MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 23994

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_021490	GCA	2	6	829645	829650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556800
17502	NC_021490	CGC	2	6	829683	829688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556800
17503	NC_021490	TCG	2	6	829697	829702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556800
17504	NC_021490	CG	4	8	829745	829752	0 %	0 %	50 %	50 %	512556800
17505	NC_021490	GGT	2	6	829821	829826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556800
17506	NC_021490	CGA	2	6	829839	829844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556800
17507	NC_021490	CAT	2	6	829899	829904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556800
17508	NC_021490	CTG	3	9	830019	830027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556801
17509	NC_021490	T	6	6	830038	830043	0 %	100 %	0 %	0 %	512556801
17510	NC_021490	TCG	2	6	830086	830091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556801
17511	NC_021490	T	6	6	830145	830150	0 %	100 %	0 %	0 %	512556801
17512	NC_021490	ACC	2	6	830167	830172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556801
17513	NC_021490	CG	3	6	830195	830200	0 %	0 %	50 %	50 %	512556801
17514	NC_021490	TCA	2	6	830209	830214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556801
17515	NC_021490	CTG	2	6	830220	830225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556801
17516	NC_021490	TG	3	6	830224	830229	0 %	50 %	50 %	0 %	512556801
17517	NC_021490	CG	3	6	830243	830248	0 %	0 %	50 %	50 %	512556801
17518	NC_021490	ATC	2	6	830332	830337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556801
17519	NC_021490	AGC	2	6	830428	830433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556801
17520	NC_021490	CAA	2	6	830448	830453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556801
17521	NC_021490	CTG	2	6	830454	830459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556801
17522	NC_021490	AAT	2	6	830529	830534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556801
17523	NC_021490	AAT	2	6	830607	830612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556801
17524	NC_021490	CTT	2	6	830621	830626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556801
17525	NC_021490	T	7	7	830642	830648	0 %	100 %	0 %	0 %	512556801
17526	NC_021490	CAC	2	6	830745	830750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556801
17527	NC_021490	GC	3	6	830787	830792	0 %	0 %	50 %	50 %	512556801
17528	NC_021490	CT	3	6	830856	830861	0 %	50 %	0 %	50 %	512556801
17529	NC_021490	AGC	2	6	830952	830957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556801
17530	NC_021490	GGT	2	6	830973	830978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556801
17531	NC_021490	CCAT	2	8	830989	830996	25 %	25 %	0 %	50 %	512556801
17532	NC_021490	GGC	2	6	831056	831061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556801
17533	NC_021490	AAT	2	6	831093	831098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556801
17534	NC_021490	A	6	6	831195	831200	100 %	0 %	0 %	0 %	512556801
17535	NC_021490	GCAA	2	8	831232	831239	50 %	0 %	25 %	25 %	512556801
17536	NC_021490	GACC	2	8	831260	831267	25 %	0 %	25 %	50 %	512556801
17537	NC_021490	C	6	6	831291	831296	0 %	0 %	0 %	100 %	512556801
17538	NC_021490	ACT	2	6	831334	831339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556801
17539	NC_021490	CTT	2	6	831350	831355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556801
17540	NC_021490	GTG	2	6	831391	831396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556801
17541	NC_021490	CTT	2	6	831404	831409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556801
17542	NC_021490	CCG	2	6	831413	831418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556801
17543	NC_021490	GC	3	6	831423	831428	0 %	0 %	50 %	50 %	512556801
17544	NC_021490	A	6	6	831504	831509	100 %	0 %	0 %	0 %	512556801
17545	NC_021490	AGC	2	6	831517	831522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556801
17546	NC_021490	CG	3	6	831563	831568	0 %	0 %	50 %	50 %	512556801
17547	NC_021490	ACC	2	6	831583	831588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556801
17548	NC_021490	TAGG	2	8	831643	831650	25 %	25 %	50 %	0 %	512556801
17549	NC_021490	AG	3	6	831663	831668	50 %	0 %	50 %	0 %	512556801
17550	NC_021490	GC	3	6	831699	831704	0 %	0 %	50 %	50 %	512556801
17551	NC_021490	ACA	2	6	831736	831741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556801
17552	NC_021490	GAT	2	6	831792	831797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556801
17553	NC_021490	AGCA	2	8	831834	831841	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17554	NC_021490	CGAG	2	8	831863	831870	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17555	NC_021490	GAC	2	6	831910	831915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17556	NC_021490	G	6	6	831935	831940	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
17557	NC_021490	A	6	6	831948	831953	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17558	NC_021490	GAA	2	6	831967	831972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17559	NC_021490	GC	3	6	832027	832032	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17560	NC_021490	AAG	2	6	832059	832064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17561	NC_021490	TG	3	6	832082	832087	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17562	NC_021490	TGC	2	6	832137	832142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17563	NC_021490	A	7	7	832143	832149	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17564	NC_021490	CG	4	8	832154	832161	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17565	NC_021490	GC	3	6	832180	832185	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17566	NC_021490	ACCT	2	8	832211	832218	25 %	25 %	0 %	50 %	512556802
