MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 23984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_021508	TTCC	2	8	733802	733809	0 %	50 %	0 %	50 %	512444121
15502	NC_021508	CGT	2	6	733885	733890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444121
15503	NC_021508	CTG	2	6	734066	734071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444121
15504	NC_021508	T	6	6	734181	734186	0 %	100 %	0 %	0 %	512444121
15505	NC_021508	ATC	2	6	734202	734207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444121
15506	NC_021508	ATC	2	6	734224	734229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444121
15507	NC_021508	CGC	2	6	734277	734282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444121
15508	NC_021508	TAA	2	6	734306	734311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512444121
15509	NC_021508	CGCA	2	8	734340	734347	25 %	0 %	25 %	50 %	512444121
15510	NC_021508	CTT	2	6	734360	734365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444121
15511	NC_021508	CAAAA	2	10	734375	734384	80 %	0 %	0 %	20 %	512444121
15512	NC_021508	CAA	2	6	734489	734494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444121
15513	NC_021508	CCCCG	2	10	734512	734521	0 %	0 %	20 %	80 %	512444121
15514	NC_021508	TAA	2	6	734555	734560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512444121
15515	NC_021508	CAA	2	6	734585	734590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444121
15516	NC_021508	ATCC	2	8	734592	734599	25 %	25 %	0 %	50 %	512444121
15517	NC_021508	TTC	2	6	734640	734645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444121
15518	NC_021508	ACT	2	6	734650	734655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444121
15519	NC_021508	AGC	2	6	734743	734748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444121
15520	NC_021508	T	6	6	734840	734845	0 %	100 %	0 %	0 %	512444121
15521	NC_021508	AGA	2	6	734847	734852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444121
15522	NC_021508	TTC	3	9	734905	734913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444121
15523	NC_021508	CAG	2	6	734925	734930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444121
15524	NC_021508	CGT	2	6	734972	734977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444121
15525	NC_021508	ACC	2	6	734983	734988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444121
15526	NC_021508	TCAA	2	8	735016	735023	50 %	25 %	0 %	25 %	512444121
15527	NC_021508	TCT	2	6	735038	735043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444121
15528	NC_021508	TCA	2	6	735046	735051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444121
15529	NC_021508	GC	3	6	735111	735116	0 %	0 %	50 %	50 %	512444121
15530	NC_021508	TTC	2	6	735120	735125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444121
15531	NC_021508	CAAGA	2	10	735173	735182	60 %	0 %	20 %	20 %	512444121
15532	NC_021508	GTA	2	6	735243	735248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444121
15533	NC_021508	GGA	2	6	735270	735275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444121
15534	NC_021508	AGCA	2	8	735312	735319	50 %	0 %	25 %	25 %	512444121
15535	NC_021508	CAG	2	6	735422	735427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444121
15536	NC_021508	AAGCGC	2	12	735477	735488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444121
15537	NC_021508	GAA	2	6	735532	735537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444121
15538	NC_021508	TCCA	2	8	735540	735547	25 %	25 %	0 %	50 %	512444121
15539	NC_021508	AAT	2	6	735554	735559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512444121
15540	NC_021508	GC	3	6	735591	735596	0 %	0 %	50 %	50 %	512444121
15541	NC_021508	A	6	6	735606	735611	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15542	NC_021508	ACAGC	2	10	735639	735648	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
15543	NC_021508	TTG	2	6	735658	735663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15544	NC_021508	TA	3	6	735670	735675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15545	NC_021508	AGGG	2	8	735762	735769	25 %	0 %	75 %	0 %	512444122
15546	NC_021508	GTC	2	6	735792	735797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444122
15547	NC_021508	GCA	2	6	735820	735825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444122
15548	NC_021508	CA	3	6	735839	735844	50 %	0 %	0 %	50 %	512444122
15549	NC_021508	GCG	2	6	735871	735876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444122
15550	NC_021508	CG	3	6	735875	735880	0 %	0 %	50 %	50 %	512444122
15551	NC_021508	A	7	7	736035	736041	100 %	0 %	0 %	0 %	512444122
15552	NC_021508	GC	3	6	736081	736086	0 %	0 %	50 %	50 %	512444122
15553	NC_021508	CG	3	6	736147	736152	0 %	0 %	50 %	50 %	512444122
15554	NC_021508	CG	4	8	736267	736274	0 %	0 %	50 %	50 %	512444122
15555	NC_021508	CCA	2	6	736286	736291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444122
15556	NC_021508	CTGCA	2	10	736350	736359	20 %	20 %	20 %	40 %	512444122
15557	NC_021508	CTGC	2	8	736375	736382	0 %	25 %	25 %	50 %	512444122
15558	NC_021508	CAA	2	6	736433	736438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444122
15559	NC_021508	TGCATA	2	12	736444	736455	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	512444122
15560	NC_021508	CGC	2	6	736503	736508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444122
15561	NC_021508	CA	3	6	736556	736561	50 %	0 %	0 %	50 %	512444122
15562	NC_021508	GCA	2	6	736586	736591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444122
15563	NC_021508	AC	3	6	736663	736668	50 %	0 %	0 %	50 %	512444122
15564	NC_021508	ACC	2	6	736701	736706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444122
15565	NC_021508	AC	3	6	736719	736724	50 %	0 %	0 %	50 %	512444122
