MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 23984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_021508	TGG	2	6	545235	545240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443971
11502	NC_021508	CGTT	2	8	545243	545250	0 %	50 %	25 %	25 %	512443971
11503	NC_021508	GT	3	6	545278	545283	0 %	50 %	50 %	0 %	512443971
11504	NC_021508	GAT	2	6	545365	545370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443971
11505	NC_021508	GTCTT	2	10	545528	545537	0 %	60 %	20 %	20 %	512443971
11506	NC_021508	TGA	2	6	545538	545543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443971
11507	NC_021508	CAG	2	6	545566	545571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443971
11508	NC_021508	A	6	6	545582	545587	100 %	0 %	0 %	0 %	512443971
11509	NC_021508	GAA	2	6	545685	545690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443971
11510	NC_021508	TGGTG	2	10	545749	545758	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
11511	NC_021508	ACTTT	2	10	545781	545790	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11512	NC_021508	GTTT	2	8	545796	545803	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11513	NC_021508	G	6	6	545899	545904	0 %	0 %	100 %	0 %	512443972
11514	NC_021508	TG	3	6	545982	545987	0 %	50 %	50 %	0 %	512443972
11515	NC_021508	CG	4	8	546009	546016	0 %	0 %	50 %	50 %	512443972
11516	NC_021508	GACA	2	8	546102	546109	50 %	0 %	25 %	25 %	512443972
11517	NC_021508	GAT	2	6	546132	546137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443972
11518	NC_021508	GTT	2	6	546177	546182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443972
11519	NC_021508	TCAG	2	8	546303	546310	25 %	25 %	25 %	25 %	512443972
11520	NC_021508	GC	3	6	546425	546430	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11521	NC_021508	TGC	2	6	546463	546468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11522	NC_021508	TG	3	6	546475	546480	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11523	NC_021508	GCA	2	6	546516	546521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11524	NC_021508	A	6	6	546572	546577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11525	NC_021508	CCA	2	6	546654	546659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512443973
11526	NC_021508	CTTC	2	8	546678	546685	0 %	50 %	0 %	50 %	512443973
11527	NC_021508	CG	3	6	546771	546776	0 %	0 %	50 %	50 %	512443973
11528	NC_021508	CCG	2	6	546788	546793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443973
11529	NC_021508	CTG	2	6	546820	546825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443973
11530	NC_021508	CA	3	6	546852	546857	50 %	0 %	0 %	50 %	512443973
11531	NC_021508	TAA	2	6	546927	546932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512443973
11532	NC_021508	CG	3	6	547111	547116	0 %	0 %	50 %	50 %	512443973
11533	NC_021508	CA	3	6	547239	547244	50 %	0 %	0 %	50 %	512443973
11534	NC_021508	GCT	2	6	547332	547337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443973
11535	NC_021508	ACT	2	6	547340	547345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443973
11536	NC_021508	CGT	2	6	547428	547433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443973
11537	NC_021508	TCA	2	6	547475	547480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443973
11538	NC_021508	ACC	2	6	547508	547513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512443973
11539	NC_021508	CA	3	6	547638	547643	50 %	0 %	0 %	50 %	512443973
11540	NC_021508	TCT	2	6	547685	547690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443973
11541	NC_021508	GGA	2	6	547847	547852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443973
11542	NC_021508	TC	3	6	547890	547895	0 %	50 %	0 %	50 %	512443973
11543	NC_021508	AC	3	6	547914	547919	50 %	0 %	0 %	50 %	512443973
11544	NC_021508	ACC	2	6	548087	548092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512443973
11545	NC_021508	GCA	2	6	548111	548116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443973
11546	NC_021508	GC	3	6	548120	548125	0 %	0 %	50 %	50 %	512443973
11547	NC_021508	AC	3	6	548212	548217	50 %	0 %	0 %	50 %	512443973
11548	NC_021508	TGT	2	6	548262	548267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443973
11549	NC_021508	TGC	2	6	548282	548287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443973
11550	NC_021508	CG	4	8	548302	548309	0 %	0 %	50 %	50 %	512443973
11551	NC_021508	GC	3	6	548402	548407	0 %	0 %	50 %	50 %	512443973
11552	NC_021508	TAG	2	6	548409	548414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443973
11553	NC_021508	GTG	2	6	548466	548471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443974
11554	NC_021508	T	6	6	548509	548514	0 %	100 %	0 %	0 %	512443974
11555	NC_021508	GTG	2	6	548575	548580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443974
11556	NC_021508	A	6	6	548621	548626	100 %	0 %	0 %	0 %	512443974
11557	NC_021508	GCT	2	6	548643	548648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443974
11558	NC_021508	TAC	2	6	548650	548655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443974
11559	NC_021508	AGGA	2	8	548740	548747	50 %	0 %	50 %	0 %	512443974
11560	NC_021508	GC	3	6	548754	548759	0 %	0 %	50 %	50 %	512443974
11561	NC_021508	TCTG	2	8	548769	548776	0 %	50 %	25 %	25 %	512443974
11562	NC_021508	GTG	2	6	548843	548848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443974
11563	NC_021508	GCTC	2	8	548876	548883	0 %	25 %	25 %	50 %	512443974
11564	NC_021508	ACC	2	6	548885	548890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512443974
