MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 23994

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18502	NC_021490	AC	3	6	876555	876560	50 %	0 %	0 %	50 %	512556840
18503	NC_021490	TG	4	8	876564	876571	0 %	50 %	50 %	0 %	512556840
18504	NC_021490	TGC	2	6	876579	876584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556840
18505	NC_021490	TTCC	2	8	876841	876848	0 %	50 %	0 %	50 %	512556840
18506	NC_021490	T	7	7	876936	876942	0 %	100 %	0 %	0 %	512556840
18507	NC_021490	GCG	2	6	876993	876998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556840
18508	NC_021490	CAAA	2	8	877011	877018	75 %	0 %	0 %	25 %	512556840
18509	NC_021490	C	6	6	877072	877077	0 %	0 %	0 %	100 %	512556840
18510	NC_021490	A	6	6	877097	877102	100 %	0 %	0 %	0 %	512556840
18511	NC_021490	CG	4	8	877129	877136	0 %	0 %	50 %	50 %	512556840
18512	NC_021490	GAA	2	6	877197	877202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556840
18513	NC_021490	CACGCG	2	12	877235	877246	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	512556840
18514	NC_021490	CTCG	2	8	877291	877298	0 %	25 %	25 %	50 %	512556840
18515	NC_021490	AC	3	6	877308	877313	50 %	0 %	0 %	50 %	512556840
18516	NC_021490	ACC	2	6	877458	877463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556841
18517	NC_021490	GCA	2	6	877496	877501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556841
18518	NC_021490	CG	3	6	877647	877652	0 %	0 %	50 %	50 %	512556841
18519	NC_021490	CTT	2	6	877659	877664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556841
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18521	NC_021490	TCA	2	6	877787	877792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556841
18522	NC_021490	TTC	2	6	877844	877849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556841
18523	NC_021490	GT	3	6	877851	877856	0 %	50 %	50 %	0 %	512556841
18524	NC_021490	TGC	2	6	877882	877887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556841
18525	NC_021490	TGC	2	6	877927	877932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556841
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18529	NC_021490	CCG	2	6	878028	878033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556841
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18531	NC_021490	CCT	2	6	878055	878060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556841
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18534	NC_021490	AGC	2	6	878209	878214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556841
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18537	NC_021490	GAGC	2	8	878305	878312	25 %	0 %	50 %	25 %	512556841
18538	NC_021490	GCA	2	6	878318	878323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556841
18539	NC_021490	GC	3	6	878385	878390	0 %	0 %	50 %	50 %	512556841
18540	NC_021490	GC	4	8	878420	878427	0 %	0 %	50 %	50 %	512556841
18541	NC_021490	ACGT	2	8	878585	878592	25 %	25 %	25 %	25 %	512556841
18542	NC_021490	CGCT	2	8	878605	878612	0 %	25 %	25 %	50 %	512556841
18543	NC_021490	CT	3	6	878803	878808	0 %	50 %	0 %	50 %	512556841
18544	NC_021490	CA	3	6	878839	878844	50 %	0 %	0 %	50 %	512556841
18545	NC_021490	AAG	2	6	878868	878873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18546	NC_021490	CA	3	6	878874	878879	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18547	NC_021490	GAA	2	6	878902	878907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18548	NC_021490	TG	3	6	878926	878931	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18549	NC_021490	GCAC	2	8	879015	879022	25 %	0 %	25 %	50 %	512556842
18550	NC_021490	TTG	2	6	879067	879072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556842
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18552	NC_021490	TGA	2	6	879158	879163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556842
18553	NC_021490	AGG	2	6	879221	879226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18554	NC_021490	GTT	2	6	879242	879247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556843
18555	NC_021490	GGA	2	6	879287	879292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556843
18556	NC_021490	TCC	2	6	879312	879317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556843
18557	NC_021490	GAG	2	6	879322	879327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556843
18558	NC_021490	CGA	2	6	879401	879406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556843
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18562	NC_021490	GCC	2	6	879698	879703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556844
18563	NC_021490	GAG	2	6	879842	879847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556844
18564	NC_021490	AGG	2	6	879853	879858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556844
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18566	NC_021490	T	7	7	879912	879918	0 %	100 %	0 %	0 %	512556844
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18569	NC_021490	GTA	2	6	880050	880055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556844
18570	NC_021490	GTC	2	6	880070	880075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556844
18571	NC_021490	A	7	7	880163	880169	100 %	0 %	0 %	0 %	512556844
18572	NC_021490	TGC	2	6	880238	880243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18574	NC_021490	AGG	2	6	880303	880308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556845
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18576	NC_021490	ATCT	3	12	880439	880450	25 %	50 %	0 %	25 %	512556845
18577	NC_021490	CTG	2	6	880466	880471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556845
18578	NC_021490	TG	3	6	880470	880475	0 %	50 %	50 %	0 %	512556845
18579	NC_021490	AGA	2	6	880501	880506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556845
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18581	NC_021490	GCG	2	6	880567	880572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556845
