MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 23994

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_021490	CTTC	2	8	757962	757969	0 %	50 %	0 %	50 %	512556730
16003	NC_021490	CAA	2	6	757970	757975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556730
16004	NC_021490	TCT	2	6	758035	758040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556730
16005	NC_021490	CGA	2	6	758071	758076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556730
16006	NC_021490	TACAA	2	10	758079	758088	60 %	20 %	0 %	20 %	512556730
16007	NC_021490	AGT	2	6	758128	758133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556730
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16009	NC_021490	GTA	2	6	758238	758243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556730
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16011	NC_021490	TCA	2	6	758290	758295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556730
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16013	NC_021490	ATC	2	6	758345	758350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556730
16014	NC_021490	ACCGT	2	10	758462	758471	20 %	20 %	20 %	40 %	512556730
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16016	NC_021490	CTC	2	6	758494	758499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556730
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16019	NC_021490	TCT	2	6	758568	758573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556730
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16089	NC_021490	ACA	2	6	761718	761723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16090	NC_021490	TTC	2	6	761734	761739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16097	NC_021490	CCTG	2	8	762249	762256	0 %	25 %	25 %	50 %	512556734
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16115	NC_021490	CAC	2	6	763167	763172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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16117	NC_021490	TCT	2	6	763246	763251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16118	NC_021490	GAC	2	6	763271	763276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16119	NC_021490	ACC	2	6	763283	763288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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16121	NC_021490	GC	3	6	763338	763343	0 %	0 %	50 %	50 %	512556735
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16123	NC_021490	TTC	2	6	763429	763434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556735
16124	NC_021490	GCCCCT	2	12	763440	763451	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	512556735
16125	NC_021490	CAC	2	6	763590	763595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556735
16126	NC_021490	CA	3	6	763634	763639	50 %	0 %	0 %	50 %	512556735
16127	NC_021490	C	6	6	763653	763658	0 %	0 %	0 %	100 %	512556735
16128	NC_021490	CGG	2	6	763761	763766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556735
16129	NC_021490	CGC	2	6	763797	763802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556735
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16131	NC_021490	CTA	2	6	763821	763826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556735
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16134	NC_021490	CA	3	6	763994	763999	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16135	NC_021490	TGCA	2	8	764002	764009	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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16137	NC_021490	GCA	2	6	764113	764118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556736
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16143	NC_021490	TCG	2	6	764522	764527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556736
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16154	NC_021490	CTGG	2	8	764999	765006	0 %	25 %	50 %	25 %	512556736
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16162	NC_021490	CGTA	2	8	765282	765289	25 %	25 %	25 %	25 %	512556736
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16192	NC_021490	ACCCC	2	10	766717	766726	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
16193	NC_021490	AGC	2	6	766727	766732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16195	NC_021490	A	6	6	766918	766923	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16197	NC_021490	ACCC	2	8	767030	767037	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
16198	NC_021490	GC	3	6	767049	767054	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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16210	NC_021490	CGA	2	6	767782	767787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556738
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16496	NC_021490	CTA	2	6	782409	782414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556751
16497	NC_021490	AAG	2	6	782596	782601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556751
16498	NC_021490	CAC	2	6	782638	782643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556751
16499	NC_021490	TCT	2	6	782661	782666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556751
16500	NC_021490	TGAG	2	8	782687	782694	25 %	25 %	50 %	0 %	512556751

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