11565	NC_021508	CGC	2	6	549083	549088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443975
11566	NC_021508	GCAG	2	8	549105	549112	25 %	0 %	50 %	25 %	512443975
11567	NC_021508	GGT	2	6	549132	549137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443975
11568	NC_021508	GT	3	6	549140	549145	0 %	50 %	50 %	0 %	512443975
11569	NC_021508	CCT	2	6	549194	549199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443975
11570	NC_021508	CGTG	2	8	549212	549219	0 %	25 %	50 %	25 %	512443975
11571	NC_021508	TTC	2	6	549237	549242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443975
11572	NC_021508	GTT	2	6	549249	549254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443975
11573	NC_021508	GC	3	6	549386	549391	0 %	0 %	50 %	50 %	512443975
11574	NC_021508	ACG	2	6	549439	549444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443975
11575	NC_021508	ATTC	2	8	549474	549481	25 %	50 %	0 %	25 %	512443975
11576	NC_021508	TGC	2	6	549554	549559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443975
11577	NC_021508	GCT	2	6	549660	549665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443975
11578	NC_021508	TGA	2	6	549686	549691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443975
11579	NC_021508	CGCT	2	8	549704	549711	0 %	25 %	25 %	50 %	512443975
11580	NC_021508	GGA	2	6	549770	549775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443975
11581	NC_021508	AGC	2	6	549781	549786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443975
11582	NC_021508	GAA	2	6	549837	549842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443975
11583	NC_021508	TG	3	6	549883	549888	0 %	50 %	50 %	0 %	512443975
11584	NC_021508	AAG	2	6	549930	549935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443975
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11586	NC_021508	GACG	2	8	550041	550048	25 %	0 %	50 %	25 %	512443975
11587	NC_021508	GC	3	6	550100	550105	0 %	0 %	50 %	50 %	512443975
11588	NC_021508	GGC	2	6	550114	550119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443975
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11590	NC_021508	AGC	2	6	550150	550155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443975
11591	NC_021508	GC	3	6	550184	550189	0 %	0 %	50 %	50 %	512443975
11592	NC_021508	TCGC	2	8	550191	550198	0 %	25 %	25 %	50 %	512443975
11593	NC_021508	GCG	2	6	550278	550283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443975
11594	NC_021508	GC	3	6	550349	550354	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11595	NC_021508	A	7	7	550364	550370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11596	NC_021508	CTA	2	6	550378	550383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11597	NC_021508	TTG	3	9	550406	550414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443976
11598	NC_021508	CGT	2	6	550444	550449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443976
11599	NC_021508	TTG	2	6	550478	550483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443976
11600	NC_021508	TCA	2	6	550542	550547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443976
11601	NC_021508	TTG	2	6	550601	550606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443976
11602	NC_021508	TG	3	6	550640	550645	0 %	50 %	50 %	0 %	512443976
11603	NC_021508	GCC	2	6	550651	550656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443976
11604	NC_021508	GT	3	6	550717	550722	0 %	50 %	50 %	0 %	512443976
11605	NC_021508	TGCG	2	8	550781	550788	0 %	25 %	50 %	25 %	512443976
11606	NC_021508	CT	3	6	550903	550908	0 %	50 %	0 %	50 %	512443976
11607	NC_021508	CGT	2	6	550915	550920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443976
11608	NC_021508	TTG	2	6	550937	550942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443976
11609	NC_021508	GAG	2	6	550965	550970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443976
11610	NC_021508	A	8	8	551085	551092	100 %	0 %	0 %	0 %	512443976
11611	NC_021508	GGTA	2	8	551115	551122	25 %	25 %	50 %	0 %	512443976
11612	NC_021508	AGT	2	6	551170	551175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443976
11613	NC_021508	GT	3	6	551248	551253	0 %	50 %	50 %	0 %	512443976
11614	NC_021508	T	6	6	551304	551309	0 %	100 %	0 %	0 %	512443976
11615	NC_021508	ACC	2	6	551347	551352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512443976
11616	NC_021508	TAA	2	6	551355	551360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512443976
11617	NC_021508	GGA	2	6	551445	551450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443976
11618	NC_021508	TAT	2	6	551511	551516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443976
11619	NC_021508	CATA	2	8	551547	551554	50 %	25 %	0 %	25 %	512443976
11620	NC_021508	C	6	6	551606	551611	0 %	0 %	0 %	100 %	512443976
11621	NC_021508	CTT	2	6	551652	551657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443976
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11979	NC_021508	CGT	2	6	568719	568724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443986
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11983	NC_021508	TGC	2	6	568983	568988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443987
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11985	NC_021508	CTCA	2	8	569032	569039	25 %	25 %	0 %	50 %	512443987
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11988	NC_021508	CCA	2	6	569261	569266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512443987
11989	NC_021508	CA	3	6	569285	569290	50 %	0 %	0 %	50 %	512443987
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