MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 23994

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_021490	CTG	2	6	901832	901837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556866
19002	NC_021490	TATCAG	2	12	901912	901923	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	512556866
19003	NC_021490	CCT	2	6	901928	901933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556866
19004	NC_021490	TTC	2	6	901946	901951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556866
19005	NC_021490	TAC	2	6	902083	902088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556866
19006	NC_021490	GCG	2	6	902094	902099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556866
19007	NC_021490	CG	3	6	902102	902107	0 %	0 %	50 %	50 %	512556866
19008	NC_021490	AC	4	8	902180	902187	50 %	0 %	0 %	50 %	512556866
19009	NC_021490	GCG	2	6	902190	902195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556866
19010	NC_021490	GCG	2	6	902210	902215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556866
19011	NC_021490	CG	3	6	902277	902282	0 %	0 %	50 %	50 %	512556866
19012	NC_021490	CGTG	2	8	902315	902322	0 %	25 %	50 %	25 %	512556866
19013	NC_021490	AAC	2	6	902340	902345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556866
19014	NC_021490	GC	3	6	902349	902354	0 %	0 %	50 %	50 %	512556866
19015	NC_021490	TCG	2	6	902408	902413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556866
19016	NC_021490	ACA	2	6	902443	902448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556866
19017	NC_021490	GACAC	2	10	902459	902468	40 %	0 %	20 %	40 %	512556866
19018	NC_021490	ACT	2	6	902535	902540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556867
19019	NC_021490	CAC	2	6	902563	902568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556867
19020	NC_021490	T	6	6	902572	902577	0 %	100 %	0 %	0 %	512556867
19021	NC_021490	CG	3	6	902581	902586	0 %	0 %	50 %	50 %	512556867
19022	NC_021490	CCGTC	2	10	902595	902604	0 %	20 %	20 %	60 %	512556867
19023	NC_021490	CTC	2	6	902670	902675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556867
19024	NC_021490	GTA	2	6	902708	902713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556867
19025	NC_021490	ACAA	2	8	902729	902736	75 %	0 %	0 %	25 %	512556867
19026	NC_021490	CCG	2	6	902813	902818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556867
19027	NC_021490	CG	4	8	902824	902831	0 %	0 %	50 %	50 %	512556867
19028	NC_021490	AATT	2	8	902910	902917	50 %	50 %	0 %	0 %	512556867
19029	NC_021490	CGC	2	6	902978	902983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556867
19030	NC_021490	AAG	2	6	903050	903055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556867
19031	NC_021490	T	6	6	903081	903086	0 %	100 %	0 %	0 %	512556867
19032	NC_021490	CAA	2	6	903168	903173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556867
19033	NC_021490	ATC	2	6	903187	903192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556867
19034	NC_021490	GCC	2	6	903193	903198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556867
19035	NC_021490	A	6	6	903236	903241	100 %	0 %	0 %	0 %	512556867
19036	NC_021490	GAAAG	2	10	903276	903285	60 %	0 %	40 %	0 %	512556867
19037	NC_021490	CCAA	2	8	903387	903394	50 %	0 %	0 %	50 %	512556867
19038	NC_021490	ATT	2	6	903400	903405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556867
19039	NC_021490	GAAA	2	8	903434	903441	75 %	0 %	25 %	0 %	512556867
19040	NC_021490	CG	3	6	903539	903544	0 %	0 %	50 %	50 %	512556867
19041	NC_021490	CA	3	6	903585	903590	50 %	0 %	0 %	50 %	512556867
19042	NC_021490	ACT	2	6	903634	903639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556867
19043	NC_021490	TAA	2	6	903723	903728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556867
19044	NC_021490	GAC	2	6	903902	903907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556868
19045	NC_021490	TC	3	6	903935	903940	0 %	50 %	0 %	50 %	512556868
19046	NC_021490	TGC	2	6	904017	904022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556868
19047	NC_021490	CCA	2	6	904073	904078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556868
19048	NC_021490	GTT	2	6	904137	904142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556868
19049	NC_021490	T	6	6	904201	904206	0 %	100 %	0 %	0 %	512556868
19050	NC_021490	GCG	2	6	904412	904417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556868
19051	NC_021490	CG	3	6	904433	904438	0 %	0 %	50 %	50 %	512556868
19052	NC_021490	CCT	2	6	904450	904455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556868
19053	NC_021490	GC	3	6	904459	904464	0 %	0 %	50 %	50 %	512556868
19054	NC_021490	CGC	2	6	904467	904472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556868
19055	NC_021490	ACTG	2	8	904477	904484	25 %	25 %	25 %	25 %	512556868
19056	NC_021490	CATA	2	8	904523	904530	50 %	25 %	0 %	25 %	512556868
19057	NC_021490	CTG	2	6	904533	904538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556868
19058	NC_021490	CA	3	6	904809	904814	50 %	0 %	0 %	50 %	512556868
19059	NC_021490	CCTG	2	8	904870	904877	0 %	25 %	25 %	50 %	512556868
19060	NC_021490	GCA	2	6	904883	904888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556868
19061	NC_021490	GCG	2	6	905033	905038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556868
19062	NC_021490	TCC	2	6	905043	905048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556868
19063	NC_021490	AATCC	2	10	905082	905091	40 %	20 %	0 %	40 %	512556868
19064	NC_021490	TCA	2	6	905174	905179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556868
