MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 23994

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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22003	NC_021490	CTG	2	6	1043351	1043356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556988
22004	NC_021490	AAT	2	6	1043493	1043498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556988
22005	NC_021490	GAAC	2	8	1043556	1043563	50 %	0 %	25 %	25 %	512556988
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22007	NC_021490	GT	3	6	1043735	1043740	0 %	50 %	50 %	0 %	512556988
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22011	NC_021490	AGC	2	6	1043889	1043894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556988
22012	NC_021490	CCTC	2	8	1043921	1043928	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
22013	NC_021490	TCT	2	6	1043959	1043964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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22119	NC_021490	GCT	2	6	1048820	1048825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556993
22120	NC_021490	CTT	2	6	1048860	1048865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556993
22121	NC_021490	CAC	2	6	1048977	1048982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556993
22122	NC_021490	GGC	2	6	1049005	1049010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556993
22123	NC_021490	GAA	2	6	1049042	1049047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556993
22124	NC_021490	AAG	2	6	1049053	1049058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556993
22125	NC_021490	ACC	2	6	1049071	1049076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556993
22126	NC_021490	CTGTG	2	10	1049109	1049118	0 %	40 %	40 %	20 %	512556993
22127	NC_021490	CTTC	2	8	1049128	1049135	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22128	NC_021490	TGA	2	6	1049222	1049227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556994
22129	NC_021490	GC	3	6	1049267	1049272	0 %	0 %	50 %	50 %	512556994
22130	NC_021490	CTC	2	6	1049279	1049284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556994
22131	NC_021490	GCC	2	6	1049344	1049349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556994
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22133	NC_021490	CCG	2	6	1049578	1049583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556994
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22135	NC_021490	AGA	2	6	1049763	1049768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556994
22136	NC_021490	GC	3	6	1049883	1049888	0 %	0 %	50 %	50 %	512556994
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22138	NC_021490	CT	4	8	1049900	1049907	0 %	50 %	0 %	50 %	512556994
22139	NC_021490	GCGT	2	8	1049910	1049917	0 %	25 %	50 %	25 %	512556994
22140	NC_021490	AGC	2	6	1050022	1050027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556994
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22142	NC_021490	TGC	2	6	1050085	1050090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556994
22143	NC_021490	GC	3	6	1050129	1050134	0 %	0 %	50 %	50 %	512556994
22144	NC_021490	CGC	2	6	1050136	1050141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556994
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22146	NC_021490	CGC	2	6	1050160	1050165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556994
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22148	NC_021490	GCG	2	6	1050437	1050442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556994
22149	NC_021490	TGC	2	6	1050460	1050465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556994
22150	NC_021490	GCA	2	6	1050476	1050481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556994
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22152	NC_021490	GCT	2	6	1050578	1050583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556994
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22154	NC_021490	GT	3	6	1050631	1050636	0 %	50 %	50 %	0 %	512556994
22155	NC_021490	GAG	2	6	1050641	1050646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556994
22156	NC_021490	CTG	2	6	1050689	1050694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556994
22157	NC_021490	GGC	2	6	1050702	1050707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556994
22158	NC_021490	CA	3	6	1050716	1050721	50 %	0 %	0 %	50 %	512556994
22159	NC_021490	CAC	2	6	1050729	1050734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556994
22160	NC_021490	ACG	2	6	1050737	1050742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556994
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22162	NC_021490	TGCG	2	8	1050770	1050777	0 %	25 %	50 %	25 %	512556994
22163	NC_021490	C	6	6	1050787	1050792	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
22164	NC_021490	GCA	2	6	1050801	1050806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22165	NC_021490	CATGTT	2	12	1050824	1050835	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	512556995
