MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 23984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_021508	A	6	6	638483	638488	100 %	0 %	0 %	0 %	512444045
13502	NC_021508	TG	3	6	638522	638527	0 %	50 %	50 %	0 %	512444045
13503	NC_021508	GCG	2	6	638554	638559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444045
13504	NC_021508	GGT	2	6	638666	638671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512444045
13505	NC_021508	CG	3	6	638751	638756	0 %	0 %	50 %	50 %	512444045
13506	NC_021508	CAGA	2	8	638788	638795	50 %	0 %	25 %	25 %	512444045
13507	NC_021508	GAA	2	6	638966	638971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444045
13508	NC_021508	TGC	2	6	638984	638989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444045
13509	NC_021508	GTG	2	6	639018	639023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512444045
13510	NC_021508	ATTGG	2	10	639123	639132	20 %	40 %	40 %	0 %	512444045
13511	NC_021508	GCG	2	6	639141	639146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444045
13512	NC_021508	AC	3	6	639299	639304	50 %	0 %	0 %	50 %	512444045
13513	NC_021508	GCA	2	6	639341	639346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444045
13514	NC_021508	A	6	6	639346	639351	100 %	0 %	0 %	0 %	512444045
13515	NC_021508	CAATC	2	10	639418	639427	40 %	20 %	0 %	40 %	512444045
13516	NC_021508	GTG	2	6	639563	639568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512444045
13517	NC_021508	GTC	2	6	639653	639658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444045
13518	NC_021508	CG	3	6	639694	639699	0 %	0 %	50 %	50 %	512444045
13519	NC_021508	TTG	2	6	639708	639713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512444045
13520	NC_021508	TCCT	2	8	639823	639830	0 %	50 %	0 %	50 %	512444045
13521	NC_021508	CCG	2	6	639882	639887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444045
13522	NC_021508	GC	3	6	639929	639934	0 %	0 %	50 %	50 %	512444045
13523	NC_021508	AAAC	2	8	639984	639991	75 %	0 %	0 %	25 %	512444045
13524	NC_021508	CTG	2	6	640015	640020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444045
13525	NC_021508	GGT	2	6	640112	640117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512444045
13526	NC_021508	CGT	2	6	640236	640241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444045
13527	NC_021508	GC	3	6	640263	640268	0 %	0 %	50 %	50 %	512444045
13528	NC_021508	ACG	2	6	640278	640283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444045
13529	NC_021508	GTC	2	6	640379	640384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444045
13530	NC_021508	TGA	2	6	640390	640395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444045
13531	NC_021508	A	6	6	640512	640517	100 %	0 %	0 %	0 %	512444045
13532	NC_021508	GGC	2	6	640540	640545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444045
13533	NC_021508	GCC	2	6	640579	640584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444045
13534	NC_021508	GCAC	2	8	640594	640601	25 %	0 %	25 %	50 %	512444045
13535	NC_021508	GCA	2	6	640614	640619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444045
13536	NC_021508	CGA	2	6	640666	640671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444045
13537	NC_021508	TCAG	2	8	640701	640708	25 %	25 %	25 %	25 %	512444045
13538	NC_021508	ATG	2	6	640709	640714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444045
13539	NC_021508	GGA	2	6	640746	640751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444045
13540	NC_021508	CT	3	6	640793	640798	0 %	50 %	0 %	50 %	512444045
13541	NC_021508	CAC	2	6	640806	640811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444045
13542	NC_021508	AGA	2	6	640819	640824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444045
13543	NC_021508	TG	3	6	640836	640841	0 %	50 %	50 %	0 %	512444045
13544	NC_021508	GCACAC	2	12	640843	640854	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	512444045
13545	NC_021508	TG	3	6	640906	640911	0 %	50 %	50 %	0 %	512444045
13546	NC_021508	GTG	2	6	640919	640924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512444045
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13548	NC_021508	GCA	2	6	641035	641040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444045
13549	NC_021508	TG	3	6	641125	641130	0 %	50 %	50 %	0 %	512444046
13550	NC_021508	GTCT	2	8	641219	641226	0 %	50 %	25 %	25 %	512444046
13551	NC_021508	GC	3	6	641280	641285	0 %	0 %	50 %	50 %	512444046
13552	NC_021508	TCC	2	6	641352	641357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444046
13553	NC_021508	AGC	2	6	641442	641447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444046
13554	NC_021508	TCT	2	6	641517	641522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444046
13555	NC_021508	TG	3	6	641525	641530	0 %	50 %	50 %	0 %	512444046
13556	NC_021508	GCG	2	6	641564	641569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444046
13557	NC_021508	A	8	8	641579	641586	100 %	0 %	0 %	0 %	512444046
13558	NC_021508	GTT	2	6	641624	641629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512444046
13559	NC_021508	CCA	2	6	641632	641637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444046
13560	NC_021508	AAG	2	6	641642	641647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444046
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13562	NC_021508	A	9	9	641687	641695	100 %	0 %	0 %	0 %	512444046
13563	NC_021508	T	6	6	641714	641719	0 %	100 %	0 %	0 %	512444046
13564	NC_021508	AAC	2	6	641727	641732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444046
13565	NC_021508	A	6	6	641737	641742	100 %	0 %	0 %	0 %	512444046
13566	NC_021508	GC	3	6	641826	641831	0 %	0 %	50 %	50 %	512444046
13567	NC_021508	GCC	2	6	641834	641839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444046