19065	NC_021490	GCA	2	6	905222	905227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556868
19066	NC_021490	ATC	2	6	905254	905259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556868
19067	NC_021490	CAC	2	6	905340	905345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556868
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19069	NC_021490	CG	3	6	905399	905404	0 %	0 %	50 %	50 %	512556868
19070	NC_021490	GCG	2	6	905420	905425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556868
19071	NC_021490	TCT	2	6	905440	905445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556868
19072	NC_021490	GAT	2	6	905492	905497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556868
19073	NC_021490	GCG	2	6	905519	905524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556868
19074	NC_021490	CTGCGC	2	12	905555	905566	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	512556868
19075	NC_021490	CTA	2	6	905567	905572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556868
19076	NC_021490	CCAA	2	8	905680	905687	50 %	0 %	0 %	50 %	512556868
19077	NC_021490	CACG	2	8	905744	905751	25 %	0 %	25 %	50 %	512556868
19078	NC_021490	GCA	3	9	905771	905779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556868
19079	NC_021490	GCA	2	6	905785	905790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556868
19080	NC_021490	CCTGC	2	10	905795	905804	0 %	20 %	20 %	60 %	512556868
19081	NC_021490	T	6	6	905842	905847	0 %	100 %	0 %	0 %	512556868
19082	NC_021490	GCG	2	6	905921	905926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556868
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19085	NC_021490	GCA	2	6	906043	906048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556868
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19087	NC_021490	CTG	2	6	906064	906069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556868
19088	NC_021490	GCG	2	6	906083	906088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556868
19089	NC_021490	GCAC	2	8	906163	906170	25 %	0 %	25 %	50 %	512556868
19090	NC_021490	CCA	2	6	906359	906364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556868
19091	NC_021490	GCG	2	6	906368	906373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556868
19092	NC_021490	AG	3	6	906414	906419	50 %	0 %	50 %	0 %	512556868
19093	NC_021490	CGT	2	6	906440	906445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556868
19094	NC_021490	CG	3	6	906542	906547	0 %	0 %	50 %	50 %	512556868
19095	NC_021490	GAG	2	6	906578	906583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556868
19096	NC_021490	GTA	2	6	906595	906600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556868
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19098	NC_021490	ATGC	2	8	906672	906679	25 %	25 %	25 %	25 %	512556868
19099	NC_021490	TCC	2	6	906686	906691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19100	NC_021490	GT	4	8	906716	906723	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19101	NC_021490	CTG	2	6	906833	906838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556869
19102	NC_021490	CA	3	6	906871	906876	50 %	0 %	0 %	50 %	512556869
19103	NC_021490	CTG	3	9	906878	906886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556869
19104	NC_021490	GCG	2	6	906958	906963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556869
19105	NC_021490	CGG	2	6	906966	906971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556869
19106	NC_021490	CA	3	6	906973	906978	50 %	0 %	0 %	50 %	512556869
19107	NC_021490	GTA	2	6	906985	906990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556869
19108	NC_021490	CGC	2	6	907086	907091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556869
19109	NC_021490	CTG	2	6	907150	907155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556869
19110	NC_021490	AGG	2	6	907167	907172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556869
19111	NC_021490	GCG	2	6	907213	907218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556869
19112	NC_021490	A	7	7	907276	907282	100 %	0 %	0 %	0 %	512556869
19113	NC_021490	TGC	2	6	907323	907328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556869
19114	NC_021490	GCT	2	6	907336	907341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556869
19115	NC_021490	GT	3	6	907434	907439	0 %	50 %	50 %	0 %	512556869
19116	NC_021490	GCAC	2	8	907464	907471	25 %	0 %	25 %	50 %	512556869
19117	NC_021490	A	6	6	907494	907499	100 %	0 %	0 %	0 %	512556869
19118	NC_021490	GCG	2	6	907504	907509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556869
19119	NC_021490	CG	3	6	907565	907570	0 %	0 %	50 %	50 %	512556869
19120	NC_021490	GCG	2	6	907611	907616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556869
19121	NC_021490	CTA	2	6	907672	907677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19122	NC_021490	GGCGCA	2	12	907718	907729	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
19123	NC_021490	TCC	2	6	907743	907748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19124	NC_021490	ACC	2	6	907769	907774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19125	NC_021490	AGA	2	6	907804	907809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556870
19126	NC_021490	TGC	2	6	907821	907826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556870
19127	NC_021490	CT	3	6	907896	907901	0 %	50 %	0 %	50 %	512556870
19128	NC_021490	GCC	2	6	907927	907932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556870
19129	NC_021490	GC	3	6	908014	908019	0 %	0 %	50 %	50 %	512556870
19130	NC_021490	TGCG	2	8	908025	908032	0 %	25 %	50 %	25 %	512556870