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22167	NC_021490	CG	4	8	1050861	1050868	0 %	0 %	50 %	50 %	512556995
22168	NC_021490	TTCGCC	2	12	1050896	1050907	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	512556995
22169	NC_021490	CGTA	2	8	1050923	1050930	25 %	25 %	25 %	25 %	512556995
22170	NC_021490	CG	3	6	1050956	1050961	0 %	0 %	50 %	50 %	512556995
22171	NC_021490	GC	3	6	1050993	1050998	0 %	0 %	50 %	50 %	512556995
22172	NC_021490	CTG	2	6	1051096	1051101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556995
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22174	NC_021490	CTG	2	6	1051377	1051382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556995
22175	NC_021490	CG	3	6	1051388	1051393	0 %	0 %	50 %	50 %	512556995
22176	NC_021490	CAGC	2	8	1051464	1051471	25 %	0 %	25 %	50 %	512556995
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22203	NC_021490	TCC	2	6	1052511	1052516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556996
22204	NC_021490	CG	3	6	1052525	1052530	0 %	0 %	50 %	50 %	512556996
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22206	NC_021490	CG	3	6	1052573	1052578	0 %	0 %	50 %	50 %	512556996
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22220	NC_021490	GC	3	6	1053326	1053331	0 %	0 %	50 %	50 %	512556996
22221	NC_021490	GCC	2	6	1053406	1053411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556996
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22225	NC_021490	CCG	2	6	1053620	1053625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556996
22226	NC_021490	ACGT	2	8	1053658	1053665	25 %	25 %	25 %	25 %	512556996
22227	NC_021490	CTG	2	6	1053668	1053673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556996
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22229	NC_021490	GC	3	6	1053725	1053730	0 %	0 %	50 %	50 %	512556996
22230	NC_021490	GCT	2	6	1053770	1053775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556996
22231	NC_021490	GCC	2	6	1053787	1053792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556996
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22233	NC_021490	AC	3	6	1053806	1053811	50 %	0 %	0 %	50 %	512556996
22234	NC_021490	GCC	2	6	1053826	1053831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556996
22235	NC_021490	CGC	2	6	1053841	1053846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556996
22236	NC_021490	TGC	2	6	1053946	1053951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556996
22237	NC_021490	ACGA	2	8	1053961	1053968	50 %	0 %	25 %	25 %	512556996
22238	NC_021490	ACC	2	6	1053971	1053976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556996
22239	NC_021490	CT	3	6	1054008	1054013	0 %	50 %	0 %	50 %	512556997
22240	NC_021490	TTCTT	2	10	1054014	1054023	0 %	80 %	0 %	20 %	512556997
22241	NC_021490	ACC	2	6	1054044	1054049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556997
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22253	NC_021490	GC	3	6	1054389	1054394	0 %	0 %	50 %	50 %	512556997
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22357	NC_021490	A	6	6	1058606	1058611	100 %	0 %	0 %	0 %	512557000
22358	NC_021490	CGTGC	2	10	1058685	1058694	0 %	20 %	40 %	40 %	512557000
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22375	NC_021490	GCCT	2	8	1059655	1059662	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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22453	NC_021490	CG	3	6	1063777	1063782	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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22455	NC_021490	CG	3	6	1063790	1063795	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22456	NC_021490	CG	3	6	1063823	1063828	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22457	NC_021490	GTA	2	6	1063925	1063930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512557006
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22464	NC_021490	A	7	7	1064227	1064233	100 %	0 %	0 %	0 %	512557006
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22469	NC_021490	TTTC	2	8	1064376	1064383	0 %	75 %	0 %	25 %	512557006
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22471	NC_021490	ACCG	2	8	1064511	1064518	25 %	0 %	25 %	50 %	512557006
22472	NC_021490	CA	3	6	1064522	1064527	50 %	0 %	0 %	50 %	512557006
22473	NC_021490	TGAG	2	8	1064626	1064633	25 %	25 %	50 %	0 %	512557006
22474	NC_021490	CAG	2	6	1064634	1064639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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22476	NC_021490	ATC	2	6	1064659	1064664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512557007
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22478	NC_021490	T	6	6	1064703	1064708	0 %	100 %	0 %	0 %	512557007
22479	NC_021490	AAGC	2	8	1064764	1064771	50 %	0 %	25 %	25 %	512557007
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22485	NC_021490	TGGG	2	8	1065110	1065117	0 %	25 %	75 %	0 %	512557007
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