MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 23994

< Previous12...3031323334353637383940...4748Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_021490	AC	3	6	805277	805282	50 %	0 %	0 %	50 %	512556774
17003	NC_021490	CGC	2	6	805311	805316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556774
17004	NC_021490	TGC	2	6	805352	805357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556774
17005	NC_021490	GGA	2	6	805379	805384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556774
17006	NC_021490	AG	3	6	805387	805392	50 %	0 %	50 %	0 %	512556774
17007	NC_021490	A	8	8	805400	805407	100 %	0 %	0 %	0 %	512556774
17008	NC_021490	CG	3	6	805463	805468	0 %	0 %	50 %	50 %	512556775
17009	NC_021490	GC	4	8	805508	805515	0 %	0 %	50 %	50 %	512556775
17010	NC_021490	GC	3	6	805518	805523	0 %	0 %	50 %	50 %	512556775
17011	NC_021490	T	7	7	805588	805594	0 %	100 %	0 %	0 %	512556775
17012	NC_021490	GCC	2	6	805622	805627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556775
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17016	NC_021490	GC	4	8	805739	805746	0 %	0 %	50 %	50 %	512556775
17017	NC_021490	CA	3	6	805749	805754	50 %	0 %	0 %	50 %	512556775
17018	NC_021490	AGC	2	6	805774	805779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556775
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17034	NC_021490	CGCT	2	8	806683	806690	0 %	25 %	25 %	50 %	512556776
17035	NC_021490	CG	3	6	806769	806774	0 %	0 %	50 %	50 %	512556776
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17041	NC_021490	GAG	2	6	806943	806948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556776
17042	NC_021490	A	7	7	806950	806956	100 %	0 %	0 %	0 %	512556776
17043	NC_021490	TCG	2	6	807006	807011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17045	NC_021490	CA	3	6	807146	807151	50 %	0 %	0 %	50 %	512556777
17046	NC_021490	CACT	2	8	807159	807166	25 %	25 %	0 %	50 %	512556777
17047	NC_021490	GCA	2	6	807173	807178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556777
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17053	NC_021490	GC	3	6	807374	807379	0 %	0 %	50 %	50 %	512556777
17054	NC_021490	CGCA	2	8	807432	807439	25 %	0 %	25 %	50 %	512556777
17055	NC_021490	GCA	3	9	807437	807445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556777
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17060	NC_021490	GAAA	3	12	807694	807705	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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17062	NC_021490	GAA	2	6	807719	807724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17063	NC_021490	AAG	2	6	807741	807746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17064	NC_021490	CG	3	6	807774	807779	0 %	0 %	50 %	50 %	512556778
17065	NC_021490	ATA	2	6	807780	807785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556778
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17072	NC_021490	TGC	2	6	808101	808106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556778
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17083	NC_021490	GCAAA	2	10	808711	808720	60 %	0 %	20 %	20 %	512556779
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17088	NC_021490	A	7	7	808954	808960	100 %	0 %	0 %	0 %	512556779
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17092	NC_021490	CTG	2	6	809083	809088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556779
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17100	NC_021490	TCA	2	6	809477	809482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556779
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17103	NC_021490	AGG	2	6	809585	809590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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17106	NC_021490	CCTT	2	8	809658	809665	0 %	50 %	0 %	50 %	512556780
17107	NC_021490	GAGCAA	2	12	809688	809699	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	512556780
17108	NC_021490	ACC	2	6	809794	809799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556780
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17110	NC_021490	CT	3	6	809862	809867	0 %	50 %	0 %	50 %	512556780
17111	NC_021490	TAC	2	6	809877	809882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556780
17112	NC_021490	C	6	6	809882	809887	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
17113	NC_021490	CA	3	6	809913	809918	50 %	0 %	0 %	50 %	512556781
17114	NC_021490	CGCA	2	8	809930	809937	25 %	0 %	25 %	50 %	512556781
17115	NC_021490	ACGT	2	8	809970	809977	25 %	25 %	25 %	25 %	512556781
17116	NC_021490	AG	3	6	810012	810017	50 %	0 %	50 %	0 %	512556781
17117	NC_021490	C	7	7	810037	810043	0 %	0 %	0 %	100 %	512556781
17118	NC_021490	GA	3	6	810053	810058	50 %	0 %	50 %	0 %	512556781
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17125	NC_021490	CG	3	6	810379	810384	0 %	0 %	50 %	50 %	512556782
17126	NC_021490	CCA	2	6	810434	810439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556782
17127	NC_021490	ATC	2	6	810440	810445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556782
17128	NC_021490	CCCG	2	8	810469	810476	0 %	0 %	25 %	75 %	512556782
17129	NC_021490	TAT	2	6	810492	810497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556782
17130	NC_021490	TAC	3	9	810507	810515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556782
17131	NC_021490	A	6	6	810574	810579	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17132	NC_021490	ACGCAG	2	12	810601	810612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17133	NC_021490	ACGA	2	8	810659	810666	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17134	NC_021490	GC	3	6	810678	810683	0 %	0 %	50 %	50 %	512556783
17135	NC_021490	CCTT	2	8	810732	810739	0 %	50 %	0 %	50 %	512556783
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17137	NC_021490	CG	3	6	810943	810948	0 %	0 %	50 %	50 %	512556783
17138	NC_021490	GC	3	6	811088	811093	0 %	0 %	50 %	50 %	512556783
17139	NC_021490	GCAG	2	8	811119	811126	25 %	0 %	50 %	25 %	512556783
17140	NC_021490	CACC	2	8	811138	811145	25 %	0 %	0 %	75 %	512556783
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17144	NC_021490	CTC	2	6	811451	811456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556783
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17146	NC_021490	CGG	2	6	811680	811685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556783
17147	NC_021490	TCT	2	6	811701	811706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556783
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17155	NC_021490	AGAA	2	8	812075	812082	75 %	0 %	25 %	0 %	512556783
17156	NC_021490	CACGC	2	10	812176	812185	20 %	0 %	20 %	60 %	512556783
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17232	NC_021490	CCT	2	6	816365	816370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556785
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17235	NC_021490	CCT	2	6	816434	816439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556785
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17238	NC_021490	TCG	2	6	816597	816602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556786
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17240	NC_021490	T	6	6	816642	816647	0 %	100 %	0 %	0 %	512556786
17241	NC_021490	T	6	6	816654	816659	0 %	100 %	0 %	0 %	512556786
17242	NC_021490	A	6	6	816723	816728	100 %	0 %	0 %	0 %	512556786
17243	NC_021490	TGCA	2	8	816772	816779	25 %	25 %	25 %	25 %	512556787
17244	NC_021490	TGA	2	6	816811	816816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556787
17245	NC_021490	CAG	2	6	816854	816859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556787
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17247	NC_021490	ATT	2	6	816996	817001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556787
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17368	NC_021490	A	7	7	822967	822973	100 %	0 %	0 %	0 %	512556794
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17375	NC_021490	GCT	2	6	823310	823315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556794
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