MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 23984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10502	NC_021508	TTG	2	6	497256	497261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443935
10503	NC_021508	TGC	2	6	497288	497293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443935
10504	NC_021508	T	6	6	497335	497340	0 %	100 %	0 %	0 %	512443935
10505	NC_021508	CTG	2	6	497399	497404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443935
10506	NC_021508	CTT	2	6	497419	497424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443935
10507	NC_021508	AGC	2	6	497442	497447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443935
10508	NC_021508	CTTC	2	8	497524	497531	0 %	50 %	0 %	50 %	512443935
10509	NC_021508	CAC	2	6	497533	497538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512443935
10510	NC_021508	CG	3	6	497565	497570	0 %	0 %	50 %	50 %	512443935
10511	NC_021508	GCA	2	6	497598	497603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443935
10512	NC_021508	GCA	2	6	497640	497645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443935
10513	NC_021508	CACG	2	8	497688	497695	25 %	0 %	25 %	50 %	512443935
10514	NC_021508	A	6	6	497786	497791	100 %	0 %	0 %	0 %	512443935
10515	NC_021508	CGC	2	6	497822	497827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443935
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10517	NC_021508	GTC	2	6	497957	497962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443935
10518	NC_021508	CTTC	2	8	498034	498041	0 %	50 %	0 %	50 %	512443935
10519	NC_021508	CTG	2	6	498145	498150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443935
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10521	NC_021508	CGT	2	6	498222	498227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443935
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10524	NC_021508	CGGGG	2	10	498381	498390	0 %	0 %	80 %	20 %	512443935
10525	NC_021508	CG	3	6	498399	498404	0 %	0 %	50 %	50 %	512443935
10526	NC_021508	CT	3	6	498437	498442	0 %	50 %	0 %	50 %	512443935
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10530	NC_021508	GCA	2	6	498580	498585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443935
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10532	NC_021508	CTC	3	9	498629	498637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443935
10533	NC_021508	GC	3	6	498672	498677	0 %	0 %	50 %	50 %	512443935
10534	NC_021508	ACC	2	6	498678	498683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512443935
10535	NC_021508	C	6	6	498682	498687	0 %	0 %	0 %	100 %	512443935
10536	NC_021508	AAG	2	6	498719	498724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443935
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10540	NC_021508	CG	3	6	498829	498834	0 %	0 %	50 %	50 %	512443936
10541	NC_021508	TCC	2	6	498835	498840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443936
10542	NC_021508	GC	4	8	498857	498864	0 %	0 %	50 %	50 %	512443936
10543	NC_021508	CCT	2	6	498884	498889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443936
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10568	NC_021508	TGC	2	6	499485	499490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443936
10569	NC_021508	TGCTG	2	10	499510	499519	0 %	40 %	40 %	20 %	512443936
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10588	NC_021508	CT	3	6	500362	500367	0 %	50 %	0 %	50 %	512443937
10589	NC_021508	GAAA	2	8	500390	500397	75 %	0 %	25 %	0 %	512443937
10590	NC_021508	GCG	2	6	500406	500411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443937
10591	NC_021508	GAG	2	6	500438	500443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443937
10592	NC_021508	TGC	2	6	500449	500454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443937
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10600	NC_021508	GTG	3	9	500997	501005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443937
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10604	NC_021508	GTT	2	6	501205	501210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443938
10605	NC_021508	GT	3	6	501235	501240	0 %	50 %	50 %	0 %	512443938
10606	NC_021508	GAAC	2	8	501306	501313	50 %	0 %	25 %	25 %	512443938
10607	NC_021508	AGCA	2	8	501321	501328	50 %	0 %	25 %	25 %	512443938
10608	NC_021508	TG	3	6	501332	501337	0 %	50 %	50 %	0 %	512443938
10609	NC_021508	CTTT	2	8	501386	501393	0 %	75 %	0 %	25 %	512443938
10610	NC_021508	GCA	2	6	501452	501457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443938
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10612	NC_021508	CGA	2	6	501475	501480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443938
10613	NC_021508	GTG	2	6	501491	501496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443938
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10615	NC_021508	GT	3	6	501650	501655	0 %	50 %	50 %	0 %	512443938
10616	NC_021508	CGG	2	6	501664	501669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443938
10617	NC_021508	TGA	2	6	501961	501966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443938
10618	NC_021508	GC	3	6	501974	501979	0 %	0 %	50 %	50 %	512443938
10619	NC_021508	GT	3	6	501989	501994	0 %	50 %	50 %	0 %	512443938
10620	NC_021508	TGCAG	2	10	502014	502023	20 %	20 %	40 %	20 %	512443938
10621	NC_021508	CGT	2	6	502025	502030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443938
10622	NC_021508	TGG	2	6	502052	502057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443938
10623	NC_021508	GAA	2	6	502147	502152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443938
10624	NC_021508	GCG	2	6	502160	502165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443938
10625	NC_021508	GTATG	2	10	502274	502283	20 %	40 %	40 %	0 %	512443938
10626	NC_021508	AGT	2	6	502289	502294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443938
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10642	NC_021508	T	7	7	502929	502935	0 %	100 %	0 %	0 %	512443938
10643	NC_021508	GT	3	6	502940	502945	0 %	50 %	50 %	0 %	512443938
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10727	NC_021508	CCTG	2	8	507765	507772	0 %	25 %	25 %	50 %	512443942
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10735	NC_021508	GCACG	2	10	508284	508293	20 %	0 %	40 %	40 %	512443943
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10987	NC_021508	ACC	2	6	519969	519974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512443951
10988	NC_021508	GC	3	6	519983	519988	0 %	0 %	50 %	50 %	512443951
10989	NC_021508	CGTG	2	8	520049	520056	0 %	25 %	50 %	25 %	512443951
10990	NC_021508	GGC	2	6	520079	520084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443951
10991	NC_021508	GGC	2	6	520094	520099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443951
10992	NC_021508	TGT	2	6	520114	520119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443951
10993	NC_021508	ATG	2	6	520149	520154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443951
10994	NC_021508	CCG	2	6	520236	520241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443951
10995	NC_021508	GCG	3	9	520281	520289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443951
10996	NC_021508	CA	3	6	520405	520410	50 %	0 %	0 %	50 %	512443951
10997	NC_021508	GCA	2	6	520414	520419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443951
10998	NC_021508	TTC	2	6	520422	520427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443951
10999	NC_021508	TCA	2	6	520504	520509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11000	NC_021508	GC	4	8	520638	520645	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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