MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 23984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_021508	TA	3	6	472903	472908	50 %	50 %	0 %	0 %	512443911
10002	NC_021508	A	8	8	472908	472915	100 %	0 %	0 %	0 %	512443911
10003	NC_021508	TTC	2	6	472956	472961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10004	NC_021508	TGC	2	6	472975	472980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10005	NC_021508	GGA	2	6	473018	473023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_021508	TG	3	6	473039	473044	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10007	NC_021508	TTG	2	6	473113	473118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443912
10008	NC_021508	GTT	2	6	473214	473219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443912
10009	NC_021508	TTC	3	9	473314	473322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443912
10010	NC_021508	G	6	6	473325	473330	0 %	0 %	100 %	0 %	512443912
10011	NC_021508	GCC	2	6	473352	473357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443912
10012	NC_021508	GCG	2	6	473361	473366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443912
10013	NC_021508	GGA	2	6	473400	473405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443912
10014	NC_021508	TCG	2	6	473407	473412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443912
10015	NC_021508	TG	3	6	473419	473424	0 %	50 %	50 %	0 %	512443912
10016	NC_021508	CT	3	6	473442	473447	0 %	50 %	0 %	50 %	512443912
10017	NC_021508	CGG	2	6	473500	473505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443912
10018	NC_021508	GC	4	8	473579	473586	0 %	0 %	50 %	50 %	512443912
10019	NC_021508	GGT	2	6	473588	473593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443912
10020	NC_021508	AGA	2	6	473636	473641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443912
10021	NC_021508	TTTC	2	8	473644	473651	0 %	75 %	0 %	25 %	512443912
10022	NC_021508	GTGGA	2	10	473671	473680	20 %	20 %	60 %	0 %	512443912
10023	NC_021508	GTGC	2	8	473694	473701	0 %	25 %	50 %	25 %	512443912
10024	NC_021508	GTG	2	6	473706	473711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443912
10025	NC_021508	TGC	2	6	473737	473742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10026	NC_021508	GT	3	6	473778	473783	0 %	50 %	50 %	0 %	512443913
10027	NC_021508	GGA	2	6	473879	473884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443913
10028	NC_021508	TGCG	2	8	473895	473902	0 %	25 %	50 %	25 %	512443913
10029	NC_021508	GC	4	8	474078	474085	0 %	0 %	50 %	50 %	512443913
10030	NC_021508	TTG	2	6	474099	474104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443913
10031	NC_021508	GGAC	2	8	474145	474152	25 %	0 %	50 %	25 %	512443913
10032	NC_021508	GCGT	2	8	474201	474208	0 %	25 %	50 %	25 %	512443913
10033	NC_021508	GGT	2	6	474211	474216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443913
10034	NC_021508	GTG	2	6	474281	474286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443913
10035	NC_021508	GC	3	6	474289	474294	0 %	0 %	50 %	50 %	512443913
10036	NC_021508	GCG	2	6	474299	474304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443913
10037	NC_021508	GGATG	2	10	474313	474322	20 %	20 %	60 %	0 %	512443913
10038	NC_021508	CAGT	2	8	474323	474330	25 %	25 %	25 %	25 %	512443913
10039	NC_021508	GCA	2	6	474469	474474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443913
10040	NC_021508	GCTG	2	8	474625	474632	0 %	25 %	50 %	25 %	512443913
10041	NC_021508	TGG	2	6	474667	474672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443913
10042	NC_021508	GGA	2	6	474850	474855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443913
10043	NC_021508	T	8	8	474864	474871	0 %	100 %	0 %	0 %	512443913
10044	NC_021508	ATA	2	6	474935	474940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512443913
10045	NC_021508	GCG	2	6	474997	475002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443914
10046	NC_021508	TGC	2	6	475014	475019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443914
10047	NC_021508	GGA	2	6	475074	475079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443914
10048	NC_021508	CGG	2	6	475171	475176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443914
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10050	NC_021508	GAG	2	6	475283	475288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443914
10051	NC_021508	GCA	2	6	475461	475466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443914
10052	NC_021508	CGCT	2	8	475512	475519	0 %	25 %	25 %	50 %	512443914
10053	NC_021508	TCAG	2	8	475559	475566	25 %	25 %	25 %	25 %	512443914
10054	NC_021508	CTC	2	6	475674	475679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443914
10055	NC_021508	T	6	6	475696	475701	0 %	100 %	0 %	0 %	512443914
