MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 23994

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16502	NC_021490	CTG	2	6	782770	782775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556751
16503	NC_021490	T	6	6	782820	782825	0 %	100 %	0 %	0 %	512556751
16504	NC_021490	AGC	2	6	782848	782853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556751
16505	NC_021490	AC	3	6	782856	782861	50 %	0 %	0 %	50 %	512556751
16506	NC_021490	TGA	2	6	782896	782901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556751
16507	NC_021490	A	9	9	782922	782930	100 %	0 %	0 %	0 %	512556751
16508	NC_021490	A	6	6	782959	782964	100 %	0 %	0 %	0 %	512556751
16509	NC_021490	TAT	2	6	782973	782978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556751
16510	NC_021490	TGCG	2	8	782984	782991	0 %	25 %	50 %	25 %	512556751
16511	NC_021490	CTA	2	6	783063	783068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556751
16512	NC_021490	ACT	2	6	783112	783117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556752
16513	NC_021490	CT	3	6	783144	783149	0 %	50 %	0 %	50 %	512556752
16514	NC_021490	TAC	2	6	783158	783163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556752
16515	NC_021490	CTT	2	6	783196	783201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556752
16516	NC_021490	A	7	7	783235	783241	100 %	0 %	0 %	0 %	512556752
16517	NC_021490	CGT	2	6	783272	783277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556752
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16519	NC_021490	GA	4	8	783359	783366	50 %	0 %	50 %	0 %	512556752
16520	NC_021490	GAG	2	6	783429	783434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556752
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16522	NC_021490	CAT	2	6	783667	783672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556752
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16534	NC_021490	A	6	6	784316	784321	100 %	0 %	0 %	0 %	512556752
16535	NC_021490	AATAA	2	10	784379	784388	80 %	20 %	0 %	0 %	512556752
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16543	NC_021490	A	7	7	784676	784682	100 %	0 %	0 %	0 %	512556752
16544	NC_021490	CTT	3	9	784720	784728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556752
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16553	NC_021490	AAGAT	2	10	785103	785112	60 %	20 %	20 %	0 %	512556752
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16557	NC_021490	AGT	2	6	785204	785209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556752
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16604	NC_021490	GAG	2	6	787269	787274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556755
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16607	NC_021490	CA	3	6	787464	787469	50 %	0 %	0 %	50 %	512556755
16608	NC_021490	CTAT	2	8	787507	787514	25 %	50 %	0 %	25 %	512556756
16609	NC_021490	CAG	2	6	787515	787520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556756
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16988	NC_021490	TTGC	2	8	804700	804707	0 %	50 %	25 %	25 %	512556774
16989	NC_021490	GAC	2	6	804769	804774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556774
16990	NC_021490	AAAC	2	8	804852	804859	75 %	0 %	0 %	25 %	512556774
16991	NC_021490	ACC	2	6	804860	804865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556774
16992	NC_021490	GC	3	6	804871	804876	0 %	0 %	50 %	50 %	512556774
16993	NC_021490	TCAT	2	8	804887	804894	25 %	50 %	0 %	25 %	512556774
16994	NC_021490	ATCGC	2	10	804908	804917	20 %	20 %	20 %	40 %	512556774
16995	NC_021490	GCGT	2	8	804985	804992	0 %	25 %	50 %	25 %	512556774
16996	NC_021490	ACTG	2	8	805023	805030	25 %	25 %	25 %	25 %	512556774
16997	NC_021490	A	7	7	805063	805069	100 %	0 %	0 %	0 %	512556774
16998	NC_021490	GC	3	6	805070	805075	0 %	0 %	50 %	50 %	512556774
16999	NC_021490	CT	3	6	805099	805104	0 %	50 %	0 %	50 %	512556774
17000	NC_021490	GAA	2	6	805141	805146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556774

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