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13569	NC_021508	CG	3	6	642024	642029	0 %	0 %	50 %	50 %	512444046
13570	NC_021508	CCT	2	6	642034	642039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444046
13571	NC_021508	GCA	2	6	642231	642236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444047
13572	NC_021508	CAAC	2	8	642256	642263	50 %	0 %	0 %	50 %	512444047
13573	NC_021508	AGCCAT	2	12	642287	642298	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	512444047
13574	NC_021508	ATA	2	6	642306	642311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512444047
13575	NC_021508	TTCC	2	8	642455	642462	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13576	NC_021508	T	6	6	642481	642486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13577	NC_021508	ATC	2	6	642502	642507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444048
13578	NC_021508	ATA	2	6	642514	642519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512444048
13579	NC_021508	TGC	2	6	642529	642534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444048
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13581	NC_021508	GAT	2	6	642631	642636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444048
13582	NC_021508	TTCC	2	8	642644	642651	0 %	50 %	0 %	50 %	512444048
13583	NC_021508	TAG	2	6	642696	642701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444048
13584	NC_021508	GAA	2	6	642740	642745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444048
13585	NC_021508	ACC	2	6	642764	642769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444048
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13587	NC_021508	TGA	2	6	642825	642830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444048
13588	NC_021508	C	6	6	642876	642881	0 %	0 %	0 %	100 %	512444048
13589	NC_021508	CTA	2	6	642918	642923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444048
13590	NC_021508	CAA	2	6	642933	642938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444048
13591	NC_021508	CCA	2	6	643029	643034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444048
13592	NC_021508	TCG	2	6	643053	643058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444048
13593	NC_021508	GA	3	6	643073	643078	50 %	0 %	50 %	0 %	512444048
13594	NC_021508	AAAG	2	8	643094	643101	75 %	0 %	25 %	0 %	512444048
13595	NC_021508	CTCG	2	8	643102	643109	0 %	25 %	25 %	50 %	512444048
13596	NC_021508	AAG	3	9	643137	643145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444048
13597	NC_021508	CGG	2	6	643171	643176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444048
13598	NC_021508	ACA	2	6	643198	643203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444048
13599	NC_021508	CCG	2	6	643303	643308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444048
13600	NC_021508	A	6	6	643324	643329	100 %	0 %	0 %	0 %	512444048
13601	NC_021508	CT	3	6	643540	643545	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13602	NC_021508	AG	3	6	643549	643554	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13603	NC_021508	TACA	2	8	643585	643592	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13604	NC_021508	CTG	2	6	643601	643606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13605	NC_021508	GA	3	6	643648	643653	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13606	NC_021508	GCC	2	6	643657	643662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13607	NC_021508	GTC	2	6	643689	643694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13608	NC_021508	GC	3	6	643763	643768	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13609	NC_021508	ACC	2	6	643781	643786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13610	NC_021508	CA	3	6	643804	643809	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13611	NC_021508	CGCAC	2	10	643820	643829	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
13612	NC_021508	GC	3	6	643921	643926	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13613	NC_021508	GCG	2	6	643956	643961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13614	NC_021508	GCC	2	6	644050	644055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13615	NC_021508	A	6	6	644056	644061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13616	NC_021508	CAC	2	6	644074	644079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13617	NC_021508	T	8	8	644094	644101	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13618	NC_021508	TGC	2	6	644164	644169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13619	NC_021508	CG	3	6	644186	644191	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13620	NC_021508	TCG	2	6	644223	644228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444049
13621	NC_021508	CTT	2	6	644245	644250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444049
13622	NC_021508	AAC	2	6	644311	644316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444049
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13624	NC_021508	CAT	2	6	644490	644495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444049
13625	NC_021508	CG	3	6	644508	644513	0 %	0 %	50 %	50 %	512444049
13626	NC_021508	AGA	2	6	644544	644549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444049
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13629	NC_021508	CG	4	8	644670	644677	0 %	0 %	50 %	50 %	512444049
13630	NC_021508	TCA	2	6	644720	644725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444049
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13632	NC_021508	A	6	6	644970	644975	100 %	0 %	0 %	0 %	512444049
13633	NC_021508	ATC	2	6	644998	645003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444049
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13635	NC_021508	GTG	2	6	645148	645153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512444049