10056	NC_021508	GC	3	6	475734	475739	0 %	0 %	50 %	50 %	512443914
10057	NC_021508	GTAC	2	8	475761	475768	25 %	25 %	25 %	25 %	512443914
10058	NC_021508	T	6	6	475842	475847	0 %	100 %	0 %	0 %	512443914
10059	NC_021508	ATTT	2	8	475889	475896	25 %	75 %	0 %	0 %	512443914
10060	NC_021508	CG	3	6	476058	476063	0 %	0 %	50 %	50 %	512443914
10061	NC_021508	TGC	2	6	476067	476072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443914
10062	NC_021508	TC	3	6	476083	476088	0 %	50 %	0 %	50 %	512443914
10063	NC_021508	GTG	2	6	476098	476103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10064	NC_021508	CG	3	6	476118	476123	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10065	NC_021508	GAG	2	6	476144	476149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10066	NC_021508	GC	3	6	476170	476175	0 %	0 %	50 %	50 %	512443915
10067	NC_021508	TGA	2	6	476202	476207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443915
10068	NC_021508	TAT	2	6	476230	476235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443915
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10070	NC_021508	GAA	2	6	476326	476331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443915
10071	NC_021508	ATC	2	6	476335	476340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443915
10072	NC_021508	GA	3	6	476426	476431	50 %	0 %	50 %	0 %	512443915
10073	NC_021508	GTT	2	6	476452	476457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443915
10074	NC_021508	CTA	2	6	476499	476504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443915
10075	NC_021508	CA	3	6	476505	476510	50 %	0 %	0 %	50 %	512443915
10076	NC_021508	GCGT	2	8	476511	476518	0 %	25 %	50 %	25 %	512443915
10077	NC_021508	CGG	2	6	476544	476549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443915
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10080	NC_021508	GAG	2	6	476681	476686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443915
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10083	NC_021508	TTC	2	6	476730	476735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443915
10084	NC_021508	GAT	2	6	476779	476784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443915
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10087	NC_021508	TGGA	2	8	477040	477047	25 %	25 %	50 %	0 %	512443915
10088	NC_021508	CG	3	6	477060	477065	0 %	0 %	50 %	50 %	512443915
10089	NC_021508	TAT	2	6	477072	477077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443915
10090	NC_021508	CTGA	2	8	477234	477241	25 %	25 %	25 %	25 %	512443915
10091	NC_021508	T	8	8	477265	477272	0 %	100 %	0 %	0 %	512443916
10092	NC_021508	GTC	2	6	477318	477323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443916
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10094	NC_021508	GT	4	8	477455	477462	0 %	50 %	50 %	0 %	512443916
10095	NC_021508	CTG	2	6	477485	477490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443916
10096	NC_021508	TGC	2	6	477540	477545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443916
10097	NC_021508	CGCGTA	2	12	477546	477557	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	512443916
10098	NC_021508	CTTT	2	8	477565	477572	0 %	75 %	0 %	25 %	512443916
10099	NC_021508	CG	3	6	477586	477591	0 %	0 %	50 %	50 %	512443916
10100	NC_021508	CTT	2	6	477595	477600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443916
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10102	NC_021508	A	7	7	477710	477716	100 %	0 %	0 %	0 %	512443916
10103	NC_021508	TGC	2	6	477749	477754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443916
10104	NC_021508	ACC	2	6	477786	477791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512443916
10105	NC_021508	GCT	2	6	477896	477901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10106	NC_021508	ATG	2	6	477902	477907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10107	NC_021508	AGT	2	6	477914	477919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10108	NC_021508	T	6	6	477931	477936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10109	NC_021508	ACA	2	6	477973	477978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512443917
10110	NC_021508	ACT	2	6	478025	478030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443917
10111	NC_021508	T	6	6	478047	478052	0 %	100 %	0 %	0 %	512443917
10112	NC_021508	TGA	2	6	478084	478089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443917
10113	NC_021508	TGGAT	2	10	478104	478113	20 %	40 %	40 %	0 %	512443917
10114	NC_021508	ACAGGA	2	12	478117	478128	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	512443917
10115	NC_021508	TGC	2	6	478150	478155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443917
