MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 23984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7502	NC_021508	TGCAG	2	10	362238	362247	20 %	20 %	40 %	20 %	512443811
7503	NC_021508	T	9	9	362335	362343	0 %	100 %	0 %	0 %	512443811
7504	NC_021508	CGTG	2	8	362369	362376	0 %	25 %	50 %	25 %	512443811
7505	NC_021508	TG	4	8	362380	362387	0 %	50 %	50 %	0 %	512443811
7506	NC_021508	AT	3	6	362485	362490	50 %	50 %	0 %	0 %	512443811
7507	NC_021508	ATT	2	6	362520	362525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443811
7508	NC_021508	T	6	6	362672	362677	0 %	100 %	0 %	0 %	512443811
7509	NC_021508	CTC	2	6	362733	362738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443811
7510	NC_021508	CATG	2	8	362750	362757	25 %	25 %	25 %	25 %	512443811
7511	NC_021508	CGTT	2	8	362775	362782	0 %	50 %	25 %	25 %	512443811
7512	NC_021508	A	7	7	362784	362790	100 %	0 %	0 %	0 %	512443811
7513	NC_021508	ACA	2	6	362859	362864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512443811
7514	NC_021508	AGA	2	6	362877	362882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443811
7515	NC_021508	ACGC	2	8	362885	362892	25 %	0 %	25 %	50 %	512443811
7516	NC_021508	TTG	2	6	362896	362901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443811
7517	NC_021508	TGA	2	6	362950	362955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443811
7518	NC_021508	CG	3	6	363026	363031	0 %	0 %	50 %	50 %	512443811
7519	NC_021508	TTC	2	6	363133	363138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443811
7520	NC_021508	A	6	6	363147	363152	100 %	0 %	0 %	0 %	512443811
7521	NC_021508	TAGG	2	8	363215	363222	25 %	25 %	50 %	0 %	512443811
7522	NC_021508	GTGC	2	8	363232	363239	0 %	25 %	50 %	25 %	512443812
7523	NC_021508	CAG	2	6	363257	363262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443812
7524	NC_021508	AGAA	2	8	363269	363276	75 %	0 %	25 %	0 %	512443812
7525	NC_021508	AAT	2	6	363330	363335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512443812
7526	NC_021508	A	6	6	363356	363361	100 %	0 %	0 %	0 %	512443812
7527	NC_021508	T	6	6	363404	363409	0 %	100 %	0 %	0 %	512443812
7528	NC_021508	A	7	7	363445	363451	100 %	0 %	0 %	0 %	512443812
7529	NC_021508	GGC	2	6	363459	363464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443812
7530	NC_021508	A	6	6	363470	363475	100 %	0 %	0 %	0 %	512443812
7531	NC_021508	G	6	6	363478	363483	0 %	0 %	100 %	0 %	512443812
7532	NC_021508	CCG	2	6	363503	363508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443812
7533	NC_021508	CGCA	2	8	363509	363516	25 %	0 %	25 %	50 %	512443812
7534	NC_021508	GTA	2	6	363542	363547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443812
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7536	NC_021508	AAAT	2	8	363699	363706	75 %	25 %	0 %	0 %	512443812
7537	NC_021508	CGCA	2	8	363716	363723	25 %	0 %	25 %	50 %	512443812
7538	NC_021508	TGC	2	6	363729	363734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443812
7539	NC_021508	T	6	6	363736	363741	0 %	100 %	0 %	0 %	512443812
7540	NC_021508	AAT	2	6	363790	363795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512443812
7541	NC_021508	GCG	2	6	363811	363816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443812
7542	NC_021508	GT	4	8	363835	363842	0 %	50 %	50 %	0 %	512443812
7543	NC_021508	TG	3	6	363868	363873	0 %	50 %	50 %	0 %	512443812
7544	NC_021508	GTAA	2	8	363884	363891	50 %	25 %	25 %	0 %	512443812
7545	NC_021508	AAG	2	6	363892	363897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443812
7546	NC_021508	CG	3	6	363913	363918	0 %	0 %	50 %	50 %	512443812
7547	NC_021508	TCT	2	6	363943	363948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443812
7548	NC_021508	CAAAA	2	10	363956	363965	80 %	0 %	0 %	20 %	512443812
7549	NC_021508	A	6	6	363962	363967	100 %	0 %	0 %	0 %	512443812
7550	NC_021508	GCC	2	6	363990	363995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443812
7551	NC_021508	CTTTT	2	10	363996	364005	0 %	80 %	0 %	20 %	512443812
7552	NC_021508	GT	3	6	364039	364044	0 %	50 %	50 %	0 %	512443812
7553	NC_021508	ATG	2	6	364084	364089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443812
7554	NC_021508	TTG	2	6	364091	364096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443812
7555	NC_021508	TCC	2	6	364107	364112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443812
7556	NC_021508	GTT	2	6	364145	364150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443812
7557	NC_021508	T	7	7	364226	364232	0 %	100 %	0 %	0 %	512443812
7558	NC_021508	GT	3	6	364248	364253	0 %	50 %	50 %	0 %	512443812
7559	NC_021508	A	7	7	364280	364286	100 %	0 %	0 %	0 %	512443812
7560	NC_021508	CG	3	6	364293	364298	0 %	0 %	50 %	50 %	512443812
7561	NC_021508	TC	5	10	364305	364314	0 %	50 %	0 %	50 %	512443812
7562	NC_021508	GAG	2	6	364328	364333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443812
7563	NC_021508	TG	3	6	364442	364447	0 %	50 %	50 %	0 %	512443812
7564	NC_021508	GC	3	6	364457	364462	0 %	0 %	50 %	50 %	512443812
7565	NC_021508	GGT	2	6	364489	364494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443812
7566	NC_021508	GCA	2	6	364627	364632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443812
7567	NC_021508	TG	3	6	364792	364797	0 %	50 %	50 %	0 %	512443813
7568	NC_021508	GT	3	6	364810	364815	0 %	50 %	50 %	0 %	512443813
7569	NC_021508	CT	3	6	364885	364890	0 %	50 %	0 %	50 %	512443813
7570	NC_021508	GAA	2	6	364953	364958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443813
