MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 23994

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21122	NC_021490	A	6	6	1001279	1001284	100 %	0 %	0 %	0 %	512556951
21123	NC_021490	AGC	2	6	1001289	1001294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556951
21124	NC_021490	CCA	2	6	1001365	1001370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556951
21125	NC_021490	A	7	7	1001370	1001376	100 %	0 %	0 %	0 %	512556951
21126	NC_021490	CGATG	2	10	1001389	1001398	20 %	20 %	40 %	20 %	512556951
21127	NC_021490	ATT	2	6	1001415	1001420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556951
21128	NC_021490	ACG	2	6	1001421	1001426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556951
21129	NC_021490	CATCA	2	10	1001465	1001474	40 %	20 %	0 %	40 %	512556951
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21131	NC_021490	GTG	2	6	1001534	1001539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556951
21132	NC_021490	CTT	2	6	1001736	1001741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556951
21133	NC_021490	ATGCG	2	10	1001760	1001769	20 %	20 %	40 %	20 %	512556951
21134	NC_021490	GCG	2	6	1001783	1001788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556951
21135	NC_021490	GC	3	6	1001890	1001895	0 %	0 %	50 %	50 %	512556951
21136	NC_021490	CG	3	6	1001896	1001901	0 %	0 %	50 %	50 %	512556951
21137	NC_021490	A	7	7	1002002	1002008	100 %	0 %	0 %	0 %	512556951
21138	NC_021490	TC	3	6	1002072	1002077	0 %	50 %	0 %	50 %	512556951
21139	NC_021490	CTG	2	6	1002116	1002121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556951
21140	NC_021490	TTCT	2	8	1002128	1002135	0 %	75 %	0 %	25 %	512556951
21141	NC_021490	GGC	2	6	1002172	1002177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556951
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21143	NC_021490	AGA	2	6	1002258	1002263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21144	NC_021490	TGG	2	6	1002369	1002374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556952
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21149	NC_021490	CT	3	6	1002515	1002520	0 %	50 %	0 %	50 %	512556952
21150	NC_021490	GCG	2	6	1002565	1002570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556952
21151	NC_021490	GCAC	2	8	1002605	1002612	25 %	0 %	25 %	50 %	512556952
21152	NC_021490	TGA	2	6	1002646	1002651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556952
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21202	NC_021490	CGC	2	6	1004335	1004340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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21233	NC_021490	GAG	2	6	1006057	1006062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556954
21234	NC_021490	GTA	2	6	1006072	1006077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556954
21235	NC_021490	TC	3	6	1006126	1006131	0 %	50 %	0 %	50 %	512556954
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21237	NC_021490	CAGT	2	8	1006229	1006236	25 %	25 %	25 %	25 %	512556954
21238	NC_021490	A	6	6	1006247	1006252	100 %	0 %	0 %	0 %	512556954
21239	NC_021490	GC	3	6	1006365	1006370	0 %	0 %	50 %	50 %	512556954
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21243	NC_021490	TGC	2	6	1006505	1006510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556954
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21246	NC_021490	A	6	6	1006672	1006677	100 %	0 %	0 %	0 %	512556954
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21257	NC_021490	CTG	2	6	1007191	1007196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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21353	NC_021490	GC	3	6	1011973	1011978	0 %	0 %	50 %	50 %	512556959
21354	NC_021490	CTT	2	6	1012005	1012010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556959
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21356	NC_021490	GCA	2	6	1012079	1012084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556959
21357	NC_021490	CA	4	8	1012133	1012140	50 %	0 %	0 %	50 %	512556959
21358	NC_021490	TGC	2	6	1012150	1012155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556959
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21360	NC_021490	GC	3	6	1012329	1012334	0 %	0 %	50 %	50 %	512556959
21361	NC_021490	AT	3	6	1012336	1012341	50 %	50 %	0 %	0 %	512556959
21362	NC_021490	ACC	2	6	1012384	1012389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556959
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21384	NC_021490	CGA	2	6	1013584	1013589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556960
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21447	NC_021490	CCG	2	6	1016866	1016871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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21480	NC_021490	CTCC	2	8	1018457	1018464	0 %	25 %	0 %	75 %	512556963
21481	NC_021490	GC	3	6	1018516	1018521	0 %	0 %	50 %	50 %	512556963
21482	NC_021490	AC	3	6	1018524	1018529	50 %	0 %	0 %	50 %	512556963
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21484	NC_021490	TCT	2	6	1018622	1018627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556963
21485	NC_021490	CAT	2	6	1018649	1018654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556963
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