15566	NC_021508	ACG	2	6	736815	736820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444122
15567	NC_021508	GT	3	6	736843	736848	0 %	50 %	50 %	0 %	512444122
15568	NC_021508	GC	3	6	736863	736868	0 %	0 %	50 %	50 %	512444122
15569	NC_021508	CAC	2	6	736938	736943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444122
15570	NC_021508	GCCAAT	2	12	736971	736982	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	512444123
15571	NC_021508	TAC	2	6	737040	737045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444123
15572	NC_021508	ACA	2	6	737088	737093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444123
15573	NC_021508	TCCC	2	8	737134	737141	0 %	25 %	0 %	75 %	512444123
15574	NC_021508	TA	3	6	737206	737211	50 %	50 %	0 %	0 %	512444123
15575	NC_021508	AGAA	2	8	737252	737259	75 %	0 %	25 %	0 %	512444123
15576	NC_021508	A	7	7	737276	737282	100 %	0 %	0 %	0 %	512444123
15577	NC_021508	A	6	6	737325	737330	100 %	0 %	0 %	0 %	512444123
15578	NC_021508	AC	3	6	737332	737337	50 %	0 %	0 %	50 %	512444123
15579	NC_021508	A	7	7	737382	737388	100 %	0 %	0 %	0 %	512444123
15580	NC_021508	GC	3	6	737479	737484	0 %	0 %	50 %	50 %	512444123
15581	NC_021508	A	6	6	737548	737553	100 %	0 %	0 %	0 %	512444123
15582	NC_021508	CAG	2	6	737611	737616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444123
15583	NC_021508	ACA	2	6	737621	737626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444123
15584	NC_021508	C	6	6	737765	737770	0 %	0 %	0 %	100 %	512444123
15585	NC_021508	AGC	2	6	737801	737806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444123
15586	NC_021508	CAC	2	6	737857	737862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444123
15587	NC_021508	AGCG	2	8	737909	737916	25 %	0 %	50 %	25 %	512444123
15588	NC_021508	CG	3	6	737986	737991	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15589	NC_021508	AG	3	6	737993	737998	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15590	NC_021508	ACA	2	6	738002	738007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15591	NC_021508	GA	3	6	738066	738071	50 %	0 %	50 %	0 %	512444124
15592	NC_021508	ACCGTA	2	12	738104	738115	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	512444124
15593	NC_021508	CGG	2	6	738176	738181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444124
15594	NC_021508	TCG	2	6	738239	738244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444124
15595	NC_021508	CGCAC	2	10	738245	738254	20 %	0 %	20 %	60 %	512444124
15596	NC_021508	T	7	7	738277	738283	0 %	100 %	0 %	0 %	512444124
15597	NC_021508	A	6	6	738293	738298	100 %	0 %	0 %	0 %	512444124
15598	NC_021508	GTG	2	6	738305	738310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512444124
15599	NC_021508	GCA	2	6	738362	738367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444124
15600	NC_021508	CTT	2	6	738369	738374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444124
15601	NC_021508	CTGT	2	8	738381	738388	0 %	50 %	25 %	25 %	512444124
15602	NC_021508	TTC	2	6	738427	738432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444124
15603	NC_021508	TGC	2	6	738569	738574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444124
15604	NC_021508	CAC	2	6	738597	738602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444124
15605	NC_021508	GCA	2	6	738692	738697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444124
15606	NC_021508	A	6	6	738805	738810	100 %	0 %	0 %	0 %	512444124
15607	NC_021508	T	6	6	738854	738859	0 %	100 %	0 %	0 %	512444124
15608	NC_021508	ACGC	2	8	739045	739052	25 %	0 %	25 %	50 %	512444124
15609	NC_021508	CAC	2	6	739065	739070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444124
15610	NC_021508	ACGGC	2	10	739095	739104	20 %	0 %	40 %	40 %	512444124
15611	NC_021508	CG	3	6	739114	739119	0 %	0 %	50 %	50 %	512444124
15612	NC_021508	AC	3	6	739132	739137	50 %	0 %	0 %	50 %	512444124
15613	NC_021508	TGC	2	6	739213	739218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444124
15614	NC_021508	CGA	2	6	739227	739232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444124
15615	NC_021508	CCA	2	6	739261	739266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444124
15616	NC_021508	T	6	6	739283	739288	0 %	100 %	0 %	0 %	512444124
15617	NC_021508	CCT	2	6	739322	739327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444124
15618	NC_021508	CCA	2	6	739331	739336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444124
15619	NC_021508	TCT	2	6	739389	739394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444124
15620	NC_021508	CGC	2	6	739406	739411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15621	NC_021508	C	6	6	739419	739424	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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15623	NC_021508	CCT	2	6	739537	739542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444125
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15993	NC_021508	TCT	2	6	757915	757920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444141
15994	NC_021508	CGA	2	6	757951	757956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444141
15995	NC_021508	TACAA	2	10	757959	757968	60 %	20 %	0 %	20 %	512444141
15996	NC_021508	AGT	2	6	758008	758013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444141
15997	NC_021508	CCG	2	6	758053	758058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444141
15998	NC_021508	GTA	2	6	758118	758123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444141
15999	NC_021508	CA	3	6	758134	758139	50 %	0 %	0 %	50 %	512444141
16000	NC_021508	TCA	2	6	758170	758175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444141

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