_021508	CAA	2	6	784907	784912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444163
16541	NC_021508	CAA	2	6	784948	784953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444163
16542	NC_021508	AAGAT	2	10	784983	784992	60 %	20 %	20 %	0 %	512444163
16543	NC_021508	AAC	2	6	785033	785038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444163
16544	NC_021508	ACC	2	6	785052	785057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444163
16545	NC_021508	CAA	2	6	785071	785076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444163
16546	NC_021508	AGT	2	6	785084	785089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444163
16547	NC_021508	TC	3	6	785210	785215	0 %	50 %	0 %	50 %	512444164
16548	NC_021508	GTTT	2	8	785253	785260	0 %	75 %	25 %	0 %	512444164
16549	NC_021508	TCT	2	6	785261	785266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444164
16550	NC_021508	CT	3	6	785437	785442	0 %	50 %	0 %	50 %	512444164
16551	NC_021508	CTC	2	6	785509	785514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444164
16552	NC_021508	CTT	2	6	785558	785563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444164
16553	NC_021508	GAA	2	6	785566	785571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444164
16554	NC_021508	ACTT	2	8	785605	785612	25 %	50 %	0 %	25 %	512444164
16555	NC_021508	GAG	2	6	785614	785619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444164
16556	NC_021508	ATGTA	2	10	785637	785646	40 %	40 %	20 %	0 %	512444164
16557	NC_021508	AAAC	2	8	785682	785689	75 %	0 %	0 %	25 %	512444164
16558	NC_021508	A	6	6	785725	785730	100 %	0 %	0 %	0 %	512444164
16559	NC_021508	GA	3	6	785749	785754	50 %	0 %	50 %	0 %	512444164
16560	NC_021508	A	7	7	785784	785790	100 %	0 %	0 %	0 %	512444164
16561	NC_021508	A	6	6	785801	785806	100 %	0 %	0 %	0 %	512444164
16562	NC_021508	CAA	2	6	785913	785918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444164
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16564	NC_021508	TGGA	2	8	785981	785988	25 %	25 %	50 %	0 %	512444164
16565	NC_021508	GTA	2	6	785993	785998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444164
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16567	NC_021508	GCAA	2	8	786053	786060	50 %	0 %	25 %	25 %	512444164
16568	NC_021508	CTT	2	6	786129	786134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444164
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16570	NC_021508	CTT	2	6	786240	786245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444164
16571	NC_021508	GCT	2	6	786281	786286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444165
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16573	NC_021508	GAA	2	6	786341	786346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444165
16574	NC_021508	AAAC	2	8	786359	786366	75 %	0 %	0 %	25 %	512444165
16575	NC_021508	AG	3	6	786396	786401	50 %	0 %	50 %	0 %	512444165
16576	NC_021508	TAA	2	6	786429	786434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512444165
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16578	NC_021508	A	6	6	786525	786530	100 %	0 %	0 %	0 %	512444165
16579	NC_021508	CAG	2	6	786531	786536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444165
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16583	NC_021508	A	7	7	786740	786746	100 %	0 %	0 %	0 %	512444165
16584	NC_021508	TAA	2	6	786782	786787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512444165
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16586	NC_021508	CAA	2	6	786825	786830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444165
16587	NC_021508	AG	3	6	786956	786961	50 %	0 %	50 %	0 %	512444165
16588	NC_021508	CCG	2	6	786992	786997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444165
16589	NC_021508	A	8	8	787002	787009	100 %	0 %	0 %	0 %	512444165
16590	NC_021508	CTC	2	6	787075	787080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444166
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16592	NC_021508	CCAC	2	8	787140	787147	25 %	0 %	0 %	75 %	512444166
16593	NC_021508	GAG	2	6	787149	787154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444166
16594	NC_021508	ACC	2	6	787291	787296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444166
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16596	NC_021508	CA	3	6	787344	787349	50 %	0 %	0 %	50 %	512444166
16597	NC_021508	CTAT	2	8	787387	787394	25 %	50 %	0 %	25 %	512444167
16598	NC_021508	CAG	2	6	787395	787400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444167
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16601	NC_021508	CAA	2	6	787511	787516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444167
16602	NC_021508	AGA	2	6	787662	787667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444167
16603	NC_021508	TG	3	6	787846	787851	0 %	50 %	50 %	0 %	512444167
16604	NC_021508	GGC	2	6	787852	787857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444167
16605	NC_021508	TGC	2	6	787861	787866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444167
16606	NC_021508	TCA	2	6	787922	787927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444167
16607	NC_021508	TGA	2	6	788030	788035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444167
16608	NC_021508	GCCG	2	8	788050	788057	0 %	0 %	50 %	50 %	512444167
16609	NC_021508	CGC	2	6	788078	788083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444167
16610	NC_021508	CG	3	6	788096	788101	0 %	0 %	50 %	50 %	512444167
16611	NC_021508	GAA	2	6	788121	788126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444167
16612	NC_021508	GC	3	6	788147	788152	0 %	0 %	50 %	50 %	512444167
16613	NC_021508	ACGC	2	8	788158	788165	25 %	0 %	25 %	50 %	512444167
16614	NC_021508	GCA	2	6	788193	788198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444168
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16616	NC_021508	CTT	2	6	788234	788239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444168
16617	NC_021508	CG	4	8	788293	788300	0 %	0 %	50 %	50 %	512444168
16618	NC_021508	GC	3	6	788309	788314	0 %	0 %	50 %	50 %	512444168
16619	NC_021508	TCA	2	6	788355	788360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444168
16620	NC_021508	CGA	2	6	788362	788367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444168
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16622	NC_021508	GC	3	6	788478	788483	0 %	0 %	50 %	50 %	512444168
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16867	NC_021508	CCG	2	6	799690	799695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444180
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16901	NC_021508	CG	3	6	801221	801226	0 %	0 %	50 %	50 %	512444182
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16903	NC_021508	CG	3	6	801316	801321	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16904	NC_021508	GCA	2	6	801338	801343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16978	NC_021508	GAC	2	6	804649	804654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444185
16979	NC_021508	AAAC	2	8	804732	804739	75 %	0 %	0 %	25 %	512444185
16980	NC_021508	ACC	2	6	804740	804745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444185
16981	NC_021508	GC	3	6	804751	804756	0 %	0 %	50 %	50 %	512444185
16982	NC_021508	TCAT	2	8	804767	804774	25 %	50 %	0 %	25 %	512444185
16983	NC_021508	ATCGC	2	10	804788	804797	20 %	20 %	20 %	40 %	512444185
16984	NC_021508	GCGT	2	8	804865	804872	0 %	25 %	50 %	25 %	512444185
16985	NC_021508	ACTG	2	8	804903	804910	25 %	25 %	25 %	25 %	512444185
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