MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 23994

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23002	NC_021490	CGGT	2	8	1090735	1090742	0 %	25 %	50 %	25 %	512557027
23003	NC_021490	GGT	2	6	1090758	1090763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512557027
23004	NC_021490	AGC	2	6	1091038	1091043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23005	NC_021490	T	7	7	1091082	1091088	0 %	100 %	0 %	0 %	512557028
23006	NC_021490	A	6	6	1091172	1091177	100 %	0 %	0 %	0 %	512557028
23007	NC_021490	CT	4	8	1091182	1091189	0 %	50 %	0 %	50 %	512557028
23008	NC_021490	CGTG	2	8	1091204	1091211	0 %	25 %	50 %	25 %	512557028
23009	NC_021490	T	6	6	1091296	1091301	0 %	100 %	0 %	0 %	512557028
23010	NC_021490	AGC	2	6	1091320	1091325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512557028
23011	NC_021490	CAG	2	6	1091456	1091461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512557028
23012	NC_021490	TCA	2	6	1091467	1091472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512557028
23013	NC_021490	GGAC	2	8	1091659	1091666	25 %	0 %	50 %	25 %	512557028
23014	NC_021490	ACC	2	6	1091767	1091772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512557028
23015	NC_021490	TGC	2	6	1091773	1091778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512557028
23016	NC_021490	ACA	2	6	1091941	1091946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512557028
23017	NC_021490	CG	3	6	1091963	1091968	0 %	0 %	50 %	50 %	512557028
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23020	NC_021490	AGC	2	6	1092106	1092111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512557028
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23024	NC_021490	CAA	3	9	1092315	1092323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512557029
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23033	NC_021490	AG	3	6	1092627	1092632	50 %	0 %	50 %	0 %	512557029
23034	NC_021490	GC	3	6	1092636	1092641	0 %	0 %	50 %	50 %	512557029
23035	NC_021490	AAGA	2	8	1092655	1092662	75 %	0 %	25 %	0 %	512557029
23036	NC_021490	CCCT	2	8	1092715	1092722	0 %	25 %	0 %	75 %	512557029
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23039	NC_021490	CA	3	6	1092985	1092990	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23040	NC_021490	TCC	2	6	1093009	1093014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23041	NC_021490	AAG	2	6	1093051	1093056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23042	NC_021490	GCA	2	6	1093067	1093072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23043	NC_021490	GTC	2	6	1093137	1093142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512557030
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23053	NC_021490	TGC	2	6	1093328	1093333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512557030
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23068	NC_021490	CTG	2	6	1093758	1093763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512557030
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23072	NC_021490	CTA	2	6	1093889	1093894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512557030
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23090	NC_021490	GCA	2	6	1094605	1094610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512557031
23091	NC_021490	CA	4	8	1094609	1094616	50 %	0 %	0 %	50 %	512557031
23092	NC_021490	CG	3	6	1094649	1094654	0 %	0 %	50 %	50 %	512557031
23093	NC_021490	ACT	2	6	1094753	1094758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512557031
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23102	NC_021490	AG	3	6	1095031	1095036	50 %	0 %	50 %	0 %	512557032
23103	NC_021490	AGC	2	6	1095153	1095158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512557032
23104	NC_021490	GA	3	6	1095169	1095174	50 %	0 %	50 %	0 %	512557032
23105	NC_021490	TGCG	2	8	1095192	1095199	0 %	25 %	50 %	25 %	512557032
23106	NC_021490	CA	3	6	1095210	1095215	50 %	0 %	0 %	50 %	512557032
23107	NC_021490	GAA	2	6	1095243	1095248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512557032
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23109	NC_021490	ACGC	2	8	1095310	1095317	25 %	0 %	25 %	50 %	512557032
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23112	NC_021490	CTG	2	6	1095440	1095445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512557032
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23114	NC_021490	ACTC	2	8	1095487	1095494	25 %	25 %	0 %	50 %	512557032
23115	NC_021490	GGC	2	6	1095779	1095784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512557032
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23118	NC_021490	GTC	2	6	1095830	1095835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512557032
23119	NC_021490	T	8	8	1095851	1095858	0 %	100 %	0 %	0 %	512557032
23120	NC_021490	ATCTGC	2	12	1095984	1095995	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	512557032
23121	NC_021490	TTG	2	6	1096055	1096060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512557032
23122	NC_021490	GTT	2	6	1096101	1096106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512557032