13636	NC_021508	GAT	2	6	645160	645165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444049
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13653	NC_021508	CTT	2	6	645804	645809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444050
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13658	NC_021508	AGT	2	6	646104	646109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444050
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13689	NC_021508	AT	3	6	647465	647470	50 %	50 %	0 %	0 %	512444050
13690	NC_021508	CTG	2	6	647495	647500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444050
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13731	NC_021508	AAAC	2	8	649046	649053	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13732	NC_021508	GAA	2	6	649075	649080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444053
13733	NC_021508	A	6	6	649079	649084	100 %	0 %	0 %	0 %	512444053
13734	NC_021508	TC	3	6	649100	649105	0 %	50 %	0 %	50 %	512444053
13735	NC_021508	CA	3	6	649109	649114	50 %	0 %	0 %	50 %	512444053
13736	NC_021508	CGC	2	6	649134	649139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444053
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13738	NC_021508	GGA	2	6	649201	649206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444053
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13740	NC_021508	CGTA	2	8	649310	649317	25 %	25 %	25 %	25 %	512444053
13741	NC_021508	A	7	7	649383	649389	100 %	0 %	0 %	0 %	512444053
13742	NC_021508	AGT	2	6	649421	649426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444053
13743	NC_021508	GC	3	6	649471	649476	0 %	0 %	50 %	50 %	512444053
13744	NC_021508	GCG	2	6	649483	649488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444053
13745	NC_021508	TCG	2	6	649519	649524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444053
13746	NC_021508	GGGA	2	8	649532	649539	25 %	0 %	75 %	0 %	512444053
13747	NC_021508	C	6	6	649545	649550	0 %	0 %	0 %	100 %	512444053
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13750	NC_021508	GCG	2	6	649578	649583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444053
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13752	NC_021508	TCC	2	6	649798	649803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444053
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13754	NC_021508	AAC	2	6	649930	649935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444053
13755	NC_021508	CGA	2	6	650021	650026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444053
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13757	NC_021508	TCC	2	6	650193	650198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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13759	NC_021508	GCA	2	6	650400	650405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444054
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13764	NC_021508	GC	3	6	650668	650673	0 %	0 %	50 %	50 %	512444054
13765	NC_021508	GCA	2	6	650734	650739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444054
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13780	NC_021508	CA	3	6	651375	651380	50 %	0 %	0 %	50 %	512444054
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13797	NC_021508	CCCG	2	8	652059	652066	0 %	0 %	25 %	75 %	512444054
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13805	NC_021508	GC	3	6	652302	652307	0 %	0 %	50 %	50 %	512444054
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13807	NC_021508	TGC	2	6	652369	652374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13853	NC_021508	CA	3	6	654439	654444	50 %	0 %	0 %	50 %	512444057
13854	NC_021508	CTT	2	6	654472	654477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444057
13855	NC_021508	GC	3	6	654495	654500	0 %	0 %	50 %	50 %	512444057
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13867	NC_021508	AGC	2	6	655109	655114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444057
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13972	NC_021508	AG	3	6	659587	659592	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13973	NC_021508	TC	3	6	659611	659616	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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13975	NC_021508	CA	3	6	659676	659681	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13976	NC_021508	GCA	2	6	659752	659757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13985	NC_021508	GA	3	6	660104	660109	50 %	0 %	50 %	0 %	512444063
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13990	NC_021508	CCT	2	6	660397	660402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444063
13991	NC_021508	TCA	2	6	660408	660413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444063
13992	NC_021508	CCT	2	6	660436	660441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444063
13993	NC_021508	CAC	2	6	660503	660508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444063
13994	NC_021508	TCA	2	6	660544	660549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444063
13995	NC_021508	CTG	2	6	660599	660604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444063
13996	NC_021508	CAAAAG	2	12	660622	660633	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	512444063
13997	NC_021508	AAG	3	9	660648	660656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444063
13998	NC_021508	GCT	2	6	660658	660663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444063
13999	NC_021508	TCC	2	6	660676	660681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444063
14000	NC_021508	GCACG	2	10	660725	660734	20 %	0 %	40 %	40 %	512444063

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