MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 23984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_021508	CTG	2	6	406829	406834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443849
8502	NC_021508	AAT	2	6	406847	406852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512443849
8503	NC_021508	GC	3	6	406875	406880	0 %	0 %	50 %	50 %	512443849
8504	NC_021508	ACC	2	6	406893	406898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512443849
8505	NC_021508	GTACTG	2	12	406958	406969	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	512443849
8506	NC_021508	CGCAC	2	10	407002	407011	20 %	0 %	20 %	60 %	512443849
8507	NC_021508	TCT	2	6	407103	407108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443849
8508	NC_021508	CGT	2	6	407136	407141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443849
8509	NC_021508	ACC	2	6	407142	407147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512443849
8510	NC_021508	AAT	2	6	407204	407209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512443849
8511	NC_021508	GATG	2	8	407342	407349	25 %	25 %	50 %	0 %	512443849
8512	NC_021508	T	6	6	407365	407370	0 %	100 %	0 %	0 %	512443849
8513	NC_021508	CA	3	6	407371	407376	50 %	0 %	0 %	50 %	512443849
8514	NC_021508	TG	3	6	407517	407522	0 %	50 %	50 %	0 %	512443849
8515	NC_021508	CGA	2	6	407530	407535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443849
8516	NC_021508	GCT	2	6	407544	407549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443849
8517	NC_021508	ACA	2	6	407597	407602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512443849
8518	NC_021508	AGG	3	9	407618	407626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443849
8519	NC_021508	GA	3	6	407638	407643	50 %	0 %	50 %	0 %	512443849
8520	NC_021508	TCA	2	6	407688	407693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443849
8521	NC_021508	GC	3	6	407822	407827	0 %	0 %	50 %	50 %	512443849
8522	NC_021508	GGC	2	6	407903	407908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443849
8523	NC_021508	TG	3	6	407923	407928	0 %	50 %	50 %	0 %	512443849
8524	NC_021508	CGT	2	6	407963	407968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443849
8525	NC_021508	ATC	2	6	408075	408080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443849
8526	NC_021508	GAGT	2	8	408124	408131	25 %	25 %	50 %	0 %	512443849
8527	NC_021508	TGC	2	6	408194	408199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443849
8528	NC_021508	GAT	2	6	408248	408253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443849
8529	NC_021508	GC	3	6	408330	408335	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8530	NC_021508	CCA	2	6	408343	408348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8531	NC_021508	AGC	2	6	408412	408417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443850
8532	NC_021508	TTC	2	6	408437	408442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443850
8533	NC_021508	TTGGC	2	10	408447	408456	0 %	40 %	40 %	20 %	512443850
8534	NC_021508	GTAG	2	8	408464	408471	25 %	25 %	50 %	0 %	512443850
8535	NC_021508	CAG	2	6	408507	408512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443850
8536	NC_021508	A	7	7	408522	408528	100 %	0 %	0 %	0 %	512443850
8537	NC_021508	TGC	2	6	408615	408620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443850
8538	NC_021508	AGA	2	6	408625	408630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443850
8539	NC_021508	CAG	2	6	408816	408821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443850
8540	NC_021508	CGG	2	6	408838	408843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443850
8541	NC_021508	TGA	2	6	408845	408850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443850
8542	NC_021508	CA	3	6	408935	408940	50 %	0 %	0 %	50 %	512443850
8543	NC_021508	A	7	7	408958	408964	100 %	0 %	0 %	0 %	512443850
8544	NC_021508	CG	4	8	408978	408985	0 %	0 %	50 %	50 %	512443850
8545	NC_021508	AGC	2	6	409003	409008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443850
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8548	NC_021508	CGAC	2	8	409058	409065	25 %	0 %	25 %	50 %	512443850
8549	NC_021508	C	9	9	409141	409149	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8550	NC_021508	AAG	2	6	409229	409234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8551	NC_021508	AGGG	2	8	409247	409254	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
8552	NC_021508	ATGT	2	8	409256	409263	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8553	NC_021508	GGA	2	6	409325	409330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8554	NC_021508	GGA	2	6	409365	409370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443851
8555	NC_021508	GC	3	6	409432	409437	0 %	0 %	50 %	50 %	512443851
8556	NC_021508	CCTG	2	8	409490	409497	0 %	25 %	25 %	50 %	512443851
8557	NC_021508	TTC	2	6	409530	409535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443851
