MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 23994

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_021490	GT	3	6	1019486	1019491	0 %	50 %	50 %	0 %	512556964
21502	NC_021490	CGT	2	6	1019497	1019502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556964
21503	NC_021490	CATC	2	8	1019542	1019549	25 %	25 %	0 %	50 %	512556964
21504	NC_021490	AACGC	2	10	1019626	1019635	40 %	0 %	20 %	40 %	512556964
21505	NC_021490	TCA	2	6	1019645	1019650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556964
21506	NC_021490	TTA	2	6	1019745	1019750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556964
21507	NC_021490	GCT	2	6	1019769	1019774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556964
21508	NC_021490	GCC	2	6	1019835	1019840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556964
21509	NC_021490	CA	4	8	1019988	1019995	50 %	0 %	0 %	50 %	512556964
21510	NC_021490	TGC	2	6	1020017	1020022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556964
21511	NC_021490	ATC	2	6	1020026	1020031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556964
21512	NC_021490	GC	4	8	1020053	1020060	0 %	0 %	50 %	50 %	512556964
21513	NC_021490	AC	3	6	1020118	1020123	50 %	0 %	0 %	50 %	512556964
21514	NC_021490	GCA	2	6	1020147	1020152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556964
21515	NC_021490	GCGCGT	2	12	1020158	1020169	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	512556964
21516	NC_021490	A	6	6	1020201	1020206	100 %	0 %	0 %	0 %	512556964
21517	NC_021490	TAA	2	6	1020255	1020260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556964
21518	NC_021490	GC	3	6	1020320	1020325	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21519	NC_021490	AGC	2	6	1020358	1020363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21520	NC_021490	CAAC	2	8	1020428	1020435	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21521	NC_021490	CTAC	2	8	1020455	1020462	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
21522	NC_021490	GCC	2	6	1020510	1020515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556965
21523	NC_021490	CGTG	2	8	1020532	1020539	0 %	25 %	50 %	25 %	512556965
21524	NC_021490	TG	4	8	1020538	1020545	0 %	50 %	50 %	0 %	512556965
21525	NC_021490	TGCG	2	8	1020577	1020584	0 %	25 %	50 %	25 %	512556965
21526	NC_021490	GATT	2	8	1020615	1020622	25 %	50 %	25 %	0 %	512556965
21527	NC_021490	AC	3	6	1020641	1020646	50 %	0 %	0 %	50 %	512556965
21528	NC_021490	TAC	2	6	1020681	1020686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556965
21529	NC_021490	CGT	2	6	1020878	1020883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556965
21530	NC_021490	ACA	2	6	1020900	1020905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556965
21531	NC_021490	AAG	2	6	1020931	1020936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556965
21532	NC_021490	ACC	2	6	1020965	1020970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556965
21533	NC_021490	CAA	2	6	1021012	1021017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556965
21534	NC_021490	CCA	2	6	1021138	1021143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556966
21535	NC_021490	GCAC	2	8	1021201	1021208	25 %	0 %	25 %	50 %	512556966
21536	NC_021490	CATAG	2	10	1021236	1021245	40 %	20 %	20 %	20 %	512556966
21537	NC_021490	GGA	2	6	1021248	1021253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556966
21538	NC_021490	A	6	6	1021253	1021258	100 %	0 %	0 %	0 %	512556966
21539	NC_021490	CG	3	6	1021336	1021341	0 %	0 %	50 %	50 %	512556966
21540	NC_021490	TGC	2	6	1021368	1021373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556966
21541	NC_021490	TCT	2	6	1021435	1021440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556966
21542	NC_021490	CCTG	2	8	1021471	1021478	0 %	25 %	25 %	50 %	512556966
21543	NC_021490	ACC	2	6	1021560	1021565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556966
21544	NC_021490	CCA	2	6	1021676	1021681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556966
21545	NC_021490	CG	4	8	1021684	1021691	0 %	0 %	50 %	50 %	512556966
21546	NC_021490	T	6	6	1021753	1021758	0 %	100 %	0 %	0 %	512556966
21547	NC_021490	CTG	2	6	1021779	1021784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556966
21548	NC_021490	AGGA	2	8	1021787	1021794	50 %	0 %	50 %	0 %	512556966
21549	NC_021490	GA	3	6	1021793	1021798	50 %	0 %	50 %	0 %	512556966
21550	NC_021490	GA	3	6	1021851	1021856	50 %	0 %	50 %	0 %	512556966
21551	NC_021490	AC	3	6	1021863	1021868	50 %	0 %	0 %	50 %	512556966
21552	NC_021490	CG	3	6	1021879	1021884	0 %	0 %	50 %	50 %	512556966
21553	NC_021490	TTCA	2	8	1021924	1021931	25 %	50 %	0 %	25 %	512556966
21554	NC_021490	CTC	2	6	1021956	1021961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21555	NC_021490	GC	3	6	1021980	1021985	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21556	NC_021490	ACGG	2	8	1021998	1022005	25 %	0 %	50 %	25 %	512556967
21557	NC_021490	CTTCT	2	10	1022044	1022053	0 %	60 %	0 %	40 %	512556967
21558	NC_021490	GC	3	6	1022054	1022059	0 %	0 %	50 %	50 %	512556967
21559	NC_021490	AGC	2	6	1022063	1022068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556967
21560	NC_021490	GCTC	2	8	1022075	1022082	0 %	25 %	25 %	50 %	512556967
21561	NC_021490	CTT	2	6	1022115	1022120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556967
21562	NC_021490	T	6	6	1022177	1022182	0 %	100 %	0 %	0 %	512556967
21563	NC_021490	CAT	2	6	1022322	1022327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556967
21564	NC_021490	CT	3	6	1022338	1022343	0 %	50 %	0 %	50 %	512556967
21565	NC_021490	CGC	2	6	1022455	1022460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556967
21566	NC_021490	ACC	2	6	1022506	1022511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556967