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7573	NC_021508	TACC	2	8	365003	365010	25 %	25 %	0 %	50 %	512443813
7574	NC_021508	GAC	2	6	365075	365080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443813
7575	NC_021508	GAT	2	6	365090	365095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443813
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7577	NC_021508	TG	3	6	365172	365177	0 %	50 %	50 %	0 %	512443813
7578	NC_021508	T	6	6	365196	365201	0 %	100 %	0 %	0 %	512443813
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7582	NC_021508	TTATT	2	10	365364	365373	20 %	80 %	0 %	0 %	512443813
7583	NC_021508	CGTG	2	8	365457	365464	0 %	25 %	50 %	25 %	512443813
7584	NC_021508	GAA	2	6	365615	365620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443813
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7587	NC_021508	GTC	2	6	365817	365822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443813
7588	NC_021508	CATA	2	8	365835	365842	50 %	25 %	0 %	25 %	512443813
7589	NC_021508	CTC	2	6	365859	365864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443813
7590	NC_021508	CGG	2	6	365994	365999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443813
7591	NC_021508	TAT	2	6	366003	366008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443813
7592	NC_021508	GCAG	2	8	366023	366030	25 %	0 %	50 %	25 %	512443813
7593	NC_021508	T	6	6	366035	366040	0 %	100 %	0 %	0 %	512443813
7594	NC_021508	GTT	2	6	366113	366118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443813
7595	NC_021508	ATT	2	6	366121	366126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443813
7596	NC_021508	AGG	2	6	366133	366138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443813
7597	NC_021508	TGG	3	9	366168	366176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7598	NC_021508	TGG	2	6	366192	366197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7599	NC_021508	ATGG	2	8	366226	366233	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7600	NC_021508	ACC	2	6	366339	366344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512443814
7601	NC_021508	TTGC	2	8	366354	366361	0 %	50 %	25 %	25 %	512443814
7602	NC_021508	TC	3	6	366424	366429	0 %	50 %	0 %	50 %	512443814
7603	NC_021508	CGGA	2	8	366453	366460	25 %	0 %	50 %	25 %	512443814
7604	NC_021508	TTC	2	6	366512	366517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443814
7605	NC_021508	TGGT	2	8	366546	366553	0 %	50 %	50 %	0 %	512443814
7606	NC_021508	AGGG	3	12	366621	366632	25 %	0 %	75 %	0 %	512443814
7607	NC_021508	GTG	2	6	366774	366779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443814
7608	NC_021508	TAT	3	9	366782	366790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443814
7609	NC_021508	CAG	2	6	366887	366892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443815
7610	NC_021508	ACA	2	6	366958	366963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512443815
7611	NC_021508	GT	3	6	366980	366985	0 %	50 %	50 %	0 %	512443815
7612	NC_021508	CTT	2	6	367017	367022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443815
7613	NC_021508	TGCG	2	8	367033	367040	0 %	25 %	50 %	25 %	512443815
7614	NC_021508	TGGAT	2	10	367067	367076	20 %	40 %	40 %	0 %	512443815
7615	NC_021508	ACA	2	6	367083	367088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512443815
7616	NC_021508	GC	3	6	367090	367095	0 %	0 %	50 %	50 %	512443815
7617	NC_021508	T	6	6	367099	367104	0 %	100 %	0 %	0 %	512443815
7618	NC_021508	TTG	2	6	367125	367130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443815
7619	NC_021508	AGT	2	6	367144	367149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443815
7620	NC_021508	TGA	2	6	367153	367158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443815
7621	NC_021508	AAG	2	6	367172	367177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443815
7622	NC_021508	TTGC	2	8	367212	367219	0 %	50 %	25 %	25 %	512443815
7623	NC_021508	AAAC	2	8	367251	367258	75 %	0 %	0 %	25 %	512443815
7624	NC_021508	TTTC	2	8	367282	367289	0 %	75 %	0 %	25 %	512443815
7625	NC_021508	TAC	2	6	367370	367375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443815
7626	NC_021508	TCG	2	6	367426	367431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443815
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7628	NC_021508	AG	3	6	367499	367504	50 %	0 %	50 %	0 %	512443815
7629	NC_021508	GTA	2	6	367613	367618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443815
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7631	NC_021508	GCT	2	6	367745	367750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443816
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7634	NC_021508	TGAG	2	8	367862	367869	25 %	25 %	50 %	0 %	512443816
7635	NC_021508	CGCAC	2	10	367886	367895	20 %	0 %	20 %	60 %	512443816
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7742	NC_021508	AGGG	2	8	372323	372330	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
7743	NC_021508	CGAG	2	8	372355	372362	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7744	NC_021508	TTTCCG	2	12	372431	372442	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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7747	NC_021508	GT	3	6	372512	372517	0 %	50 %	50 %	0 %	512443818
7748	NC_021508	TCT	2	6	372566	372571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443818
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