8558	NC_021508	TGC	2	6	409583	409588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443851
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8561	NC_021508	CCTT	2	8	409651	409658	0 %	50 %	0 %	50 %	512443851
8562	NC_021508	GCC	2	6	409669	409674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443851
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8564	NC_021508	CA	3	6	409830	409835	50 %	0 %	0 %	50 %	512443852
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8568	NC_021508	GGGGCG	2	12	409980	409991	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	512443852
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8574	NC_021508	GCAG	2	8	410261	410268	25 %	0 %	50 %	25 %	512443852
8575	NC_021508	T	6	6	410291	410296	0 %	100 %	0 %	0 %	512443852
8576	NC_021508	G	6	6	410305	410310	0 %	0 %	100 %	0 %	512443852
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8580	NC_021508	CG	3	6	410456	410461	0 %	0 %	50 %	50 %	512443852
8581	NC_021508	GC	3	6	410482	410487	0 %	0 %	50 %	50 %	512443852
8582	NC_021508	GC	4	8	410514	410521	0 %	0 %	50 %	50 %	512443852
8583	NC_021508	GC	3	6	410538	410543	0 %	0 %	50 %	50 %	512443852
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8589	NC_021508	AGGAT	2	10	410752	410761	40 %	20 %	40 %	0 %	512443852
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8593	NC_021508	TGC	2	6	410894	410899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443852
8594	NC_021508	GA	3	6	410981	410986	50 %	0 %	50 %	0 %	512443853
8595	NC_021508	AGC	2	6	410989	410994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443853
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8598	NC_021508	GTG	2	6	411126	411131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443853
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8602	NC_021508	TGA	2	6	411333	411338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443853
8603	NC_021508	GC	3	6	411385	411390	0 %	0 %	50 %	50 %	512443854
8604	NC_021508	GTG	2	6	411455	411460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443854
8605	NC_021508	GAA	2	6	411487	411492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443854
8606	NC_021508	CCT	2	6	411629	411634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443854
8607	NC_021508	TTA	2	6	411659	411664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443854
8608	NC_021508	CG	3	6	411715	411720	0 %	0 %	50 %	50 %	512443854
8609	NC_021508	GGT	2	6	411741	411746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443854
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8611	NC_021508	GTGC	2	8	411802	411809	0 %	25 %	50 %	25 %	512443854
8612	NC_021508	TCG	2	6	411846	411851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443854
8613	NC_021508	G	6	6	411851	411856	0 %	0 %	100 %	0 %	512443854
8614	NC_021508	CGCT	2	8	411866	411873	0 %	25 %	25 %	50 %	512443854
8615	NC_021508	GCA	2	6	411942	411947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443854
8616	NC_021508	A	6	6	411964	411969	100 %	0 %	0 %	0 %	512443854
8617	NC_021508	T	6	6	411974	411979	0 %	100 %	0 %	0 %	512443854
8618	NC_021508	CGA	2	6	412014	412019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443854
8619	NC_021508	G	7	7	412077	412083	0 %	0 %	100 %	0 %	512443854
8620	NC_021508	CTG	2	6	412232	412237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443854
8621	NC_021508	GT	3	6	412294	412299	0 %	50 %	50 %	0 %	512443854
8622	NC_021508	GCG	2	6	412354	412359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443854
8623	NC_021508	TG	3	6	412367	412372	0 %	50 %	50 %	0 %	512443854
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8876	NC_021508	GTT	2	6	424568	424573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443867
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8879	NC_021508	GCA	2	6	424749	424754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443867
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8881	NC_021508	GCG	2	6	424855	424860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443867
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8885	NC_021508	GTA	2	6	424922	424927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443867
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8896	NC_021508	GAAG	2	8	425668	425675	50 %	0 %	50 %	0 %	512443867
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8984	NC_021508	GCGCA	2	10	429248	429257	20 %	0 %	40 %	40 %	512443870
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8996	NC_021508	CTTT	2	8	429870	429877	0 %	75 %	0 %	25 %	512443871
8997	NC_021508	ACGCGC	2	12	429904	429915	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	512443871
8998	NC_021508	GAA	2	6	429945	429950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443871
8999	NC_021508	AGC	2	6	429973	429978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443871
9000	NC_021508	GC	3	6	429983	429988	0 %	0 %	50 %	50 %	512443871

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