MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 23984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_021508	CG	3	6	660733	660738	0 %	0 %	50 %	50 %	512444063
14002	NC_021508	CAC	2	6	660762	660767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444063
14003	NC_021508	AC	3	6	660805	660810	50 %	0 %	0 %	50 %	512444063
14004	NC_021508	CG	3	6	660877	660882	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14005	NC_021508	AGA	2	6	660957	660962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14006	NC_021508	CTC	2	6	660977	660982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14007	NC_021508	AG	3	6	660987	660992	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14008	NC_021508	ACG	2	6	661012	661017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14009	NC_021508	GCG	2	6	661051	661056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14010	NC_021508	GCT	2	6	661099	661104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14011	NC_021508	GTGC	2	8	661147	661154	0 %	25 %	50 %	25 %	512444064
14012	NC_021508	C	6	6	661189	661194	0 %	0 %	0 %	100 %	512444064
14013	NC_021508	TCC	2	6	661382	661387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444064
14014	NC_021508	CGCT	2	8	661397	661404	0 %	25 %	25 %	50 %	512444064
14015	NC_021508	TAC	2	6	661422	661427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444064
14016	NC_021508	TCCCC	2	10	661460	661469	0 %	20 %	0 %	80 %	512444064
14017	NC_021508	GC	3	6	661494	661499	0 %	0 %	50 %	50 %	512444064
14018	NC_021508	CTG	2	6	661529	661534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444064
14019	NC_021508	AGA	2	6	661550	661555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444064
14020	NC_021508	TGCG	2	8	661577	661584	0 %	25 %	50 %	25 %	512444064
14021	NC_021508	GC	5	10	661596	661605	0 %	0 %	50 %	50 %	512444064
14022	NC_021508	CA	3	6	661696	661701	50 %	0 %	0 %	50 %	512444064
14023	NC_021508	ACT	2	6	661753	661758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444064
14024	NC_021508	GC	3	6	661777	661782	0 %	0 %	50 %	50 %	512444064
14025	NC_021508	GGCA	2	8	661803	661810	25 %	0 %	50 %	25 %	512444064
14026	NC_021508	GAC	2	6	661834	661839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444064
14027	NC_021508	T	6	6	661840	661845	0 %	100 %	0 %	0 %	512444064
14028	NC_021508	GC	3	6	661855	661860	0 %	0 %	50 %	50 %	512444064
14029	NC_021508	GCC	2	6	661961	661966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444064
14030	NC_021508	TGG	2	6	661985	661990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512444064
14031	NC_021508	ACTG	2	8	662017	662024	25 %	25 %	25 %	25 %	512444064
14032	NC_021508	GCA	2	6	662065	662070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444064
14033	NC_021508	GC	3	6	662081	662086	0 %	0 %	50 %	50 %	512444064
14034	NC_021508	CCTT	2	8	662096	662103	0 %	50 %	0 %	50 %	512444064
14035	NC_021508	GC	3	6	662109	662114	0 %	0 %	50 %	50 %	512444064
14036	NC_021508	GCA	2	6	662118	662123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444064
14037	NC_021508	GC	3	6	662132	662137	0 %	0 %	50 %	50 %	512444064
14038	NC_021508	AC	3	6	662144	662149	50 %	0 %	0 %	50 %	512444064
14039	NC_021508	CG	3	6	662157	662162	0 %	0 %	50 %	50 %	512444064
14040	NC_021508	GC	3	6	662170	662175	0 %	0 %	50 %	50 %	512444064
14041	NC_021508	CG	3	6	662230	662235	0 %	0 %	50 %	50 %	512444064
14042	NC_021508	ACT	2	6	662271	662276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444064
14043	NC_021508	T	6	6	662346	662351	0 %	100 %	0 %	0 %	512444064
14044	NC_021508	AGA	2	6	662355	662360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444064
14045	NC_021508	TGC	2	6	662639	662644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444064
14046	NC_021508	CGC	2	6	662696	662701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444064
14047	NC_021508	CGG	2	6	662791	662796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444065
14048	NC_021508	ACGC	2	8	662799	662806	25 %	0 %	25 %	50 %	512444065
14049	NC_021508	CGG	2	6	662819	662824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444065
14050	NC_021508	CTC	2	6	662832	662837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444065
14051	NC_021508	CAG	2	6	662861	662866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444065
14052	NC_021508	GTCAG	2	10	662875	662884	20 %	20 %	40 %	20 %	512444065
14053	NC_021508	CTC	2	6	662899	662904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444065
14054	NC_021508	GTC	2	6	662910	662915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444065
14055	NC_021508	GCA	2	6	662917	662922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444065
14056	NC_021508	TG	3	6	662927	662932	0 %	50 %	50 %	0 %	512444065
14057	NC_021508	CGC	2	6	662963	662968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444065
14058	NC_021508	CCG	2	6	663031	663036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444065
14059	NC_021508	GCC	2	6	663045	663050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444065
14060	NC_021508	CGA	2	6	663069	663074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444065
14061	NC_021508	AGA	2	6	663129	663134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444065
14062	NC_021508	GC	3	6	663151	663156	0 %	0 %	50 %	50 %	512444065