10116	NC_021508	ACG	2	6	478157	478162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443917
10117	NC_021508	ATT	2	6	478190	478195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443917
10118	NC_021508	GTG	2	6	478262	478267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443917
10119	NC_021508	TG	3	6	478272	478277	0 %	50 %	50 %	0 %	512443917
10120	NC_021508	CAGA	2	8	478298	478305	50 %	0 %	25 %	25 %	512443917
10121	NC_021508	GTTT	2	8	478346	478353	0 %	75 %	25 %	0 %	512443917
10122	NC_021508	GGATC	2	10	478366	478375	20 %	20 %	40 %	20 %	512443917
10123	NC_021508	TTGAT	2	10	478482	478491	20 %	60 %	20 %	0 %	512443917
10124	NC_021508	AGT	2	6	478523	478528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443917
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10140	NC_021508	GT	3	6	479755	479760	0 %	50 %	50 %	0 %	512443917
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10226	NC_021508	TTTCT	2	10	484726	484735	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10227	NC_021508	TCCT	2	8	484795	484802	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10228	NC_021508	C	6	6	484843	484848	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10229	NC_021508	C	6	6	484863	484868	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10230	NC_021508	TGCT	2	8	484913	484920	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10231	NC_021508	GT	4	8	484925	484932	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10232	NC_021508	AGC	2	6	485039	485044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443922
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10236	NC_021508	CTGC	2	8	485345	485352	0 %	25 %	25 %	50 %	512443922
10237	NC_021508	CG	3	6	485362	485367	0 %	0 %	50 %	50 %	512443922
10238	NC_021508	GA	3	6	485370	485375	50 %	0 %	50 %	0 %	512443922
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10240	NC_021508	CG	3	6	485405	485410	0 %	0 %	50 %	50 %	512443922
10241	NC_021508	TGAG	2	8	485440	485447	25 %	25 %	50 %	0 %	512443922
10242	NC_021508	TGA	2	6	485480	485485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443922
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10245	NC_021508	TCA	2	6	485627	485632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443922
10246	NC_021508	GGA	2	6	485687	485692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443923
10247	NC_021508	CTT	2	6	485711	485716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443923
10248	NC_021508	T	6	6	485785	485790	0 %	100 %	0 %	0 %	512443923
10249	NC_021508	GCA	2	6	485814	485819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443923
10250	NC_021508	ATCA	2	8	485864	485871	50 %	25 %	0 %	25 %	512443923
10251	NC_021508	TGT	2	6	485872	485877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443923
10252	NC_021508	GCG	2	6	485906	485911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443923
10253	NC_021508	A	6	6	485960	485965	100 %	0 %	0 %	0 %	512443923
10254	NC_021508	G	6	6	486056	486061	0 %	0 %	100 %	0 %	512443923
10255	NC_021508	GCC	2	6	486084	486089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443923
10256	NC_021508	GCA	2	6	486090	486095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443923
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10259	NC_021508	TTC	2	6	486348	486353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443923
10260	NC_021508	GTC	2	6	486389	486394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443923
10261	NC_021508	AGCAA	2	10	486556	486565	60 %	0 %	20 %	20 %	512443923
10262	NC_021508	TAC	2	6	486735	486740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443924
10263	NC_021508	AAG	2	6	486749	486754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443924
10264	NC_021508	TTC	2	6	486760	486765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443924
10265	NC_021508	GAGG	2	8	486778	486785	25 %	0 %	75 %	0 %	512443924
10266	NC_021508	GA	3	6	486791	486796	50 %	0 %	50 %	0 %	512443924
10267	NC_021508	GAAG	2	8	486799	486806	50 %	0 %	50 %	0 %	512443924
10268	NC_021508	CGTG	2	8	486839	486846	0 %	25 %	50 %	25 %	512443924
10269	NC_021508	TCT	2	6	486860	486865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443924
10270	NC_021508	GC	3	6	486917	486922	0 %	0 %	50 %	50 %	512443924
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10272	NC_021508	TCA	2	6	486962	486967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443924
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10274	NC_021508	CG	3	6	487053	487058	0 %	0 %	50 %	50 %	512443924
10275	NC_021508	CAAG	2	8	487059	487066	50 %	0 %	25 %	25 %	512443924
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10277	NC_021508	GGC	2	6	487162	487167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443924