23123	NC_021490	CGG	2	6	1096127	1096132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512557032
23124	NC_021490	TCA	2	6	1096191	1096196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512557032
23125	NC_021490	ATA	2	6	1096197	1096202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512557032
23126	NC_021490	ACGT	2	8	1096256	1096263	25 %	25 %	25 %	25 %	512557032
23127	NC_021490	TG	4	8	1096274	1096281	0 %	50 %	50 %	0 %	512557032
23128	NC_021490	TC	3	6	1096327	1096332	0 %	50 %	0 %	50 %	512557032
23129	NC_021490	CA	3	6	1096376	1096381	50 %	0 %	0 %	50 %	512557032
23130	NC_021490	CAC	2	6	1096594	1096599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23131	NC_021490	AT	3	6	1096647	1096652	50 %	50 %	0 %	0 %	512557033
23132	NC_021490	CAC	2	6	1096743	1096748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512557033
23133	NC_021490	CAT	2	6	1096752	1096757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512557033
23134	NC_021490	CCAT	2	8	1096801	1096808	25 %	25 %	0 %	50 %	512557033
23135	NC_021490	T	7	7	1096847	1096853	0 %	100 %	0 %	0 %	512557033
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23144	NC_021490	GC	3	6	1097352	1097357	0 %	0 %	50 %	50 %	512557033
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23156	NC_021490	GCAAC	2	10	1097771	1097780	40 %	0 %	20 %	40 %	512557033
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23172	NC_021490	CTG	2	6	1098654	1098659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512557034
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23195	NC_021490	AAAG	2	8	1099569	1099576	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23196	NC_021490	CA	3	6	1099628	1099633	50 %	0 %	0 %	50 %	512557035
23197	NC_021490	CGTA	2	8	1099657	1099664	25 %	25 %	25 %	25 %	512557035
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23222	NC_021490	CGCA	2	8	1101078	1101085	25 %	0 %	25 %	50 %	512557035
23223	NC_021490	TCCC	2	8	1101107	1101114	0 %	25 %	0 %	75 %	512557035
23224	NC_021490	TGC	2	6	1101146	1101151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512557035
23225	NC_021490	TGA	2	6	1101205	1101210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512557035
23226	NC_021490	GC	3	6	1101219	1101224	0 %	0 %	50 %	50 %	512557035
23227	NC_021490	TCAT	2	8	1101313	1101320	25 %	50 %	0 %	25 %	512557035
23228	NC_021490	GAG	2	6	1101356	1101361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512557035
23229	NC_021490	CTG	2	6	1101421	1101426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512557035
23230	NC_021490	GTGC	2	8	1101495	1101502	0 %	25 %	50 %	25 %	512557035
23231	NC_021490	AAGC	2	8	1101615	1101622	50 %	0 %	25 %	25 %	512557035
23232	NC_021490	GC	3	6	1101621	1101626	0 %	0 %	50 %	50 %	512557035
23233	NC_021490	CAGT	2	8	1101659	1101666	25 %	25 %	25 %	25 %	512557035
23234	NC_021490	TAA	2	6	1101680	1101685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512557035
23235	NC_021490	CTT	2	6	1101716	1101721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512557035
23236	NC_021490	T	6	6	1101720	1101725	0 %	100 %	0 %	0 %	512557035
23237	NC_021490	TTG	2	6	1101783	1101788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512557035
23238	NC_021490	TTTC	2	8	1101791	1101798	0 %	75 %	0 %	25 %	512557035
23239	NC_021490	T	6	6	1101859	1101864	0 %	100 %	0 %	0 %	512557035
23240	NC_021490	CTTCA	2	10	1101894	1101903	20 %	40 %	0 %	40 %	512557035
23241	NC_021490	TGA	2	6	1102025	1102030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512557035
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23244	NC_021490	TGA	2	6	1102136	1102141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512557035
23245	NC_021490	AT	3	6	1102147	1102152	50 %	50 %	0 %	0 %	512557035
23246	NC_021490	TCCG	2	8	1102156	1102163	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23247	NC_021490	CG	3	6	1102251	1102256	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23248	NC_021490	GAA	2	6	1102257	1102262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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23250	NC_021490	TTCA	2	8	1102623	1102630	25 %	50 %	0 %	25 %	512557036
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23262	NC_021490	TTTCG	2	10	1103210	1103219	0 %	60 %	20 %	20 %	512557036
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23265	NC_021490	GCA	2	6	1103293	1103298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512557036
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23276	NC_021490	TTCT	2	8	1103942	1103949	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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23308	NC_021490	TTC	2	6	1105706	1105711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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23310	NC_021490	GAG	2	6	1105788	1105793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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23340	NC_021490	TG	3	6	1106954	1106959	0 %	50 %	50 %	0 %	512557041
23341	NC_021490	GCGT	2	8	1107065	1107072	0 %	25 %	50 %	25 %	512557041
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23346	NC_021490	GGC	2	6	1107371	1107376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512557041
