MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 23994

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19502	NC_021490	ATTAT	2	10	927258	927267	40 %	60 %	0 %	0 %	512556887
19503	NC_021490	CG	3	6	927349	927354	0 %	0 %	50 %	50 %	512556887
19504	NC_021490	GA	3	6	927376	927381	50 %	0 %	50 %	0 %	512556887
19505	NC_021490	AAG	2	6	927429	927434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556887
19506	NC_021490	ATG	2	6	927507	927512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556887
19507	NC_021490	ATC	2	6	927524	927529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556887
19508	NC_021490	AGT	2	6	927547	927552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556887
19509	NC_021490	GC	3	6	927568	927573	0 %	0 %	50 %	50 %	512556887
19510	NC_021490	ATC	2	6	927602	927607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556887
19511	NC_021490	TTTCC	2	10	927676	927685	0 %	60 %	0 %	40 %	512556887
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19517	NC_021490	ATC	2	6	927831	927836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556887
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19521	NC_021490	ATC	2	6	928202	928207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556887
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19524	NC_021490	CTGT	2	8	928310	928317	0 %	50 %	25 %	25 %	512556887
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19543	NC_021490	CTGA	2	8	929201	929208	25 %	25 %	25 %	25 %	512556887
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19553	NC_021490	GCT	2	6	929482	929487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556887
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19557	NC_021490	GCA	2	6	929700	929705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556887
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19606	NC_021490	GTAGC	2	10	932198	932207	20 %	20 %	40 %	20 %	512556888
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19988	NC_021490	GTGC	2	8	949794	949801	0 %	25 %	50 %	25 %	512556901
19989	NC_021490	GCG	2	6	949807	949812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556901
19990	NC_021490	AGGG	2	8	949881	949888	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
19991	NC_021490	ATCA	2	8	949899	949906	50 %	25 %	0 %	25 %	512556902
19992	NC_021490	GAT	2	6	950013	950018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556902
19993	NC_021490	A	6	6	950041	950046	100 %	0 %	0 %	0 %	512556902
19994	NC_021490	CAGG	2	8	950073	950080	25 %	0 %	50 %	25 %	512556902
19995	NC_021490	TTCA	2	8	950106	950113	25 %	50 %	0 %	25 %	512556902
19996	NC_021490	GGC	2	6	950180	950185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556902
19997	NC_021490	CCG	2	6	950200	950205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556902
19998	NC_021490	CGA	2	6	950246	950251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556902
19999	NC_021490	GC	3	6	950503	950508	0 %	0 %	50 %	50 %	512556902
20000	NC_021490	CGG	2	6	950590	950595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556902

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