MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 23984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7002	NC_021508	GTG	2	6	338367	338372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443795
7003	NC_021508	CGG	2	6	338393	338398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443795
7004	NC_021508	CG	3	6	338459	338464	0 %	0 %	50 %	50 %	512443795
7005	NC_021508	GCG	2	6	338473	338478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443795
7006	NC_021508	GCA	2	6	338506	338511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443795
7007	NC_021508	A	6	6	338528	338533	100 %	0 %	0 %	0 %	512443795
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7010	NC_021508	CG	3	6	338664	338669	0 %	0 %	50 %	50 %	512443795
7011	NC_021508	G	7	7	338727	338733	0 %	0 %	100 %	0 %	512443795
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7014	NC_021508	A	6	6	338882	338887	100 %	0 %	0 %	0 %	512443795
7015	NC_021508	A	7	7	338900	338906	100 %	0 %	0 %	0 %	512443795
7016	NC_021508	GCT	2	6	338967	338972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443796
7017	NC_021508	GGT	2	6	339015	339020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443796
7018	NC_021508	GTG	2	6	339148	339153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443796
7019	NC_021508	GT	4	8	339262	339269	0 %	50 %	50 %	0 %	512443796
7020	NC_021508	CTTT	3	12	339292	339303	0 %	75 %	0 %	25 %	512443796
7021	NC_021508	GCG	2	6	339313	339318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443796
7022	NC_021508	GGA	2	6	339340	339345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443796
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7024	NC_021508	GGT	3	9	339396	339404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443796
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7029	NC_021508	GT	3	6	339743	339748	0 %	50 %	50 %	0 %	512443796
7030	NC_021508	CGGG	2	8	339774	339781	0 %	0 %	75 %	25 %	512443796
7031	NC_021508	TGG	2	6	339830	339835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443796
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7033	NC_021508	CGG	2	6	339864	339869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443796
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7039	NC_021508	TGG	2	6	340051	340056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443797
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7051	NC_021508	T	6	6	340433	340438	0 %	100 %	0 %	0 %	512443797
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7054	NC_021508	CGTG	2	8	340559	340566	0 %	25 %	50 %	25 %	512443797
7055	NC_021508	GT	3	6	340609	340614	0 %	50 %	50 %	0 %	512443797
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7060	NC_021508	TGC	2	6	340906	340911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443797
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7063	NC_021508	T	6	6	341063	341068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7066	NC_021508	GTGCTC	2	12	341134	341145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443798
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7091	NC_021508	CT	4	8	343016	343023	0 %	50 %	0 %	50 %	512443798
7092	NC_021508	TCA	2	6	343089	343094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443798
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7095	NC_021508	T	6	6	343204	343209	0 %	100 %	0 %	0 %	512443798
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7101	NC_021508	GCGT	2	8	343659	343666	0 %	25 %	50 %	25 %	512443798
7102	NC_021508	CAC	2	6	343674	343679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512443798
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7106	NC_021508	T	6	6	344004	344009	0 %	100 %	0 %	0 %	512443798
7107	NC_021508	CAG	2	6	344032	344037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443798
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7110	NC_021508	GC	3	6	344161	344166	0 %	0 %	50 %	50 %	512443798
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7113	NC_021508	TAG	2	6	344258	344263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443798
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7122	NC_021508	G	6	6	344754	344759	0 %	0 %	100 %	0 %	512443798
7123	NC_021508	T	7	7	344764	344770	0 %	100 %	0 %	0 %	512443798
7124	NC_021508	TTTCG	2	10	344846	344855	0 %	60 %	20 %	20 %	512443798
7125	NC_021508	CCG	2	6	344959	344964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443798
7126	NC_021508	GGT	2	6	345000	345005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443798
7127	NC_021508	GGA	2	6	345096	345101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443798
7128	NC_021508	TTTGGA	2	12	345117	345128	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	512443798
7129	NC_021508	GCA	2	6	345194	345199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443798
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7131	NC_021508	CGT	2	6	345250	345255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443798
7132	NC_021508	GCT	2	6	345282	345287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443798
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7134	NC_021508	CCGG	2	8	345363	345370	0 %	0 %	50 %	50 %	512443798
7135	NC_021508	T	7	7	345397	345403	0 %	100 %	0 %	0 %	512443798
7136	NC_021508	A	6	6	345528	345533	100 %	0 %	0 %	0 %	512443799
7137	NC_021508	GTT	2	6	345556	345561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443799
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7139	NC_021508	T	6	6	345676	345681	0 %	100 %	0 %	0 %	512443799
7140	NC_021508	TCC	2	6	345904	345909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443799
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7150	NC_021508	CG	3	6	346250	346255	0 %	0 %	50 %	50 %	512443799
7151	NC_021508	A	7	7	346284	346290	100 %	0 %	0 %	0 %	512443799
7152	NC_021508	TGG	2	6	346330	346335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443799
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7163	NC_021508	TCG	2	6	346737	346742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443799
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7166	NC_021508	TGGGG	2	10	346847	346856	0 %	20 %	80 %	0 %	512443799
7167	NC_021508	AGGC	2	8	346858	346865	25 %	0 %	50 %	25 %	512443799
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7169	NC_021508	T	6	6	346907	346912	0 %	100 %	0 %	0 %	512443799
7170	NC_021508	CTTTGA	2	12	347021	347032	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	512443799
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7191	NC_021508	CCA	2	6	348073	348078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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7233	NC_021508	TCA	2	6	350533	350538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443801
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7235	NC_021508	T	6	6	350659	350664	0 %	100 %	0 %	0 %	512443801
7236	NC_021508	GC	3	6	350691	350696	0 %	0 %	50 %	50 %	512443801
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7238	NC_021508	CA	3	6	350734	350739	50 %	0 %	0 %	50 %	512443801
7239	NC_021508	GCA	2	6	350748	350753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443801
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7243	NC_021508	A	6	6	350973	350978	100 %	0 %	0 %	0 %	512443801
7244	NC_021508	CG	3	6	351057	351062	0 %	0 %	50 %	50 %	512443801
7245	NC_021508	GCA	2	6	351083	351088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443801
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7360	NC_021508	GCAT	2	8	356335	356342	25 %	25 %	25 %	25 %	512443804
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7366	NC_021508	CCT	2	6	356681	356686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7367	NC_021508	TGCG	2	8	356688	356695	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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7500	NC_021508	TGACG	2	10	362085	362094	20 %	20 %	40 %	20 %	512443810

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