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23350	NC_021490	CCT	2	6	1107533	1107538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512557041
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23353	NC_021490	GCA	2	6	1107674	1107679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512557041
23354	NC_021490	CAT	2	6	1107687	1107692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512557041
23355	NC_021490	CTT	2	6	1107698	1107703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512557041
23356	NC_021490	CGA	2	6	1107784	1107789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512557041
23357	NC_021490	CG	3	6	1107794	1107799	0 %	0 %	50 %	50 %	512557041
23358	NC_021490	CCA	2	6	1107804	1107809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512557041
23359	NC_021490	TC	3	6	1107877	1107882	0 %	50 %	0 %	50 %	512557041
23360	NC_021490	ACCC	2	8	1107934	1107941	25 %	0 %	0 %	75 %	512557041
23361	NC_021490	ACT	2	6	1107944	1107949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512557041
23362	NC_021490	AG	3	6	1107958	1107963	50 %	0 %	50 %	0 %	512557041
23363	NC_021490	TAC	2	6	1107975	1107980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512557041
23364	NC_021490	GTC	2	6	1108028	1108033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512557042
23365	NC_021490	ACG	3	9	1108074	1108082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512557042
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23367	NC_021490	CA	3	6	1108187	1108192	50 %	0 %	0 %	50 %	512557042
23368	NC_021490	AGG	2	6	1108265	1108270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512557042
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23370	NC_021490	AG	3	6	1108339	1108344	50 %	0 %	50 %	0 %	512557042
23371	NC_021490	GC	3	6	1108365	1108370	0 %	0 %	50 %	50 %	512557042
23372	NC_021490	CTC	2	6	1108371	1108376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512557042
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23380	NC_021490	GCA	3	9	1108868	1108876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512557043
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23384	NC_021490	CTT	2	6	1109011	1109016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512557043
23385	NC_021490	TGC	2	6	1109090	1109095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512557043
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23387	NC_021490	CAG	2	6	1109301	1109306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512557043
23388	NC_021490	CTT	2	6	1109314	1109319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512557043
23389	NC_021490	AAC	2	6	1109498	1109503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23390	NC_021490	CA	3	6	1109521	1109526	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23391	NC_021490	GCA	2	6	1109544	1109549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23392	NC_021490	CG	3	6	1109587	1109592	0 %	0 %	50 %	50 %	512557044
23393	NC_021490	CGC	2	6	1109597	1109602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512557044
23394	NC_021490	CGC	2	6	1109608	1109613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512557044
23395	NC_021490	CA	3	6	1109679	1109684	50 %	0 %	0 %	50 %	512557044
23396	NC_021490	AAC	2	6	1109744	1109749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512557044
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23399	NC_021490	ACCC	2	8	1110021	1110028	25 %	0 %	0 %	75 %	512557044
23400	NC_021490	CGTAT	2	10	1110160	1110169	20 %	40 %	20 %	20 %	512557044
23401	NC_021490	ATC	2	6	1110227	1110232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512557044
23402	NC_021490	CAC	2	6	1110358	1110363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512557044
23403	NC_021490	GC	3	6	1110364	1110369	0 %	0 %	50 %	50 %	512557044
23404	NC_021490	GAGG	2	8	1110370	1110377	25 %	0 %	75 %	0 %	512557044
23405	NC_021490	CTTC	2	8	1110403	1110410	0 %	50 %	0 %	50 %	512557044
23406	NC_021490	CGT	2	6	1110543	1110548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512557044
23407	NC_021490	CA	3	6	1110685	1110690	50 %	0 %	0 %	50 %	512557044
23408	NC_021490	GAC	2	6	1110789	1110794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512557044
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23412	NC_021490	GC	3	6	1110916	1110921	0 %	0 %	50 %	50 %	512557044
23413	NC_021490	TCA	2	6	1110956	1110961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512557044
23414	NC_021490	CCT	3	9	1111065	1111073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512557044
23415	NC_021490	ATGC	2	8	1111234	1111241	25 %	25 %	25 %	25 %	512557044
23416	NC_021490	CAG	2	6	1111242	1111247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512557044
23417	NC_021490	AAG	2	6	1111322	1111327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512557044
