MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 23994

< Previous12...36373839404142434445464748Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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20003	NC_021490	GAA	2	6	950663	950668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556902
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20108	NC_021490	TCA	2	6	956102	956107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556909
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20123	NC_021490	ATC	2	6	956808	956813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556910
20124	NC_021490	A	7	7	956821	956827	100 %	0 %	0 %	0 %	512556910
20125	NC_021490	AGC	2	6	956904	956909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556910
20126	NC_021490	T	9	9	956914	956922	0 %	100 %	0 %	0 %	512556910
20127	NC_021490	CTGCA	2	10	956934	956943	20 %	20 %	20 %	40 %	512556910
20128	NC_021490	GTT	2	6	956945	956950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556910
20129	NC_021490	A	6	6	956971	956976	100 %	0 %	0 %	0 %	512556910
20130	NC_021490	TAT	2	6	956981	956986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556910
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20132	NC_021490	AAT	2	6	957028	957033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556910
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20137	NC_021490	GCT	2	6	957300	957305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556910
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20154	NC_021490	CTG	2	6	958319	958324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556911
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20185	NC_021490	A	6	6	959515	959520	100 %	0 %	0 %	0 %	512556912
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20197	NC_021490	CAG	2	6	960358	960363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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20199	NC_021490	T	8	8	960419	960426	0 %	100 %	0 %	0 %	512556914
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20203	NC_021490	TTTG	2	8	960522	960529	0 %	75 %	25 %	0 %	512556914
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20238	NC_021490	AGAC	2	8	961882	961889	50 %	0 %	25 %	25 %	512556914
20239	NC_021490	CACAC	2	10	961940	961949	40 %	0 %	0 %	60 %	512556915
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20241	NC_021490	A	6	6	961983	961988	100 %	0 %	0 %	0 %	512556915
20242	NC_021490	TTC	2	6	962013	962018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556915
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20489	NC_021490	AGC	2	6	972914	972919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556924
20490	NC_021490	ATC	2	6	973030	973035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556924
20491	NC_021490	CG	4	8	973106	973113	0 %	0 %	50 %	50 %	512556924
20492	NC_021490	GTA	2	6	973117	973122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556924
20493	NC_021490	TC	3	6	973134	973139	0 %	50 %	0 %	50 %	512556924
20494	NC_021490	CTT	2	6	973140	973145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556924
20495	NC_021490	GCTCA	2	10	973189	973198	20 %	20 %	20 %	40 %	512556924
20496	NC_021490	CCA	2	6	973257	973262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556924
20497	NC_021490	AGT	2	6	973282	973287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556924
20498	NC_021490	GC	3	6	973360	973365	0 %	0 %	50 %	50 %	512556924
20499	NC_021490	AC	3	6	973372	973377	50 %	0 %	0 %	50 %	512556924
20500	NC_021490	CTC	2	6	973381	973386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556924

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