MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 23984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_021508	AGG	2	6	593186	593191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444009
12502	NC_021508	GGC	2	6	593272	593277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444009
12503	NC_021508	ACC	2	6	593325	593330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444009
12504	NC_021508	CTT	2	6	593425	593430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444009
12505	NC_021508	CCA	2	6	593485	593490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444009
12506	NC_021508	CA	3	6	593508	593513	50 %	0 %	0 %	50 %	512444009
12507	NC_021508	GC	3	6	593569	593574	0 %	0 %	50 %	50 %	512444009
12508	NC_021508	CTTCT	2	10	593575	593584	0 %	60 %	0 %	40 %	512444009
12509	NC_021508	AGC	2	6	593621	593626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444009
12510	NC_021508	AGT	2	6	593627	593632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444009
12511	NC_021508	CGG	2	6	593644	593649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444009
12512	NC_021508	GC	3	6	593815	593820	0 %	0 %	50 %	50 %	512444009
12513	NC_021508	CCGG	2	8	593965	593972	0 %	0 %	50 %	50 %	512444009
12514	NC_021508	GCA	2	6	594001	594006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444009
12515	NC_021508	T	7	7	594053	594059	0 %	100 %	0 %	0 %	512444009
12516	NC_021508	CTC	2	6	594077	594082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444009
12517	NC_021508	CTG	2	6	594087	594092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444009
12518	NC_021508	AAAGG	2	10	594098	594107	60 %	0 %	40 %	0 %	512444009
12519	NC_021508	GGC	2	6	594122	594127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444009
12520	NC_021508	GCC	2	6	594191	594196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444009
12521	NC_021508	CAC	2	6	594203	594208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444009
12522	NC_021508	CGG	2	6	594241	594246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444009
12523	NC_021508	GCG	2	6	594313	594318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444009
12524	NC_021508	AAG	2	6	594324	594329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444009
12525	NC_021508	GCT	2	6	594380	594385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444009
12526	NC_021508	GC	3	6	594397	594402	0 %	0 %	50 %	50 %	512444009
12527	NC_021508	ACG	2	6	594403	594408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444009
12528	NC_021508	TC	3	6	594434	594439	0 %	50 %	0 %	50 %	512444009
12529	NC_021508	CGC	2	6	594488	594493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12530	NC_021508	CA	3	6	594511	594516	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12531	NC_021508	CCG	2	6	594536	594541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12532	NC_021508	AGGG	2	8	594543	594550	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
12533	NC_021508	GCA	2	6	594834	594839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444010
12534	NC_021508	GAG	2	6	594906	594911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444010
12535	NC_021508	CT	3	6	594919	594924	0 %	50 %	0 %	50 %	512444010
12536	NC_021508	CTCG	2	8	594950	594957	0 %	25 %	25 %	50 %	512444010
12537	NC_021508	CCTCA	2	10	594985	594994	20 %	20 %	0 %	60 %	512444010
12538	NC_021508	ACC	2	6	595002	595007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444010
12539	NC_021508	CG	5	10	595071	595080	0 %	0 %	50 %	50 %	512444010
12540	NC_021508	A	6	6	595154	595159	100 %	0 %	0 %	0 %	512444010
12541	NC_021508	GAG	2	6	595236	595241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444010
12542	NC_021508	CTG	2	6	595254	595259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444010
12543	NC_021508	CGT	2	6	595268	595273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444010
12544	NC_021508	GCC	2	6	595287	595292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444010
12545	NC_021508	GAG	2	6	595326	595331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444010
12546	NC_021508	ATT	2	6	595344	595349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512444010
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12548	NC_021508	GAA	2	6	595359	595364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444010
12549	NC_021508	CA	3	6	595398	595403	50 %	0 %	0 %	50 %	512444010
12550	NC_021508	AGG	2	6	595415	595420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444010
12551	NC_021508	CGC	2	6	595439	595444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444010
12552	NC_021508	CAA	2	6	595495	595500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444010
12553	NC_021508	CCG	2	6	595547	595552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444010
12554	NC_021508	CGTG	2	8	595568	595575	0 %	25 %	50 %	25 %	512444010
12555	NC_021508	GAA	2	6	595587	595592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444010
12556	NC_021508	AAAAT	2	10	595611	595620	80 %	20 %	0 %	0 %	512444010
12557	NC_021508	ACGA	2	8	595627	595634	50 %	0 %	25 %	25 %	512444010
12558	NC_021508	A	6	6	595669	595674	100 %	0 %	0 %	0 %	512444010
12559	NC_021508	TTG	2	6	595675	595680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512444010
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12561	NC_021508	GC	3	6	595772	595777	0 %	0 %	50 %	50 %	512444010
12562	NC_021508	GC	3	6	595838	595843	0 %	0 %	50 %	50 %	512444010
12563	NC_021508	GC	5	10	595863	595872	0 %	0 %	50 %	50 %	512444010
12564	NC_021508	AC	3	6	595880	595885	50 %	0 %	0 %	50 %	512444010
12565	NC_021508	GC	4	8	595936	595943	0 %	0 %	50 %	50 %	512444010
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12569	NC_021508	CG	4	8	596105	596112	0 %	0 %	50 %	50 %	512444010
12570	NC_021508	CG	4	8	596121	596128	0 %	0 %	50 %	50 %	512444010
12571	NC_021508	TCCT	2	8	596163	596170	0 %	50 %	0 %	50 %	512444010
12572	NC_021508	GACC	2	8	596179	596186	25 %	0 %	25 %	50 %	512444010
12573	NC_021508	CAG	2	6	596239	596244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444010
12574	NC_021508	ACA	2	6	596287	596292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444010
12575	NC_021508	TCC	2	6	596434	596439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444010
