MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 23994

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021490	TCG	2	6	76452	76457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556153
1502	NC_021490	AT	3	6	76471	76476	50 %	50 %	0 %	0 %	512556153
1503	NC_021490	TCA	2	6	76506	76511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556153
1504	NC_021490	AAG	2	6	76514	76519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556153
1505	NC_021490	CGT	2	6	76536	76541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556153
1506	NC_021490	C	6	6	76560	76565	0 %	0 %	0 %	100 %	512556153
1507	NC_021490	GC	3	6	76591	76596	0 %	0 %	50 %	50 %	512556153
1508	NC_021490	GAAAA	2	10	76670	76679	80 %	0 %	20 %	0 %	512556153
1509	NC_021490	ACGT	2	8	76687	76694	25 %	25 %	25 %	25 %	512556153
1510	NC_021490	TTA	2	6	76776	76781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556153
1511	NC_021490	CGA	2	6	76782	76787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556153
1512	NC_021490	CAT	2	6	76883	76888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556153
1513	NC_021490	AAT	2	6	76919	76924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556153
1514	NC_021490	CA	3	6	76942	76947	50 %	0 %	0 %	50 %	512556153
1515	NC_021490	T	6	6	76982	76987	0 %	100 %	0 %	0 %	512556153
1516	NC_021490	AAG	2	6	77003	77008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556153
1517	NC_021490	T	9	9	77014	77022	0 %	100 %	0 %	0 %	512556153
1518	NC_021490	CTC	2	6	77117	77122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556153
1519	NC_021490	GCG	2	6	77129	77134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556153
1520	NC_021490	TCC	2	6	77146	77151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556153
1521	NC_021490	GCA	2	6	77181	77186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556153
1522	NC_021490	CTTT	2	8	77253	77260	0 %	75 %	0 %	25 %	512556153
1523	NC_021490	GA	3	6	77264	77269	50 %	0 %	50 %	0 %	512556153
1524	NC_021490	GGC	2	6	77350	77355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556153
1525	NC_021490	TGC	2	6	77357	77362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556153
1526	NC_021490	CCA	2	6	77368	77373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556153
1527	NC_021490	TGC	2	6	77432	77437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556153
1528	NC_021490	TCC	2	6	77517	77522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556153
1529	NC_021490	GCG	2	6	77555	77560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556153
1530	NC_021490	AT	3	6	77583	77588	50 %	50 %	0 %	0 %	512556153
1531	NC_021490	CG	3	6	77635	77640	0 %	0 %	50 %	50 %	512556153
1532	NC_021490	GT	3	6	77706	77711	0 %	50 %	50 %	0 %	512556153
1533	NC_021490	TCA	2	6	77715	77720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556153
1534	NC_021490	AATAA	2	10	77724	77733	80 %	20 %	0 %	0 %	512556153
1535	NC_021490	TTC	2	6	77780	77785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556153
1536	NC_021490	T	6	6	77952	77957	0 %	100 %	0 %	0 %	512556153
1537	NC_021490	ACG	2	6	77960	77965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556153
1538	NC_021490	TCA	2	6	77997	78002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556153
1539	NC_021490	T	6	6	78022	78027	0 %	100 %	0 %	0 %	512556153
1540	NC_021490	GTA	2	6	78042	78047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556153
1541	NC_021490	TGC	2	6	78112	78117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556153
1542	NC_021490	GGC	2	6	78134	78139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556153
1543	NC_021490	GGC	2	6	78314	78319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556153
1544	NC_021490	GCG	2	6	78341	78346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556153
1545	NC_021490	T	6	6	78394	78399	0 %	100 %	0 %	0 %	512556153
1546	NC_021490	GA	3	6	78409	78414	50 %	0 %	50 %	0 %	512556153
1547	NC_021490	TCC	2	6	78456	78461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556153
1548	NC_021490	GCTT	2	8	78518	78525	0 %	50 %	25 %	25 %	512556153
1549	NC_021490	CTGT	2	8	78537	78544	0 %	50 %	25 %	25 %	512556153
1550	NC_021490	T	6	6	78577	78582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_021490	T	6	6	78598	78603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_021490	AGT	2	6	78629	78634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_021490	A	6	6	78758	78763	100 %	0 %	0 %	0 %	512556154
1554	NC_021490	GAA	2	6	78870	78875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556154
1555	NC_021490	T	6	6	78885	78890	0 %	100 %	0 %	0 %	512556154
1556	NC_021490	TGA	2	6	78918	78923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556154
1557	NC_021490	GAA	2	6	78927	78932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556154
1558	NC_021490	ACG	2	6	78968	78973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556154
1559	NC_021490	GT	3	6	79041	79046	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_021490	GTC	2	6	79060	79065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_021490	GCT	2	6	79120	79125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556155
1562	NC_021490	GCT	2	6	79152	79157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556155
1563	NC_021490	GAA	2	6	79174	79179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556155
1564	NC_021490	GAG	2	6	79183	79188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556155
1565	NC_021490	GCGCC	2	10	79359	79368	0 %	0 %	40 %	60 %	512556155
1566	NC_021490	ATG	2	6	79394	79399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556155
1567	NC_021490	TGA	2	6	79452	79457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556155
1568	NC_021490	AGG	2	6	79505	79510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556155
1569	NC_021490	GCT	2	6	79605	79610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556155
1570	NC_021490	TCG	2	6	79619	79624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556155
1571	NC_021490	GCA	2	6	79632	79637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556155
1572	NC_021490	ACA	2	6	79659	79664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556155
1573	NC_021490	AAC	2	6	79716	79721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556155
1574	NC_021490	GC	3	6	79738	79743	0 %	0 %	50 %	50 %	512556155
1575	NC_021490	AGT	2	6	79853	79858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556155