21567	NC_021490	ACC	2	6	1022584	1022589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556967
21568	NC_021490	GGT	2	6	1022649	1022654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556967
21569	NC_021490	GA	3	6	1022659	1022664	50 %	0 %	50 %	0 %	512556967
21570	NC_021490	GCT	2	6	1022733	1022738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556967
21571	NC_021490	CTG	2	6	1022761	1022766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556967
21572	NC_021490	A	6	6	1022772	1022777	100 %	0 %	0 %	0 %	512556967
21573	NC_021490	GCC	2	6	1022795	1022800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556967
21574	NC_021490	CTG	2	6	1022886	1022891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556967
21575	NC_021490	CGT	2	6	1022941	1022946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556967
21576	NC_021490	AT	3	6	1022974	1022979	50 %	50 %	0 %	0 %	512556967
21577	NC_021490	GAA	2	6	1022981	1022986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556967
21578	NC_021490	CAA	2	6	1023021	1023026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556967
21579	NC_021490	TCA	2	6	1023033	1023038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556967
21580	NC_021490	GGCA	2	8	1023069	1023076	25 %	0 %	50 %	25 %	512556967
21581	NC_021490	CTT	2	6	1023136	1023141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556967
21582	NC_021490	AAG	2	6	1023167	1023172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556967
21583	NC_021490	T	6	6	1023251	1023256	0 %	100 %	0 %	0 %	512556967
21584	NC_021490	TGC	2	6	1023266	1023271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556967
21585	NC_021490	AC	3	6	1023430	1023435	50 %	0 %	0 %	50 %	512556967
21586	NC_021490	GAC	2	6	1023642	1023647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556967
21587	NC_021490	CCA	2	6	1023681	1023686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556967
21588	NC_021490	AGCG	2	8	1023697	1023704	25 %	0 %	50 %	25 %	512556967
21589	NC_021490	GTG	2	6	1023716	1023721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556967
21590	NC_021490	A	6	6	1023827	1023832	100 %	0 %	0 %	0 %	512556967
21591	NC_021490	CAC	2	6	1023844	1023849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556967
21592	NC_021490	CCT	2	6	1023915	1023920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556967
21593	NC_021490	TCT	2	6	1024104	1024109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556967
21594	NC_021490	ACC	2	6	1024141	1024146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556967
21595	NC_021490	CTT	2	6	1024150	1024155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556967
21596	NC_021490	TTA	2	6	1024184	1024189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556967
21597	NC_021490	AAT	2	6	1024204	1024209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556967
21598	NC_021490	AC	3	6	1024273	1024278	50 %	0 %	0 %	50 %	512556967
21599	NC_021490	ATC	2	6	1024285	1024290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556967
21600	NC_021490	GCT	2	6	1024318	1024323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556967
21601	NC_021490	CAT	2	6	1024332	1024337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556967
21602	NC_021490	ACCG	2	8	1024345	1024352	25 %	0 %	25 %	50 %	512556967
21603	NC_021490	TCT	2	6	1024365	1024370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556967
21604	NC_021490	ACC	2	6	1024441	1024446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556967
21605	NC_021490	CTT	2	6	1024477	1024482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556967
21606	NC_021490	AG	3	6	1024524	1024529	50 %	0 %	50 %	0 %	512556967
21607	NC_021490	TCGA	2	8	1024558	1024565	25 %	25 %	25 %	25 %	512556967
21608	NC_021490	TCC	2	6	1024660	1024665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556967
21609	NC_021490	GTA	2	6	1024753	1024758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556967
21610	NC_021490	CTGTG	2	10	1024885	1024894	0 %	40 %	40 %	20 %	512556967
21611	NC_021490	AGTC	2	8	1024918	1024925	25 %	25 %	25 %	25 %	512556967
21612	NC_021490	TCG	3	9	1024952	1024960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556967
21613	NC_021490	CTT	2	6	1024989	1024994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556967
21614	NC_021490	A	7	7	1025032	1025038	100 %	0 %	0 %	0 %	512556967
21615	NC_021490	CG	3	6	1025052	1025057	0 %	0 %	50 %	50 %	512556967
21616	NC_021490	GCA	2	6	1025069	1025074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556967
21617	NC_021490	CCT	2	6	1025100	1025105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556967
21618	NC_021490	GGC	2	6	1025142	1025147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556967
21619	NC_021490	TGA	2	6	1025162	1025167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556967
21620	NC_021490	GCA	2	6	1025207	1025212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556967
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21632	NC_021490	A	7	7	1025725	1025731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21633	NC_021490	CGA	2	6	1025797	1025802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556968
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21740	NC_021490	AGA	2	6	1031603	1031608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556976
21741	NC_021490	CAT	2	6	1031619	1031624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556976
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21855	NC_021490	CA	6	12	1036522	1036533	50 %	0 %	0 %	50 %	512556981
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21982	NC_021490	GCA	2	6	1042232	1042237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556986
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