14063	NC_021508	CA	3	6	663189	663194	50 %	0 %	0 %	50 %	512444065
14064	NC_021508	TG	3	6	663197	663202	0 %	50 %	50 %	0 %	512444065
14065	NC_021508	GTT	2	6	663213	663218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512444065
14066	NC_021508	GC	3	6	663240	663245	0 %	0 %	50 %	50 %	512444065
14067	NC_021508	AGA	2	6	663348	663353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444065
14068	NC_021508	AGG	2	6	663476	663481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444065
14069	NC_021508	CGG	2	6	663510	663515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444065
14070	NC_021508	CTTT	2	8	663573	663580	0 %	75 %	0 %	25 %	512444065
14071	NC_021508	CTGCTC	2	12	663617	663628	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	512444065
14072	NC_021508	GCG	2	6	663640	663645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444065
14073	NC_021508	GACGC	2	10	663682	663691	20 %	0 %	40 %	40 %	512444065
14074	NC_021508	CAGC	2	8	663737	663744	25 %	0 %	25 %	50 %	512444065
14075	NC_021508	GC	4	8	663827	663834	0 %	0 %	50 %	50 %	512444065
14076	NC_021508	CTC	2	6	663845	663850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444065
14077	NC_021508	GGT	2	6	663864	663869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512444065
14078	NC_021508	A	6	6	663947	663952	100 %	0 %	0 %	0 %	512444065
14079	NC_021508	AGTT	2	8	664122	664129	25 %	50 %	25 %	0 %	512444065
14080	NC_021508	CTTG	2	8	664137	664144	0 %	50 %	25 %	25 %	512444065
14081	NC_021508	CAA	2	6	664168	664173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444065
14082	NC_021508	GCG	2	6	664232	664237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444065
14083	NC_021508	CA	4	8	664299	664306	50 %	0 %	0 %	50 %	512444065
14084	NC_021508	CGG	3	9	664311	664319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444065
14085	NC_021508	AC	3	6	664357	664362	50 %	0 %	0 %	50 %	512444065
14086	NC_021508	TAC	2	6	664447	664452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444065
14087	NC_021508	TC	3	6	664454	664459	0 %	50 %	0 %	50 %	512444065
14088	NC_021508	GT	3	6	664466	664471	0 %	50 %	50 %	0 %	512444065
14089	NC_021508	GC	3	6	664522	664527	0 %	0 %	50 %	50 %	512444065
14090	NC_021508	CAC	2	6	664584	664589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444065
14091	NC_021508	CT	3	6	664666	664671	0 %	50 %	0 %	50 %	512444065
14092	NC_021508	TTA	2	6	664739	664744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512444065
14093	NC_021508	ACAT	2	8	664894	664901	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14094	NC_021508	CTC	2	6	664960	664965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444066
14095	NC_021508	ATTT	2	8	665137	665144	25 %	75 %	0 %	0 %	512444066
14096	NC_021508	ACG	2	6	665162	665167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444066
14097	NC_021508	GC	3	6	665181	665186	0 %	0 %	50 %	50 %	512444066
14098	NC_021508	CGG	2	6	665188	665193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444066
14099	NC_021508	TC	3	6	665202	665207	0 %	50 %	0 %	50 %	512444066
14100	NC_021508	GAG	2	6	665245	665250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444066
14101	NC_021508	CG	3	6	665257	665262	0 %	0 %	50 %	50 %	512444066
14102	NC_021508	TGCG	2	8	665318	665325	0 %	25 %	50 %	25 %	512444066
14103	NC_021508	CG	3	6	665363	665368	0 %	0 %	50 %	50 %	512444066
14104	NC_021508	GA	3	6	665393	665398	50 %	0 %	50 %	0 %	512444066
14105	NC_021508	A	8	8	665398	665405	100 %	0 %	0 %	0 %	512444066
14106	NC_021508	ATC	2	6	665545	665550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444066
14107	NC_021508	GTG	2	6	665590	665595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512444066
14108	NC_021508	TCG	2	6	665603	665608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444066
14109	NC_021508	AGG	2	6	665703	665708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444066
14110	NC_021508	AAGT	2	8	665734	665741	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14111	NC_021508	GC	3	6	665757	665762	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14112	NC_021508	CAG	2	6	665774	665779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14113	NC_021508	ACGT	2	8	665856	665863	25 %	25 %	25 %	25 %	512444067
14114	NC_021508	ACCTAC	2	12	665907	665918	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	512444067
14115	NC_021508	AGA	2	6	666151	666156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444067
14116	NC_021508	GGT	2	6	666230	666235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512444067
14117	NC_021508	AAC	2	6	666262	666267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444067
14118	NC_021508	GTG	2	6	666273	666278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512444067
14119	NC_021508	CG	3	6	666324	666329	0 %	0 %	50 %	50 %	512444067
14120	NC_021508	TGC	2	6	666368	666373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444067
14121	NC_021508	TCGT	2	8	666402	666409	0 %	50 %	25 %	25 %	512444067
14122	NC_021508	AATC	2	8	666471	666478	50 %	25 %	0 %	25 %	512444067
14123	NC_021508	TCA	2	6	666499	666504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444067
14124	NC_021508	GC	3	6	666547	666552	0 %	0 %	50 %	50 %	512444067
14125	NC_021508	TAC	2	6	666558	666563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444067