1576	NC_021490	GTC	2	6	79879	79884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556155
1577	NC_021490	TGAGCA	2	12	80022	80033	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	512556155
1578	NC_021490	GGCC	2	8	80052	80059	0 %	0 %	50 %	50 %	512556155
1579	NC_021490	GC	3	6	80113	80118	0 %	0 %	50 %	50 %	512556155
1580	NC_021490	TGT	2	6	80240	80245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556155
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1582	NC_021490	TTC	2	6	80281	80286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556155
1583	NC_021490	AAT	2	6	80415	80420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556155
1584	NC_021490	GGT	2	6	80506	80511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556155
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1588	NC_021490	ACA	2	6	80618	80623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556155
1589	NC_021490	CG	3	6	80624	80629	0 %	0 %	50 %	50 %	512556155
1590	NC_021490	TTG	2	6	80687	80692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_021490	GC	3	6	80800	80805	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1592	NC_021490	GCGT	2	8	80861	80868	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1593	NC_021490	TGGTG	2	10	80873	80882	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_021490	GTT	2	6	80962	80967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556156
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1596	NC_021490	TGC	2	6	80993	80998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556156
1597	NC_021490	TGT	2	6	81003	81008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556156
1598	NC_021490	CGTGT	2	10	81015	81024	0 %	40 %	40 %	20 %	512556156
1599	NC_021490	CTT	2	6	81033	81038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556156
1600	NC_021490	GGC	2	6	81099	81104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556156
1601	NC_021490	GT	3	6	81128	81133	0 %	50 %	50 %	0 %	512556156
1602	NC_021490	CTT	2	6	81147	81152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556156
1603	NC_021490	GC	3	6	81230	81235	0 %	0 %	50 %	50 %	512556156
1604	NC_021490	GTG	2	6	81273	81278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556156
1605	NC_021490	CG	3	6	81327	81332	0 %	0 %	50 %	50 %	512556156
1606	NC_021490	T	6	6	81356	81361	0 %	100 %	0 %	0 %	512556156
1607	NC_021490	ATG	2	6	81570	81575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556156
1608	NC_021490	CG	3	6	81608	81613	0 %	0 %	50 %	50 %	512556156
1609	NC_021490	CAG	2	6	81650	81655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556156
1610	NC_021490	TAC	2	6	81672	81677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556156
1611	NC_021490	CGC	2	6	81679	81684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556156
1612	NC_021490	GTGC	2	8	81956	81963	0 %	25 %	50 %	25 %	512556156
1613	NC_021490	GGC	2	6	81974	81979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556156
1614	NC_021490	CA	3	6	81996	82001	50 %	0 %	0 %	50 %	512556156
1615	NC_021490	TGC	2	6	82006	82011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556156
1616	NC_021490	AGC	2	6	82018	82023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556156
1617	NC_021490	GTG	2	6	82070	82075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556156
1618	NC_021490	G	6	6	82209	82214	0 %	0 %	100 %	0 %	512556156
1619	NC_021490	GTGA	2	8	82262	82269	25 %	25 %	50 %	0 %	512556156
1620	NC_021490	TGC	2	6	82296	82301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556156
1621	NC_021490	CGT	2	6	82307	82312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556156
1622	NC_021490	CGT	2	6	82319	82324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556156
1623	NC_021490	CGCA	2	8	82329	82336	25 %	0 %	25 %	50 %	512556156
1624	NC_021490	TCT	3	9	82358	82366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_021490	AG	3	6	82374	82379	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_021490	T	7	7	82589	82595	0 %	100 %	0 %	0 %	512556157
1627	NC_021490	ACG	2	6	82695	82700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556157
1628	NC_021490	GTG	3	9	82719	82727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556157
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1631	NC_021490	GTG	3	9	82833	82841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556157
1632	NC_021490	TG	3	6	82973	82978	0 %	50 %	50 %	0 %	512556157
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1662	NC_021490	GCA	2	6	84254	84259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1663	NC_021490	GCG	2	6	84267	84272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556159
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1729	NC_021490	TGC	2	6	87198	87203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556161
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1736	NC_021490	CTC	2	6	87538	87543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556161
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1742	NC_021490	TGTT	2	8	87915	87922	0 %	75 %	25 %	0 %	512556161
1743	NC_021490	GATC	2	8	87958	87965	25 %	25 %	25 %	25 %	512556161
1744	NC_021490	ATGG	2	8	88074	88081	25 %	25 %	50 %	0 %	512556161
1745	NC_021490	AT	3	6	88143	88148	50 %	50 %	0 %	0 %	512556161
1746	NC_021490	TG	3	6	88224	88229	0 %	50 %	50 %	0 %	512556161
1747	NC_021490	AGGA	2	8	88230	88237	50 %	0 %	50 %	0 %	512556161
1748	NC_021490	TCG	2	6	88243	88248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556161
1749	NC_021490	GC	3	6	88409	88414	0 %	0 %	50 %	50 %	512556161
1750	NC_021490	TCA	2	6	88473	88478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556161
1751	NC_021490	GGA	2	6	88495	88500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556161
1752	NC_021490	T	6	6	88508	88513	0 %	100 %	0 %	0 %	512556161
1753	NC_021490	AGT	2	6	88517	88522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556161
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1890	NC_021490	TCGA	2	8	95090	95097	25 %	25 %	25 %	25 %	512556167
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1997	NC_021490	ACTGC	2	10	100331	100340	20 %	20 %	20 %	40 %	512556173
1998	NC_021490	CG	3	6	100420	100425	0 %	0 %	50 %	50 %	512556173
1999	NC_021490	AGG	2	6	100444	100449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556173
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