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18583	NC_021490	TCAAT	2	10	880672	880681	40 %	40 %	0 %	20 %	512556845
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18586	NC_021490	TGA	2	6	880789	880794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556845
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18588	NC_021490	GAG	2	6	880875	880880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556845
18589	NC_021490	AGC	2	6	880948	880953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556845
18590	NC_021490	TGC	2	6	880966	880971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556845
18591	NC_021490	TGCA	2	8	880976	880983	25 %	25 %	25 %	25 %	512556845
18592	NC_021490	CG	3	6	880990	880995	0 %	0 %	50 %	50 %	512556845
18593	NC_021490	CAA	2	6	881066	881071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556845
18594	NC_021490	ATCGC	2	10	881196	881205	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
18595	NC_021490	GCG	2	6	881211	881216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18596	NC_021490	AC	3	6	881293	881298	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18597	NC_021490	GTA	2	6	881311	881316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18598	NC_021490	TGC	2	6	881494	881499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18599	NC_021490	GC	3	6	881565	881570	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18600	NC_021490	GCT	2	6	881788	881793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18601	NC_021490	ACGG	2	8	881890	881897	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18602	NC_021490	GAA	2	6	881931	881936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18603	NC_021490	GTG	2	6	881968	881973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18604	NC_021490	CTC	2	6	881999	882004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18605	NC_021490	CG	3	6	882045	882050	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18606	NC_021490	ACGC	2	8	882075	882082	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18607	NC_021490	T	6	6	882092	882097	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18608	NC_021490	CTC	2	6	882100	882105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18609	NC_021490	GT	3	6	882130	882135	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18610	NC_021490	T	8	8	882149	882156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18611	NC_021490	GCA	2	6	882211	882216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18612	NC_021490	AGC	2	6	882276	882281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18613	NC_021490	CGC	2	6	882290	882295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18614	NC_021490	GGA	2	6	882326	882331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18615	NC_021490	AC	3	6	882373	882378	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18616	NC_021490	AAAGAC	2	12	882473	882484	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18617	NC_021490	GGCT	2	8	882650	882657	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18618	NC_021490	TCC	2	6	882699	882704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18619	NC_021490	GCA	2	6	882708	882713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18620	NC_021490	GC	3	6	882737	882742	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18621	NC_021490	TTGT	2	8	882768	882775	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18622	NC_021490	CGTG	2	8	882792	882799	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18623	NC_021490	GCAC	2	8	882802	882809	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18624	NC_021490	CGAA	2	8	882868	882875	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18625	NC_021490	A	6	6	882960	882965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18626	NC_021490	AC	3	6	882996	883001	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18627	NC_021490	A	7	7	883076	883082	100 %	0 %	0 %	0 %	512556846
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18973	NC_021490	GCG	2	6	900603	900608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556864
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18976	NC_021490	CTG	2	6	900655	900660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556864
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18979	NC_021490	GCC	2	6	900825	900830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556864
18980	NC_021490	CA	3	6	900837	900842	50 %	0 %	0 %	50 %	512556864
18981	NC_021490	CCTCA	2	10	900855	900864	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
18982	NC_021490	GAAC	2	8	900878	900885	50 %	0 %	25 %	25 %	512556865
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18987	NC_021490	GC	3	6	901179	901184	0 %	0 %	50 %	50 %	512556865
18988	NC_021490	CCT	2	6	901231	901236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556865
18989	NC_021490	TGT	2	6	901296	901301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556865
18990	NC_021490	AGCCG	2	10	901442	901451	20 %	0 %	40 %	40 %	512556865
18991	NC_021490	ACG	2	6	901460	901465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556865
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18993	NC_021490	TCT	2	6	901547	901552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556865
18994	NC_021490	GAAA	2	8	901558	901565	75 %	0 %	25 %	0 %	512556865
18995	NC_021490	TGA	2	6	901613	901618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556865
18996	NC_021490	TGC	2	6	901681	901686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556865
18997	NC_021490	AC	3	6	901687	901692	50 %	0 %	0 %	50 %	512556865
18998	NC_021490	A	6	6	901713	901718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18999	NC_021490	AGC	2	6	901739	901744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19000	NC_021490	CG	3	6	901825	901830	0 %	0 %	50 %	50 %	512556866

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