19131	NC_021490	GGT	2	6	908053	908058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556870
19132	NC_021490	CAAG	2	8	908101	908108	50 %	0 %	25 %	25 %	512556870
19133	NC_021490	GAC	2	6	908132	908137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556870
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19136	NC_021490	GAA	2	6	908411	908416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556870
19137	NC_021490	CAG	2	6	908471	908476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556870
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19139	NC_021490	CCT	2	6	908845	908850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556870
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19142	NC_021490	AGC	2	6	908983	908988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556870
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19144	NC_021490	CAAC	2	8	909154	909161	50 %	0 %	0 %	50 %	512556870
19145	NC_021490	C	6	6	909250	909255	0 %	0 %	0 %	100 %	512556870
19146	NC_021490	GCAG	2	8	909271	909278	25 %	0 %	50 %	25 %	512556870
19147	NC_021490	GCA	2	6	909316	909321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556870
19148	NC_021490	GCAG	2	8	909358	909365	25 %	0 %	50 %	25 %	512556870
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19152	NC_021490	CCG	2	6	909642	909647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556871
19153	NC_021490	GC	4	8	909655	909662	0 %	0 %	50 %	50 %	512556871
19154	NC_021490	CAT	2	6	909704	909709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556871
19155	NC_021490	CGAT	2	8	909711	909718	25 %	25 %	25 %	25 %	512556871
19156	NC_021490	CG	3	6	909724	909729	0 %	0 %	50 %	50 %	512556871
19157	NC_021490	TAAA	2	8	909787	909794	75 %	25 %	0 %	0 %	512556871
19158	NC_021490	A	6	6	909993	909998	100 %	0 %	0 %	0 %	512556871
19159	NC_021490	CGTA	2	8	910002	910009	25 %	25 %	25 %	25 %	512556871
19160	NC_021490	ATC	2	6	910022	910027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556871
19161	NC_021490	CG	3	6	910184	910189	0 %	0 %	50 %	50 %	512556871
19162	NC_021490	CGA	2	6	910201	910206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556871
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19171	NC_021490	TTC	2	6	910685	910690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556871
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19177	NC_021490	GCGATA	2	12	911091	911102	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	512556871
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19183	NC_021490	AC	3	6	911399	911404	50 %	0 %	0 %	50 %	512556872
19184	NC_021490	CAA	2	6	911535	911540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556872
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19190	NC_021490	TTTC	2	8	911983	911990	0 %	75 %	0 %	25 %	512556872
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19235	NC_021490	GCAC	2	8	914169	914176	25 %	0 %	25 %	50 %	512556873
19236	NC_021490	AC	3	6	914175	914180	50 %	0 %	0 %	50 %	512556873
19237	NC_021490	GC	3	6	914217	914222	0 %	0 %	50 %	50 %	512556873
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19241	NC_021490	TACCG	2	10	914412	914421	20 %	20 %	20 %	40 %	512556873
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19245	NC_021490	CTG	2	6	914607	914612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556873
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19369	NC_021490	GCT	2	6	920554	920559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556880
19370	NC_021490	CTTC	2	8	920617	920624	0 %	50 %	0 %	50 %	512556880
19371	NC_021490	TCC	2	6	920661	920666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556880
19372	NC_021490	C	6	6	920702	920707	0 %	0 %	0 %	100 %	512556881
19373	NC_021490	GA	3	6	920771	920776	50 %	0 %	50 %	0 %	512556881
19374	NC_021490	CGC	2	6	920953	920958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556881
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19381	NC_021490	CAT	2	6	921341	921346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556883
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19393	NC_021490	ATGTC	2	10	921939	921948	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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19465	NC_021490	TTAT	2	8	925416	925423	25 %	75 %	0 %	0 %	512556886
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19481	NC_021490	TGCC	2	8	926167	926174	0 %	25 %	25 %	50 %	512556886
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19489	NC_021490	CA	3	6	926554	926559	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19490	NC_021490	TCTT	2	8	926593	926600	0 %	75 %	0 %	25 %	512556887
19491	NC_021490	ATC	2	6	926618	926623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556887
19492	NC_021490	GTC	2	6	926630	926635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556887
19493	NC_021490	GC	3	6	926690	926695	0 %	0 %	50 %	50 %	512556887
19494	NC_021490	T	6	6	926744	926749	0 %	100 %	0 %	0 %	512556887
19495	NC_021490	GGTT	2	8	926770	926777	0 %	50 %	50 %	0 %	512556887
19496	NC_021490	TGC	2	6	926950	926955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556887
19497	NC_021490	CTC	2	6	926975	926980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556887
19498	NC_021490	CAT	2	6	927016	927021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556887
19499	NC_021490	ATCA	2	8	927167	927174	50 %	25 %	0 %	25 %	512556887
19500	NC_021490	GCA	2	6	927195	927200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556887

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