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10279	NC_021508	AGGG	2	8	487253	487260	25 %	0 %	75 %	0 %	512443924
10280	NC_021508	GC	3	6	487376	487381	0 %	0 %	50 %	50 %	512443924
10281	NC_021508	AGCG	2	8	487401	487408	25 %	0 %	50 %	25 %	512443924
10282	NC_021508	AACA	2	8	487489	487496	75 %	0 %	0 %	25 %	512443924
10283	NC_021508	G	6	6	487521	487526	0 %	0 %	100 %	0 %	512443924
10284	NC_021508	TG	3	6	487568	487573	0 %	50 %	50 %	0 %	512443924
10285	NC_021508	G	6	6	487585	487590	0 %	0 %	100 %	0 %	512443924
10286	NC_021508	GTC	2	6	487607	487612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443924
10287	NC_021508	TGA	2	6	487701	487706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443924
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10289	NC_021508	CGTC	2	8	487820	487827	0 %	25 %	25 %	50 %	512443924
10290	NC_021508	CGTG	2	8	487828	487835	0 %	25 %	50 %	25 %	512443924
10291	NC_021508	CGG	2	6	487887	487892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443924
10292	NC_021508	GT	3	6	487906	487911	0 %	50 %	50 %	0 %	512443924
10293	NC_021508	GTGC	2	8	487937	487944	0 %	25 %	50 %	25 %	512443924
10294	NC_021508	CA	3	6	487977	487982	50 %	0 %	0 %	50 %	512443924
10295	NC_021508	GGCG	2	8	488050	488057	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10296	NC_021508	CAG	2	6	488068	488073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10299	NC_021508	TGC	2	6	488214	488219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443925
10300	NC_021508	GCT	2	6	488224	488229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443925
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10302	NC_021508	GAG	2	6	488249	488254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443925
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10304	NC_021508	ACC	2	6	488490	488495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512443925
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10307	NC_021508	CG	3	6	488751	488756	0 %	0 %	50 %	50 %	512443925
10308	NC_021508	TGTA	2	8	488769	488776	25 %	50 %	25 %	0 %	512443925
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10313	NC_021508	GGAT	2	8	489034	489041	25 %	25 %	50 %	0 %	512443925
10314	NC_021508	GTGG	2	8	489178	489185	0 %	25 %	75 %	0 %	512443925
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10319	NC_021508	GGCAGC	2	12	489331	489342	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	512443925
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10328	NC_021508	GGTGCG	2	12	489814	489825	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	512443925
10329	NC_021508	AGG	2	6	489915	489920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10330	NC_021508	TTTG	2	8	490015	490022	0 %	75 %	25 %	0 %	512443926
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10332	NC_021508	GC	3	6	490128	490133	0 %	0 %	50 %	50 %	512443926
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10351	NC_021508	CG	3	6	490871	490876	0 %	0 %	50 %	50 %	512443927
10352	NC_021508	CGGC	2	8	490925	490932	0 %	0 %	50 %	50 %	512443927
10353	NC_021508	GC	3	6	490951	490956	0 %	0 %	50 %	50 %	512443927
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10356	NC_021508	GTGC	2	8	491111	491118	0 %	25 %	50 %	25 %	512443927
10357	NC_021508	GC	4	8	491117	491124	0 %	0 %	50 %	50 %	512443927
10358	NC_021508	GT	3	6	491141	491146	0 %	50 %	50 %	0 %	512443927
10359	NC_021508	CTGG	2	8	491357	491364	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10360	NC_021508	G	6	6	491363	491368	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10361	NC_021508	TGC	2	6	491414	491419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443928
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10363	NC_021508	GAG	2	6	491455	491460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443928
10364	NC_021508	GAC	2	6	491461	491466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443928
10365	NC_021508	T	6	6	491478	491483	0 %	100 %	0 %	0 %	512443928
10366	NC_021508	GGC	2	6	491509	491514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443928
10367	NC_021508	GC	4	8	491569	491576	0 %	0 %	50 %	50 %	512443928
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10493	NC_021508	CG	3	6	496967	496972	0 %	0 %	50 %	50 %	512443935
10494	NC_021508	GAGC	2	8	496981	496988	25 %	0 %	50 %	25 %	512443935
10495	NC_021508	CG	3	6	497000	497005	0 %	0 %	50 %	50 %	512443935
10496	NC_021508	TACA	2	8	497033	497040	50 %	25 %	0 %	25 %	512443935
10497	NC_021508	GGC	2	6	497087	497092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443935
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10500	NC_021508	GCC	2	6	497193	497198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443935

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