17567	NC_021490	CGC	2	6	832256	832261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556802
17568	NC_021490	GC	3	6	832344	832349	0 %	0 %	50 %	50 %	512556802
17569	NC_021490	GCAC	2	8	832377	832384	25 %	0 %	25 %	50 %	512556802
17570	NC_021490	CGA	2	6	832439	832444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556802
17571	NC_021490	CTC	2	6	832483	832488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556802
17572	NC_021490	CCG	2	6	832512	832517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556802
17573	NC_021490	CTCC	2	8	832518	832525	0 %	25 %	0 %	75 %	512556802
17574	NC_021490	GCCC	2	8	832531	832538	0 %	0 %	25 %	75 %	512556802
17575	NC_021490	TTC	3	9	832553	832561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556802
17576	NC_021490	GCT	2	6	832643	832648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556802
17577	NC_021490	GC	4	8	832658	832665	0 %	0 %	50 %	50 %	512556802
17578	NC_021490	CT	3	6	832792	832797	0 %	50 %	0 %	50 %	512556802
17579	NC_021490	GCA	2	6	832811	832816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556802
17580	NC_021490	GC	3	6	832820	832825	0 %	0 %	50 %	50 %	512556802
17581	NC_021490	TCAT	2	8	832849	832856	25 %	50 %	0 %	25 %	512556802
17582	NC_021490	AGG	2	6	832865	832870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556802
17583	NC_021490	TC	4	8	832897	832904	0 %	50 %	0 %	50 %	512556802
17584	NC_021490	GATT	2	8	832910	832917	25 %	50 %	25 %	0 %	512556802
17585	NC_021490	CTCA	2	8	833015	833022	25 %	25 %	0 %	50 %	512556802
17586	NC_021490	GCG	2	6	833032	833037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556802
17587	NC_021490	TCT	2	6	833055	833060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556802
17588	NC_021490	AGG	2	6	833070	833075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556802
17589	NC_021490	GC	3	6	833133	833138	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17590	NC_021490	GGCG	2	8	833169	833176	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17591	NC_021490	CTG	2	6	833219	833224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17592	NC_021490	GC	3	6	833266	833271	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17593	NC_021490	GAA	2	6	833283	833288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17594	NC_021490	GC	3	6	833338	833343	0 %	0 %	50 %	50 %	512556803
17595	NC_021490	CCAT	2	8	833407	833414	25 %	25 %	0 %	50 %	512556803
17596	NC_021490	CCA	2	6	833443	833448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556803
17597	NC_021490	ACA	2	6	833452	833457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556803
17598	NC_021490	AC	3	6	833522	833527	50 %	0 %	0 %	50 %	512556803
17599	NC_021490	CCAGTC	2	12	833636	833647	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	512556803
17600	NC_021490	CCG	2	6	833669	833674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556803
17601	NC_021490	GC	3	6	833872	833877	0 %	0 %	50 %	50 %	512556803
17602	NC_021490	CGTG	2	8	833879	833886	0 %	25 %	50 %	25 %	512556803
17603	NC_021490	GCG	2	6	833949	833954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556803
17604	NC_021490	T	6	6	834064	834069	0 %	100 %	0 %	0 %	512556803
17605	NC_021490	TAC	2	6	834123	834128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556803
17606	NC_021490	GAG	2	6	834180	834185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556803
17607	NC_021490	A	6	6	834297	834302	100 %	0 %	0 %	0 %	512556803
17608	NC_021490	CG	4	8	834324	834331	0 %	0 %	50 %	50 %	512556803
17609	NC_021490	TGTT	2	8	834490	834497	0 %	75 %	25 %	0 %	512556803
17610	NC_021490	ATC	2	6	834633	834638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556803
17611	NC_021490	GC	4	8	834750	834757	0 %	0 %	50 %	50 %	512556803
17612	NC_021490	CGG	2	6	834788	834793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556803
17613	NC_021490	ATCAA	2	10	834862	834871	60 %	20 %	0 %	20 %	512556803
17614	NC_021490	GAG	2	6	834874	834879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556803
17615	NC_021490	AAAG	2	8	834932	834939	75 %	0 %	25 %	0 %	512556803
17616	NC_021490	CTC	2	6	835010	835015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556803
17617	NC_021490	GGC	2	6	835031	835036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556803
17618	NC_021490	AGT	2	6	835079	835084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556803
17619	NC_021490	TTAA	2	8	835149	835156	50 %	50 %	0 %	0 %	512556803
17620	NC_021490	GCG	2	6	835160	835165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556803
17621	NC_021490	TTC	2	6	835262	835267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556803
17622	NC_021490	CA	3	6	835268	835273	50 %	0 %	0 %	50 %	512556803
17623	NC_021490	GGC	2	6	835399	835404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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17625	NC_021490	GAG	2	6	835495	835500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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