14126	NC_021508	A	6	6	666602	666607	100 %	0 %	0 %	0 %	512444067
14127	NC_021508	CG	3	6	666611	666616	0 %	0 %	50 %	50 %	512444067
14128	NC_021508	CCA	2	6	666628	666633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444067
14129	NC_021508	GC	3	6	666674	666679	0 %	0 %	50 %	50 %	512444067
14130	NC_021508	TCGC	2	8	666773	666780	0 %	25 %	25 %	50 %	512444067
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14132	NC_021508	GTAC	2	8	667032	667039	25 %	25 %	25 %	25 %	512444067
14133	NC_021508	CGT	2	6	667091	667096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444067
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14139	NC_021508	T	6	6	667292	667297	0 %	100 %	0 %	0 %	512444068
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14223	NC_021508	AAACG	2	10	671014	671023	60 %	0 %	20 %	20 %	512444072
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14229	NC_021508	CGAA	2	8	671208	671215	50 %	0 %	25 %	25 %	512444072
14230	NC_021508	CGC	2	6	671293	671298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14231	NC_021508	C	10	10	671319	671328	0 %	0 %	0 %	100 %	512444073
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14234	NC_021508	GA	3	6	671597	671602	50 %	0 %	50 %	0 %	512444073
14235	NC_021508	CG	3	6	671611	671616	0 %	0 %	50 %	50 %	512444073
14236	NC_021508	CACG	2	8	671619	671626	25 %	0 %	25 %	50 %	512444073
14237	NC_021508	CAC	2	6	671646	671651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444073
14238	NC_021508	CTC	2	6	671683	671688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14239	NC_021508	TTC	2	6	671696	671701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14240	NC_021508	TCC	2	6	671714	671719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14241	NC_021508	AAACG	2	10	671803	671812	60 %	0 %	20 %	20 %	512444074
14242	NC_021508	GC	3	6	671838	671843	0 %	0 %	50 %	50 %	512444074
14243	NC_021508	AGT	2	6	671847	671852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444074
14244	NC_021508	GCACCG	2	12	671868	671879	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	512444074
14245	NC_021508	CCT	2	6	671931	671936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444074
14246	NC_021508	GCT	2	6	672004	672009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444074
14247	NC_021508	GAAA	2	8	672038	672045	75 %	0 %	25 %	0 %	512444074
14248	NC_021508	CGC	2	6	672085	672090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444074
14249	NC_021508	TAC	2	6	672105	672110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444074
14250	NC_021508	TGAA	2	8	672123	672130	50 %	25 %	25 %	0 %	512444074
14251	NC_021508	CCA	2	6	672234	672239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444074
14252	NC_021508	CCG	2	6	672329	672334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444074
14253	NC_021508	GA	4	8	672365	672372	50 %	0 %	50 %	0 %	512444074
14254	NC_021508	CGC	2	6	672379	672384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444074
14255	NC_021508	GC	3	6	672471	672476	0 %	0 %	50 %	50 %	512444074
14256	NC_021508	ACC	2	6	672547	672552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444075
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14258	NC_021508	TTCA	2	8	672714	672721	25 %	50 %	0 %	25 %	512444075
14259	NC_021508	TAA	2	6	672740	672745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512444075
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14275	NC_021508	GGAA	2	8	674024	674031	50 %	0 %	50 %	0 %	512444075
14276	NC_021508	AGA	2	6	674070	674075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444075
14277	NC_021508	CAGCTG	2	12	674100	674111	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	512444075
14278	NC_021508	CGG	2	6	674140	674145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444075
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14280	NC_021508	TTC	2	6	674239	674244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444075
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14284	NC_021508	CACT	2	8	674367	674374	25 %	25 %	0 %	50 %	512444075
14285	NC_021508	CTC	2	6	674379	674384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14286	NC_021508	C	9	9	674399	674407	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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14326	NC_021508	C	11	11	676714	676724	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14327	NC_021508	TAG	2	6	676734	676739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14329	NC_021508	ACT	2	6	676763	676768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444077
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14331	NC_021508	TGC	2	6	676807	676812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444077
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14353	NC_021508	TGCG	3	12	677959	677970	0 %	25 %	50 %	25 %	512444077
14354	NC_021508	CG	3	6	677969	677974	0 %	0 %	50 %	50 %	512444077
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14359	NC_021508	CA	3	6	678197	678202	50 %	0 %	0 %	50 %	512444077
14360	NC_021508	CCGG	2	8	678235	678242	0 %	0 %	50 %	50 %	512444077
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14366	NC_021508	GAA	2	6	678454	678459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444077
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