23418	NC_021490	TAT	2	6	1111381	1111386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23419	NC_021490	CTG	2	6	1111397	1111402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23420	NC_021490	CT	3	6	1111443	1111448	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23421	NC_021490	CA	3	6	1111484	1111489	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23422	NC_021490	A	6	6	1111524	1111529	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23423	NC_021490	CA	4	8	1111539	1111546	50 %	0 %	0 %	50 %	512557045
23424	NC_021490	TCC	2	6	1111667	1111672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512557045
23425	NC_021490	AGG	2	6	1111673	1111678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512557045
23426	NC_021490	AAG	2	6	1111685	1111690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512557045
23427	NC_021490	AAAAG	2	10	1111700	1111709	80 %	0 %	20 %	0 %	512557045
23428	NC_021490	GAAA	2	8	1111744	1111751	75 %	0 %	25 %	0 %	512557045
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23430	NC_021490	GAC	2	6	1111765	1111770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512557045
23431	NC_021490	AGCTG	2	10	1111782	1111791	20 %	20 %	40 %	20 %	512557045
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23433	NC_021490	CT	3	6	1111831	1111836	0 %	50 %	0 %	50 %	512557045
23434	NC_021490	CG	4	8	1111838	1111845	0 %	0 %	50 %	50 %	512557045
23435	NC_021490	AAG	2	6	1111901	1111906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512557045
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23438	NC_021490	ACG	2	6	1112003	1112008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512557045
23439	NC_021490	TCA	2	6	1112018	1112023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512557045
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23441	NC_021490	CG	5	10	1112062	1112071	0 %	0 %	50 %	50 %	512557045
23442	NC_021490	TAC	2	6	1112082	1112087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512557045
23443	NC_021490	CTG	2	6	1112102	1112107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512557045
23444	NC_021490	GAA	2	6	1112152	1112157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512557045
23445	NC_021490	CAT	2	6	1112169	1112174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512557045
23446	NC_021490	CG	3	6	1112197	1112202	0 %	0 %	50 %	50 %	512557045
23447	NC_021490	AC	3	6	1112240	1112245	50 %	0 %	0 %	50 %	512557045
23448	NC_021490	GTC	2	6	1112254	1112259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512557045
23449	NC_021490	GC	3	6	1112293	1112298	0 %	0 %	50 %	50 %	512557045
23450	NC_021490	TC	3	6	1112300	1112305	0 %	50 %	0 %	50 %	512557045
23451	NC_021490	ATCC	2	8	1112332	1112339	25 %	25 %	0 %	50 %	512557045
23452	NC_021490	GC	3	6	1112341	1112346	0 %	0 %	50 %	50 %	512557045
23453	NC_021490	A	6	6	1112387	1112392	100 %	0 %	0 %	0 %	512557045
23454	NC_021490	AGG	2	6	1112519	1112524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512557045
23455	NC_021490	TTGCCA	2	12	1112570	1112581	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	512557045
23456	NC_021490	TGC	2	6	1112594	1112599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512557045
23457	NC_021490	ATGA	2	8	1112674	1112681	50 %	25 %	25 %	0 %	512557045
23458	NC_021490	CAC	2	6	1112713	1112718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512557045
23459	NC_021490	GTGTT	2	10	1112733	1112742	0 %	60 %	40 %	0 %	512557045
23460	NC_021490	CTG	2	6	1112777	1112782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512557045
23461	NC_021490	TGG	2	6	1112807	1112812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512557045
23462	NC_021490	AAC	2	6	1112920	1112925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512557045
23463	NC_021490	AG	3	6	1112982	1112987	50 %	0 %	50 %	0 %	512557045
23464	NC_021490	CG	3	6	1113035	1113040	0 %	0 %	50 %	50 %	512557045
23465	NC_021490	GA	3	6	1113076	1113081	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23466	NC_021490	CAA	2	6	1113159	1113164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512557046
23467	NC_021490	GCT	2	6	1113219	1113224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512557046
23468	NC_021490	AGC	2	6	1113244	1113249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512557046
23469	NC_021490	CGA	2	6	1113333	1113338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512557046
23470	NC_021490	CTG	2	6	1113396	1113401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512557046
23471	NC_021490	CG	4	8	1113500	1113507	0 %	0 %	50 %	50 %	512557046
23472	NC_021490	TGCG	2	8	1113611	1113618	0 %	25 %	50 %	25 %	512557047
23473	NC_021490	AC	3	6	1113641	1113646	50 %	0 %	0 %	50 %	512557047
23474	NC_021490	GGA	2	6	1113693	1113698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512557047
23475	NC_021490	CG	3	6	1113702	1113707	0 %	0 %	50 %	50 %	512557047
23476	NC_021490	G	6	6	1113766	1113771	0 %	0 %	100 %	0 %	512557047
23477	NC_021490	GAAAG	2	10	1113831	1113840	60 %	0 %	40 %	0 %	512557047
23478	NC_021490	GTT	2	6	1113898	1113903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512557047
23479	NC_021490	GC	3	6	1113904	1113909	0 %	0 %	50 %	50 %	512557047
23480	NC_021490	GC	3	6	1113912	1113917	0 %	0 %	50 %	50 %	512557047
23481	NC_021490	GAAC	2	8	1113941	1113948	50 %	0 %	25 %	25 %	512557047
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