12576	NC_021508	AGA	2	6	596447	596452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444010
12577	NC_021508	ATC	3	9	596502	596510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444010
12578	NC_021508	CG	4	8	596571	596578	0 %	0 %	50 %	50 %	512444010
12579	NC_021508	TCT	2	6	596632	596637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444010
12580	NC_021508	GA	3	6	596692	596697	50 %	0 %	50 %	0 %	512444010
12581	NC_021508	GAA	2	6	596726	596731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444010
12582	NC_021508	TGC	2	6	596764	596769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444010
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12586	NC_021508	CGTG	2	8	596914	596921	0 %	25 %	50 %	25 %	512444010
12587	NC_021508	GC	4	8	596938	596945	0 %	0 %	50 %	50 %	512444010
12588	NC_021508	A	6	6	596962	596967	100 %	0 %	0 %	0 %	512444010
12589	NC_021508	CA	3	6	597049	597054	50 %	0 %	0 %	50 %	512444011
12590	NC_021508	CAC	2	6	597145	597150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444011
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12593	NC_021508	CTC	2	6	597253	597258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444011
12594	NC_021508	CCG	2	6	597272	597277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444011
12595	NC_021508	GCA	2	6	597279	597284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444011
12596	NC_021508	AC	4	8	597338	597345	50 %	0 %	0 %	50 %	512444011
12597	NC_021508	GC	3	6	597350	597355	0 %	0 %	50 %	50 %	512444011
12598	NC_021508	CG	4	8	597414	597421	0 %	0 %	50 %	50 %	512444011
12599	NC_021508	GC	3	6	597430	597435	0 %	0 %	50 %	50 %	512444011
12600	NC_021508	ACA	2	6	597441	597446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444011
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12602	NC_021508	AGACAT	2	12	597496	597507	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	512444011
12603	NC_021508	ACTACC	2	12	597524	597535	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	512444011
12604	NC_021508	GAAA	2	8	597554	597561	75 %	0 %	25 %	0 %	512444011
12605	NC_021508	TAA	2	6	597597	597602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512444011
12606	NC_021508	A	6	6	597606	597611	100 %	0 %	0 %	0 %	512444011
12607	NC_021508	CA	3	6	597699	597704	50 %	0 %	0 %	50 %	512444011
12608	NC_021508	CG	3	6	597750	597755	0 %	0 %	50 %	50 %	512444011
12609	NC_021508	GAT	2	6	597815	597820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444011
12610	NC_021508	CCG	2	6	597839	597844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444011
12611	NC_021508	CAG	2	6	597887	597892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444011
12612	NC_021508	ATATCG	2	12	597938	597949	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	512444011
12613	NC_021508	TTC	2	6	597961	597966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444011
12614	NC_021508	GCT	2	6	598031	598036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444011
12615	NC_021508	CTG	2	6	598042	598047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444011
12616	NC_021508	TGC	3	9	598076	598084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444011
12617	NC_021508	CGTG	2	8	598093	598100	0 %	25 %	50 %	25 %	512444011
12618	NC_021508	GGC	2	6	598186	598191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444011
12619	NC_021508	GTACG	2	10	598230	598239	20 %	20 %	40 %	20 %	512444011
12620	NC_021508	AAT	2	6	598255	598260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512444011
12621	NC_021508	CAG	2	6	598306	598311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444011
12622	NC_021508	TAC	2	6	598312	598317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444011
12623	NC_021508	ATCC	2	8	598346	598353	25 %	25 %	0 %	50 %	512444011
12624	NC_021508	GC	3	6	598376	598381	0 %	0 %	50 %	50 %	512444011
12625	NC_021508	A	7	7	598401	598407	100 %	0 %	0 %	0 %	512444011
12626	NC_021508	GCT	2	6	598429	598434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444011
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12676	NC_021508	A	7	7	600332	600338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12681	NC_021508	ATGC	2	8	600577	600584	25 %	25 %	25 %	25 %	512444014
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12723	NC_021508	CTTT	2	8	602312	602319	0 %	75 %	0 %	25 %	512444015
12724	NC_021508	ACG	2	6	602353	602358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12730	NC_021508	A	7	7	602702	602708	100 %	0 %	0 %	0 %	512444016
12731	NC_021508	TG	3	6	602737	602742	0 %	50 %	50 %	0 %	512444016
12732	NC_021508	GCAG	2	8	602779	602786	25 %	0 %	50 %	25 %	512444016
12733	NC_021508	TGC	2	6	602829	602834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444016
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12742	NC_021508	CGA	2	6	603100	603105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444016
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12744	NC_021508	AAC	2	6	603285	603290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444016
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12873	NC_021508	ACGC	2	8	608564	608571	25 %	0 %	25 %	50 %	512444021
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12990	NC_021508	CGG	2	6	614085	614090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444025
12991	NC_021508	GC	4	8	614185	614192	0 %	0 %	50 %	50 %	512444025
12992	NC_021508	CTG	2	6	614229	614234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444025
12993	NC_021508	GC	3	6	614300	614305	0 %	0 %	50 %	50 %	512444025
12994	NC_021508	CCA	2	6	614306	614311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444025
12995	NC_021508	TCG	2	6	614483	614488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444025
12996	NC_021508	AGA	2	6	614511	614516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444025
12997	NC_021508	AG	3	6	614567	614572	50 %	0 %	50 %	0 %	512444026
12998	NC_021508	CAC	2	6	614588	614593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444026
12999	NC_021508	CGTG	2	8	614645	614652	0 %	25 %	50 %	25 %	512444026
13000	NC_021508	ACT	2	6	614743	614748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444026

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